[R-br] Como instalar o edgeR no Rstudio versão 3.6.3

[Michele Claire Breton]

Bom dia Marcus Nunes,

Obrigada por me orientar.

Michele

Marcus Nunes <marcus.nunes em gmail.com> escreveu no dia quinta, 4/08/2022
à(s) 12:13:

> O edgeR não está disponível no CRAN. Ele faz parte do Bioconductor. Dê uma
> lida neste tutorial -
> https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/edgeR.html - para
> encontrar as instruções de intalação.
> --
> Marcus Nunes
> Professor Adjunto
> https://marcusnunes.me/
> Universidade Federal do Rio Grande do Norte
> Departamento de Estatística
> Laboratório de Estatística Aplicada - http://lea.estatistica.ccet.ufrn.br
> Curso de Big Data - https://introbigdata.org
> Aplicações em Shiny - http://shiny.estatistica.ccet.ufrn.br
>
>
> On Thu, Aug 4, 2022 at 7:06 AM Michele Claire Breton por (R-br) <
> r-br em listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
>
>> Caríssimos(as) utilizadores do R, bom dia
>>
>> Espero que todos estejam bem.
>> Preciso converter dados de expressão gênica de FPKM para CPM, a fim de
>> comparar estes dados com outros bancos que estão em CPM. Para fazer a
>> conversão, eu deveria usar o pacote edgeR, entretanto, não consigo
>> instalá-lo no RStudio V.3.6.3. a seguinte mensagem aparece: "Warning in
>> install.packages :   package ‘edgeR’ is not available (for R version
>> 3.6.3)".
>> Por favor, como posso instalar o pacote? Ou então, há outro pacote que eu
>> possa usar para fazer a conversão que seja compatível com esta versão do R?
>>
>> Muitíssimo obrigada!
>>
>> Michele
>>
>> --
>> ------------------------------------------------------------------------
>> *Dra. Michele Claire Breton*
>> Researcher in Bioinformatics
>> PhD in Cellular and Molecular Biology
>> CICS - Health Sciences Research Center
>> Faculty of Health Sciences
>> University of Beira Interior
>> Covilhã - Castelo Branco - Portugal
>> _______________________________________________
>> R-br mailing list
>> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>> código mínimo reproduzível.
>>
>
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