[R-br] (sem assunto)

Cesar Rabak cesar.rabak em gmail.com
Sábado Abril 27 22:10:03 BRT 2013


Vitor,

Essa sugestão é boa se o OP tiver os dados das frequências já calculadas
por algum outro meio (eventualmente o exemplo do livro que ele cita, que
não tenho acesso por ora).

Uma leitura do *post* inicial dele me faz crer que ele tem um dataframe com
(pelo menos) duas colunas uma contendo a espécie e outra presença ou
ausência. Nesse caso ele tem que gerar a tabela de contingência a partir
desse dataframe.

[]s

--
Cesar Rabak




2013/4/27 Vitor Bertoli Nascimento <vitorbertolinascimento em yahoo.com.br>

>
>  Use este para formar sua tabela de contingência:
> > d<-matrix(c(3,17,2,64,52,9),nc=2);d
>      [,1] [,2]
> [1,]    3   64
> [2,]   17   52
> [3,]    2    9
>
> Assim poderá utilizar o
> > chisq.test(d)
>
>         Pearson's Chi-squared test
>
> data:  d
> X-squared = 10.9526, df = 2, p-value = 0.004185
>
>
>   ------------------------------
>  *De:* Cesar Rabak <cesar.rabak em gmail.com>
> *Para:* r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> *Enviadas:* Sábado, 27 de Abril de 2013 20:45
> *Assunto:* Re: [R-br] (sem assunto)
>
> Por favor siga as recomendações no http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia  e  forneça
> código mínimo reproduzível, mostrando* exatamente* o que você fez.
>
> Em particular o comando:
> > example(chisq.test)
>
> Não é suficientemente ilustrativo?
>
> Obviamente há o help da própria função, mas para o seu caso, acho que lhe
> está faltando mais base no uso do R em geral.
>
>
>
>
> 2013/4/24 Antonio Silva <aolinto.lst em gmail.com>
>
> Olá
>
> Eu estou tentado utilizar o teste de Qui-quadrado para verificar a
> dependência entre a distribuição de duas espécies, como indicado no livro
> do Jean Valetin (Ecologia Numérica 2a ed, pg 49).
>
> Eu tenho um dataframe com dados de presença/ausência de duas espécies em
> um determinado número de unidades amostrais
>
> A equação indicada no livro é:
>
> X2= p*(|ad-bc|-p/2)^2 / ((a+b)*(c+d)*(a+c)*(b+d))
>
> Onde a é o número de dupla presença (1-1), b o número de 1-0, c o número
> de 0-1 e d o número de 0,0 (dupla ausência)
> p é a+b+c+d
>
> Há alguma função no R para este cálculo? Eu não consegui utilizar a função
> chisq.test para este cálculo.
>
> Obrigado!
>
> Antonio Olinto
>
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