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Pesquisa de artigos na área de Estatística
by Manasses Nóbrega 13 Mai '20

13 Mai '20

Boa noite, pessoal. Por conta de meus estudos, tenho utilizado nos últimos anos a plataforma PubMEd para busca de artigos científicos na área das "ciências da vida". Entretanto, surgiu a necessidade de pesquisar alguns temas da área de Estatística. Assim como no caso do PubMed, existe alguma plataforma específica para busca de artigos científicos na área de Estatística? Caso não haja, poderiam me indicar sites de busca específicos da área? Desde já agradeço a colaboração de vocês. Atenciosamente, Manasses -- *I am a brain, Watson. The rest of me is a mere appendix. * *(Sherlock Holmes)*

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Atualizar pacotes R em outra versão
by Diogo Jerônimo 09 Mai '20

09 Mai '20

Bom dia!!! Talvez ridícula, mas não achei resposta. Quero atualizar meu R para outra versão (3.6.0 para 4.0.0). Tem um monte de libraries no anterior que não estão no atual, e que me darão muito trabalho de reinstalar, devido a quantidade. Pergunta: é possível instalar a versão nova, e fazer com que as libraries do antigo apareçam no atual? Obrigado!!! Diogo JerônimoBacharel em Ciências Estatísticas - ENCE/IBGEMestre em Metrologia - PUC-Rio/PósMQICONRE: 8514 - SÉRIE AEmail: diogojose21@yahoo.com.brhttp://lattes.cnpq.br/8996149312896520

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Problema com a instalação de pacotes no R!
by Andre Oliveira 09 Mai '20

09 Mai '20

bom dia, mesmo depois de executar o R como administrador tenho alguns problemas para instalar alguns pacotes no R (nlme e lubridate entre outros). Alguma dica para solução deste problema? > install.packages("nlme") Installing package into 'C:/Users/andreoliveira/Documents/R/win-library/3.6' (as 'lib' is unspecified) tentando a URL 'https://cran-r.c3sl.ufpr.br/.../contrib/3.6/nlme_3.1-147.zip' Content type 'application/zip' length 2374568 bytes (2.3 MB) downloaded 2.3 MB package 'nlme' successfully unpacked and MD5 sums checked Warning: cannot remove prior installation of package 'nlme' Warning: restored 'nlme' The downloaded binary packages are in C:\Users\andreoliveira\AppData\Local\Temp\RtmpMH69CO\downloaded_packages Warning message: In file.copy(savedcopy, lib, recursive = TRUE) : problem copying C:\Users\andreoliveira\Documents\R\win-library\3.6\00LOCK\nlme\libs\x64\nlme.dll to C:\Users\andreoliveira\Documents\R\win-library\3.6\nlme\libs\x64\nlme.dll: Permission denied att,.André

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Pacote Bipartite
by Sarah Reis 09 Mai '20

09 Mai '20

Olá pessoal, Estou realizando análises de interações ectoparasita-hospedeiro utilizando o pacote Bipartite. Utilizei a função dfun, porém, com o modelo padrão fornecido pelo pacote, sendo dfun(web,abuns=NULL), onde a abundância não é levada em consideração, só a frequência de interações. Agora, gostaria de refazer as análises levando em consideração a abundância dos ectoparasitas, contudo, quando insiro o vetor abundância, o R diz que "o comprimento do vetor não condiz com o número de espécies do nível trófico mais alto". Utilizo uma matriz de abundância do mesmo modelo da matriz de frequência utilizada para a análise. Já tentei inverter a matriz, mas o erro continua o mesmo. Alguém pode me ajudar? Desde já, muito obrigada! -- Sarah Fontes Reis Mestranda em Biologia Animal - UFV Bacharela em Ciências Biológicas - UFV Museu de Zoologia João Moojen Contato: (31)9-98993346 (wpp)

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Re: [R-br] Atualizar pacotes R em outra versão
by sznelwar＠uol.com.br 07 Mai '20

07 Mai '20

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Boxplot
by Alexandre Loures 07 Mai '20

07 Mai '20

Boa noite, Listeiros! Saberiam como adaptar meu script para criar um Boxplot igual ao da figura anexada? p <- ggplot (df, aes (type, lmean, fill = type)) + geom_boxplot () + scale_fill_viridis (discrete = TRUE, alpha = .6) + geom_jitter (color = 'black', size = 1, alpha = .9) + theme_ipsum () + theme (legend.position = 'none', plot.title = element_text (size = 11)) + ggtitle ('A boxplot with jitter') + xlab (' ') Seguem meus dados abaixo: dput (df) structure(list(Mean = c(14935404544, 15222448128, 38751113216, 14268438528, 14946194432, 15161123840, 9273937920, 9673856000, 14560262144, 17200879616, 3811098880, 7633272320, 290639968, 89202434048, 2005522432, 625789952, 1819531136, 2311044096, 1209199872, 296506752, 915887232, 2633880832, 488109632, 91674344, 694895872, 170653968, 586009152, 67529624, 2587323136, 66061892), type = c("gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean"), lmean = c(23.4270003752245, 23.4460370258537, 24.380425320488, 23.3813158390422, 23.4277225513355, 23.4420003463391, 22.9504739289101, 22.992692825977, 23.4015618839485, 23.5682263599233, 22.0611834044475, 22.7557824657935, 19.4875958357754, 25.2141741636937, 21.4191704283524, 20.2545253328222, 21.3218446872636, 21.560965248974, 20.9132247150145, 19.5075805484868, 20.6354038058895, 21.6917241970269, 20.0060505943238, 18.3337531161829, 20.3592725678438, 18.9551484853174, 20.1888459651668, 18.0280769336398, 21.673889639965, 18.0061026181465)), datalabel = "", time.stamp = " 1 May 2020 12:05", formats = c("%9s", "%9.0g", "%9s"), types = c(5L, 254L, 5L), val.labels = c("", "", ""), var.labels = c("Reporter.ISO", "", ""), row.names = c("1", "2", "3", "4", "5", "6", "7", "8", "9", "10", "11", "12", "13", "14", "15", "16", "17", "18", "19", "20", "21", "22", "23", "24", "25", "26", "27", "28", "29", "30"), version = 12L, class = "data.frame")Boxplot com dados experimentais plotados -- *Alexandre Loures* Professor Substituto Universidade Federal da Paraíba <https://ufpb.br> Pós-graduação em Economia - PPGE <https://sigaa.ufpb.br/sigaa/public/programa/portal.jsf?lc=pt_BR&id=1875> www.rodriguesloures.com

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IC em tabelas de frequência
by Emerson Cotta Bodevan 07 Mai '20

07 Mai '20

Prezados, boa noite. Uma dúvida sobre como reproduzir alguns resultados de um artigo no R. O artigo tem o seguinte DOI: 10.1590/1980-549720190009 (Revista Brasileira de Epidemiologia). Tem-se uma amostra de 28427 indivíduos. Destes 17244 tem o habito de ler a bula de remédios (A) e 11183 (o restante) não tem este hábito (B). A dúvida é como obter a prevalência e o IC95% que eles conseguiram no artigo, a saber: (A) 59.6 (57.7 - 61.5) (B) 40.4 (38.5 - 42.5) Eu obtive os seguintes resultados: (A) 17244/28427 = 60.7 17244/28427-1.96*sqrt(17244/28427*(1-17244/28427)/28427) = 60.1 17244/28427+1.96*sqrt(17244/28427*(1-17244/28427)/28427) = 61.2 *60.7 (60.1 - 61.2)* (B) 11183/28427 = 39.3 11183/28427-1.96*sqrt(11183/28427*(1-11183/28427)/28427) = 38.8 11183/28427+1.96*sqrt(11183/28427*(1-11183/28427)/28427) = 39.9 *39.3 (38.8, 39.9)* Primeiro... o porquê das diferenças. Segundo... sugestão de material para leitura. E terceiro... como fazer isso no R? Há algum pacote pronto? Qualquer ajuda será bem vinda. Obrigado. *Emerson*

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Re: [R-br] Problema com a instalação de pacotes no R!
by Andre Oliveira 27 Abr '20

27 Abr '20

Oi Rodrigo, obrigado pelas ponderações! Faz poucos dias que coloquei a versão do R mais nova na tentativa de resolução do problema e alguns destes pacotes não estão instalados e tem o mesmo problema! att,.André Em segunda-feira, 27 de abril de 2020 09:27:54 BRT, Rodrigo Araujo e Castro <webyard1(a)yahoo.com.br> escreveu: Bom dia André, Inicialmente eu sugiro desinstalar manualmente esses pacotes com o "uninstall.packages()" e te tentar novamente a instalação. Uma atualização de todos os pacotes e do R (e do R Studio se você usa) pode ajudar também, pois algo pode ter sido corrigido nos últimos patches. Se nada disso funcionar, reinstalar o R não costuma dar tanto trabalho e não afeta seu trabalho já feito, já que você não perde nada. Se alguma dessas dicas resolver, avise. Rodrigo Sent from Yahoo Mail on Android On Mon, Apr 27, 2020 at 9:11, Andre Oliveira por (R-br)<r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> wrote: bom dia, mesmo depois de executar o R como administrador tenho alguns problemas para instalar alguns pacotes no R (nlme e lubridate entre outros). Alguma dica para solução deste problema? > install.packages("nlme") Installing package into 'C:/Users/andreoliveira/Documents/R/win-library/3.6' (as 'lib' is unspecified) tentando a URL 'https://cran-r.c3sl.ufpr.br/.../contrib/3.6/nlme_3.1-147.zip' Content type 'application/zip' length 2374568 bytes (2.3 MB) downloaded 2.3 MB package 'nlme' successfully unpacked and MD5 sums checked Warning: cannot remove prior installation of package 'nlme' Warning: restored 'nlme' The downloaded binary packages are in C:\Users\andreoliveira\AppData\Local\Temp\RtmpMH69CO\downloaded_packages Warning message: In file.copy(savedcopy, lib, recursive = TRUE) : problem copying C:\Users\andreoliveira\Documents\R\win-library\3.6\00LOCK\nlme\libs\x64\nlme.dll to C:\Users\andreoliveira\Documents\R\win-library\3.6\nlme\libs\x64\nlme.dll: Permission denied att,.André _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.

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Subset a data.frame com base no valor absoluto de uma coluna
by Marcelo Laia 26 Abr '20

26 Abr '20

Prezado(a), Tenho o seguinte problema: data <- replicate(5, rnorm(10)) colnames(data) <- paste("Sample", c(1:ncol(data))) rownames(data) <- paste("Gene", c(1:nrow(data))) head(data) Sample 1 Sample 2 Sample 3 Sample 4 Sample 5 Gene 1 -1.29177540 2.61720282 -0.64705357 -2.05636255 0.5752323 Gene 2 -1.20619719 1.13791932 1.12844157 -0.04053514 1.2973240 Gene 3 -0.15952476 -0.56391140 -1.34226004 -1.21020574 -1.1353717 Gene 4 1.58893451 -1.33082381 0.02267418 1.42659928 2.2377680 Gene 5 -0.56417983 -0.14454059 -0.14543579 0.43021823 -1.1564112 Gene 6 -0.01443123 0.08013149 0.44877039 -0.38360173 1.7286058 Gene 7 -0.40133700 -0.84755154 -1.05251409 1.87298617 0.7788947 Gene 8 -1.81773166 -1.50967753 0.30168885 1.06245963 0.2409281 Gene 9 -2.27682903 0.83455263 -0.93035283 -0.49503281 -0.7293654 Gene 10 -0.19309118 -0.84698014 -0.12649364 -1.32398348 1.3218277 Eu desejo fazer um subset em um novo data.frame com os dados das colunas 1 e 2 (Sample 1 e Sample 2) baseados no valor absoluto da coluna 4 (Sample 4). Eu tentei o seguinte: mydata <- subset(data, (data[ ,4]>abs(1.3))) mydata Sample 1 Sample 2 Sample 3 Sample 4 Sample 5 Gene 4 1.588935 -1.3308238 0.02267418 1.426599 2.2377680 Gene 7 -0.401337 -0.8475515 -1.05251409 1.872986 0.7788947 No entanto, neste primeiro passo ele só pega os positivos da coluna 4 que são maiores que 1,3. Os valores negativos maiores que módulo de -1,3 são todos excluídos. No segundo passo eu excluiria as colunas 3, 4 e 5. myvars <- colnames(mydata) %in% c("Sample 3", "Sample 4", "Sample 5") mydata2 <- mydata[!myvars] Como não consegui obter o primeiro passo, o segundo também não rodou. Obrigado -- Marcelo

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Manter o R atualizado no linux mint 9.3
by Emerson Cotta Bodevan 24 Abr '20

24 Abr '20

Pessoal não estou obtendo sucesso para manter o R atualizado no linux mint 9.3. O que estou fazendo: Adicionei o repositório deb https://cran-r.c3sl.ufpr.br/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ pelo synaptic Quando pedi para recarregar aconteceu o seguinte erro ##### Não foi possível baixar todos os índices de repositórios O repositório pode não estar mais disponível ou pode não ter sido possível entrar em contato com o mesmo devido a problemas de rede. Caso esteja disponível, uma versão mais antiga do índice que falhou será usada. Senão o repositório será ignorado. Verifique sua conexão de rede e certifique-se de que o endereço do repositório esteja correto nas preferências. The repository 'https://cran-r.c3sl.ufpr.br/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Release' does not have a Release file. ###### Depois disso minha intenção é instalar o pacote Rcmdr, pois com a versão atual do R 3.4.4 está ocorrendo o seguinte erro: #### > install.packages("Rcmdr") Installing package into ‘/home/ecbodevan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4’ (as ‘lib’ is unspecified) Warning message: package ‘Rcmdr’ is not available (for R version 3.4.4) #### Alguém poderia me ajudar? *Emerson*

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