[R-br] função geom_oint

Michele Claire Breton michele.breton20 em gmail.com
Qua Maio 25 08:01:07 -03 2022


Caríssimos(as) colegas(as), muito bom dia!

Espero que todos se encontrem bem.

Estou com uma dificuldade. Quero fazer um bubble plot usando as funções
ggplot2 e dplyr, onde pretendo plotar no eixo x o gene_ID (são 84 linhas),
no y a % de ocorrência da expressão na célula e no color, o valor da
expressão. O meu primeiro problema é que no y são 9 tipos celulares
diferentes e cada um tem, na tabela de entrada de dados, uma coluna com os
dados de expressão e outra com os dados de % de ocorrência (amostra
abaixo). Como eu escrevo a função geom_point para plotar o gráfico?

Amostra da tabela de entrada
gene BE-exp BE% CE_exp CE% E_exp E% F_exp F% HE_exp HE% L-exp L% LE-exp LE%
N-exp N% SM-exp SM%
ACTB 4.006 99.8 3.690 99.6 2.691 95.2 2.377 80.1 2.901 97.7 3.182 94.1 2.864
94.0 3.243 96.0 3.214 93.5
ACTG1 3.850 5.9 3.592 7.1 2.469 1.5 2.252 1.1 3.129 6.4 2.451 0.6 2.979 1.1
3.104 0 2.500 2.4
AJUBA 1.185 5.9 0.972 7.1 1.042 1.5 0.912 1.1 1.043 6.4 0.865 0.6 1.024 1.1
0 0 1.149 2.4

Muitíssimo obrigada pela ajuda!

Michele



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*Dra. Michele Claire Breton*
Técnica Superior em Bioinformática
CICS - Centro de Investigação em Ciências da Saúde
Faculdade de Ciências da Saúde
Universidade da Beira Interior
Covilhã - Castelo Branco - Portugal
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