[R-br] função geom_oint
Daniel Guimarães Tiezzi
dtiezzi em usp.br
Qua Maio 25 10:28:21 -03 2022
Vc precisa transformar a tabela do formate wide para long.
Existem varias formas. Aqui tem um exemplo
https://www.datasciencemadesimple.com/reshape-in-r-from-wide-to-long-from-long-to-wide/ <https://www.datasciencemadesimple.com/reshape-in-r-from-wide-to-long-from-long-to-wide/>
daniel
> On May 25, 2022, at 8:01 AM, Michele Claire Breton por (R-br) <r-br em listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
>
> Caríssimos(as) colegas(as), muito bom dia!
>
> Espero que todos se encontrem bem.
>
> Estou com uma dificuldade. Quero fazer um bubble plot usando as funções ggplot2 e dplyr, onde pretendo plotar no eixo x o gene_ID (são 84 linhas), no y a % de ocorrência da expressão na célula e no color, o valor da expressão. O meu primeiro problema é que no y são 9 tipos celulares diferentes e cada um tem, na tabela de entrada de dados, uma coluna com os dados de expressão e outra com os dados de % de ocorrência (amostra abaixo). Como eu escrevo a função geom_point para plotar o gráfico?
>
> Amostra da tabela de entrada
> gene BE-exp BE% CE_exp CE% E_exp E% F_exp F% HE_exp HE% L-exp L% LE-exp LE% N-exp N% SM-exp SM%
> ACTB 4.006 99.8 3.690 99.6 2.691 95.2 2.377 80.1 2.901 97.7 3.182 94.1 2.864 94.0 3.243 96.0 3.214 93.5
> ACTG1 3.850 5.9 3.592 7.1 2.469 1.5 2.252 1.1 3.129 6.4 2.451 0.6 2.979 1.1 3.104 0 2.500 2.4
> AJUBA 1.185 5.9 0.972 7.1 1.042 1.5 0.912 1.1 1.043 6.4 0.865 0.6 1.024 1.1 0 0 1.149 2.4
>
> Muitíssimo obrigada pela ajuda!
>
> Michele
>
>
>
> --
> ------------------------------------------------------------------------
> Dra. Michele Claire Breton
> Técnica Superior em Bioinformática
> CICS - Centro de Investigação em Ciências da Saúde
> Faculdade de Ciências da Saúde
> Universidade da Beira Interior
> Covilhã - Castelo Branco - Portugal
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