[R-br] ANOVA por medidas repetidas

Emmanuel Arnhold emmanuelarnhold em yahoo.com.br
Sexta Junho 3 14:10:12 BRT 2011


Então, esta melhor explicado. Parece que esta correto então sua análise. 90 unidades experimentais vc teria se quisesse comparar as magnificações desconsiderando os outros fatores. Justifique aos editores da revista que vc tem realmente 540 unidades experimentais. Se quiser pode retirar as interações das magnificações, mas os resultados deste modelo não mudará suas conclusões. Vc também pode avaliar uma correlação de Pearson entre os valores medidos das tecnicas e dos avaliadores para cada magnificação.
 
 
 
--- Em sex, 3/6/11, Evandro Malanski <evanmal em hotmail.com> escreveu:


De: Evandro Malanski <evanmal em hotmail.com>
Assunto: Re: [R-br] ANOVA por medidas repetidas
Para: "R-BR Fórum" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Data: Sexta-feira, 3 de Junho de 2011, 14:27




Vou explicar melhor o caso:
O objetivo deste trabalho foi comparar duas técnicas de medição. Isso pois em um outro trabalho eu uso a medição por duas técnicas diferentes, então preciso saber se as técnicas produzem o mesmo resultado.
Contudo, aproveitei para verificar se o analisador é um fator que pode causar erros.
Também, organismos menores podem estar mais sujeitos a erros de medição que organismos maiores (usando o microscópio), então verifiquei se o fator magnificação também poderia causar erros.
Foi assim que "desenhei" o experimento.
Então, as medidas repetidas não são ao longo do tempo, mas sim entre analisadores.
A restrição da magnificação é somente para separar organismos maiores de menores, tanto é que tenho 30 + 30 + 30 = 90. Neste caso seria óbvio que haveriam diferenças significativas nas medições, como mostrou naquele sumário.
Ficou melhor explicado?

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Evandro Malanski, Oc. 
Curso de Mestrado em Oceanografia Biológica
Laboratório de Ecologia do Ictioplâncton - LEI
Instituto de Oceanografia - IOUniversidade Federal de Rio Grande - FURG
+55(53)3233-6529 / +55(53)8439-6755

Master Course in Biological Oceanography
Ichthyoplankton Ecology Laboratory - LEI
Oceanography Institute - IO
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Date: Fri, 3 Jun 2011 11:12:52 -0300
From: eder em leg.ufpr.br
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] ANOVA por medidas repetidas

Evandro,
Algumas duvidas:
1) Os analisadores seriam uma restrição a casulização em meu ponto de vista o popular BLOCO, caso seja isso as interações não fazem sentido com esse fator
2) quando vc fala em medidas repetidas, quer dizer no tempo?
3) magnificações, foi um fator de interesse ou mais uma restrição?
Att


Em 3 de junho de 2011 10:59, Evandro Malanski <evanmal em hotmail.com> escreveu:


Pessoal, tenho algumas dúvidas quanto a ANOVA. Se puderem me ajudar, ficarei muito grato.

Montei o seguinte experimento com medição de organismos:
3 analisadores diferentes
3 magnificações no microscópio possíveis
2 técnicas de medição diferentes
90 organismos

Dos 90 organismos, 30 foram medidos pela magnificação 1, outros 30 na magnificação 2, e os últimos 30 na magnificação 3, por cada um dos 3 analisadores, e usando as 2 técnicas.
Ou seja, para cada organismo, tenho 6 medidas.
Eu montei a planilha da seguinte forma, mostrando somente as 10 primeiras medições:

> compara
    Larva     Técnica Analisador Magnificação  Medida
1       1      1                    1          20x  3.8303
2       2      1                    1          20x  4.2159
3       3      1                    1          20x  4.4470
4       4      1                    1          20x  4.9549
5       5      1                    1          20x  4.0265
6       6      1                    1          20x  3.9235
7       7      1                    1          20x  3.7697
8       8      1                    1          20x  3.9166
9       9      1                    1          20x  3.5777
10     10      1                    1          20x  3.7515
...

Como eu tenho medidas repetidas, usei a seguinte análise do R:

compara.aov<- aov(Medida~Analisador+Magnificação+Técnica+
    Analisador:Magnificação+Analisador:Técnica+Magnificação:Técnica+
    Analisador:Magnificação:Técnica)

Ou seja, até mesmo a interação entre os fatores analiso.
Contudo, agora que enviei para correção o meu trabalho, questionaram que a análise está incorreta.
Segue o sumário da análise que fiz, e destaco o grau de liberdade do resíduo, que foi a partir daí que me questionaram:

> summary(compara.aov)
                                                  Df  Sum Sq Mean Sq  F value Pr(>F)    
Analisador                                    2    0.43    0.21   0.2253 0.7984    
Magnificação                                2 1278.94  639.47 672.4928 <2e-16 ***
Técnica                                        1    0.03    0.03   0.0288 0.8654    
Analisador:Magnificação                4    0.13    0.03   0.0330 0.9979    
Analisador:Técnica                       2    0.44    0.22   0.2336 0.7918    
Magnificação:Técnica                   2    0.86    0.43   0.4521 0.6366    
Analisador:Magnificação:Técnica   4    0.10    0.03   0.0269 0.9986    
Residuals                                 522  496.37    0.95                    
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 

Esta análise eu fiz para observar se haveriam diferenças significativas entre técnicas.
Falaram que minha comparação não está baseada nas 90 larvas medidas, mas sim em todas as 540 medidas que eu tenho, como verificado nos graus de liberdade dos resíduos.
Alguém saberia me explicar melhor isso?
E, como eu poderia solucionar esse erro? Modificando a organização da planilha dos dados? Modificando a análise?
Agradeço a ajuda.


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