<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:12pt"><div><span>com um CMR seria mais facil postar uma dica :)</span></div><div> </div><div>Elias T. Krainski<br><blockquote style="border-left: 2px solid rgb(16, 16, 255); margin-left: 5px; margin-top: 5px; padding-left: 5px;">  <div style="font-size: 12pt; font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; "> <div style="font-size: 12pt; font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; "> <div dir="ltr"> <font size="2" face="Arial"> <hr size="1">  <b><span style="font-weight:bold;">De:</span></b> Antonio Silva <aolinto.lst@gmail.com><br> <b><span style="font-weight: bold;">Para:</span></b> R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> <br> <b><span style="font-weight: bold;">Enviadas:</span></b> Quarta-feira, 7 de Março de 2012 9:20<br> <b><span style="font-weight: bold;">Assunto:</span></b> [R-br] sobre a
 utilização de processamento em vários núcleos<br> </font> </div> <br><meta http-equiv="x-dns-prefetch-control" content="off"><div id="yiv1316467650">Olá,<br><br>Rodo o R 64-bit no Ubuntu 10.04 em uma máquina com processador Core i7 e 8 Gb de RAM.<br><br>Nesta semana começei a fazer uma análise de cluster, utilizando basicamente o pacote vegan, sobre uma matriz grande.<br>
<br>O cálculo das ligações (hclust) levou três hora e meia para ser efetuado (!!!). Vi que apenas um núcleo do processador estava sendo utilizado.<br><br>Começei então a procurar alternativas que permitissem o aceleramento dos cálculos e a utilização dos outros núcleos, que estão sub-utilizados.<br>
<br>Li sobre o pacote multicore e outros, inclusive em mensagens nesta lista. Muitas coisas não ficaram claras para mim e, no final, não compreendi como proceder sua utilização no meu caso (ou mesmo se é possível).<br><br>
É possivel rodar uma análise de cluster fazendo utilização dos diversos núcleos?<br><br>Agradeço qualquer orientação e/ou indicação de documentação.<br><br>Abraços,<br><br>Antônio<br clear="all"><br>-- <br>Antônio Olinto Ávila da Silva<div>
Biólogo / Oceanógrafo</div><div>Instituto de Pesca<br></div><div>São Paulo, Brasil</div><br>
</div><meta http-equiv="x-dns-prefetch-control" content="on"><br>_______________________________________________<br>R-br mailing list<br><a ymailto="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br><a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br><br> </div> </div> </blockquote></div>   </div></body></html>