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Sugestão sobre etiqueta na lista
by Cesar Rabak 28 Nov '15

28 Nov '15

Prez@dos, Fiz uma rápida consulta ao "Guia de postagem" desta lista, e como ele está em construção, gostaria de aproveitar o ensejo de uma postagem recente nesta lista, que ficará evidente em seguida, evito citá-la diretamente. Essa postagem, que insisto apenas me chamou a atenção de um número similar em teor dela, tem como estrutura geral o seguinte: OP: > Estou usando o programa/SO/pacote X e estou tendo as dificuldades/problemas/ dúvidas Y. Resposta que coloco para análise dos colegas: > O "programa/SO/pacote X" 'não funciona'/'é ruim'/'deve ser evitado' use o "programa/SO/pacote Z" que alem de resolver "Y" vai <várias expressões de julgamento de valor [que não ajudam em nada o OP]>. Minha proposta é que o tipo de resposta acima seja desaconselhado, especialmente se for baseado apenas em opinião "vazia", preconceito, ou preferência que só pode ser definida como "pessoal" e não objetiva. Por exemplo, se um certo pacote for "deprecado" tando pela equipa do CRAN como eventualmente tenha sido descontinuado pelo desenvolvedor, uma orientação sobre o novo pacote ou solução de contorno me parece OK, mas dizer que "A" é melhor que "B" quando ambos os pacotes estão à disposição me parece arbitrário, a menos que o proponente ofereça uma comparação objetiva sobre sob quais aspectos "A" seria superior a "B". Assim, críticas a determinada distribuição do Linux, uso do Windows em vez de outro SO, e até mesmo a pejorativa denominação do sistema operacional comercial da Microsoft de "ruindows" e equivalentes deveria ser desencorajada na mesma alínea dessa orientação no Guia. Deixo a sugestão para a lista para termos uma democrática e produtiva discussão e inclusive para poder melhorar minha ideia e posterior inclusão no Guia. []s -- Cesar Rabak

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Simulação - Geo Estatística
by Andre Oliveira 28 Nov '15

28 Nov '15

Boa noite,como simular dados com (altitude e longitude + Y) para formar um banco de dados? Algo como o CMR abaixo, só que para Geo Estatística! da <- expand.grid(Tratamentos=gl(4,1),Repetição=gl(4,1)) da$Resposta<- rnorm(nrow(da),40,3) da obrigado André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES

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[LEMBRETE] Meetup R São Paulo Users Group (IME-USP) - 27 de novembro do 2015
by Luis Benites Sánchez 26 Nov '15

26 Nov '15

Caros, Amanha 27 de novembro teremos nossa reunião numero 7 do Meetup de usuários de R de São Paulo, no auditório Jacy Monteiro no Bloco B. Segue a programação: Programação da sexta 27 de novembro (14:00h-16:00h) - [14:00 - 14:55] Uma introdução aos modelos mistos em R - Ana Paula Zerbeto (IME-USP) - [Presencial] - [14:55 - 15:05] Coffee Break - [15:05 - 16:00] Web scraping usando o R - Julio Trecenti (IME-USP) - [Presencial] As palestras serão transmitidas ao vivo pela conexão IPTV da USP e YouTube ( https://plus.google.com/u/0/events/cpjg070m652k6su1gkeuivrr6bc) Para poder participar, pode confirmar sua participação gratuitamente no site do Meetup :) Para mais informações: Site: www.meetup.com/pt/useR-SP Canal de YouTube: www.youtube.com/channel/UCb9PdJYYaElE6Uqb1KxhE8w e-mail: meetuprsp(a)gmail.com Um abraço, Luis Benites Sánchez Rocío Paola Maehara Organizadores do São Paulo R Users Group --

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Aplicar função em parte de um vetor
by joão Rodrigo Castro 25 Nov '15

25 Nov '15

Prezados, Estou com uma dificuldade de atribuir uma função à parte de um vetor. Suponhamos o seguinte data.frame: ano <-c(2008,2009,2010,2011,2008,2009,2010,2011,2008,2009,2010,2011,2008,2009,2010,2011) cultivar <-c("c1","c1","c1","c1","c2","c2","c2","c2","c3","c3","c3","c3","c4","c4","c4","c4") produtividade <- c(3000,4023,5432,3212,4567,6543,5467,2345,3245,99,5467,7654,3214,1234,5456,-99) exemplo <- data.frame(ano,cultivar, produtividade) Gostaria de calcular separadamente as médias das produtividades de cada uma das cultivares, para o intervalo de anos agrícolas (2008-2011). Desde já agradeço a colaboração, -- João Rodrigo de Castro Programa de Pós-Graduação em Meteorologia - Universidade Federal de Pelotas Bolsista Laboratório de Agrometeorologia - Embrapa Clima Temperado

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Re: [R-br] Resíduos e MCMCglmm
by Filipe Cristovão 23 Nov '15

23 Nov '15

Olá, Muito obrigado pelas mensagens. Vou dar continuidade a discussão com alguns esclarecimentos e um pouco de código: 1- Elias pergunta como calculo os resíduos nesse modelo: >residuals_model<-(data$response_variable-predict(model)) 2- Wagner, sua pergunta é, de alguma maneira, minha grande dúvida: "Se vc já sabe que sua variável resposta é gamma pq não ajusta um modelo gamma? Ou mesmo qq outro modelo para resposta contínua como a Gaussian Inverse?”. Contudo, qual tipo de análise que não MCMCglmm me permitiria controlar meus dados quanto à filogenia? 3. E finalmente sobre os motivos de se usar MCMCglmm: recaem novamente na não independência dos dados e na possibilidade de se controlar filogeneticamente. Mas, a mesma pergunta que foi feita, é parte da minha questão: "Por que assumindo distribuição de probabilidade aos parâmetros, a interpretação dos resultados é baseada no fato de que também se obtem distribuições de probabilidade à posteriori para interpretar?” Em outras palavras, por que os resíduos devem seguir uma distribuição normal mesmo se os dados não são normais? Ou essa última frase está equivocada? O modelo segue: #Phylo é minha árvore filogenética. >MCMC1<-MCMCglmm(Response_var~var1*var2*+var3, + random = ~Phylo, family=“?”, + ginverse=list(Phylo=inv.phylo$Ainv), prior = prior, + nitt = 10000, + burnin = 1000, thin = 500, data = mob, + verbose = F ) # Os resíduos estão acima. E para checar a normalidade dos resíduos usei: > qqnorm(residuals_model) > shapiro.test(residuals_model) Enfim, após as mensagens que me fizeram estudar novos artigos =) refaço as perguntas: A) Meus resíduos precisam ser normais quando uso um modelo MCMCglmm? B) Que outro pacote me permite controlar a filogenia em um modelo? Abraços, Filipe Cristovão R. da Cunha Anthropological Institute & Museum University of Zurich - Campus Irchel Winterthurerstrasse 190, CH-8057 Zürich Switzerland www.aim.uzh.ch/Research/birdfamilies/filipe.html <http://www.aim.uzh.ch/Research/birdfamilies/filipe.html> <http://www.flickr.com/photos/filipe_cristovao>www.flickr.com/photos/filipe_cristovao <http://www.flickr.com/photos/filipe_cristovao>

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Resíduos e MCMCglmm
by Filipe Cristovão 23 Nov '15

23 Nov '15

Olá, Bom dia. Talvez o assunto aqui abordado não seja tanto sobre o uso geral do software, mas uma questão teórica sobre estatística. Espero estar adequado às “guidelines” do grupo. Recentemente tenho optado por analisar meus dados usando MCMCglmm, isso se deu por várias questões, mas principalmente pela liberdade que o pacote me dá de criar meus “priors" e de poder controlar meus dados filogenéticamente. Contudo, sempre ouvi e li que “os resíduos de um modelo seguindo MCMCglmm devem ter distribuição normal”. Ai sequem algumas questões sobre isso: I) Isso é mesmo verdade absoluta? Pergunto isso porque tenho uma variável que não consigo normalizar. Essa variável apresenta uma distribuição gamma com uma obliqüidade positiva (ou "positive skewed”). Já tentei de tudo inclusive o “milagroso” boxcox. É uma variável que não se normaliza - se é que posso dizer isso =). II) Mesmo com meus resíduos não obedecendo uma distribuição normal, levei em consideração alguns dados importantes do “output” do meu modelo: i) não existe colinearidade entre as variáveis, ii) a influência da filogenia da minha amostra (ou melhor da diversidade filogenetica da minha amostra) é “irrelevante” - pois apresenta um intervalo de confiança exageradamente pequeno, iii) e os resultados são os mesmos (diferentes valores mesma direção) que quando conduzo um glm por exemplo. As questões são: a) poderia ignorar o controle filogenético? b) Ou existe outra maneira de normalizar meus dados? e por fim c) Em algum outro pacote posso controlar meu modelo quanto à filogenia e ainda assim executar meu modelo usando estatística "bayseana"? Obrigado pela paciência ao ler o email =) Atenciosamente, Filipe Cristovão R. da Cunha Anthropological Institute & Museum University of Zurich - Campus Irchel Winterthurerstrasse 190, CH-8057 Zürich Switzerland www.aim.uzh.ch/Research/birdfamilies/filipe.html <http://www.aim.uzh.ch/Research/birdfamilies/filipe.html> <http://www.flickr.com/photos/filipe_cristovao>www.flickr.com/photos/filipe_cristovao <http://www.flickr.com/photos/filipe_cristovao>

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Re: [R-br] Digest R-br, volume 59, assunto 21
by Wilson Cohen 22 Nov '15

22 Nov '15

Uso R e RStudio atualizados em 3 máquinas: note com Ubuntu Trusty, note com Linux Mint 17 e PC com LInux Mint 17......tudo rodando redondinho!!.....com certeza problemas no Rwindows!! Seja Livre, Use Linux!! Em 22 de novembro de 2015 11:00, <r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: > Enviar submissões para a lista de discussão R-br para > r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou > corpo da mensagem para > r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo > endereço > r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será > mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." > > > Tópicos de Hoje: > > 1. Problema na ultima versão do RStudio (Leonardo Monteiro) > 2. Re: Problema na ultima versão do RStudio (Jobenil - Gmail) > > > ---------------------------------------------------------------------- > > Message: 1 > Date: Sat, 21 Nov 2015 15:28:43 +0000 > From: Leonardo Monteiro <monteiroleonardo6(a)gmail.com> > To: Lista R <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: [R-br] Problema na ultima versão do RStudio > Message-ID: > < > CAH4vHCHQjekqJVcS07WU+wa4rnBJBRHbARsFyhJXXP2Ub7-AqA(a)mail.gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Prezados, Venho rodando o R em Windows 10.. > > Fiz o update do RStudio dia 13/novembro e nao estou conseguindo a mesma > performance, ou melhor, nem estou conseguindo abrir, e quando o programa > abre, fica tudo travado e nao consigo rodar os meus codigos. > > Para desligar, eu estou conseguindo apenas pelo Gerenciador de tarefas > (ctrl+alt+del). > > Alguem sugere alguma coisa para resolver este problema? (que nao seja > trocar o OS kkk) > > obrigado. > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20151121/5b72af39/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 2 > Date: Sat, 21 Nov 2015 13:41:05 -0200 > From: Jobenil - Gmail <pjobenil(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] Problema na ultima versão do RStudio > Message-ID: <FDEE088F-7613-45F5-80E8-3E4F429CB5A9(a)gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset=utf-8 > > Em três máquinas diferentes, todas com win 10, instalei e uso sem > problemas o RStudio e R. > Acho que você deve verificar a instalação do Windows. Quando ocorre o > travamento ele envia uma mensagem de log para Microsoft. Tente verificar > qual é o tipo de erro e consultar no próprio suporte da Microsoft como > reparar o erro. > At. > Jobenil > > Enviado do meu iPhone > > > Em 21 de nov de 2015, às 13:28, Leonardo Monteiro < > monteiroleonardo6(a)gmail.com> escreveu: > > > > Prezados, Venho rodando o R em Windows 10.. > > > > Fiz o update do RStudio dia 13/novembro e nao estou conseguindo a mesma > performance, ou melhor, nem estou conseguindo abrir, e quando o programa > abre, fica tudo travado e nao consigo rodar os meus codigos. > > > > Para desligar, eu estou conseguindo apenas pelo Gerenciador de tarefas > (ctrl+alt+del). > > > > Alguem sugere alguma coisa para resolver este problema? (que nao seja > trocar o OS kkk) > > > > obrigado. > > > > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > > > ------------------------------ > > Subject: Legenda do Digest > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > > ------------------------------ > > Fim da Digest R-br, volume 59, assunto 21 > ***************************************** > -- *Prof. MSc. Wilson Martins da Silva* *Mestre em Ecologia Aquática e Pesca - PPGEAP/ICB/UFPA* *Especialista em Biodiversidade Amazônica - UFPA/ATMDepto de Morfologia e Ciências Fisiológicas* *Centro de Ciências Biológicas e da Saúde* *Universidade do Estado do Pará* *Campus IX - Altamira - Pará* http://lattes.cnpq.br/2440617911389759 wilsoncelula(a)gmail.com, wilsonms(a)ufpa.br

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Problema na ultima versão do RStudio
by Leonardo Monteiro 21 Nov '15

21 Nov '15

Prezados, Venho rodando o R em Windows 10.. Fiz o update do RStudio dia 13/novembro e nao estou conseguindo a mesma performance, ou melhor, nem estou conseguindo abrir, e quando o programa abre, fica tudo travado e nao consigo rodar os meus codigos. Para desligar, eu estou conseguindo apenas pelo Gerenciador de tarefas (ctrl+alt+del). Alguem sugere alguma coisa para resolver este problema? (que nao seja trocar o OS kkk) obrigado.

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Re: [R-br] : Extensão .DBC
by sznelwar 19 Nov '15

19 Nov '15

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📊 Curso Básico de R + RStudio 📈
by Leonardo Aguirre 18 Nov '15

18 Nov '15

> De: Leonardo Aguirre <leoaguirre32(a)gmail.com> > Data: 18 de novembro de 2015 10:35:48 BRST > Assunto: 📊 Curso Básico de R + RStudio 📈 > > Pessoal, > > Segue divulgação de um curso de R em Brasília, caso alguém tenha interesse. > As inscrições podem ser feitas em http://oddsactions.com.br/cursos/inscricao/ > > Abraços, > > Enviado do meu iPhone > > Início da mensagem encaminhada > >> De: Odds&Actions - Inteligência Analítica <contato(a)oddsactions.com.br> >> Data: 18 de novembro de 2015 09:59:55 BRST >> Para: <leoaguirre32(a)gmail.com> >> Assunto: 📊 Curso Básico de R + RStudio 📈 >> Responder A: Odds&Actions - Inteligência Analítica <contato(a)oddsactions.com.br> >> >> >> Inscrições abertas para o Curso de R e RStudio Veja esse e-mail em seu navegador. >> >> Curso Básico de R + RStudio >> Aprenda a programar na língua universal de análise de dados. >> >> Quem deveria aprender R? >> >> Se você trabalha com análises de dados, sejam eles de planilhas de Excel, dados de pesquisas, bancos de dados da sua empresa ou qualquer outra fonte de informação, o R é para você. E a melhor parte: você não precisa saber programar para aprender R. >> >> O que o R é capaz de fazer? >> >> Manusear bases de dados, gerar relatórios estatísticos com tabelas, gráficos e mapas profissionais, criar aplicações estilo dashboards, criar modelos preditivos, fazer análises de redes sociais, trabalhar com Big Data e muito mais. >> >> Como funciona o curso? >> >> Nossa próxima turma será dos dias 7 a 11 de dezembro, no período da manhã (9:00-12:00), na SCLRN 710 Bloco A. Nesses dias, ensinaremos você: a estrutura básica da linguagem R; como importar, manipular e exportar dados; como gerar estatísticas básicas; como gerar seus primeiros gráficos; e como escrever suas próprias funções. Faremos vários exercícios ao longo do curso e espero que você se divirta com nossos desafios! >> >> Investimento: R$ 700 (setecentos reais) por pessoa. >> (à vista ou em 2x de R$ 350) >> Não é necessário levar notebook. >> >> Que tal aprender a programar em R? Inscreva-se agora! >> Essa é uma turma especial e estamos abrindo apenas 5 vagas! >> Inscreva-se agora >> Odds&Actions © 2015 Odds&Actions - Inteligência Analítica, Todos os direitos reservados. >> Você se inscreveu em nosso mailing pelo site http://oddsactions.com.br/cursos >> >> Nosso endereço: >> Odds&Actions - Inteligência Analítica >> SCN Quadra 2 Bloco D Entrada B Sala 823 Parte A >> Brasília, DF 70712-903 >> Brazil >> >> Add us to your address book >> me remova dessa lista editar preferências de recebimento >> >>

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