[R-br] Área foliar

Sábado Maio 30 10:32:19 BRT 2015

Continua reclamando da  tiff, alguma sugestão?
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tentando a URL 'http://bioconductor.org/packages/3.1/bioc/src/contrib/EBImage_4.10.0.tar.gz'Content type 'application/x-gzip' length 4114806 bytes (3.9 MB)==================================================downloaded 3.9 MB
* installing *source* package ‘tiff’ ...** package ‘tiff’ successfully unpacked and MD5 sums checked** libsgcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c common.c -o common.oIn file included from common.c:1:0:common.h:5:18: fatal error: tiff.h: Arquivo ou diretório não encontrado #include <tiff.h>                  ^compilation terminated.make: ** [common.o] Erro 1ERROR: compilation failed for package ‘tiff’* removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/tiff’ERROR: dependency ‘tiff’ is not available for package ‘EBImage’* removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/EBImage’

André Oliveira Souza. 

Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo.  IFES

     Em Sábado, 30 de Maio de 2015 9:18, Augusto Ribas <ribas.aca em gmail.com> escreveu:

 Opa, ele está reclamando que não tem todas as livrarias que precisa para compitar.

Ta faltando do ffw3h.h

Ta usando linux certo?

No ubuntu, abra um terminal  e instale os pacotes necessários com apt-get

sudo apt-get install fftw3 fftw3-dev pkg-config

depois tenta instalar denovo que vai funcionar.

Em 30 de maio de 2015 07:48, Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br> escreveu:

Pois é o erro que ocorre ..mas consegui identificar com clareza os motivos!

> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")Bioconductor version 3.1 (BiocInstaller 1.18.2), ?biocLite for help> biocLite("EBImage")BioC_mirror: http://bioconductor.orgUsing Bioconductor version 3.1 (BiocInstaller 1.18.2), R version 3.2.0.Installing package(s) ‘EBImage’also installing the dependencies ‘tiff’, ‘fftwtools’
tentando a URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/tiff_0.1-5.tar.gz'Content type 'application/x-gzip' length 28925 bytes (28 KB)==================================================downloaded 28 KB
tentando a URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/fftwtools_0.9-7.tar.gz'Content type 'application/x-gzip' length 145998 bytes (142 KB)==================================================downloaded 142 KB
tentando a URL 'http://bioconductor.org/packages/3.1/bioc/src/contrib/EBImage_4.10.0.tar.gz'Content type 'application/x-gzip' length 4114806 bytes (3.9 MB)==================================================downloaded 3.9 MB
* installing *source* package ‘tiff’ ...** package ‘tiff’ successfully unpacked and MD5 sums checked** libsgcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c common.c -o common.oIn file included from common.c:1:0:common.h:5:18: fatal error: tiff.h: Arquivo ou diretório não encontrado #include <tiff.h>                  ^compilation terminated.make: ** [common.o] Erro 1ERROR: compilation failed for package ‘tiff’* removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/tiff’* installing *source* package ‘fftwtools’ ...** package ‘fftwtools’ successfully unpacked and MD5 sums checked** libsgcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c fftwtools.c -o fftwtools.offtwtools.c:28:18: fatal error: fftw3.h: Arquivo ou diretório não encontrado #include<fftw3.h>                  ^compilation terminated.make: ** [fftwtools.o] Erro 1ERROR: compilation failed for package ‘fftwtools’* removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/fftwtools’ERROR: dependencies ‘tiff’, ‘fftwtools’ are not available for package ‘EBImage’* removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/EBImage’
The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpDc7Umf/downloaded_packages’Old packages: 'car', 'tcltk2', 'MASS', 'spatial'Update all/some/none? [a/s/n]: 

André Oliveira Souza. 

Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo.  IFES

     Em Sexta-feira, 29 de Maio de 2015 21:03, Augusto Ribas <ribas.aca em gmail.com> escreveu:

 O pacote é do biocondutor, você tentou instalar pela função biocLite?

####################################################
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("EBImage")
Em 29 de maio de 2015 18:54, Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br> escreveu:

Boa noite,existe alguma forma de fazer o cálculo da área da folha de uma árvore no R?  Tentei esta dica abaixo, mas não achei o pacote referido! 
https://ridiculas.wordpress.com/page/2/

André Oliveira Souza. 

Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo.  IFES

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