[R-br] Duvida sobre como alterar o contraste no options de "contr.poly" para "contr.sum" e entender o que acontece.
Augusto Ribas
ribas.aca em gmail.com
Terça Fevereiro 5 12:06:04 BRST 2013
Ola caros colegas da lista, eu estava tentando estabelecer a matriz de
contrastes para usar na função lm, mas não estou conseguindo entender
como as coisas funcionam no R.
Eu li um tutorial antigo, esse aqui
(http://wwwuser.gwdg.de/~cscherb1/content/Statistics%20Course%20files/Working%20with%20orthogonal%20contrasts%20in%20R.pdf).
Eu não entendo se as coisas mudaram desde que esse tutorial foi
escrito, mas com matriz de soma como no exemplo acima tudo é simples,
mas eu não consigo mais replicar o exemplo no R.
Mais precisamente o que eu estava tentando era o seguinte:
#Dados de exemplo:
variavel<-factor(rep(letters[1:3],each=10))
resposta<-rnorm(30,rep(c(1,1,2),each=10))
#Ai eu ajusto um modelo linear
#modelo usando opções default
modelo<-lm(resposta~variavel)
summary(modelo)
#Eu imagino que a matriz que deveria fazer os contrastes como acima
seria essa no caso de usar soma como no texto
cbind(c(-1,1,0),c(-1,0,1))
Mas o default usa outro esquema de matriz de contrastes, logo so
colocar isso nos contrastes não funciona
#O default não usa esse sistema certo?
options("contrasts")
#Eu imaginei que essa opção que fosse a que eu precisaria mudar
options("contrasts")$contrasts[2]
#Mas tentando mudar de forma simples assim eu obtenho um erro
#mas não é uma mudança simples assim, quando eu tento isso:
options("contrasts")$contrasts[2]<-"contr.sum"
#eu tenho essa mensagem de Erro
Erro em options("contrasts")$contrasts[2] <- "contr.sum" :
destino da atribuição expande para um objeto fora da linguagem
Mas como eu faço ao invéz de escrever isso,
contrasts(variavel)
#Escrever isso, ou algo assim
cbind(c(-1,1,0),c(-1,0,1))
#E obter o mesmo resultado que esta no summary(modelo) la em cima, se
não me perdi em algum momento mais para cima.
#Porque mesmo a opção contr.sum parece que ele trabalha de outra forma
do que estou imaginando.
contr.sum(3,contrasts=T,sparse=F)
Bem é isso, é apenas uma duvida sobre como o R funciona que não estou
conseguir entender, se alguém puder dar uma luz eu serei grato.
Abraços
Augusto Ribas
--
Grato
Augusto C. A. Ribas
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