[R-br] ajuste com glmmADMB

[Walmes Zeviani]

No meu jeito de entender o problema, como já analisei dados semelhantes, o
mais adequado é análise de sobrevivência e não binomial.
Binomial é assim: você diz que vai observar um evento no tempo t1, t2, t3,
etc que pode ter desfecho de 0 (fracasso) ou 1 (sucesso). Com
sobrevivência  assim: você fica observando até ocorrer o desfecho e
registra quando ele ocorreu (tempo para ocorrência).

O experimento, se for como os que já trabalhei, coloca 50 sementes para
germinar e periodicamente conta quantas germinaram. O número de sementes
germinadas no tempo é uma função escada que não decai. Ou seja, se em t1
tem x=3 sementes, em t2 tem-se que x>=3. Dessa forma, o n da binomial no t2
não é mais 50 e sim 47 (sementes que restaram). Isso tem que ser levado em
consideração. Considerar n fixo em 50 não considero adequando e tão pouco
assumir independência entre os x observados com n=50. Se o n for decaindo
conforme os sucessos aumentam, tem uma coisa aí de independência
condicional, não sei ao certo.

Chega um ponto também, que por razões naturais, mesmo que o tempo vá para
infinito, algumas sementes não germinam, ou seja, você não observa
germinação das 50. Isso porque existem sementes com potencial para germinar
e existem aquelas (uma fração) que não vão germinar (proporção de curados
ou fração de zeros) que sofreram impacto mecânico danoso ou ataque de
insetos, etc.

Com modelo de sobrevivência o raciocínio é assim: cada semente (das 50 por
gerbox) é um indivíduo para o qual eu meço o tempo para germinar. No caso,
é uma censura intervalar de 1 dia. As caixas de gerbox são as unidades
experimentais, as sementes são as amostrais. Você declararia um modelo de
sobrevivência com efeito aleatório de gerbox. Pode declarar fração de cura
para estimar a fração de sementes sem potencial de germinação. Estão seria
estimado a curva de sobrevivência das sementes que relaciona probabilidade
de germinação (esse é o desfecho) e tempo. No binomial você também teria
probabilidade e tempo associados. A diferença é quem a variável aleatória
do problema: o desfecho observado no tempo ou o tempo observado para o
desfecho.

À disposição.
Walmes.



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