[R-br] Tempo de Processamento

[Fabio Mathias Corrêa]

Ricardo,

Com um exemplo reproduzível fica mais fácil nós ajudarmos!

Valeu!
 
        Fábio Mathias Corrêa


   Universidade Estadual de Santa Cruz
Departamento de Ciências Exatas e da Terra - DCET


Campus Soane Nazaré de Andrade, km 16 Rodovia Ilhéus-Itabuna
CEP 45662-900. Ilhéus-Bahia


Tel.: 73-3680-5076


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De: Ricardo Fernandes Campos Junior <ricardofcj em gmail.com>
Para: r-br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Enviadas: Domingo, 2 de Outubro de 2011 21:51
Assunto: [R-br] Tempo de Processamento


Olá, pessoal.
Estou usando a função pairwise.fst() do pacote adegenet. Eu a uso porque ela implementa uma forma de computar Fst independente da ploidia dos dados, diferentemente de Fst() implementado no pegas.
No entanto, para meus propósitos, ela demora muito tempo. Gostaria de saber se algum de vocês conhece algum outro pacote que faça o mesmo cálculo mais rápido, alguma implementação em C para esta, ou alguma forma de diminuir o tempo de processamento significativamente.

Desde já, muito obrigado.

Abraços,
Ricardo Fernandes Campos Junior
Departamento de Genética e Biologia Evolutiva
Universidade de São Paulo

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