O pacote 'pgirmess' tem a função kruskalmc, que também realiza comparações multiplas não paramétricas. Deve ser o mesmo sugerido pelo Emmanuel.

Abraços,
Lucas Petri Damiani 

2011/9/20 Emmanuel Arnhold <emmanuelarnhold@yahoo.com.br>
Use a função kruskal() do pacote agricolae. Na função é feito o teste de Kruskall-Wallis e automaticamente a função faz um "pós teste" que é um teste t baseado na soma de ranks dos tratamentos, que é apropriado. 


install.packages("agricolae")
require(agricolae)
?kruskal

kruskal(Variávelresposta, Tratamentos)


De: Marcelo Claro de Souza <marcelo_claro@yahoo.com.br>
Para: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
Enviadas: Terça-feira, 20 de Setembro de 2011 9:27

Assunto: Re: [R-br] Kruskal-wallis - comparação entre tratamentos

Olá,
Mas nesse caso eu rodo o teste de Tukey juntamente ao Kruskal por TukeyHDS(kruskal.test(wet~FG,data=dados)) ???
Muito obrigado
 
Marcelo Claro de Souza
Biologist, PhD student in Plant Biology
Institute of Bioscience - UNESP, Brazil



De: Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com>
Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Enviadas: Terça-feira, 20 de Setembro de 2011 14:19
Assunto: Re: [R-br] Kruskal-wallis - comparação entre tratamentos

Você pode usar o testes de Tukey após o teste de Kruskal-Wallis para ver qual o tratamento que apresentam diferenças . O Teste de Kruaskal-Wallis você tem a hipótese alternativa afirmando que ao menos um tratamento é diferente. Se saber que ao menos um é diferente é suficiente não necessita a aplicação do teste de Tukey.


Pedro Rafael

Em 20 de setembro de 2011 07:56, Marcelo Claro de Souza [via R-br] <ml-node+s2285057n3826415h42@n4.nabble.com> escreveu:
Bom dia a todos.
Essa é primeira vez que utilizo uma análise não paramétrica, logo estou meio perdido.
Eu rodei um teste de kruskal-wallis utilizando o conjunto de dados em anexo, e observei que na estação úmida existem variações significativas. Entretanto, eu gostaria de saber como devo proceder para comparar meus três tratamentos (D, SD, EG) dois a dois, ou simultaneamente.
comandos utilizados:
kruskal.test(wet~FG, data=teste)
kruskal.test(dry~FG, data=teste)
Muito obrigado.
 
Marcelo Claro de Souza
Biologist, PhD student in Plant Biology
Institute of Bioscience - UNESP, Brazil


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Saudações,
Pedro Rafael Diniz Marinho.
Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB.



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