[R-br] Fwd: ks.test e dados efeitos alelopáticos

Polliana Zocche farbby em gmail.com
Quinta Maio 30 14:36:25 BRT 2013


Olá, Benilton,
Desculpe a falta de clareza. Vou tentar explicar com mais informações.
Observei o efeito de 8 extratos aquosos de uma planta sobre a germinação de
sementes de alface. Então a coleta dos dados foi a contagem do total de
sementes germinadas em cada tratamento por dia.
_______
Exemplo do formato dos dados
> alelo$time #variável X (tempo em horas)
 [1]  24  48  72  96 120 144 168 192 216 240 264 288 312 336 360
alelo$control #exemplo dos dados
[1]  91  95  96  98  98  99  99  99  99  99 100 100 100 100 100
> alelo$v200
 [1] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
 alelo$s100
 [1] 38 45 45 45 45 46 46 45 46 47 48 49 49 51 55 56 56 56 56 58
> alelo$v200ph
 [1] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 5 5 5 5 5
.
.
.
ks.test(alelo$control, alelo$ph5.7, alelo$v100, alelo$v200,
        alelo$v200ph, alelo$s100, alelo$s200, alelo$s200ph)
_________

Procuro um teste que seja apropriado para esses tipos de dados. Você sugere
um GLM?
Espero que tenha ficado mais claro agora.
Obrigada pela ajuda.
Polliana.



Em 30 de maio de 2013 14:16, Benilton Carvalho
<beniltoncarvalho em gmail.com>escreveu:

> Nem todo mundo entende que o que voce esta' olhando e' a influencia de
> um organismo noutro e mensurando este efeito com o numero de
> germinacoes por dia.
>
> Para que voce obtenha uma ajuda mais util, voce precisa descrever os
> dados. Apresentar, pelo menos, uma amostra deles (mas nao envie
> arquivos anexados para a lista) e explicar quais sao as comparacoes
> que voce deseja fazer.
>
> Eu tenho la' minhas duvidas sobre a adequacidade de Kolmogorov-Smirnov
> para isso... principalmente se vc tiver mais que 2 grupos. Talvez,
> voce queira olhar a familia de GLM e suas extensoes para
> "zero-inflated cases" (Poisson, Binomial Negativa, etc)... Mas sem a
> apresentacao precisa dos seus dados (e tambem esquema de amostragem e
> coleta), e' dificil alguem poder te ajudar.
>
> b
>
> Em 30 de maio de 2013 13:21, Polliana Zocche <farbby em gmail.com> escreveu:
> > Olá,
> >
> > Eu estou procurando que teste seria apropriado para dados que contém
> zeros
> > em seus vetores, vetores com valores repetidos e vetores com valores
> > crescentes até 100.
> >
> > Eu usei o ks.test() para verificar as diferentes entre número de
> > germinações/dia entre diferentes tratamentos avaliando alelopatia, mas o
> > teste retorna um warning por causa dos valores repetidos (ties):
> >
> > "Mensagens de aviso perdidas:
> > In ks.test(alelo$control, alelo$ph5.7, alelo$v100, alelo$v200,
> alelo$v200ph,
> > :
> >   cannot compute exact p-values with ties"
> >
> > Alguém tem uma sugestão de que teste seria apropriado para fazer
> comparações
> > com dados dessa natureza?
> > Muito obrigada!
> >
> > --
> > Polliana Zocche de Souza
> > Bióloga/Mestre em Ecologia
> > Doutoranda em Ecologia
> > Departamento de Biologia Vegetal, IB, UNICAMP
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