[R-br] sobre a utilização de processamento em vários núcleos

[Elias T. Krainski]

com um CMR seria mais facil postar uma dica :)
 
Elias T. Krainski


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> De: Antonio Silva <aolinto.lst em gmail.com>
>Para: R-br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br> 
>Enviadas: Quarta-feira, 7 de Março de 2012 9:20
>Assunto: [R-br] sobre a utilização de processamento em vários núcleos
> 
>
>Olá,
>
>Rodo o R 64-bit no Ubuntu 10.04 em uma máquina com processador Core i7 e 8 Gb de RAM.
>
>Nesta semana começei a fazer uma análise de cluster, utilizando basicamente o pacote vegan, sobre uma matriz grande.
>
>O cálculo das ligações (hclust) levou três hora e meia para ser efetuado (!!!). Vi que apenas um núcleo do processador estava sendo utilizado.
>
>Começei então a procurar alternativas que permitissem o aceleramento dos cálculos e a utilização dos outros núcleos, que estão sub-utilizados.
>
>Li sobre o pacote multicore e outros, inclusive em mensagens nesta lista. Muitas coisas não ficaram claras para mim e, no final, não compreendi como proceder sua utilização no meu caso (ou mesmo se é possível).
>
>É possivel rodar uma análise de cluster fazendo utilização dos diversos núcleos?
>
>Agradeço qualquer orientação e/ou indicação de documentação.
>
>Abraços,
>
>Antônio
>
>-- 
>Antônio Olinto Ávila da Silva
>Biólogo / Oceanógrafo
>Instituto de Pesca
>
>São Paulo, Brasil
>
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>R-br mailing list
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