[R-br] Área foliar

Sábado Maio 30 10:36:20 BRT 2015

sudo apt-get install libtiff4-dev

Em 30 de maio de 2015 09:32, Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br>
escreveu:

> Continua reclamando da  tiff, alguma sugestão?
>
> ..........................................................
>
>
> tentando a URL '
> http://bioconductor.org/packages/3.1/bioc/src/contrib/EBImage_4.10.0.tar.gz
> '
> Content type 'application/x-gzip' length 4114806 bytes (3.9 MB)
> ==================================================
> downloaded 3.9 MB
>
> * installing *source* package ‘tiff’ ...
> ** package ‘tiff’ successfully unpacked and MD5 sums checked
> ** libs
> gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2
> -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat
> -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c common.c -o common.o
> In file included from common.c:1:0:
> common.h:5:18: fatal error: tiff.h: Arquivo ou diretório não encontrado
>  #include <tiff.h>
>                   ^
> compilation terminated.
> make: ** [common.o] Erro 1
> ERROR: compilation failed for package ‘tiff’
> * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/tiff’
> ERROR: dependency ‘tiff’ is not available for package ‘EBImage’
> * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/EBImage’
>
>
>
>
> André Oliveira Souza.
>
> Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto
> Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo.  IFES
>
>
>
>
>
>
>   Em Sábado, 30 de Maio de 2015 9:18, Augusto Ribas <ribas.aca em gmail.com>
> escreveu:
>
>
> Opa, ele está reclamando que não tem todas as livrarias que precisa para
> compitar.
>
> Ta faltando do ffw3h.h
>
> Ta usando linux certo?
>
> No ubuntu, abra um terminal  e instale os pacotes necessários com apt-get
>
>
> sudo apt-get install fftw3 fftw3-dev pkg-config
>
>
> depois tenta instalar denovo que vai funcionar.
>
>
>
> Em 30 de maio de 2015 07:48, Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br>
> escreveu:
>
> Pois é o erro que ocorre ..mas consegui identificar com clareza os motivos!
>
>
> > source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> Bioconductor version 3.1 (BiocInstaller 1.18.2), ?biocLite for help
> > biocLite("EBImage")
> BioC_mirror: http://bioconductor.org
> Using Bioconductor version 3.1 (BiocInstaller 1.18.2), R version 3.2.0.
> Installing package(s) ‘EBImage’
> also installing the dependencies ‘tiff’, ‘fftwtools’
>
> tentando a URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/tiff_0.1-5.tar.gz'
> Content type 'application/x-gzip' length 28925 bytes (28 KB)
> ==================================================
> downloaded 28 KB
>
> tentando a URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/fftwtools_0.9-7.tar.gz
> '
> Content type 'application/x-gzip' length 145998 bytes (142 KB)
> ==================================================
> downloaded 142 KB
>
> tentando a URL '
> http://bioconductor.org/packages/3.1/bioc/src/contrib/EBImage_4.10.0.tar.gz
> '
> Content type 'application/x-gzip' length 4114806 bytes (3.9 MB)
> ==================================================
> downloaded 3.9 MB
>
> * installing *source* package ‘tiff’ ...
> ** package ‘tiff’ successfully unpacked and MD5 sums checked
> ** libs
> gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2
> -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat
> -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c common.c -o common.o
> In file included from common.c:1:0:
> common.h:5:18: fatal error: tiff.h: Arquivo ou diretório não encontrado
>  #include <tiff.h>
>                   ^
> compilation terminated.
> make: ** [common.o] Erro 1
> ERROR: compilation failed for package ‘tiff’
> * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/tiff’
> * installing *source* package ‘fftwtools’ ...
> ** package ‘fftwtools’ successfully unpacked and MD5 sums checked
> ** libs
> gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2
> -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat
> -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c fftwtools.c -o
> fftwtools.o
> fftwtools.c:28:18: fatal error: fftw3.h: Arquivo ou diretório não
> encontrado
>  #include<fftw3.h>
>                   ^
> compilation terminated.
> make: ** [fftwtools.o] Erro 1
> ERROR: compilation failed for package ‘fftwtools’
> * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/fftwtools’
> ERROR: dependencies ‘tiff’, ‘fftwtools’ are not available for package
> ‘EBImage’
> * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/EBImage’
>
> The downloaded source packages are in
> ‘/tmp/RtmpDc7Umf/downloaded_packages’
> Old packages: 'car', 'tcltk2', 'MASS', 'spatial'
> Update all/some/none? [a/s/n]:
>
>
>
>
>
> André Oliveira Souza.
>
> Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto
> Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo.  IFES
>
>
>
>
>
>
>   Em Sexta-feira, 29 de Maio de 2015 21:03, Augusto Ribas <
> ribas.aca em gmail.com> escreveu:
>
>
> O pacote é do biocondutor, você tentou instalar pela função biocLite?
>
> ####################################################
> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> biocLite("EBImage")
>
>
> Em 29 de maio de 2015 18:54, Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br>
> escreveu:
>
> Boa noite,
> existe alguma forma de fazer o cálculo da área da folha de uma árvore no
> R?  Tentei esta dica abaixo, mas não achei o pacote referido!
>
> https://ridiculas.wordpress.com/page/2/
>
>
>
>
>
> André Oliveira Souza.
>
> Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto
> Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo.  IFES
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