[R-br] Cluster para r

Fabio Mathias Corrêa fabio.ufla em yahoo.com.br
Domingo Novembro 18 13:01:53 BRST 2012


O pacote bigmemory permite trabalhar com grandes bancos de dados sem sobrecarregar a memória.


 
        Fábio Mathias Corrêa


   Universidade Estadual de Santa Cruz
Departamento de Ciências Exatas e da Terra - DCET


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CEP 45662-900. Ilhéus-Bahia


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Para: r-br em listas.c3sl.ufpr.br; regis barros <regisgbarros em yahoo.com.br> 
Enviadas: Domingo, 18 de Novembro de 2012 12:07
Assunto: Re: [R-br] Cluster para r
 

Ola Regis,

Já trabalhei, ou melhor, tentei trabalhar, com R operando em servidor linux. O principal problema é a divisão do processamento. Não é possível dividir o processamento entre os nós. é possível apenas dividir dentro do próprio núcleo do processador. Eu trabalhei com bases na casa de 20x10^9. A melhor solução que encontrei foi o RevolutionR, fazer proc. paralelo local e converter os arquivos para .xdf (usado pelo revolution). Se o seu problema é computar sobre os dados, e não fazer simulações por exemplo, vc tem que encontrar uma solução que permita isso. É mais um problema de geranciamento e acesso aos dados do que capaciadade de processamento. O R tradicional carrega tudo na memória e, portanto, limita o uso de big data. O .xdf e o RevolutionR solucionam isso permitindo trabalhar com os dados sem carregá-los, além de dividir e indexar o banco, como se faz em SQL, por exemplo. Mas isso vai depender do que vc precisa fazer com os
 dados. As funções disponível para o RevolutionR são as mais simples.estão no pacote RevoscaleR.

abs



2012/11/18 regis barros <regisgbarros em yahoo.com.br>

Bom dia Pessoal
>Gostaria de saber de pessoas que trabalham com cluster para linux e usam o r para executar os cálculos e modelos que venho trabalhando. Li nos e-mails anteriores que pessoas que estavam usando uma base de dados de 1*10^9, todavia gostaria de trabalhar com mais do que isto alguém trabalha?
>Grato
>Regis Godoy Barros
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Diogo Ferrari
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