[R-br] Problema com pacote parallel

Benilton Carvalho beniltoncarvalho em gmail.com
Sexta Abril 20 11:36:35 BRT 2012


Ate' onde eu escuto falar, Windows gosta de mostrar o R como
"Application not responding..." apesar de tudo estar funcionando como
deveria.... Imagino que isso seja mais comum inclusive com codigos em
C, qdo a execucao passa para outro nivel.

Como vc diz que os testes com poucas replicacoes funcionam, entao eu
diria que nao ha' problema algum com o parallel. Mas coisas a serem
consideradas sao: vc tem RAM suficiente? O seu Windows e' 32 ou 64
bits? E o R e' 32 ou 64 bits? Como os testes menores funcionam, minha
impressao e' de que vc esta' tendo problemas com a manipulacao dos
resultados e, muito possivelmente, influenciados pelo sistema
operacional.

benilton

2012/4/20 Vanessa Leotti Torman <vleotti em yahoo.com.br>:
> Prezados membros da lista,
>
> Bom dia.
> Estou rodando uma simulação bastante complexa, pois para cada replicação
> tenho que rodar uma cadeia mcmc através do pacote brugs (que necessita do
> software OpenBUGS).
> Para que a execução seja mais rápida, estou usando o pacote paralell, mais
> especificamente a função parCapply deste pacote.
> Os testes com poucas replicações funcionam perfeitamente. Mas quando coloco
> para rodar todas (4000), mesmo após várias horas executando, o Windows dá
> uma mensagem que o R front end parou de funcionar.
> Eu percebo através do gerenciador de tarefas que apenas um dos núcleos parou
> de executar, então clico em fechar e acabo perdendo todos os resultados.
> Já tentei não usar todos os núcleos do processador, mas mesmo assim o
> problema acontece.
> Alguém teria alguma sugestão?
>
> Abraços,
> Vanessa
>
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