Novembro 2012 - R-br

Re: [R-br] excluir mar no ETOPO
by Eder Comunello 21 Nov '12

21 Nov '12

Carlos, boa noite! Você chegou a ler as imagens com raster ou rgdal? Em que ponto exatamente está com problemas? Na leitura ou no fatiamento? Dá pra fatiar o objeto criado por raster ao invés daquele criado por rgdal... O link que segue tem algumas considerações sobre o uso de rgdal() e raster para leitura de imagens do ETOPO1. Comenta sobre causas de erro e dá algumas opções. http://r-sig-geo.2731867.n2.nabble.com/Import-Part-of-a-GeoTiff-using-readG… Espero que ajude, ================================================ Éder Comunello Ph.D. Student in Agricultural Systems Engineering (USP/ESALQ) Piracicaba, SP, Brazil [22 42.7'S, 47 37.8'W] Researcher at Embrapa Western Region Agriculture Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W] ================================================ UTC-03:00 Em 20 de novembro de 2012 16:51, <r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br-request@listas.c3sl…> > escreveu: > Enviar submissões para a lista de discussão R-br para > r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou > corpo da mensagem para > r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br-request@listas.c3sl…> > > Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo > endereço > r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br-owner@listas.c3sl.u…> > > Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será > mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." > > > Tópicos de Hoje: > > 1. 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Dúvida em summary em regressão logística (Alexandre Santos) > > > ---------------------------------------------------------------------- > > Message: 1 > Date: Tue, 20 Nov 2012 07:22:57 -0800 (PST) > From: Thiago Veloso <thi_veloso(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=thi_veloso@yahoo.com.br> > > > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > Subject: Re: [R-br] excluir mar no ETOPO > Message-ID: > <1353424977.92989.YahooMailNeo(a)web121903.mail.ne1.yahoo.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1353424977.92989.YahooMa…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Carlos, > > Eu tentaria algo assim: > > library (raster) #carrega pacote exigido > r <- raster('ETOPO1_Ice_g_geotiff.tif') #carrega arquivo de trabalho > r [ r<0 ] <- NA #atribui NA a todos os valores negativos no raster. > > E caso você queira atribuir NA a um escopo de valores, pode ser mais fácil > criar uma função: > > > vals <- c(0,24,32,56) # estes são os valores que você quer eliminar da > tabela de dados do raster > fun <- function (x) { > x <- ifelse (x %in% vals, 1, NA) # aqui você substitui os valores acima > por "1" e atribui NA para todo o resto. Você pode substituir o "1" por vals > } > > E então aplicá-la sobre o raster: > r.new <- calc (r, fun) > > > Uma vantagem de usar funções é pode realizar uma tarefa para diversos > arquivos sem precisar repetir comandos para cada um deles. > > Espero que ajude, > Thiago. > > > ________________________________ > From: D'Apolito <carlosdapolito(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=carlosdapolito@gmail.com> > > > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Sent: Monday, November 19, 2012 8:15 PM > Subject: [R-br] excluir mar no ETOPO > > > Prezados, > > Estou graficando mapas com os dados do ETOPO01 de elevação e gostaria de > excluir o mar, para que os dados iniciem em zero ao invés de números > negativos (profundidades dos oceanos). > Qualquer ajuda é bem vinda, desde já agradeço > > Att > Carlos > > #código: > > library(raster) > library(rgdal) > > etopo<-"ETOPO1_Ice_g_geotiff.tif" > r.etopo<-raster(etopo) > > ext <- extent(-95,-35,-31,31) > > zoom(r.etopo, ext=ext,col=rev(gray.colors(12))) > > > > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/675bda4e/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 2 > Date: Tue, 20 Nov 2012 15:22:24 +0000 > From: "D'Apolito" <carlosdapolito(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=carlosdapolito@gmail.com> > > > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] excluir mar no ETOPO > Message-ID: > <CAObczOaGmp3ug9u_ktRu7ZfSgoQ3XUFD9V8yg= > 440j-wZhVkuQ(a)mail.gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=440j-wZhVkuQ@mail.gmail.…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Ola Eder, > > O arquivo de origem dos dados (ETOPO1) `e muito grande, de maneira que > tenho obtido erro constantemente, Tentei aumentar a capacidade da memoria > com memory.limit() mas tambem nao funcionou. > > > att > Carlos > > > Em 20 de novembro de 2012 11:30, Eder Comunello <ecomunel(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ecomunel@gmail.com> > >escreveu: > > > Carlos e colegas, bom dia! > > > > Vou aproveitar um script anterior, fazendo algumas alterações. Como da > > outra vez, creio que dá pra adaptar facilmente pro seu caso. > > > > Vou trabalhar extraindo o vetor de interesse, substituindo este vetor no > > objeto origem ao final... > > > > ##### <begin> ##### > > require(sp); require(rgdal) > > > > ### Download do exemplo (399 Kb) > > download.file('https://dl.dropbox.com/u/117618178/dourados/DDOS.tif', > > file.path(getwd(),'DDOS.tif'), mode='wb') > > > > alt = readGDAL("DDOS.tif"); gridded(alt) ### 'importa' o geotiff > > image(alt, col=terrain.colors(21)) ## visualização > > slotNames(alt) ### nome dos slots (S4) > > proj4string(alt) ### projeçãoo definida no geotiff > > head(alt@data) ### observe os valores dos dados > > head(alt@data$band1) ### observe os valores dos dados > > > > ### Opção para fatiar (0 ou 1) > > > > alt2 <- alt ### para manipular uma cópia do objeto > > z <- alt2@data$band1 ### para manipular apenas o vetor de interesse > > n <- length(z); n > > > > for(i in 1:n){if (z[i]<400){z[i]=0} else{z[i]=1}}; head(z) ### 0 ou 1 > > alt2@data$band1 <- z ### substitui o vetor manipulado no objeto > > image(alt2) ## visualização > > > > ### Opção para mascarar valores abaixo de critério (com 0 ou NA) > > > > alt3 <- alt ### para manipular outra cópia do objeto > > z <- alt3@data$band1 ### para manipular apenas o vetor de interesse > > n <- length(z); n > > > > for(i in 1:n){if (z[i]<400){z[i]=0}}; head(z) ### 0 ou 1 > > #for(i in 1:n){if (z[i]<400){z[i]=NA}}; head(z) ### 0 ou 1 > > alt3@data$band1 <- z ### substitui o vetor manipulado no objeto > > image(alt3) ## visualização > > ##### <end> ##### > > > > > > ================================================ > > Éder Comunello > > > > Ph.D. Student in Agricultural Systems Engineering (USP/ESALQ) > > Piracicaba, SP, Brazil [22 42.7'S, 47 37.8'W] > > > > Researcher at Embrapa Western Region Agriculture > > Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W] > > ================================================ > > UTC-03:00 > > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > > código mínimo reproduzível. > > > > > > -- > _____________________________________ > *Carlos D'Apolito - PhD candidate - ID:1239480* > Earth Sciences > School of Geography & Environmental Sciences > Aston Webb Building > University of Birmingham > Birmingham > B15 2TT > UK > > phone: 44 - 07 919 673 173 > CXD280(a)bham.ac.uk<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=CXD280@bham.ac.uk> > CV: http://lattes.cnpq.br/4557754746424026 > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/615af15d/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 3 > Date: Tue, 20 Nov 2012 14:14:30 -0200 > From: kaue veras <kaueveras(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=kaueveras@gmail.com> > > > To: R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: [R-br] Graficos de decomposição > Message-ID: > <CAENvtmjrMnC52i4-JYn2NdhrwWMNw= > Qu0HJLeTOqz2s5q2i6uQ(a)mail.gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=Qu0HJLeTOqz2s5q2i6uQ@mai…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Boa tarde prezados, > > Estou realizando um trabalho em que utilizo a decomposição, análises de > previsão usando o modelo ARIMA e Holt-Winters e goataria de mudar os > títulos do gráfico e titulos dos eixos. Com os comandos main, xlab e ylab > não esta dando certo, poderiam me dar uma luz ou me ajudar como faço para > gerar essas modificações? > > Desde já agradeço. > > Atenciosamente, > > Kauê P. Veras da Cunha > Estatística - UERJ > MSN: kaueveras(a)hotmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=kaueveras@hotmail.com> > E-mail: kaueveras(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=kaueveras@gmail.com> > Cel: (21) 8254-9601 > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/1154d3e8/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 4 > Date: Tue, 20 Nov 2012 14:34:00 -0200 > From: Matheus Monteiro <matheusmont(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=matheusmont@gmail.com> > > > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] Gráfico de distribuiçoes estimadas > Message-ID: > < > CAAG8985KZaYb24ckqaGFxeon85H3g18ny9gEtBc79DXK7p8mcg(a)mail.gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=CAAG8985KZaYb24ckqaGFxeo…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > mais alguem pode me ajudar? > > Em 10 de novembro de 2012 13:21, Edson Lira <edinhoestat(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=edinhoestat@yahoo.com.br> > >escreveu: > > > Mateus, no pacote MASS acho que tem alguns gráficos empírica x teórica. > > > > [. ]'s. > > Edson Lira > > Estatístico > > Ma-Am > > > > Em 10/11/2012, às 02:20, Matheus Monteiro <matheusmont(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=matheusmont@gmail.com> > > > > escreveu: > > > > Boa noite, obtive as densidades aproximadas da 't' e da 'normal', > gostaria > > de compara-las através de graficos dessas densidades estimadas. > > Alguma sugestão, como faria isso? > > > > *t * > > > > > fitdistr(x[,1],"t") > > > > m s df > > > > -0.001874414 0.009122738 3.522064232 > > > > ( 0.001726835) ( 0.001862692) ( 2.234067399)* > > > > **normal* > > > > fitdistr(x[,1],"normal") > > > > mean sd > > > > 0.0001040816 0.0128201843 > > > > (0.0018314549) (0.0012950342) > > > > > > x são dados simulados. > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > > código mínimo reproduzível. > > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > > código mínimo reproduzível. > > > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/1c03edac/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 5 > Date: Tue, 20 Nov 2012 09:06:00 -0800 (PST) > From: Edson Lira <edinhoestat(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=edinhoestat@yahoo.com.br> > > > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > Subject: Re: [R-br] (sem assunto) > Message-ID: > <1353431160.32913.YahooMailNeo(a)web161205.mail.bf1.yahoo.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1353431160.32913.YahooMa…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Mas Eder a idéia do NA é não considerar estas respostas na contagem e/ou > no percentual. > > Mas valeu e muito obrigado. > > Peço desculpas a todos, esqueci de colocar o assunto na mensagem > > Edson Lira > Estatístico > Manaus-Amazonas > > > ________________________________ > De: Eder Comunello <ecomunel(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ecomunel@gmail.com> > > > Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Enviadas: Terça-feira, 20 de Novembro de 2012 7:39 > Assunto: Re: [R-br] (sem assunto) > > > Edson e colegas, bom dia! > > Ao invés de deixar o campo 'motivo' em branco (NA), experimente atribuir > um valor, p. ex. 'sem resposta', e rode novamente. Assim estes casos serão > considerados e aparecerão na saída. Vale pros outros campos. > > ================================================ > Éder Comunello > > Ph.D. Student in Agricultural Systems Engineering (USP/ESALQ) > Piracicaba, SP, Brazil [22 42.7'S, 47 37.8'W] > > Researcher at Embrapa Western Region Agriculture > Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W] > ================================================ > UTC-03:00 > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/a9ea6c58/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 6 > Date: Tue, 20 Nov 2012 15:30:17 -0200 > From: Leonard de Assis <assis.leonard(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=assis.leonard@gmail.com> > > > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] Usando o R em grandes bases de dados > Message-ID: <50ABBE29.4030805(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=50ABBE29.4030805@gmail.c…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed" > > Bigmemory eu acredito que lide somente com matrizes, não com data > frames, resumo: todos os campos devem ter o mesmo tipo. > > []s > Leonard de Assis > http://about.me/ldeassis > > Em 20/11/2012 03:06, Vinicius Brito Rocha escreveu: > > > > fiquei brincando com o bigmemory e carreguei uma tabela mas os campos > > character vieram como NA. > > > > Quando usava a opção type="char" piorava e alterava os valores dos > > campos numéricos. O melhor ( ou menos pior resultado) foi carregar a > > tabela com a opção type="double" > > > > Alguem sabe o que pode ser? > > > > > > Abs. > > > > Vinicius Brito Rocha > > > > Em 19 de novembro de 2012 15:40, Richard Santos > > <jamesrichardsantos(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=jamesrichardsantos@gmail…><mailto: > jamesrichardsantos(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=jamesrichardsantos@gmail…> > >> > > escreveu: > > > > Valeu!! Toda e qq ajuda nesse sentido é bem vinda! > > Abç. > > Richard > > > > Em 19/11/12, Daniel C Bezerra<danielcbezerra(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=danielcbezerra@gmail.com> > > <mailto:danielcbezerra@gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=danielcbezerra@gmail.com>>> > escreveu: > > > Eu encontrei estas apresentações e achei legal dividir com vcs: > > > > > > http://goo.gl/l6fuC > > > > > > Tem link para os slides, código do R e tudo mais por lá. > > > > > > Abs, > > > > > > Daniel > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br><mailto: > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e > > forneça código mínimo reproduzível. > > > > > > > > > > -- > > /Vinicius Brito Rocha./ > > /Estatístico e Atuário (IM / UFRJ)// > > Mestre em Pesquisa Operacional (COPPE / UFRJ)/ > > > > www.aplicademic.blogspot.com <http://www.aplicademic.blogspot.com> > > http://twitter.com/viniciusbritor > > > > "Não se preocupe muito com as suas dificuldades em Matemática, posso > > assegurar-lhe que as minhas são ainda maiores." - Albert Einstein. > > > > > > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/b8d49acf/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 7 > Date: Tue, 20 Nov 2012 17:51:25 +0000 > From: alanarocha(a)sapo.pt<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=alanarocha@sapo.pt> > To: R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: [R-br] matrizes de correlação > Message-ID: > <20121120175125.Horde.X_LLT3CXF3VQq8MdQ0ASvYA(a)mail.sapo.pt<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=20121120175125.Horde.X_L…> > > > Content-Type: text/plain; charset=UTF-8; format=flowed; DelSp=Yes > > Olá, a actualização do R resultou para o meu problema. > agora preciso de ajuda pois tou a tentar fazer uma matriz de > correlação e outra de covariancias de 4 variaveis de um dataframe e > dame estes erros: > ##matriz de correlação > > cor.p<-cor.ps(dados[,2:4], Pearson=TRUE,NAs=TRUE) > cor.p > dados=na.omit(dados[,2:4]) > > cat("valores NA retirados\n") > x11() > pairs(dados) > x11() > boxplot(dados) > dados=dados[,2:4] > x11() > boxplot(dados) > correl=cor(dados[2:4]) > result=correl > return(list(sumario=summary(dados),resultado=result)) > cor(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12)) > cor.test(dados[,2:4], method='pearson')$p.value > cor_with_p_test(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12)) > ct <- cor.test(X1s10, X1s12) > ct$p > ct$v > > #matriz de covariancias > cov(dados[,2:4], na.rm=TRUE) > > > > cor.p<-cor.ps(dados[,2:4], Pearson=TRUE,NAs=TRUE) > Error: could not find function "cor.ps" > > cor.p > Error: object 'cor.p' not found > > dados=na.omit(dados[,2:4]) > > > > cat("valores NA retirados\n") > valores NA retirados > > > > > > > > > > correl=cor(dados[2:4]) > Error in `[.data.frame`(dados, 2:4) : undefined columns selected > > result=correl > Error: object 'correl' not found > > return(list(sumario=summary(dados),resultado=result)) > Error: object 'result' not found > > cor(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12)) > Error in cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12) : object 'X1s09' not found > > cor.test(dados[,2:4], method='pearson')$p.value > Error in `[.data.frame`(dados, , 2:4) : undefined columns selected > > cor_with_p_test(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12)) > Error: could not find function "cor_with_p_test" > > ct <- cor.test(X1s10, X1s12) > Error in cor.test(X1s10, X1s12) : object 'X1s10' not found > > ct$p > Error: object 'ct' not found > > ct$v > Error: object 'ct' not found > > > > #matriz de covariancias > > cov(dados[,2:4], na.rm=TRUE) > Error in cov(dados[, 2:4], na.rm = TRUE) : > unused argument(s) (na.rm = TRUE) > > > cumprimentos e obrigada Ana Rocha > > > > > > ------------------------------ > > Message: 8 > Date: Tue, 20 Nov 2012 09:57:15 -0800 (PST) > From: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > Subject: [R-br] ExpDes - Comparações múltiplas > Message-ID: > <1353434235.56527.YahooMailNeo(a)web125902.mail.ne1.yahoo.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1353434235.56527.YahooMa…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Boa tarde, > estou aqui tentando reproduzir algumas análises do ExpDes. A analise > abaixo não me deu as comparações múltiplas como faço para tais comparações? > > require(ExpDes) > Carregando pacotes exigidos: ExpDes > data(ex1) > attach(ex1) > dic(trat, ig, quali = FALSE, sigF = 0.05) > > > > André Oliveira Souza > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/696d59ab/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 9 > Date: Tue, 20 Nov 2012 16:24:10 -0200 > From: Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=walmeszeviani@gmail.com> > > > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>, > Andre Oliveira > <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > Subject: Re: [R-br] ExpDes - Comparações múltiplas > Message-ID: > <CAFU= > EkZQNQHMTUM2nUKMnJhKTcCoDJ7ngqJ+_69-XZ6mf3FJDQ(a)mail.gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=EkZQNQHMTUM2nUKMnJhKTcCo…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Você usou quali=FALSE, ou seja, está declarando que os níveis são não > qualitativos. Use quali=TRUE e leia o manual. > > À disposição. > Walmes. > > ========================================================================== > Walmes Marques Zeviani > LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) > Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná > fone: (+55) 41 3361 3573 > VoIP: (3361 3600) 1053 1173 > e-mail: walmes(a)ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=walmes@ufpr.br> > skype: walmeszeviani > twitter: @walmeszeviani > homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes > linux user number: 531218 > ========================================================================== > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/6b5bc51b/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 10 > Date: Tue, 20 Nov 2012 16:28:49 -0200 > From: Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=walmeszeviani@gmail.com> > > > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] Dúvida sobre IC simultâneos para modelagem de > variáveis binarias no R (multcomp) > Message-ID: > <CAFU=EkYKvcE65FEpjv=qb0xnJ=mME7ec_8c7DD28wQNPF= > 1_yg(a)mail.gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1_yg@mail.gmail.com> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Seu exemplo não é reproduzível. O guia de postagem não recomenda envio de > dados como anexo das mensagens. Hospede os dados na núvem e acrescente > comandos para leitura do arquivo. Assim rapidamente podemos reproduzir sua > análise e ajudar você. > > À disposição. > Walmes. > > ========================================================================== > Walmes Marques Zeviani > LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) > Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná > fone: (+55) 41 3361 3573 > VoIP: (3361 3600) 1053 1173 > e-mail: walmes(a)ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=walmes@ufpr.br> > skype: walmeszeviani > twitter: @walmeszeviani > homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes > linux user number: 531218 > ========================================================================== > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/7d4a7d34/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 11 > Date: Tue, 20 Nov 2012 10:30:37 -0800 (PST) > From: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > To: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > >, > "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > Subject: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > Message-ID: > <1353436237.16303.YahooMailNeo(a)web125901.mail.ne1.yahoo.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1353436237.16303.YahooMa…> > > > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Versão ExpDes_1.1.1.tar.gz agora sim consegui instalar no linux. > > > > André Oliveira Souza > > > ________________________________ > De: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > Para: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > > > Enviadas: Quinta-feira, 5 de Janeiro de 2012 11:05 > Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > > > O Walmes me disse, aqui mesmo na lista, ha algum tempo que realmente o > pacote para linux em português ele não consegui colocar para funcionar. E > no caso do windows eu não sabia que estava em inglês! Obrigado > > > > André Oliveira Souza > > > ________________________________ > De: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > > > Para: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > Enviadas: Quinta-feira, 5 de Janeiro de 2012 10:55 > Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > > > Olá Andre, > > Que bom que não desistiu. Vamos por partes que solucionaremos todos os > seus problemas. > Quanto ao Windows, > não se esqueça que a versão do CRAN está em ingles. Portanto, após > carregar, voce deve pedir o help da função cdr (completely randomized > design) e não dic, ou seja > ?crd > Veja se funciona. > > > Quanto ao linux, talvez voce deva escrever para o Walmes, que faz parte > dessa lista. Ele usa o ExpDes no Linux e diz que funciona perfeitamente. > > abs > > Eric. > > > Em 5 de janeiro de 2012 10:42, Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br>> > escreveu: > > Eric, > > > >eu acompanhei o pacote no seu site e nunca consegui coloca-lo para > funcionar no Linux a versão em português. Agora com ele no CRAN voltei a > tentar colocar o pacote para funcionar no Linux, mas sem sucesso. E para > minha surpresa no windows não está funcionado também. Olha a minha > tentativa no windows! > >require(ExpDes) > >Carregando pacotes exigidos: ExpDes > >> ?dic > >No documentation for ?dic? in specified packages and libraries: > >you could try ???dic? > > > > > > Estou ansioso para colocar este pacote para funcionar por aqui. Já li o > TCC e o manual sobre o mesmo e vi a importância do mesmo. Visto que antes > tinha que usar muitos pacotes para a mesma análise e com o ExpDes é muito > mais prático. > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > >André Oliveira Souza > > > > > > > > > > > > > >________________________________ > > De: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > > > >Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>; > Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > >Enviadas: Quarta-feira, 4 de Janeiro de 2012 18:25 > >Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (EspDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > > > > > >Olá André, > > > >Se quiser trocar uma ideia em particular, posso tentar te ajudar. Sou o > criador do ExpDes, mas não usu Linux. Não sei se serei útil. > > > >A princípio, posso te dizer que existe o pacote no CRAN e na minha página > pessoal: https://sites.google.com/site/ericbferreira/unifal/downloads-1 > > > >Tente pegar o pacote de lá para ver se o erro se repete. > >Peço gentilmente aos usuárioas de (R no) Linux que me ajudem a exclarecer > o André. > > > >Atenciosamente, > > > >Eric. > > > > > >Em 4 de janeiro de 2012 16:39, Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br>> > escreveu: > > > >Opa vacilo meu erro no nome do pacote > >> > >> > >> install.packages("ExpDes", dep=T) > >> > >> > >> > >> > >> > >> > >>André Oliveira Souza > >> > >> > >>________________________________ > >> De: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > >>Para: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > >>Enviadas: Quarta-feira, 4 de Janeiro de 2012 16:36 > >>Assunto: [R-br] Problema para reinstalar pacote (EspDes) no Linux Ubuntu > 10.04 > >> > >> > >> > >>Pessoal estou com problemas para reinstalar o EspDes !! Alguém saberia > dizer o que pode ser? > >> > >> > >> > >> > >>install.packages("EspDes", dep=T) > >>Installing package(s) into ?/home/andre/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.14? > >>(as ?lib? is unspecified) > >>--- Please select a CRAN mirror for use in this session --- > >>Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto > >>Mensagens de aviso perdidas: > >>In getDependencies(pkgs, dependencies, available, lib) : > >> package ?EspDes? is not available (for R version 2.14.1) > >> > >> > >> > >> > >> > >> > >> > >>André Oliveira Souza > >>obrigado > >> > >> > >>_______________________________________________ > >>R-br mailing list > >>R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > >>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > >> > >> > >>_______________________________________________ > >>R-br mailing list > >>R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > >>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > >> > > > > > >-- > >Dr Eric B Ferreira > >Exact Sciences Department > >Federal University of Alfenas > >Brazil > > > > > > > > > -- > Dr Eric B Ferreira > Exact Sciences Department > Federal University of Alfenas > Brazil > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/20c67bb9/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 12 > Date: Tue, 20 Nov 2012 10:37:54 -0800 (PST) > From: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>>, > Eric > Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > > > Subject: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > Message-ID: > <1353436674.31607.YahooMailNeo(a)web125904.mail.ne1.yahoo.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1353436674.31607.YahooMa…> > > > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Em português no linux! > > André Oliveira Souza > > > ________________________________ > De: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > Para: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com>>; > "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > Enviadas: Terça-feira, 20 de Novembro de 2012 16:30 > Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > > > Versão ExpDes_1.1.1.tar.gz agora sim consegui instalar no linux. > > > > André Oliveira Souza > > > ________________________________ > De: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > Para: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > > > Enviadas: Quinta-feira, 5 de Janeiro de 2012 11:05 > Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > > > O Walmes me disse, aqui mesmo na lista, ha algum tempo que realmente o > pacote para linux em português ele não consegui colocar para funcionar. E > no caso do windows eu não sabia que estava em inglês! Obrigado > > > > André Oliveira Souza > > > ________________________________ > De: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > > > Para: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > Enviadas: Quinta-feira, 5 de Janeiro de 2012 10:55 > Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > > > Olá Andre, > > Que bom que não desistiu. Vamos por partes que solucionaremos todos os > seus problemas. > Quanto ao Windows, > não se esqueça que a versão do CRAN está em ingles. Portanto, após > carregar, voce deve pedir o help da função cdr (completely randomized > design) e não dic, ou seja > ?crd > Veja se funciona. > > > Quanto ao linux, talvez voce deva escrever para o Walmes, que faz parte > dessa lista. Ele usa o ExpDes no Linux e diz que funciona perfeitamente. > > abs > > Eric. > > > Em 5 de janeiro de 2012 10:42, Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br>> > escreveu: > > Eric, > > > >eu acompanhei o pacote no seu site e nunca consegui coloca-lo para > funcionar no Linux a versão em português. Agora com ele no CRAN voltei a > tentar colocar o pacote para funcionar no Linux, mas sem sucesso. E para > minha surpresa no windows não está funcionado também. Olha a minha > tentativa no windows! > >require(ExpDes) > >Carregando pacotes exigidos: ExpDes > >> ?dic > >No documentation for ?dic? in specified packages and libraries: > >you could try ???dic? > > > > > > Estou ansioso para colocar este pacote para funcionar por aqui. Já li o > TCC e o manual sobre o mesmo e vi a importância do mesmo. Visto que antes > tinha que usar muitos pacotes para a mesma análise e com o ExpDes é muito > mais prático. > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > >André Oliveira Souza > > > > > > > > > > > > > >________________________________ > > De: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > > > >Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>; > Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > >Enviadas: Quarta-feira, 4 de Janeiro de 2012 18:25 > >Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (EspDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > > > > > >Olá André, > > > >Se quiser trocar uma ideia em particular, posso tentar te ajudar. Sou o > criador do ExpDes, mas não usu Linux. Não sei se serei útil. > > > >A princípio, posso te dizer que existe o pacote no CRAN e na minha página > pessoal: https://sites.google.com/site/ericbferreira/unifal/downloads-1 > > > >Tente pegar o pacote de lá para ver se o erro se repete. > >Peço gentilmente aos usuárioas de (R no) Linux que me ajudem a exclarecer > o André. > > > >Atenciosamente, > > > >Eric. > > > > > >Em 4 de janeiro de 2012 16:39, Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br>> > escreveu: > > > >Opa vacilo meu erro no nome do pacote > >> > >> > >> install.packages("ExpDes", dep=T) > >> > >> > >> > >> > >> > >> > >>André Oliveira Souza > >> > >> > >>________________________________ > >> De: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > >>Para: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > >>Enviadas: Quarta-feira, 4 de Janeiro de 2012 16:36 > >>Assunto: [R-br] Problema para reinstalar pacote (EspDes) no Linux Ubuntu > 10.04 > >> > >> > >> > >>Pessoal estou com problemas para reinstalar o EspDes !! Alguém saberia > dizer o que pode ser? > >> > >> > >> > >> > >>install.packages("EspDes", dep=T) > >>Installing package(s) into ?/home/andre/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.14? > >>(as ?lib? is unspecified) > >>--- Please select a CRAN mirror for use in this session --- > >>Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto > >>Mensagens de aviso perdidas: > >>In getDependencies(pkgs, dependencies, available, lib) : > >> package ?EspDes? is not available (for R version 2.14.1) > >> > >> > >> > >> > >> > >> > >> > >>André Oliveira Souza > >>obrigado > >> > >> > >>_______________________________________________ > >>R-br mailing list > >>R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > >>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > >> > >> > >>_______________________________________________ > >>R-br mailing list > >>R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > >>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > >> > > > > > >-- > >Dr Eric B Ferreira > >Exact Sciences Department > >Federal University of Alfenas > >Brazil > > > > > > > > > -- > Dr Eric B Ferreira > Exact Sciences Department > Federal University of Alfenas > Brazil > > > > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/6a5b8ac7/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 13 > Date: Tue, 20 Nov 2012 10:49:58 -0800 (PST) > From: Alexandre Santos <alexandresantosbr(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=alexandresantosbr@yahoo.…> > > > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > Subject: [R-br] Dúvida em summary em regressão logística > Message-ID: > <1353437398.81186.YahooMailNeo(a)web121206.mail.ne1.yahoo.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1353437398.81186.YahooMa…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Boa tarde Pessoal, > Estou ajustando uma regressão logística e me deparei com a seguinte > dúvida: > > > ################################################################################################### > #Regressão logística entre a proporção de herbívoros predados e a > densidade de herbívoros oferecidos > # > pred<-c(1,2,2,3,1,4,2,3,2,3,5,6,5,5,3,7,7,6,2 > ,3,15,12,14,12,11,11,11,13,13,13,18,14,27,26 > ,17,18,20,22,10,15,29,30,36,40,23,50,30,40,29,52)##Número de herbívoros > predados > dens<-sort(rep(2^(2:6),10))#### Densidade de herbivoros oferecidos > ## > ##Regressão pred/dens = exp(P0+P1*N+P2*N^2+P3*N3)/1+ > exp(P0+P1*N+P2*N^2+P3*N3) > p.model1<-glm(pred/par~dens+I(dens^2)+I(dens^3),family="binomial") > summary(p.model1) > # > > > Minha dúvida é se o coeficiente linear que aparece no summary esta > transformado em exp(x)/1+exp(x) > ou trata-se do valor sem transformação? > > Obrigado, > > -- > ====================================================================== > Alexandre dos Santos > Proteção Florestal > IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso > - Campus Cáceres > Avenida dos Ramires, s/n > Bairro: Distrito Industrial > Cáceres - MT CEP: 78.200-000 > Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) > e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=e-mails%3Aalexandresanto…> > alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=alexandre.santos@cas.ifm…>====================================================================== > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/0b764a8d/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 14 > Date: Tue, 20 Nov 2012 10:51:20 -0800 (PST) > From: Alexandre Santos <alexandresantosbr(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=alexandresantosbr@yahoo.…> > > > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > Subject: [R-br] Dúvida em summary em regressão logística > Message-ID: > <1353437480.93196.YahooMailNeo(a)web121202.mail.ne1.yahoo.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1353437480.93196.YahooMa…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Boa tarde Pessoal, > Estou ajustando uma regressão logística e me deparei com a seguinte > dúvida: > > > ################################################################################################### > #Regressão logística entre a proporção de herbívoros predados e a > densidade de herbívoros oferecidos > # > pred<-c(1,2,2,3,1,4,2,3,2,3,5,6,5,5,3,7,7,6,2 > ,3,15,12,14,12,11,11,11,13,13,13,18,14,27,26 > ,17,18,20,22,10,15,29,30,36,40,23,50,30,40,29,52)##Número de herbívoros > predados > dens<-sort(rep(2^(2:6),10))#### Densidade de herbivoros oferecidos > ## > ##Regressão pred/dens = exp(P0+P1*N+P2*N^2+P3*N3)/1+ > exp(P0+P1*N+P2*N^2+P3*N3) > p.model1<-glm(pred/par~dens+I(dens^2)+I(dens^3),family="binomial") > summary(p.model1) > # > > > Minha dúvida é se o coeficiente linear que aparece no summary esta > transformado em exp(x)/1+exp(x) > ou trata-se do valor sem transformação? > > Obrigado, > > -- > ====================================================================== > Alexandre dos Santos > Proteção Florestal > IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso > - Campus Cáceres > Avenida dos Ramires, s/n > Bairro: Distrito Industrial > Cáceres - MT CEP: 78.200-000 > Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) > e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=e-mails%3Aalexandresanto…> > alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=alexandre.santos@cas.ifm…>====================================================================== > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/e2cfa427/atta… > > > > ------------------------------ > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > > Fim da Digest R-br, volume 21, assunto 47 > ***************************************** >

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Preencher um serie temporal
by Daniel Marcelino 21 Nov '12

21 Nov '12

Caros, Eu gostaria de expandir os dados abaixo para realizar uma análise temporal de base diária. O meu período inicial é '2012-07-01' até '2012-10-06'. É possível eu fazer isso com meu data frame ou eu terei que criar um novo data frame com a sequencia de dias e juntar as duas tabelas? Meu data frame final deveria repetir os valores apresentados nas colunas até que uma nova medida surgisse já que os pontos de medida que tenho são exporádicos. Alguém já expandiu um data frame assim pra me dizer como fazer? structure(list(Date.beg = structure(c(15635, 15617, 15615, 15610, 15609, 15605, 15604, 15601, 15593, 15593, 15586, 15581, 15580, 15577, 15572, 15565, 15552, 15540, 15530, 15516), class = "Date"), Date.end = structure(c(15619, 15619, 15616, 15615, 15610, 15607, 15604, 15602, 15595, 15594, 15587, 15582, 15581, 15579, 15572, 15567, 15554, 15541, 15533, 15517), class = "Date"), Pollster = structure(c(1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 4L, 1L, 2L, 1L, 1L, 2L, 1L, 4L, 1L, 2L, 2L, 1L, 3L, 1L), .Label = c("Datafolha", "Ibope", "Veritá", "Vox Populi"), class = "factor"), Serra.PSDB = c(24, 22, 23, 19, 22, 17, 17, 21, 19, 20, 21, 20, 22, 22, 27, 26, 26, 30, 31.4, 31), Russomanno.PRB = c(23, 22, 25, 27, 30, 34, 34, 35, 35, 32, 35, 31, 31, 31, 31, 26, 25, 26, 17.7, 24), Haddad.PT = c(20, 22, 19, 18, 18, 18, 17, 15, 15, 17, 16, 16, 14, 14, 8, 9, 6, 7, 9.5, 6), Chalita.PMDB = c(11, 11, 11, 10, 9, 7, 5, 8, 6, 8, 7, 5, 7, 5, 6, 5, 5, 6, 4.3, 6), Others = c(8, 7, 7, 4, 7, 6, 4, 5, 6, 7, 9, 5, 8, 6, 10, 12, 15, 15, 8.6, 16), Null = c(8, 8, 8, NA, 8, 10, 10, NA, 13, 9, 8, 12, 10, NA, 10, 12, 14, 11, 13.1, 11), Undecided = c(6, 8, 6, NA, 6, 8, 13, NA, 6, 7, 4, 9, 7, 13, 6, 10, 9, 6, 13.3, 5), Round = structure(c(3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 2L), .Label = c("year before", "off campaign", "first", "second"), class = "factor"), Stage = structure(c(2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), .Label = c("0", "1", "2"), class = "factor"), Serra.Haddad = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), .Label = c("", "1", "0"), class = "factor"), N = c(3959, 1204, 2099, 1204, 1799, 1204, 2000, 1802, 1001, 1221, 1078, 1001, 1069, 1200, 1077, 805, 805, 1075, 1331, 1081), Err = c(2, 3, 2, 3, 2, 3, 2.2, 2, 3, 3, 3, 3, 3, 2.8, 3, 3, 3, 3, 2.7, 3)), .Names = c("Date.beg", "Date.end", "Pollster", "Serra.PSDB", "Russomanno.PRB", "Haddad.PT", "Chalita.PMDB", "Others", "Null", "Undecided", "Round", "Stage", "Serra.Haddad", "N", "Err"), row.names = c("6", "7", "8", "9", "10", "11", "12", "13", "14", "15", "16", "17", "18", "19", "20", "21", "22", "23", "24", "25"), class = "data.frame") -- "Small steps toward a much better world"

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Usando o R em grandes bases de dados
by Daniel C Bezerra 21 Nov '12

21 Nov '12

Eu encontrei estas apresentações e achei legal dividir com vcs: http://goo.gl/l6fuC Tem link para os slides, código do R e tudo mais por lá. Abs, Daniel

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Re: [R-br] (sem assunto)
by Eder Comunello 20 Nov '12

20 Nov '12

Edson, boa noite! Desculpe a falta de atenção, mas na verdade por padrão o NA é desconsiderado. Você deve definir se quer computá-lo, valendo a dica do colega Fernando Mayer. Para demonstrar montei o script abaixo com os dados que vc forneceu... ### criando um objeto com seus dados h <- structure(list(id = 1:31, expect_exc = structure(c(1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 1L, 2L, 2L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 1L, 2L, 2L, 2L, 1L, 2L, 2L, 1L), .Label = c("não", "sim"), class = "factor"), motivo = structure(c(NA, 1L, 1L, 4L, 5L, 7L, NA, 2L, NA, 1L, 1L, 1L, 6L, 4L, 5L, 3L, 3L, 7L, 5L, 7L, 4L, 7L, 4L, 5L, 5L, 4L, 7L, 1L, 5L, 5L, NA), .Label = c("atendimento", "despertar", "espera por apto", "mensageiro", "recepção", "reserva", "todos"), class = "factor"), visitaria.novamente = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, NA, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, NA, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), .Label = "sim", class = "factor"), nao_pq = structure(c(NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, 2L, NA, NA, NA, NA, NA, 1L, 3L), .Label = c("agilidade na troca do apto", "falta de preparo", "hospitalidade e simpatia"), class = "factor")), .Names = c("id", "expect_exc", "motivo", "visitaria.novamente", "nao_pq"), class = "data.frame", row.names = c(NA, -31L)) ### término do objeto head(h) length(h$motivo) ### retorna 31 observações length(h$expect_exc) ### idem sum(table(h$motivo,h$expect_exc)) ### retorna 27 (pois os 4 NA ficaram de fora) table(h$motivo,h$expect_exc) ### tabela de dados sem NA sum(table(h$motivo,h$expect_exc,useNA='always')) ### inclui o NA e portanto retorna 31 observações table(h$motivo,h$expect_exc,useNA='always') ### tabela de dados com NA 100*prop.table(table(h$motivo,h$expect_exc)) ### logo estes valores não consideram o NA (27 obs) 100*prop.table(table(h$motivo,h$expect_exc, useNA='always')) ### como fica se considerar o NA (31 obs) Roda aí pra confirmar! ================================================ Éder Comunello Ph.D. Student in Agricultural Systems Engineering (USP/ESALQ) Piracicaba, SP, Brazil [22 42.7'S, 47 37.8'W] Researcher at Embrapa Western Region Agriculture Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W] ================================================ UTC-03:00 Em 20 de novembro de 2012 16:51, <r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br-request@listas.c3sl…> > escreveu: > Enviar submissões para a lista de discussão R-br para > r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou > corpo da mensagem para > r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br-request@listas.c3sl…> > > Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo > endereço > r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br-owner@listas.c3sl.u…> > > Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será > mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." > > > Tópicos de Hoje: > > 1. Re: excluir mar no ETOPO (Thiago Veloso) > 2. Re: excluir mar no ETOPO (D'Apolito) > 3. Graficos de decomposição (kaue veras) > 4. Re: Gráfico de distribuiçoes estimadas (Matheus Monteiro) > 5. Re: (sem assunto) (Edson Lira) > 6. Re: Usando o R em grandes bases de dados (Leonard de Assis) > 7. matrizes de correlação (alanarocha(a)sapo.pt<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=alanarocha@sapo.pt> > ) > 8. ExpDes - Comparações múltiplas (Andre Oliveira) > 9. Re: ExpDes - Comparações múltiplas (Walmes Zeviani) > 10. Re: Dúvida sobre IC simultâneos para modelagem de variáveis > binarias no R (multcomp) (Walmes Zeviani) > 11. Re: Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux Ubuntu > 10.04 (Andre Oliveira) > 12. Re: Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux Ubuntu > 10.04 (Andre Oliveira) > 13. Dúvida em summary em regressão logística (Alexandre Santos) > 14. Dúvida em summary em regressão logística (Alexandre Santos) > > > ---------------------------------------------------------------------- > > Message: 1 > Date: Tue, 20 Nov 2012 07:22:57 -0800 (PST) > From: Thiago Veloso <thi_veloso(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=thi_veloso@yahoo.com.br> > > > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > Subject: Re: [R-br] excluir mar no ETOPO > Message-ID: > <1353424977.92989.YahooMailNeo(a)web121903.mail.ne1.yahoo.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1353424977.92989.YahooMa…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Carlos, > > Eu tentaria algo assim: > > library (raster) #carrega pacote exigido > r <- raster('ETOPO1_Ice_g_geotiff.tif') #carrega arquivo de trabalho > r [ r<0 ] <- NA #atribui NA a todos os valores negativos no raster. > > E caso você queira atribuir NA a um escopo de valores, pode ser mais fácil > criar uma função: > > > vals <- c(0,24,32,56) # estes são os valores que você quer eliminar da > tabela de dados do raster > fun <- function (x) { > x <- ifelse (x %in% vals, 1, NA) # aqui você substitui os valores acima > por "1" e atribui NA para todo o resto. Você pode substituir o "1" por vals > } > > E então aplicá-la sobre o raster: > r.new <- calc (r, fun) > > > Uma vantagem de usar funções é pode realizar uma tarefa para diversos > arquivos sem precisar repetir comandos para cada um deles. > > Espero que ajude, > Thiago. > > > ________________________________ > From: D'Apolito <carlosdapolito(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=carlosdapolito@gmail.com> > > > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Sent: Monday, November 19, 2012 8:15 PM > Subject: [R-br] excluir mar no ETOPO > > > Prezados, > > Estou graficando mapas com os dados do ETOPO01 de elevação e gostaria de > excluir o mar, para que os dados iniciem em zero ao invés de números > negativos (profundidades dos oceanos). > Qualquer ajuda é bem vinda, desde já agradeço > > Att > Carlos > > #código: > > library(raster) > library(rgdal) > > etopo<-"ETOPO1_Ice_g_geotiff.tif" > r.etopo<-raster(etopo) > > ext <- extent(-95,-35,-31,31) > > zoom(r.etopo, ext=ext,col=rev(gray.colors(12))) > > > > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/675bda4e/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 2 > Date: Tue, 20 Nov 2012 15:22:24 +0000 > From: "D'Apolito" <carlosdapolito(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=carlosdapolito@gmail.com> > > > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] excluir mar no ETOPO > Message-ID: > <CAObczOaGmp3ug9u_ktRu7ZfSgoQ3XUFD9V8yg= > 440j-wZhVkuQ(a)mail.gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=440j-wZhVkuQ@mail.gmail.…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Ola Eder, > > O arquivo de origem dos dados (ETOPO1) `e muito grande, de maneira que > tenho obtido erro constantemente, Tentei aumentar a capacidade da memoria > com memory.limit() mas tambem nao funcionou. > > > att > Carlos > > > Em 20 de novembro de 2012 11:30, Eder Comunello <ecomunel(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ecomunel@gmail.com> > >escreveu: > > > Carlos e colegas, bom dia! > > > > Vou aproveitar um script anterior, fazendo algumas alterações. Como da > > outra vez, creio que dá pra adaptar facilmente pro seu caso. > > > > Vou trabalhar extraindo o vetor de interesse, substituindo este vetor no > > objeto origem ao final... > > > > ##### <begin> ##### > > require(sp); require(rgdal) > > > > ### Download do exemplo (399 Kb) > > download.file('https://dl.dropbox.com/u/117618178/dourados/DDOS.tif', > > file.path(getwd(),'DDOS.tif'), mode='wb') > > > > alt = readGDAL("DDOS.tif"); gridded(alt) ### 'importa' o geotiff > > image(alt, col=terrain.colors(21)) ## visualização > > slotNames(alt) ### nome dos slots (S4) > > proj4string(alt) ### projeçãoo definida no geotiff > > head(alt@data) ### observe os valores dos dados > > head(alt@data$band1) ### observe os valores dos dados > > > > ### Opção para fatiar (0 ou 1) > > > > alt2 <- alt ### para manipular uma cópia do objeto > > z <- alt2@data$band1 ### para manipular apenas o vetor de interesse > > n <- length(z); n > > > > for(i in 1:n){if (z[i]<400){z[i]=0} else{z[i]=1}}; head(z) ### 0 ou 1 > > alt2@data$band1 <- z ### substitui o vetor manipulado no objeto > > image(alt2) ## visualização > > > > ### Opção para mascarar valores abaixo de critério (com 0 ou NA) > > > > alt3 <- alt ### para manipular outra cópia do objeto > > z <- alt3@data$band1 ### para manipular apenas o vetor de interesse > > n <- length(z); n > > > > for(i in 1:n){if (z[i]<400){z[i]=0}}; head(z) ### 0 ou 1 > > #for(i in 1:n){if (z[i]<400){z[i]=NA}}; head(z) ### 0 ou 1 > > alt3@data$band1 <- z ### substitui o vetor manipulado no objeto > > image(alt3) ## visualização > > ##### <end> ##### > > > > > > ================================================ > > Éder Comunello > > > > Ph.D. Student in Agricultural Systems Engineering (USP/ESALQ) > > Piracicaba, SP, Brazil [22 42.7'S, 47 37.8'W] > > > > Researcher at Embrapa Western Region Agriculture > > Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W] > > ================================================ > > UTC-03:00 > > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > > código mínimo reproduzível. > > > > > > -- > _____________________________________ > *Carlos D'Apolito - PhD candidate - ID:1239480* > Earth Sciences > School of Geography & Environmental Sciences > Aston Webb Building > University of Birmingham > Birmingham > B15 2TT > UK > > phone: 44 - 07 919 673 173 > CXD280(a)bham.ac.uk<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=CXD280@bham.ac.uk> > CV: http://lattes.cnpq.br/4557754746424026 > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/615af15d/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 3 > Date: Tue, 20 Nov 2012 14:14:30 -0200 > From: kaue veras <kaueveras(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=kaueveras@gmail.com> > > > To: R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: [R-br] Graficos de decomposição > Message-ID: > <CAENvtmjrMnC52i4-JYn2NdhrwWMNw= > Qu0HJLeTOqz2s5q2i6uQ(a)mail.gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=Qu0HJLeTOqz2s5q2i6uQ@mai…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Boa tarde prezados, > > Estou realizando um trabalho em que utilizo a decomposição, análises de > previsão usando o modelo ARIMA e Holt-Winters e goataria de mudar os > títulos do gráfico e titulos dos eixos. Com os comandos main, xlab e ylab > não esta dando certo, poderiam me dar uma luz ou me ajudar como faço para > gerar essas modificações? > > Desde já agradeço. > > Atenciosamente, > > Kauê P. Veras da Cunha > Estatística - UERJ > MSN: kaueveras(a)hotmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=kaueveras@hotmail.com> > E-mail: kaueveras(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=kaueveras@gmail.com> > Cel: (21) 8254-9601 > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/1154d3e8/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 4 > Date: Tue, 20 Nov 2012 14:34:00 -0200 > From: Matheus Monteiro <matheusmont(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=matheusmont@gmail.com> > > > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] Gráfico de distribuiçoes estimadas > Message-ID: > < > CAAG8985KZaYb24ckqaGFxeon85H3g18ny9gEtBc79DXK7p8mcg(a)mail.gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=CAAG8985KZaYb24ckqaGFxeo…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > mais alguem pode me ajudar? > > Em 10 de novembro de 2012 13:21, Edson Lira <edinhoestat(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=edinhoestat@yahoo.com.br> > >escreveu: > > > Mateus, no pacote MASS acho que tem alguns gráficos empírica x teórica. > > > > [. ]'s. > > Edson Lira > > Estatístico > > Ma-Am > > > > Em 10/11/2012, às 02:20, Matheus Monteiro <matheusmont(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=matheusmont@gmail.com> > > > > escreveu: > > > > Boa noite, obtive as densidades aproximadas da 't' e da 'normal', > gostaria > > de compara-las através de graficos dessas densidades estimadas. > > Alguma sugestão, como faria isso? > > > > *t * > > > > > fitdistr(x[,1],"t") > > > > m s df > > > > -0.001874414 0.009122738 3.522064232 > > > > ( 0.001726835) ( 0.001862692) ( 2.234067399)* > > > > **normal* > > > > fitdistr(x[,1],"normal") > > > > mean sd > > > > 0.0001040816 0.0128201843 > > > > (0.0018314549) (0.0012950342) > > > > > > x são dados simulados. > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > > código mínimo reproduzível. > > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > > código mínimo reproduzível. > > > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/1c03edac/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 5 > Date: Tue, 20 Nov 2012 09:06:00 -0800 (PST) > From: Edson Lira <edinhoestat(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=edinhoestat@yahoo.com.br> > > > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > Subject: Re: [R-br] (sem assunto) > Message-ID: > <1353431160.32913.YahooMailNeo(a)web161205.mail.bf1.yahoo.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1353431160.32913.YahooMa…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Mas Eder a idéia do NA é não considerar estas respostas na contagem e/ou > no percentual. > > Mas valeu e muito obrigado. > > Peço desculpas a todos, esqueci de colocar o assunto na mensagem > > Edson Lira > Estatístico > Manaus-Amazonas > > > ________________________________ > De: Eder Comunello <ecomunel(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ecomunel@gmail.com> > > > Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Enviadas: Terça-feira, 20 de Novembro de 2012 7:39 > Assunto: Re: [R-br] (sem assunto) > > > Edson e colegas, bom dia! > > Ao invés de deixar o campo 'motivo' em branco (NA), experimente atribuir > um valor, p. ex. 'sem resposta', e rode novamente. Assim estes casos serão > considerados e aparecerão na saída. Vale pros outros campos. > > ================================================ > Éder Comunello > > Ph.D. Student in Agricultural Systems Engineering (USP/ESALQ) > Piracicaba, SP, Brazil [22 42.7'S, 47 37.8'W] > > Researcher at Embrapa Western Region Agriculture > Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W] > ================================================ > UTC-03:00 > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/a9ea6c58/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 6 > Date: Tue, 20 Nov 2012 15:30:17 -0200 > From: Leonard de Assis <assis.leonard(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=assis.leonard@gmail.com> > > > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] Usando o R em grandes bases de dados > Message-ID: <50ABBE29.4030805(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=50ABBE29.4030805@gmail.c…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed" > > Bigmemory eu acredito que lide somente com matrizes, não com data > frames, resumo: todos os campos devem ter o mesmo tipo. > > []s > Leonard de Assis > http://about.me/ldeassis > > Em 20/11/2012 03:06, Vinicius Brito Rocha escreveu: > > > > fiquei brincando com o bigmemory e carreguei uma tabela mas os campos > > character vieram como NA. > > > > Quando usava a opção type="char" piorava e alterava os valores dos > > campos numéricos. O melhor ( ou menos pior resultado) foi carregar a > > tabela com a opção type="double" > > > > Alguem sabe o que pode ser? > > > > > > Abs. > > > > Vinicius Brito Rocha > > > > Em 19 de novembro de 2012 15:40, Richard Santos > > <jamesrichardsantos(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=jamesrichardsantos@gmail…><mailto: > jamesrichardsantos(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=jamesrichardsantos@gmail…> > >> > > escreveu: > > > > Valeu!! Toda e qq ajuda nesse sentido é bem vinda! > > Abç. > > Richard > > > > Em 19/11/12, Daniel C Bezerra<danielcbezerra(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=danielcbezerra@gmail.com> > > <mailto:danielcbezerra@gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=danielcbezerra@gmail.com>>> > escreveu: > > > Eu encontrei estas apresentações e achei legal dividir com vcs: > > > > > > http://goo.gl/l6fuC > > > > > > Tem link para os slides, código do R e tudo mais por lá. > > > > > > Abs, > > > > > > Daniel > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br><mailto: > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e > > forneça código mínimo reproduzível. > > > > > > > > > > -- > > /Vinicius Brito Rocha./ > > /Estatístico e Atuário (IM / UFRJ)// > > Mestre em Pesquisa Operacional (COPPE / UFRJ)/ > > > > www.aplicademic.blogspot.com <http://www.aplicademic.blogspot.com> > > http://twitter.com/viniciusbritor > > > > "Não se preocupe muito com as suas dificuldades em Matemática, posso > > assegurar-lhe que as minhas são ainda maiores." - Albert Einstein. > > > > > > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/b8d49acf/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 7 > Date: Tue, 20 Nov 2012 17:51:25 +0000 > From: alanarocha(a)sapo.pt<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=alanarocha@sapo.pt> > To: R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: [R-br] matrizes de correlação > Message-ID: > <20121120175125.Horde.X_LLT3CXF3VQq8MdQ0ASvYA(a)mail.sapo.pt<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=20121120175125.Horde.X_L…> > > > Content-Type: text/plain; charset=UTF-8; format=flowed; DelSp=Yes > > Olá, a actualização do R resultou para o meu problema. > agora preciso de ajuda pois tou a tentar fazer uma matriz de > correlação e outra de covariancias de 4 variaveis de um dataframe e > dame estes erros: > ##matriz de correlação > > cor.p<-cor.ps(dados[,2:4], Pearson=TRUE,NAs=TRUE) > cor.p > dados=na.omit(dados[,2:4]) > > cat("valores NA retirados\n") > x11() > pairs(dados) > x11() > boxplot(dados) > dados=dados[,2:4] > x11() > boxplot(dados) > correl=cor(dados[2:4]) > result=correl > return(list(sumario=summary(dados),resultado=result)) > cor(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12)) > cor.test(dados[,2:4], method='pearson')$p.value > cor_with_p_test(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12)) > ct <- cor.test(X1s10, X1s12) > ct$p > ct$v > > #matriz de covariancias > cov(dados[,2:4], na.rm=TRUE) > > > > cor.p<-cor.ps(dados[,2:4], Pearson=TRUE,NAs=TRUE) > Error: could not find function "cor.ps" > > cor.p > Error: object 'cor.p' not found > > dados=na.omit(dados[,2:4]) > > > > cat("valores NA retirados\n") > valores NA retirados > > > > > > > > > > correl=cor(dados[2:4]) > Error in `[.data.frame`(dados, 2:4) : undefined columns selected > > result=correl > Error: object 'correl' not found > > return(list(sumario=summary(dados),resultado=result)) > Error: object 'result' not found > > cor(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12)) > Error in cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12) : object 'X1s09' not found > > cor.test(dados[,2:4], method='pearson')$p.value > Error in `[.data.frame`(dados, , 2:4) : undefined columns selected > > cor_with_p_test(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12)) > Error: could not find function "cor_with_p_test" > > ct <- cor.test(X1s10, X1s12) > Error in cor.test(X1s10, X1s12) : object 'X1s10' not found > > ct$p > Error: object 'ct' not found > > ct$v > Error: object 'ct' not found > > > > #matriz de covariancias > > cov(dados[,2:4], na.rm=TRUE) > Error in cov(dados[, 2:4], na.rm = TRUE) : > unused argument(s) (na.rm = TRUE) > > > cumprimentos e obrigada Ana Rocha > > > > > > ------------------------------ > > Message: 8 > Date: Tue, 20 Nov 2012 09:57:15 -0800 (PST) > From: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > Subject: [R-br] ExpDes - Comparações múltiplas > Message-ID: > <1353434235.56527.YahooMailNeo(a)web125902.mail.ne1.yahoo.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1353434235.56527.YahooMa…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Boa tarde, > estou aqui tentando reproduzir algumas análises do ExpDes. A analise > abaixo não me deu as comparações múltiplas como faço para tais comparações? > > require(ExpDes) > Carregando pacotes exigidos: ExpDes > data(ex1) > attach(ex1) > dic(trat, ig, quali = FALSE, sigF = 0.05) > > > > André Oliveira Souza > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/696d59ab/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 9 > Date: Tue, 20 Nov 2012 16:24:10 -0200 > From: Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=walmeszeviani@gmail.com> > > > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>, > Andre Oliveira > <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > Subject: Re: [R-br] ExpDes - Comparações múltiplas > Message-ID: > <CAFU= > EkZQNQHMTUM2nUKMnJhKTcCoDJ7ngqJ+_69-XZ6mf3FJDQ(a)mail.gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=EkZQNQHMTUM2nUKMnJhKTcCo…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Você usou quali=FALSE, ou seja, está declarando que os níveis são não > qualitativos. Use quali=TRUE e leia o manual. > > À disposição. > Walmes. > > ========================================================================== > Walmes Marques Zeviani > LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) > Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná > fone: (+55) 41 3361 3573 > VoIP: (3361 3600) 1053 1173 > e-mail: walmes(a)ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=walmes@ufpr.br> > skype: walmeszeviani > twitter: @walmeszeviani > homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes > linux user number: 531218 > ========================================================================== > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/6b5bc51b/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 10 > Date: Tue, 20 Nov 2012 16:28:49 -0200 > From: Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=walmeszeviani@gmail.com> > > > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] Dúvida sobre IC simultâneos para modelagem de > variáveis binarias no R (multcomp) > Message-ID: > <CAFU=EkYKvcE65FEpjv=qb0xnJ=mME7ec_8c7DD28wQNPF= > 1_yg(a)mail.gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1_yg@mail.gmail.com> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Seu exemplo não é reproduzível. O guia de postagem não recomenda envio de > dados como anexo das mensagens. Hospede os dados na núvem e acrescente > comandos para leitura do arquivo. Assim rapidamente podemos reproduzir sua > análise e ajudar você. > > À disposição. > Walmes. > > ========================================================================== > Walmes Marques Zeviani > LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) > Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná > fone: (+55) 41 3361 3573 > VoIP: (3361 3600) 1053 1173 > e-mail: walmes(a)ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=walmes@ufpr.br> > skype: walmeszeviani > twitter: @walmeszeviani > homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes > linux user number: 531218 > ========================================================================== > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/7d4a7d34/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 11 > Date: Tue, 20 Nov 2012 10:30:37 -0800 (PST) > From: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > To: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > >, > "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > Subject: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > Message-ID: > <1353436237.16303.YahooMailNeo(a)web125901.mail.ne1.yahoo.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1353436237.16303.YahooMa…> > > > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Versão ExpDes_1.1.1.tar.gz agora sim consegui instalar no linux. > > > > André Oliveira Souza > > > ________________________________ > De: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > Para: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > > > Enviadas: Quinta-feira, 5 de Janeiro de 2012 11:05 > Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > > > O Walmes me disse, aqui mesmo na lista, ha algum tempo que realmente o > pacote para linux em português ele não consegui colocar para funcionar. E > no caso do windows eu não sabia que estava em inglês! Obrigado > > > > André Oliveira Souza > > > ________________________________ > De: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > > > Para: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > Enviadas: Quinta-feira, 5 de Janeiro de 2012 10:55 > Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > > > Olá Andre, > > Que bom que não desistiu. Vamos por partes que solucionaremos todos os > seus problemas. > Quanto ao Windows, > não se esqueça que a versão do CRAN está em ingles. Portanto, após > carregar, voce deve pedir o help da função cdr (completely randomized > design) e não dic, ou seja > ?crd > Veja se funciona. > > > Quanto ao linux, talvez voce deva escrever para o Walmes, que faz parte > dessa lista. Ele usa o ExpDes no Linux e diz que funciona perfeitamente. > > abs > > Eric. > > > Em 5 de janeiro de 2012 10:42, Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br>> > escreveu: > > Eric, > > > >eu acompanhei o pacote no seu site e nunca consegui coloca-lo para > funcionar no Linux a versão em português. Agora com ele no CRAN voltei a > tentar colocar o pacote para funcionar no Linux, mas sem sucesso. E para > minha surpresa no windows não está funcionado também. Olha a minha > tentativa no windows! > >require(ExpDes) > >Carregando pacotes exigidos: ExpDes > >> ?dic > >No documentation for ?dic? in specified packages and libraries: > >you could try ???dic? > > > > > > Estou ansioso para colocar este pacote para funcionar por aqui. Já li o > TCC e o manual sobre o mesmo e vi a importância do mesmo. Visto que antes > tinha que usar muitos pacotes para a mesma análise e com o ExpDes é muito > mais prático. > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > >André Oliveira Souza > > > > > > > > > > > > > >________________________________ > > De: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > > > >Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>; > Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > >Enviadas: Quarta-feira, 4 de Janeiro de 2012 18:25 > >Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (EspDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > > > > > >Olá André, > > > >Se quiser trocar uma ideia em particular, posso tentar te ajudar. Sou o > criador do ExpDes, mas não usu Linux. Não sei se serei útil. > > > >A princípio, posso te dizer que existe o pacote no CRAN e na minha página > pessoal: https://sites.google.com/site/ericbferreira/unifal/downloads-1 > > > >Tente pegar o pacote de lá para ver se o erro se repete. > >Peço gentilmente aos usuárioas de (R no) Linux que me ajudem a exclarecer > o André. > > > >Atenciosamente, > > > >Eric. > > > > > >Em 4 de janeiro de 2012 16:39, Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br>> > escreveu: > > > >Opa vacilo meu erro no nome do pacote > >> > >> > >> install.packages("ExpDes", dep=T) > >> > >> > >> > >> > >> > >> > >>André Oliveira Souza > >> > >> > >>________________________________ > >> De: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > >>Para: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > >>Enviadas: Quarta-feira, 4 de Janeiro de 2012 16:36 > >>Assunto: [R-br] Problema para reinstalar pacote (EspDes) no Linux Ubuntu > 10.04 > >> > >> > >> > >>Pessoal estou com problemas para reinstalar o EspDes !! Alguém saberia > dizer o que pode ser? > >> > >> > >> > >> > >>install.packages("EspDes", dep=T) > >>Installing package(s) into ?/home/andre/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.14? > >>(as ?lib? is unspecified) > >>--- Please select a CRAN mirror for use in this session --- > >>Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto > >>Mensagens de aviso perdidas: > >>In getDependencies(pkgs, dependencies, available, lib) : > >> package ?EspDes? is not available (for R version 2.14.1) > >> > >> > >> > >> > >> > >> > >> > >>André Oliveira Souza > >>obrigado > >> > >> > >>_______________________________________________ > >>R-br mailing list > >>R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > >>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > >> > >> > >>_______________________________________________ > >>R-br mailing list > >>R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > >>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > >> > > > > > >-- > >Dr Eric B Ferreira > >Exact Sciences Department > >Federal University of Alfenas > >Brazil > > > > > > > > > -- > Dr Eric B Ferreira > Exact Sciences Department > Federal University of Alfenas > Brazil > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/20c67bb9/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 12 > Date: Tue, 20 Nov 2012 10:37:54 -0800 (PST) > From: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>>, > Eric > Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > > > Subject: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > Message-ID: > <1353436674.31607.YahooMailNeo(a)web125904.mail.ne1.yahoo.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1353436674.31607.YahooMa…> > > > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Em português no linux! > > André Oliveira Souza > > > ________________________________ > De: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > Para: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com>>; > "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > Enviadas: Terça-feira, 20 de Novembro de 2012 16:30 > Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > > > Versão ExpDes_1.1.1.tar.gz agora sim consegui instalar no linux. > > > > André Oliveira Souza > > > ________________________________ > De: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > Para: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > > > Enviadas: Quinta-feira, 5 de Janeiro de 2012 11:05 > Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > > > O Walmes me disse, aqui mesmo na lista, ha algum tempo que realmente o > pacote para linux em português ele não consegui colocar para funcionar. E > no caso do windows eu não sabia que estava em inglês! Obrigado > > > > André Oliveira Souza > > > ________________________________ > De: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > > > Para: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > Enviadas: Quinta-feira, 5 de Janeiro de 2012 10:55 > Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > > > Olá Andre, > > Que bom que não desistiu. Vamos por partes que solucionaremos todos os > seus problemas. > Quanto ao Windows, > não se esqueça que a versão do CRAN está em ingles. Portanto, após > carregar, voce deve pedir o help da função cdr (completely randomized > design) e não dic, ou seja > ?crd > Veja se funciona. > > > Quanto ao linux, talvez voce deva escrever para o Walmes, que faz parte > dessa lista. Ele usa o ExpDes no Linux e diz que funciona perfeitamente. > > abs > > Eric. > > > Em 5 de janeiro de 2012 10:42, Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br>> > escreveu: > > Eric, > > > >eu acompanhei o pacote no seu site e nunca consegui coloca-lo para > funcionar no Linux a versão em português. Agora com ele no CRAN voltei a > tentar colocar o pacote para funcionar no Linux, mas sem sucesso. E para > minha surpresa no windows não está funcionado também. Olha a minha > tentativa no windows! > >require(ExpDes) > >Carregando pacotes exigidos: ExpDes > >> ?dic > >No documentation for ?dic? in specified packages and libraries: > >you could try ???dic? > > > > > > Estou ansioso para colocar este pacote para funcionar por aqui. Já li o > TCC e o manual sobre o mesmo e vi a importância do mesmo. Visto que antes > tinha que usar muitos pacotes para a mesma análise e com o ExpDes é muito > mais prático. > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > >André Oliveira Souza > > > > > > > > > > > > > >________________________________ > > De: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=ericbferreira@gmail.com> > > > >Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>; > Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > >Enviadas: Quarta-feira, 4 de Janeiro de 2012 18:25 > >Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (EspDes) no Linux > Ubuntu 10.04 > > > > > >Olá André, > > > >Se quiser trocar uma ideia em particular, posso tentar te ajudar. Sou o > criador do ExpDes, mas não usu Linux. Não sei se serei útil. > > > >A princípio, posso te dizer que existe o pacote no CRAN e na minha página > pessoal: https://sites.google.com/site/ericbferreira/unifal/downloads-1 > > > >Tente pegar o pacote de lá para ver se o erro se repete. > >Peço gentilmente aos usuárioas de (R no) Linux que me ajudem a exclarecer > o André. > > > >Atenciosamente, > > > >Eric. > > > > > >Em 4 de janeiro de 2012 16:39, Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br>> > escreveu: > > > >Opa vacilo meu erro no nome do pacote > >> > >> > >> install.packages("ExpDes", dep=T) > >> > >> > >> > >> > >> > >> > >>André Oliveira Souza > >> > >> > >>________________________________ > >> De: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=andreolsouza@yahoo.com.br> > > > >>Para: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > >>Enviadas: Quarta-feira, 4 de Janeiro de 2012 16:36 > >>Assunto: [R-br] Problema para reinstalar pacote (EspDes) no Linux Ubuntu > 10.04 > >> > >> > >> > >>Pessoal estou com problemas para reinstalar o EspDes !! Alguém saberia > dizer o que pode ser? > >> > >> > >> > >> > >>install.packages("EspDes", dep=T) > >>Installing package(s) into ?/home/andre/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.14? > >>(as ?lib? is unspecified) > >>--- Please select a CRAN mirror for use in this session --- > >>Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto > >>Mensagens de aviso perdidas: > >>In getDependencies(pkgs, dependencies, available, lib) : > >> package ?EspDes? is not available (for R version 2.14.1) > >> > >> > >> > >> > >> > >> > >> > >>André Oliveira Souza > >>obrigado > >> > >> > >>_______________________________________________ > >>R-br mailing list > >>R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > >>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > >> > >> > >>_______________________________________________ > >>R-br mailing list > >>R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > >>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > >> > > > > > >-- > >Dr Eric B Ferreira > >Exact Sciences Department > >Federal University of Alfenas > >Brazil > > > > > > > > > -- > Dr Eric B Ferreira > Exact Sciences Department > Federal University of Alfenas > Brazil > > > > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/6a5b8ac7/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 13 > Date: Tue, 20 Nov 2012 10:49:58 -0800 (PST) > From: Alexandre Santos <alexandresantosbr(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=alexandresantosbr@yahoo.…> > > > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > Subject: [R-br] Dúvida em summary em regressão logística > Message-ID: > <1353437398.81186.YahooMailNeo(a)web121206.mail.ne1.yahoo.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1353437398.81186.YahooMa…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Boa tarde Pessoal, > Estou ajustando uma regressão logística e me deparei com a seguinte > dúvida: > > > ################################################################################################### > #Regressão logística entre a proporção de herbívoros predados e a > densidade de herbívoros oferecidos > # > pred<-c(1,2,2,3,1,4,2,3,2,3,5,6,5,5,3,7,7,6,2 > ,3,15,12,14,12,11,11,11,13,13,13,18,14,27,26 > ,17,18,20,22,10,15,29,30,36,40,23,50,30,40,29,52)##Número de herbívoros > predados > dens<-sort(rep(2^(2:6),10))#### Densidade de herbivoros oferecidos > ## > ##Regressão pred/dens = exp(P0+P1*N+P2*N^2+P3*N3)/1+ > exp(P0+P1*N+P2*N^2+P3*N3) > p.model1<-glm(pred/par~dens+I(dens^2)+I(dens^3),family="binomial") > summary(p.model1) > # > > > Minha dúvida é se o coeficiente linear que aparece no summary esta > transformado em exp(x)/1+exp(x) > ou trata-se do valor sem transformação? > > Obrigado, > > -- > ====================================================================== > Alexandre dos Santos > Proteção Florestal > IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso > - Campus Cáceres > Avenida dos Ramires, s/n > Bairro: Distrito Industrial > Cáceres - MT CEP: 78.200-000 > Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) > e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=e-mails%3Aalexandresanto…> > alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=alexandre.santos@cas.ifm…>====================================================================== > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/0b764a8d/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 14 > Date: Tue, 20 Nov 2012 10:51:20 -0800 (PST) > From: Alexandre Santos <alexandresantosbr(a)yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=alexandresantosbr@yahoo.…> > > > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>" > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > > Subject: [R-br] Dúvida em summary em regressão logística > Message-ID: > <1353437480.93196.YahooMailNeo(a)web121202.mail.ne1.yahoo.com<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=1353437480.93196.YahooMa…> > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Boa tarde Pessoal, > Estou ajustando uma regressão logística e me deparei com a seguinte > dúvida: > > > ################################################################################################### > #Regressão logística entre a proporção de herbívoros predados e a > densidade de herbívoros oferecidos > # > pred<-c(1,2,2,3,1,4,2,3,2,3,5,6,5,5,3,7,7,6,2 > ,3,15,12,14,12,11,11,11,13,13,13,18,14,27,26 > ,17,18,20,22,10,15,29,30,36,40,23,50,30,40,29,52)##Número de herbívoros > predados > dens<-sort(rep(2^(2:6),10))#### Densidade de herbivoros oferecidos > ## > ##Regressão pred/dens = exp(P0+P1*N+P2*N^2+P3*N3)/1+ > exp(P0+P1*N+P2*N^2+P3*N3) > p.model1<-glm(pred/par~dens+I(dens^2)+I(dens^3),family="binomial") > summary(p.model1) > # > > > Minha dúvida é se o coeficiente linear que aparece no summary esta > transformado em exp(x)/1+exp(x) > ou trata-se do valor sem transformação? > > Obrigado, > > -- > ====================================================================== > Alexandre dos Santos > Proteção Florestal > IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso > - Campus Cáceres > Avenida dos Ramires, s/n > Bairro: Distrito Industrial > Cáceres - MT CEP: 78.200-000 > Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) > e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=e-mails%3Aalexandresanto…> > alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=alexandre.santos@cas.ifm…>====================================================================== > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/e2cfa427/atta… > > > > ------------------------------ > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br<https://mail.google.com/mail/?view=cm&fs=1&tf=1&to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > > Fim da Digest R-br, volume 21, assunto 47 > ***************************************** >

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Dúvida em summary em regressão logística
by Alexandre Santos 20 Nov '12

20 Nov '12

Boa tarde Pessoal, Estou ajustando uma regressão logística e me deparei com a seguinte dúvida: ################################################################################################### #Regressão logística entre a proporção de herbívoros predados e a densidade de herbívoros oferecidos # pred<-c(1,2,2,3,1,4,2,3,2,3,5,6,5,5,3,7,7,6,2 ,3,15,12,14,12,11,11,11,13,13,13,18,14,27,26 ,17,18,20,22,10,15,29,30,36,40,23,50,30,40,29,52)##Número de herbívoros predados dens<-sort(rep(2^(2:6),10))#### Densidade de herbivoros oferecidos ## ##Regressão pred/dens = exp(P0+P1*N+P2*N^2+P3*N3)/1+ exp(P0+P1*N+P2*N^2+P3*N3) p.model1<-glm(pred/par~dens+I(dens^2)+I(dens^3),family="binomial") summary(p.model1) # Minha dúvida é se o coeficiente linear que aparece no summary esta transformado em exp(x)/1+exp(x) ou trata-se do valor sem transformação? Obrigado, -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso - Campus Cáceres Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br ======================================================================

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Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux Ubuntu 10.04
by Andre Oliveira 20 Nov '12

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Versão ExpDes_1.1.1.tar.gz agora sim consegui instalar no linux. André Oliveira Souza ________________________________ De: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br> Para: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com> Enviadas: Quinta-feira, 5 de Janeiro de 2012 11:05 Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux Ubuntu 10.04 O Walmes me disse, aqui mesmo na lista, ha algum tempo que realmente o pacote para linux em português ele não consegui colocar para funcionar. E no caso do windows eu não sabia que estava em inglês! Obrigado André Oliveira Souza ________________________________ De: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com> Para: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br> Enviadas: Quinta-feira, 5 de Janeiro de 2012 10:55 Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux Ubuntu 10.04 Olá Andre, Que bom que não desistiu. Vamos por partes que solucionaremos todos os seus problemas. Quanto ao Windows, não se esqueça que a versão do CRAN está em ingles. Portanto, após carregar, voce deve pedir o help da função cdr (completely randomized design) e não dic, ou seja ?crd Veja se funciona. Quanto ao linux, talvez voce deva escrever para o Walmes, que faz parte dessa lista. Ele usa o ExpDes no Linux e diz que funciona perfeitamente. abs Eric. Em 5 de janeiro de 2012 10:42, Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br> escreveu: Eric, > >eu acompanhei o pacote no seu site e nunca consegui coloca-lo para funcionar no Linux a versão em português. Agora com ele no CRAN voltei a tentar colocar o pacote para funcionar no Linux, mas sem sucesso. E para minha surpresa no windows não está funcionado também. Olha a minha tentativa no windows! >require(ExpDes) >Carregando pacotes exigidos: ExpDes >> ?dic >No documentation for ‘dic’ in specified packages and libraries: >you could try ‘??dic’ > > > Estou ansioso para colocar este pacote para funcionar por aqui. Já li o TCC e o manual sobre o mesmo e vi a importância do mesmo. Visto que antes tinha que usar muitos pacotes para a mesma análise e com o ExpDes é muito mais prático. > > > > > > > > > > >André Oliveira Souza > > > > > > >________________________________ > De: Eric Ferreira <ericbferreira(a)gmail.com> >Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br; Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br> >Enviadas: Quarta-feira, 4 de Janeiro de 2012 18:25 >Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (EspDes) no Linux Ubuntu 10.04 > > >Olá André, > >Se quiser trocar uma ideia em particular, posso tentar te ajudar. Sou o criador do ExpDes, mas não usu Linux. Não sei se serei útil. > >A princípio, posso te dizer que existe o pacote no CRAN e na minha página pessoal: https://sites.google.com/site/ericbferreira/unifal/downloads-1 > >Tente pegar o pacote de lá para ver se o erro se repete. >Peço gentilmente aos usuárioas de (R no) Linux que me ajudem a exclarecer o André. > >Atenciosamente, > >Eric. > > >Em 4 de janeiro de 2012 16:39, Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br> escreveu: > >Opa vacilo meu erro no nome do pacote >> >> >> install.packages("ExpDes", dep=T) >> >> >> >> >> >> >>André Oliveira Souza >> >> >>________________________________ >> De: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br> >>Para: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> >>Enviadas: Quarta-feira, 4 de Janeiro de 2012 16:36 >>Assunto: [R-br] Problema para reinstalar pacote (EspDes) no Linux Ubuntu 10.04 >> >> >> >>Pessoal estou com problemas para reinstalar o EspDes !! Alguém saberia dizer o que pode ser? >> >> >> >> >>install.packages("EspDes", dep=T) >>Installing package(s) into ‘/home/andre/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.14’ >>(as ‘lib’ is unspecified) >>--- Please select a CRAN mirror for use in this session --- >>Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto >>Mensagens de aviso perdidas: >>In getDependencies(pkgs, dependencies, available, lib) : >> package ‘EspDes’ is not available (for R version 2.14.1) >> >> >> >> >> >> >> >>André Oliveira Souza >>obrigado >> >> >>_______________________________________________ >>R-br mailing list >>R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. >> >> >>_______________________________________________ >>R-br mailing list >>R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. >> > > >-- >Dr Eric B Ferreira >Exact Sciences Department >Federal University of Alfenas >Brazil > > > -- Dr Eric B Ferreira Exact Sciences Department Federal University of Alfenas Brazil

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Dúvida sobre IC simultâneos para modelagem de variáveis binarias no R (multcomp)
by Gilenio Borges Fernandes 20 Nov '12

20 Nov '12

Prezados(as) Precisamos de ajuda no seguinte problema: Estamos ajustando um modelo de transição em dados binários longitudinais, usando a resposta imediatamente anterior como covariavel. Os dados estão no arquivo "d_dogs.txt" em anexo. O interesse é construir IC simultâneos para as probabilidades condicionais. d1=read.table("d_dogs.txt", header=T, quote="\"") attach(d1) gmod1 <- glm(y ~ Trat+y_ant, data = d1, family = binomial()) summary(gmod1) ########################################################### library(multcomp) gmod1_ci <- confint(glht(gmod1, linfct = mcp(Trat = "Tukey",covariate_average = TRUE))) gmod1_ci$confint <- apply(gmod1_ci$confint, 2, binomial()$linkinv) gmod1_ci$confint apply(gmod1_ci$confint, 2, binomial()$linkinv) plot(gmod1_ci, xlab = "Media da Prob marginal", xlim = c(0, 1)) A dúvida é a seguinte: > apply(gmod1_ci$confint, 2, binomial()$linkinv) Estimate lwr upr B - A 0.5615396 0.5062051 0.6919771 C - A 0.7310586 0.5000000 0.7310586 D - A 0.5439900 0.5035155 0.6819754 C - B 0.7310586 0.5000000 0.7310586 D - B 0.5973698 0.5089817 0.7148991 D - C 0.5000000 0.5000000 0.7310586 Estes intervalos estão incoerentes com os resultados do gráfico: plot(gmod1_ci, xlab = "Media da Prob marginal", xlim = c(0, 1)) Qual é o problema??????? Desde já agradeço -- Gilenio Borges Fernandes Universidade Federal da Bahia Instituto de Matemática Departamento de Estatística Av. Adhemar de Barros, s/n – Ondina. 40.170-110 - Salvador - BA, Brasil Tel.: (071)3283-6280/6336 Fax: (071)3283-6276 URL: http://lattes.cnpq.br/6764860618464860

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ExpDes - Comparações múltiplas
by Andre Oliveira 20 Nov '12

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Boa tarde, estou aqui tentando reproduzir algumas análises do ExpDes. A analise abaixo não me deu as comparações múltiplas como faço para tais comparações? require(ExpDes) Carregando pacotes exigidos: ExpDes data(ex1) attach(ex1) dic(trat, ig, quali = FALSE, sigF = 0.05) André Oliveira Souza

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matrizes de correlação
by alanarocha＠sapo.pt 20 Nov '12

20 Nov '12

Olá, a actualização do R resultou para o meu problema. agora preciso de ajuda pois tou a tentar fazer uma matriz de correlação e outra de covariancias de 4 variaveis de um dataframe e dame estes erros: ##matriz de correlação cor.p<-cor.ps(dados[,2:4], Pearson=TRUE,NAs=TRUE) cor.p dados=na.omit(dados[,2:4]) cat("valores NA retirados\n") x11() pairs(dados) x11() boxplot(dados) dados=dados[,2:4] x11() boxplot(dados) correl=cor(dados[2:4]) result=correl return(list(sumario=summary(dados),resultado=result)) cor(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12)) cor.test(dados[,2:4], method='pearson')$p.value cor_with_p_test(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12)) ct <- cor.test(X1s10, X1s12) ct$p ct$v #matriz de covariancias cov(dados[,2:4], na.rm=TRUE) > cor.p<-cor.ps(dados[,2:4], Pearson=TRUE,NAs=TRUE) Error: could not find function "cor.ps" > cor.p Error: object 'cor.p' not found > dados=na.omit(dados[,2:4]) > > cat("valores NA retirados\n") valores NA retirados > > > > > correl=cor(dados[2:4]) Error in `[.data.frame`(dados, 2:4) : undefined columns selected > result=correl Error: object 'correl' not found > return(list(sumario=summary(dados),resultado=result)) Error: object 'result' not found > cor(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12)) Error in cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12) : object 'X1s09' not found > cor.test(dados[,2:4], method='pearson')$p.value Error in `[.data.frame`(dados, , 2:4) : undefined columns selected > cor_with_p_test(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12)) Error: could not find function "cor_with_p_test" > ct <- cor.test(X1s10, X1s12) Error in cor.test(X1s10, X1s12) : object 'X1s10' not found > ct$p Error: object 'ct' not found > ct$v Error: object 'ct' not found > > #matriz de covariancias > cov(dados[,2:4], na.rm=TRUE) Error in cov(dados[, 2:4], na.rm = TRUE) : unused argument(s) (na.rm = TRUE) > cumprimentos e obrigada Ana Rocha

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Re: [R-br] (sem assunto)
by Eder Comunello 20 Nov '12

20 Nov '12

Edson e colegas, bom dia! Ao invés de deixar o campo 'motivo' em branco (NA), experimente atribuir um valor, p. ex. 'sem resposta', e rode novamente. Assim estes casos serão considerados e aparecerão na saída. Vale pros outros campos. ================================================ Éder Comunello Ph.D. Student in Agricultural Systems Engineering (USP/ESALQ) Piracicaba, SP, Brazil [22 42.7'S, 47 37.8'W] Researcher at Embrapa Western Region Agriculture Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W] ================================================ UTC-03:00

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