<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:12pt"><div><span>Ricardo,</span></div><div><span><br></span></div><div><span>Com um exemplo reproduzível fica mais fácil nós ajudarmos!</span></div><div><span><br></span></div><div><span>Valeu!</span></div><div> </div><div> Fábio Mathias Corrêa<br><br></div><div> Universidade Estadual de Santa Cruz<br>Departamento de Ciências Exatas e da Terra - DCET</div><br><br><div>Campus Soane Nazaré de Andrade, km 16 Rodovia Ilhéus-Itabuna<br>CEP 45662-900. Ilhéus-Bahia</div><div><br><br></div><div>Tel.: 73-3680-5076<br><div style="font-size: 12pt; font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; "><div style="font-size: 12pt; font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; "><font size="2" face="Arial"><hr size="1"><b><span style="font-weight:bold;">De:</span></b> Ricardo
Fernandes Campos Junior <ricardofcj@gmail.com><br><b><span style="font-weight: bold;">Para:</span></b> r-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br><br><b><span style="font-weight: bold;">Enviadas:</span></b> Domingo, 2 de Outubro de 2011 21:51<br><b><span style="font-weight: bold;">Assunto:</span></b> [R-br] Tempo de Processamento<br></font><br><div id="yiv1869880208">Olá, pessoal.<br>Estou usando a função pairwise.fst() do pacote adegenet. Eu a uso porque ela implementa uma forma de computar Fst independente da ploidia dos dados, diferentemente de Fst() implementado no pegas.<br>No entanto, para meus propósitos, ela demora muito tempo. Gostaria de saber se algum de vocês conhece algum outro pacote que faça o mesmo cálculo mais rápido, alguma implementação em C para esta, ou alguma forma de diminuir o tempo de processamento significativamente.<br>
<br>Desde já, muito obrigado.<br clear="all"><br>Abraços,<br>Ricardo Fernandes Campos Junior<br>Departamento de Genética e Biologia Evolutiva<br>Universidade de São Paulo<br>
</div><br>_______________________________________________<br>R-br mailing list<br><a ymailto="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br><a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br><br></div></div></div></div></body></html>