Kruskal-wallis - comparação entre tratamentos
Bom dia a todos. Essa é primeira vez que utilizo uma análise não paramétrica, logo estou meio perdido. Eu rodei um teste de kruskal-wallis utilizando o conjunto de dados em anexo, e observei que na estação úmida existem variações significativas. Entretanto, eu gostaria de saber como devo proceder para comparar meus três tratamentos (D, SD, EG) dois a dois, ou simultaneamente. comandos utilizados: kruskal.test(wet~FG, data=teste) kruskal.test(dry~FG, data=teste) Muito obrigado. Marcelo Claro de Souza Biologist, PhD student in Plant Biology Institute of Bioscience - UNESP, Brazil
Você pode usar o testes de Tukey após o teste de Kruskal-Wallis para ver qual o tratamento que apresentam diferenças . O Teste de Kruaskal-Wallis você tem a hipótese alternativa afirmando que ao menos um tratamento é diferente. Se saber que ao menos um é diferente é suficiente não necessita a aplicação do teste de Tukey. Pedro Rafael Em 20 de setembro de 2011 07:56, Marcelo Claro de Souza [via R-br] < ml-node+s2285057n3826415h42@n4.nabble.com> escreveu:
Bom dia a todos. Essa é primeira vez que utilizo uma análise não paramétrica, logo estou meio perdido. Eu rodei um teste de kruskal-wallis utilizando o conjunto de dados em anexo, e observei que na estação úmida existem variações significativas. Entretanto, eu gostaria de saber como devo proceder para comparar meus três tratamentos (D, SD, EG) dois a dois, ou simultaneamente. comandos utilizados: kruskal.test(wet~FG, data=teste) kruskal.test(dry~FG, data=teste) Muito obrigado.
Marcelo Claro de Souza Biologist, PhD student in Plant Biology Institute of Bioscience - UNESP, Brazil
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Olá, Mas nesse caso eu rodo o teste de Tukey juntamente ao Kruskal por TukeyHDS(kruskal.test(wet~FG,data=dados)) ??? Muito obrigado Marcelo Claro de Souza Biologist, PhD student in Plant Biology Institute of Bioscience - UNESP, Brazil ________________________________ De: Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com> Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Enviadas: Terça-feira, 20 de Setembro de 2011 14:19 Assunto: Re: [R-br] Kruskal-wallis - comparação entre tratamentos Você pode usar o testes de Tukey após o teste de Kruskal-Wallis para ver qual o tratamento que apresentam diferenças . O Teste de Kruaskal-Wallis você tem a hipótese alternativa afirmando que ao menos um tratamento é diferente. Se saber que ao menos um é diferente é suficiente não necessita a aplicação do teste de Tukey. Pedro Rafael Em 20 de setembro de 2011 07:56, Marcelo Claro de Souza [via R-br] <ml-node+s2285057n3826415h42@n4.nabble.com> escreveu: Bom dia a todos.
Essa é primeira vez que utilizo uma análise não paramétrica, logo estou meio perdido. Eu rodei um teste de kruskal-wallis utilizando o conjunto de dados em anexo, e observei que na estação úmida existem variações significativas. Entretanto, eu gostaria de saber como devo proceder para comparar meus três tratamentos (D, SD, EG) dois a dois, ou simultaneamente. comandos utilizados: kruskal.test(wet~FG, data=teste) kruskal.test(dry~FG, data=teste) Muito obrigado.
Marcelo Claro de Souza
Biologist, PhD student in Plant Biology Institute of Bioscience - UNESP, Brazil
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Marcelo, Parece ser uma incoerência a de se usar um teste paramétrico após um não paramétrico, considerando que a adoção do teste não paramétrico é devido ao fato de não serem atendidas as pressuposições para um teste paramétrico. Se é para usar o teste de Tukey, use também a análise de variância, visto que ambos se baseiam no mesmo conjunto de pressupostos. Ou use apenas testes não paramétricos. À disposição. Walmes. ========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 VoIP: (3361 3600) 1053 1173 e-mail: walmes@ufpr.br twitter: @walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ==========================================================================
Use a função kruskal() do pacote agricolae. Na função é feito o teste de Kruskall-Wallis e automaticamente a função faz um "pós teste" que é um teste t baseado na soma de ranks dos tratamentos, que é apropriado. install.packages("agricolae") require(agricolae) ?kruskal kruskal(Variávelresposta, Tratamentos) ________________________________ De: Marcelo Claro de Souza <marcelo_claro@yahoo.com.br> Para: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Enviadas: Terça-feira, 20 de Setembro de 2011 9:27 Assunto: Re: [R-br] Kruskal-wallis - comparação entre tratamentos Olá, Mas nesse caso eu rodo o teste de Tukey juntamente ao Kruskal por TukeyHDS(kruskal.test(wet~FG,data=dados)) ??? Muito obrigado Marcelo Claro de Souza Biologist, PhD student in Plant Biology Institute of Bioscience - UNESP, Brazil ________________________________ De: Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com> Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Enviadas: Terça-feira, 20 de Setembro de 2011 14:19 Assunto: Re: [R-br] Kruskal-wallis - comparação entre tratamentos Você pode usar o testes de Tukey após o teste de Kruskal-Wallis para ver qual o tratamento que apresentam diferenças . O Teste de Kruaskal-Wallis você tem a hipótese alternativa afirmando que ao menos um tratamento é diferente. Se saber que ao menos um é diferente é suficiente não necessita a aplicação do teste de Tukey. Pedro Rafael Em 20 de setembro de 2011 07:56, Marcelo Claro de Souza [via R-br] <ml-node+s2285057n3826415h42@n4.nabble.com> escreveu: Bom dia a todos.
Essa é primeira vez que utilizo uma análise não paramétrica, logo estou meio perdido. Eu rodei um teste de kruskal-wallis utilizando o conjunto de dados em anexo, e observei que na estação úmida existem variações significativas. Entretanto, eu gostaria de saber como devo proceder para comparar meus três tratamentos (D, SD, EG) dois a dois, ou simultaneamente. comandos utilizados: kruskal.test(wet~FG, data=teste) kruskal.test(dry~FG, data=teste) Muito obrigado.
Marcelo Claro de Souza
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O pacote 'pgirmess' tem a função kruskalmc, que também realiza comparações multiplas não paramétricas. Deve ser o mesmo sugerido pelo Emmanuel. Abraços, Lucas Petri Damiani 2011/9/20 Emmanuel Arnhold <emmanuelarnhold@yahoo.com.br>
Use a função kruskal() do pacote agricolae. Na função é feito o teste de Kruskall-Wallis e automaticamente a função faz um "pós teste" que é um teste t baseado na soma de ranks dos tratamentos, que é apropriado.
install.packages("agricolae") require(agricolae) ?kruskal
kruskal(Variávelresposta, Tratamentos)
------------------------------ *De:* Marcelo Claro de Souza <marcelo_claro@yahoo.com.br> *Para:* "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> *Enviadas:* Terça-feira, 20 de Setembro de 2011 9:27
*Assunto:* Re: [R-br] Kruskal-wallis - comparação entre tratamentos
Olá, Mas nesse caso eu rodo o teste de Tukey juntamente ao Kruskal por TukeyHDS(kruskal.test(wet~FG,data=dados)) ??? Muito obrigado
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------------------------------ *De:* Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com> *Para:* r-br@listas.c3sl.ufpr.br *Enviadas:* Terça-feira, 20 de Setembro de 2011 14:19 *Assunto:* Re: [R-br] Kruskal-wallis - comparação entre tratamentos
Você pode usar o testes de Tukey após o teste de Kruskal-Wallis para ver qual o tratamento que apresentam diferenças . O Teste de Kruaskal-Wallis você tem a hipótese alternativa afirmando que ao menos um tratamento é diferente. Se saber que ao menos um é diferente é suficiente não necessita a aplicação do teste de Tukey.
Pedro Rafael
Em 20 de setembro de 2011 07:56, Marcelo Claro de Souza [via R-br] < ml-node+s2285057n3826415h42@n4.nabble.com> escreveu:
Bom dia a todos. Essa é primeira vez que utilizo uma análise não paramétrica, logo estou meio perdido. Eu rodei um teste de kruskal-wallis utilizando o conjunto de dados em anexo, e observei que na estação úmida existem variações significativas. Entretanto, eu gostaria de saber como devo proceder para comparar meus três tratamentos (D, SD, EG) dois a dois, ou simultaneamente. comandos utilizados: kruskal.test(wet~FG, data=teste) kruskal.test(dry~FG, data=teste) Muito obrigado.
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Em 20/9/2011 07:55, Marcelo Claro de Souza escreveu:
Bom dia a todos. Essa é primeira vez que utilizo uma análise não paramétrica, logo estou meio perdido. Eu rodei um teste de kruskal-wallis utilizando o conjunto de dados em anexo, e observei que na estação úmida existem variações significativas. Entretanto, eu gostaria de saber como devo proceder para comparar meus três tratamentos (D, SD, EG) dois a dois, ou simultaneamente. comandos utilizados: kruskal.test(wet~FG, data=teste) kruskal.test(dry~FG, data=teste)
Marcelo, Acho que este post de 2005 é que procuras: http://tolstoy.newcastle.edu.au/R/help/05/06/5829.html HTH -- Cesar Rabak GNU/Linux User 52247. Get counted: http://counter.li.org/
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