[R-br] Duvida em estatística espacial - Kernel em duas dimensões levando em conta prevalências.

Luis Iván Ortiz Valencia liov2067 em gmail.com
Quarta Fevereiro 25 22:39:20 BRT 2015


Veja o pacote spatstat para mapear padrões. Supondo q a doenca pode
acontecer em toda area de estudo.
Em 25/02/2015 18:21, "Augusto Ribas" <ribas.aca em gmail.com> escreveu:

> Ola.
>
> Gostaria de saber se alguém poderia me sugerir algo para avaliar o risco,
> ou aonde uma doença ocorre espacialmente, mais comumente.
>
> Meus dados são constituídos de coordenadas geográficas de cidades, na
> forma de latitude e longitude. Dai para cada cidade eu tenho o número de
> casos de uma doença para um total de vaquinhas observadas. E calculo a
> prevalência como os casos pelo total de vaquinhas observadas.
>
> Então eu tenho esses dados, e gostaria de fazer um mapinha, mostrando
> espacialmente se existe uma área que tem maior ocorrência, maior chance de
> ocorrência. Apenas para explorar os dados a principio.
>
> Segue um pequeno exemplo de como estão os dados.
>
>
> #########################################################
> library(MASS)
> set.seed(1)
> dados<-data.frame(lat=sample(1:10,20,replace=T),
>                   lon=sample(1:10,20,replace=T),
>                   casos=rpois(20,5),
>                   total=rpois(20,60)
>                   )
> dados$prevalencia<-dados$casos/dados$total
>
> #Eu gostaria de fazer uma figura mais ou menos como essa, mas levando em
> consideração as prevalências.
> contorno<-kde2d(dados$lat,dados$lon)
> contour(contorno)
> #############################################################
>
> Alguém tem alguma sugestão? Eu não sei nem o que começar a ler exatamente
> para
> Agradeço desde ja a atenção.
>
> --
> Grato
> Augusto C. A. Ribas
>
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