[R-br] Área foliar

Sábado Maio 30 10:37:59 BRT 2015

ops, esse ja ta obsoleto

sudo apt-get install libtiff5-dev:i386 libtiff5-dev

o apt fala que esses dois substituem o anterior que tinha falado.

Em 30 de maio de 2015 09:36, Augusto Ribas <ribas.aca em gmail.com> escreveu:

> sudo apt-get install libtiff4-dev
>
> Em 30 de maio de 2015 09:32, Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br>
> escreveu:
>
>> Continua reclamando da  tiff, alguma sugestão?
>>
>> ..........................................................
>>
>>
>> tentando a URL '
>> http://bioconductor.org/packages/3.1/bioc/src/contrib/EBImage_4.10.0.tar.gz
>> '
>> Content type 'application/x-gzip' length 4114806 bytes (3.9 MB)
>> ==================================================
>> downloaded 3.9 MB
>>
>> * installing *source* package ‘tiff’ ...
>> ** package ‘tiff’ successfully unpacked and MD5 sums checked
>> ** libs
>> gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2
>> -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat
>> -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c common.c -o common.o
>> In file included from common.c:1:0:
>> common.h:5:18: fatal error: tiff.h: Arquivo ou diretório não encontrado
>>  #include <tiff.h>
>>                   ^
>> compilation terminated.
>> make: ** [common.o] Erro 1
>> ERROR: compilation failed for package ‘tiff’
>> * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/tiff’
>> ERROR: dependency ‘tiff’ is not available for package ‘EBImage’
>> * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/EBImage’
>>
>>
>>
>>
>> André Oliveira Souza.
>>
>> Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto
>> Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo.  IFES
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>   Em Sábado, 30 de Maio de 2015 9:18, Augusto Ribas <ribas.aca em gmail.com>
>> escreveu:
>>
>>
>> Opa, ele está reclamando que não tem todas as livrarias que precisa para
>> compitar.
>>
>> Ta faltando do ffw3h.h
>>
>> Ta usando linux certo?
>>
>> No ubuntu, abra um terminal  e instale os pacotes necessários com apt-get
>>
>>
>> sudo apt-get install fftw3 fftw3-dev pkg-config
>>
>>
>> depois tenta instalar denovo que vai funcionar.
>>
>>
>>
>> Em 30 de maio de 2015 07:48, Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br>
>> escreveu:
>>
>> Pois é o erro que ocorre ..mas consegui identificar com clareza os
>> motivos!
>>
>>
>> > source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
>> Bioconductor version 3.1 (BiocInstaller 1.18.2), ?biocLite for help
>> > biocLite("EBImage")
>> BioC_mirror: http://bioconductor.org
>> Using Bioconductor version 3.1 (BiocInstaller 1.18.2), R version 3.2.0.
>> Installing package(s) ‘EBImage’
>> also installing the dependencies ‘tiff’, ‘fftwtools’
>>
>> tentando a URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/tiff_0.1-5.tar.gz'
>> Content type 'application/x-gzip' length 28925 bytes (28 KB)
>> ==================================================
>> downloaded 28 KB
>>
>> tentando a URL '
>> http://cran.rstudio.com/src/contrib/fftwtools_0.9-7.tar.gz'
>> Content type 'application/x-gzip' length 145998 bytes (142 KB)
>> ==================================================
>> downloaded 142 KB
>>
>> tentando a URL '
>> http://bioconductor.org/packages/3.1/bioc/src/contrib/EBImage_4.10.0.tar.gz
>> '
>> Content type 'application/x-gzip' length 4114806 bytes (3.9 MB)
>> ==================================================
>> downloaded 3.9 MB
>>
>> * installing *source* package ‘tiff’ ...
>> ** package ‘tiff’ successfully unpacked and MD5 sums checked
>> ** libs
>> gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2
>> -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat
>> -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c common.c -o common.o
>> In file included from common.c:1:0:
>> common.h:5:18: fatal error: tiff.h: Arquivo ou diretório não encontrado
>>  #include <tiff.h>
>>                   ^
>> compilation terminated.
>> make: ** [common.o] Erro 1
>> ERROR: compilation failed for package ‘tiff’
>> * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/tiff’
>> * installing *source* package ‘fftwtools’ ...
>> ** package ‘fftwtools’ successfully unpacked and MD5 sums checked
>> ** libs
>> gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2
>> -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat
>> -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c fftwtools.c -o
>> fftwtools.o
>> fftwtools.c:28:18: fatal error: fftw3.h: Arquivo ou diretório não
>> encontrado
>>  #include<fftw3.h>
>>                   ^
>> compilation terminated.
>> make: ** [fftwtools.o] Erro 1
>> ERROR: compilation failed for package ‘fftwtools’
>> * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/fftwtools’
>> ERROR: dependencies ‘tiff’, ‘fftwtools’ are not available for package
>> ‘EBImage’
>> * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/EBImage’
>>
>> The downloaded source packages are in
>> ‘/tmp/RtmpDc7Umf/downloaded_packages’
>> Old packages: 'car', 'tcltk2', 'MASS', 'spatial'
>> Update all/some/none? [a/s/n]:
>>
>>
>>
>>
>>
>> André Oliveira Souza.
>>
>> Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto
>> Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo.  IFES
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>   Em Sexta-feira, 29 de Maio de 2015 21:03, Augusto Ribas <
>> ribas.aca em gmail.com> escreveu:
>>
>>
>> O pacote é do biocondutor, você tentou instalar pela função biocLite?
>>
>> ####################################################
>> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
>> biocLite("EBImage")
>>
>>
>> Em 29 de maio de 2015 18:54, Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br>
>> escreveu:
>>
>> Boa noite,
>> existe alguma forma de fazer o cálculo da área da folha de uma árvore no
>> R?  Tentei esta dica abaixo, mas não achei o pacote referido!
>>
>> https://ridiculas.wordpress.com/page/2/
>>
>>
>>
>>
>>
>> André Oliveira Souza.
>>
>> Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto
>> Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo.  IFES
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