Março 2012 - R-br

Analise Descritiva Datas periodicas
by Eder David Borges da Silva 04 Mar '12

04 Mar '12

Bom dia pessoal, Tenho um conjunto de dados, de fenologia, (fases da planta: florescimento, frutificação, etc), e periodicamente é dado um nota de 0 a 5 para percentual da fase, por exemplo entre 40 a 60 % de florescimento recebe nota 3, e assim por diante dependendo do percentual temos uma nota. Oque me interessa saber é ter primeiramente um descritivo, por exemplo de valor médio da fase, e IC para a fase, do tipo, com 95% de confiança o florescimento com nota 1 vai de 3 de janeiro a 10 de fevereiro. Ai surge minha duvidas como fazer estes cálculos com data no R, pois não é simplesmente pedir um summary por exemplo pois oque me interessa e o período. Um exemplo do conjunto de dados é simulados abaixo: ny <- 5 #numero de anos n <- 365*ny #dias inicio <- as.Date(c('01/01/2000'),'%d/%m/%Y') periodo <- seq(inicio,inicio+(n-1),by=1) y <- as.vector(sapply(1:ny,function(x)sort(ceiling(runif(n/ny,0,4))))) y1 <- as.vector(sapply(1:ny,function(x)sort(ceiling(runif(n/ny,0,4))))) dados <- data.frame(rep=rep(1:2,each=n),periodo,resp=c(y,y1)) head(dados) lattice::xyplot(resp~periodo,groups=rep,dados) Gostaria de um descritivo por nota, alguma sugestão a mais será muito bem vinda. Obrigado.

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Problema ao instalar/carregar pacote mgarchBEKK
by Rodrigo Coster 04 Mar '12

04 Mar '12

Tentei carregar o pacote mgarchBEKK (baixei o .zip dele aqui: http://www.quantmod.com/download/mgarchBEKK/) mas aparece a seguinte mensagem de erro: > require(mgarchBEKK) Carregando pacotes exigidos: mgarchBEKK Failed with error: ‘package ‘mgarchBEKK’ does not have a NAMESPACE and should be re-installed’ Alguém sabe o que fazer (Obviamente já tentei reinstalar e o erro persistiu...)? Estou com o R 2.14.1, pelo que diz no site a ultima atualização foi pro R 2.12.0, mas acredito que isso não deveria interferir. Eu usei o mesmo .zip para instalar no pc da faculdade e la deu erro (não sei a versão do R de la). []'s

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identificação de grupos em um cluster
by Antonio Silva 03 Mar '12

03 Mar '12

Olá Gostaria de saber se há como indicar no dendrograma, na altura do corte, o número referente ao grupo, como indicado em cutree. Observei que em alguns dendrogramas que os grupos selecionados de acordo com um dado o nível de corte não seguem necessariamente uma ordem ascendente (grupo 3 pode não ser o terceiro da esquerda para direita). Seria algo semelhante ao da figura https://www.crops.org/images/publications/cs/42/5/1584f4.jpeg Por exemplo exemplo: library(vegan) data(dune) dis <- vegdist(dune) cluc <- hclust(dis, "complete") plot(cluc) rect.hclust(cluc, 3) grp <- cutree(cluc, 3) grp Notem que o grupo com os objetos 17, 19, 11 e 18, posicionado a esquerda no dedrograma é o grupo de número 3, e o grupo com os objetos 1,2, ..., 7, representado no meio do dendrograma é o de número 1. Eu gostaria que, no nível de corte, aparecesse no dendrograma, ao lado das barras verticais de cada cluster, a indicação 3, 1, 2. Agradeço qualquer dica. Abraços Antônio -- Antônio Olinto Ávila da Silva Biólogo / Oceanógrafo Instituto de Pesca São Paulo, Brasil

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Inserir valor de um objeto numérico dentro de uma expressão
by Daniel C Bezerra 03 Mar '12

03 Mar '12

Alguém saberia como inserir o valor de um objeto numérico dentro de uma expressão? Eu queria fazer um gráfico assim: hist(rnorm(n=100,mean=67,sd=37),main=expression("Media = 67"%+-%37)) mas se eu faço: media<-67 dp<-37 hist(rnorm(n=100,mean=67,sd=37),main=expression("Media ="media%+-%dp)) hist(rnorm(n=100,mean=67,sd=37),main=paste("Media =", media ,expression(""%+-%""),dp)) Não dá certo. Alguém saberia como resolver? Desde já mais uma vez agradeço, Daniel

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RGL: uma dica de ouro para instalar dependências
by Jose Claudio Faria 03 Mar '12

03 Mar '12

Pessoal, O pacote RGL tem muitas dependências e ficar checando passo a passo as mensagens de erro do R para instalar todas as dependências é muito trabalhoso. Ao instalar o Debian (estava com saudades e decidi comparar com o LMDE no notebook) me deparei novamente com o problema e resolvi dar uma olhada na web. Achei uma dica de ouro: http://r.789695.n4.nabble.com/Pkg-rgl-installation-fails-because-of-x11-td8… Ben Bolker que compartilho: sudo apt-get build-dep r-cran-rgl ou sudo aptitude build-dep r-cran-rgl Facilita muito! Ab, -- ///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\ Jose Claudio Faria Estatistica - Prof. Pleno UESC/DCET/Brasil joseclaudio.faria at gmail.com ///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\

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RES: Rosa dos Ventos
by Jodavid Ferreira 03 Mar '12

03 Mar '12

Olá Pedro, Rodei seu código,ok. Mas não estou conseguindo visualizar a Rosa. Não estou conseguindo coloca-la no mapa, ou até mesmo, plotá-la. -- Jodavid Ferreira Responsável pela comissão de Comunicação do MJ da RCCPB - http://jovem.rccpb.com.br Responsável pela comissão de Comunicação e do Ministério Jovem do Grupo de Oração Boa Esperança - http://grupoboaesperanca.com Bacharelando em Estatística - UFPB Estagiário no Laboratório de Estatística Aplicada ao Processamento de Imagens e Geoprocessamento - http://de.ufpb.br/~leapig http://jodavidferreira.com

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[OFF TOPIC] Julia
by Fernando Mayer 03 Mar '12

03 Mar '12

Achei interessante repassar para conhecimento. (Douglas Bates, na Rd) From: bates(a)stat.wisc.edu Douglas Bates To: r-devel(a)r-project.org R-devel Date: Thu, 1 Mar 2012 14:06:51 -0300 Subject: [Rd] Julia My purpose in mentioning the Julia language (julialang.org) here is not to start a flame war. I find it to be a very interesting development and others who read this list may want to read about it too. It is still very much early days for this language - about the same stage as R was in 1995 or 1996 when only a few people knew about it - but Julia holds much potential. There is a thread about "R and statistical programming" on groups.google.com/group/julia-dev. As always happens, there is a certain amount of grumbling of the "R IS SOOOO SLOOOOW" flavor but there is also some good discussion regarding features of R (well, S actually) that are central to the language. (Disclaimer: I am one of the participants discussing the importance of data frames and formulas in R.) If you want to know why Julia has attracted a lot of interest very recently (like in the last 10 days), as a language it uses multiple dispatch (like S4 methods) with methods being compiled on the fly using the LLVM (http://llvm.org) infrastructure. In some ways it achieves the Holy Grail of languages like R, Matlab, NumPy, ... in that it combines the speed of compiled languages with the flexibility of the high-level interpreted language. One of the developers, Jeff Bezanson, gave a seminar about the design of the language at Stanford yesterday, and the video is archived at http://www.stanford.edu/class/ee380/. You don't see John Chambers on camera but I am reasonably certain that a couple of the questions and comments came from him. --- Fernando Mayer Universidade Federal de Santa Catarina - UFSC Departamento de Ecologia e Zoologia - ECZ/CCB URL: http://sites.google.com/site/fernandomayer e-mail: fernandomayer [@] gmail.com

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Formato SPSS
by Edson Lira 03 Mar '12

03 Mar '12

Boa noite pessoal, o Pacote gmodels tem a função CrossTable que mostra a saída com formatos SAS, SPSS. O detalhe é mostra somente para tabelas de dupla entrada. Tem algum pacote ou função que me mostro formato do SPSS para tabelas simples? Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas

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Batch Mode Windows 7 64bits
by Leandro Marino 03 Mar '12

03 Mar '12

*Caros,* * * *estou tentando rodar a seguinte linha de comando no em um arquivo chamado Simulacao.bat* *"C:\Programas Leandro\R-2.14.0\bin\x64\" R BATCH --no-restore --no-save Simulacao.r log.txt* * * *Na pasta que o arquivo simulacao.bat se encontra tenho o Simulacao.r. Entretanto, o Rterm é aberto e recebo a tela, que está no link: https://lh3.googleusercontent.com/-NSLGLbsnlSQ/T1EOz0BHFyI/AAAAAAAABfE/FTFe… * * * *Alguém saberia me ajudar nisto?* * * *Aproveitando, quero depois passar alguns argumentos, como devo fazer?* * * *Procurei nos manuais e na lista mas não consigo entender meu erro.* * * *Att,* *Leandro Marino* * *

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Batch mode Windows 7 64bits
by Leandro Marino 02 Mar '12

02 Mar '12

*Caros,* * * *estou tentando rodar a seguinte linha de comando no em um arquivo chamado Simulacao.bat* *"C:\Programas Leandro\R-2.14.0\bin\x64\" R BATCH --no-restore --no-save Simulacao.r log.txt* * * *Na pasta que o arquivo simulacao.bat se encontra tenho o Simulacao.r. Entretanto, o Rterm é aberto e recebo a tela, que está no link: https://lh3.googleusercontent.com/-NSLGLbsnlSQ/T1EOz0BHFyI/AAAAAAAABfE/FTFe… * * * *Alguém saberia me ajudar nisto?* * * *Aproveitando, quero depois passar alguns argumentos, como devo fazer?* * * *Procurei nos manuais e na lista mas não consigo entender meu erro.* * * *Att,* *Leandro Marino* * * * * Atenciosamente, Leandro Marino http://www.leandromarino.com.br (Fotógrafo) http://est.leandromarino.com.br/Blog (Estatístico) Cel.: + 55 21 9845-7707 Cel.: + 55 21 8777-7907

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