Olá Eu estou tentado utilizar o teste de Qui-quadrado para verificar a dependência entre a distribuição de duas espécies, como indicado no livro do Jean Valetin (Ecologia Numérica 2a ed, pg 49). Eu tenho um dataframe com dados de presença/ausência de duas espécies em um determinado número de unidades amostrais A equação indicada no livro é: X2= p*(|ad-bc|-p/2)^2 / ((a+b)*(c+d)*(a+c)*(b+d)) Onde a é o número de dupla presença (1-1), b o número de 1-0, c o número de 0-1 e d o número de 0,0 (dupla ausência) p é a+b+c+d Há alguma função no R para este cálculo? Eu não consegui utilizar a função chisq.test para este cálculo. Obrigado! Antonio Olinto
Por favor siga as recomendações no http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia e forneça código mínimo reproduzível, mostrando* exatamente* o que você fez. Em particular o comando:
example(chisq.test)
Não é suficientemente ilustrativo? Obviamente há o help da própria função, mas para o seu caso, acho que lhe está faltando mais base no uso do R em geral. 2013/4/24 Antonio Silva <aolinto.lst@gmail.com>
Olá
Eu estou tentado utilizar o teste de Qui-quadrado para verificar a dependência entre a distribuição de duas espécies, como indicado no livro do Jean Valetin (Ecologia Numérica 2a ed, pg 49).
Eu tenho um dataframe com dados de presença/ausência de duas espécies em um determinado número de unidades amostrais
A equação indicada no livro é:
X2= p*(|ad-bc|-p/2)^2 / ((a+b)*(c+d)*(a+c)*(b+d))
Onde a é o número de dupla presença (1-1), b o número de 1-0, c o número de 0-1 e d o número de 0,0 (dupla ausência) p é a+b+c+d
Há alguma função no R para este cálculo? Eu não consegui utilizar a função chisq.test para este cálculo.
Obrigado!
Antonio Olinto
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
Use este para formar sua tabela de contingência:
d<-matrix(c(3,17,2,64,52,9),nc=2);d [,1] [,2] [1,] 3 64 [2,] 17 52 [3,] 2 9 Assim poderá utilizar o
chisq.test(d) Pearson's Chi-squared test data: d X-squared = 10.9526, df = 2, p-value = 0.004185 ________________________________ De: Cesar Rabak <cesar.rabak@gmail.com> Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Enviadas: Sábado, 27 de Abril de 2013 20:45 Assunto: Re: [R-br] (sem assunto) Por favor siga as recomendações no http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia e forneça código mínimo reproduzível, mostrandoexatamente o que você fez. Em particular o comando:
example(chisq.test)
Não é suficientemente ilustrativo? Obviamente há o help da própria função, mas para o seu caso, acho que lhe está faltando mais base no uso do R em geral. 2013/4/24 Antonio Silva <aolinto.lst@gmail.com> Olá
Eu estou tentado utilizar o teste de Qui-quadrado para verificar a dependência entre a distribuição de duas espécies, como indicado no livro do Jean Valetin (Ecologia Numérica 2a ed, pg 49).
Eu tenho um dataframe com dados de presença/ausência de duas espécies em um determinado número de unidades amostrais
A equação indicada no livro é:
X2= p*(|ad-bc|-p/2)^2 / ((a+b)*(c+d)*(a+c)*(b+d))
Onde a é o número de dupla presença (1-1), b o número de 1-0, c o número de 0-1 e d o número de 0,0 (dupla ausência) p é a+b+c+d
Há alguma função no R para este cálculo? Eu não consegui utilizar a função chisq.test para este cálculo.
Obrigado!
Antonio Olinto
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Vitor, Essa sugestão é boa se o OP tiver os dados das frequências já calculadas por algum outro meio (eventualmente o exemplo do livro que ele cita, que não tenho acesso por ora). Uma leitura do *post* inicial dele me faz crer que ele tem um dataframe com (pelo menos) duas colunas uma contendo a espécie e outra presença ou ausência. Nesse caso ele tem que gerar a tabela de contingência a partir desse dataframe. []s -- Cesar Rabak 2013/4/27 Vitor Bertoli Nascimento <vitorbertolinascimento@yahoo.com.br>
Use este para formar sua tabela de contingência:
d<-matrix(c(3,17,2,64,52,9),nc=2);d [,1] [,2] [1,] 3 64 [2,] 17 52 [3,] 2 9
Assim poderá utilizar o
chisq.test(d)
Pearson's Chi-squared test
data: d X-squared = 10.9526, df = 2, p-value = 0.004185
------------------------------ *De:* Cesar Rabak <cesar.rabak@gmail.com> *Para:* r-br@listas.c3sl.ufpr.br *Enviadas:* Sábado, 27 de Abril de 2013 20:45 *Assunto:* Re: [R-br] (sem assunto)
Por favor siga as recomendações no http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia e forneça código mínimo reproduzível, mostrando* exatamente* o que você fez.
Em particular o comando:
example(chisq.test)
Não é suficientemente ilustrativo?
Obviamente há o help da própria função, mas para o seu caso, acho que lhe está faltando mais base no uso do R em geral.
2013/4/24 Antonio Silva <aolinto.lst@gmail.com>
Olá
Eu estou tentado utilizar o teste de Qui-quadrado para verificar a dependência entre a distribuição de duas espécies, como indicado no livro do Jean Valetin (Ecologia Numérica 2a ed, pg 49).
Eu tenho um dataframe com dados de presença/ausência de duas espécies em um determinado número de unidades amostrais
A equação indicada no livro é:
X2= p*(|ad-bc|-p/2)^2 / ((a+b)*(c+d)*(a+c)*(b+d))
Onde a é o número de dupla presença (1-1), b o número de 1-0, c o número de 0-1 e d o número de 0,0 (dupla ausência) p é a+b+c+d
Há alguma função no R para este cálculo? Eu não consegui utilizar a função chisq.test para este cálculo.
Obrigado!
Antonio Olinto
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Cesar, não é nada que um table() não resolva 2013/4/27 Cesar Rabak <cesar.rabak@gmail.com>
Vitor,
Essa sugestão é boa se o OP tiver os dados das frequências já calculadas por algum outro meio (eventualmente o exemplo do livro que ele cita, que não tenho acesso por ora).
Uma leitura do *post* inicial dele me faz crer que ele tem um dataframe com (pelo menos) duas colunas uma contendo a espécie e outra presença ou ausência. Nesse caso ele tem que gerar a tabela de contingência a partir desse dataframe.
[]s
-- Cesar Rabak
2013/4/27 Vitor Bertoli Nascimento <vitorbertolinascimento@yahoo.com.br>
Use este para formar sua tabela de contingência:
d<-matrix(c(3,17,2,64,52,9),nc=2);d [,1] [,2] [1,] 3 64 [2,] 17 52 [3,] 2 9
Assim poderá utilizar o
chisq.test(d)
Pearson's Chi-squared test
data: d X-squared = 10.9526, df = 2, p-value = 0.004185
------------------------------ *De:* Cesar Rabak <cesar.rabak@gmail.com> *Para:* r-br@listas.c3sl.ufpr.br *Enviadas:* Sábado, 27 de Abril de 2013 20:45 *Assunto:* Re: [R-br] (sem assunto)
Por favor siga as recomendações no http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia e forneça código mínimo reproduzível, mostrando* exatamente* o que você fez.
Em particular o comando:
example(chisq.test)
Não é suficientemente ilustrativo?
Obviamente há o help da própria função, mas para o seu caso, acho que lhe está faltando mais base no uso do R em geral.
2013/4/24 Antonio Silva <aolinto.lst@gmail.com>
Olá
Eu estou tentado utilizar o teste de Qui-quadrado para verificar a dependência entre a distribuição de duas espécies, como indicado no livro do Jean Valetin (Ecologia Numérica 2a ed, pg 49).
Eu tenho um dataframe com dados de presença/ausência de duas espécies em um determinado número de unidades amostrais
A equação indicada no livro é:
X2= p*(|ad-bc|-p/2)^2 / ((a+b)*(c+d)*(a+c)*(b+d))
Onde a é o número de dupla presença (1-1), b o número de 1-0, c o número de 0-1 e d o número de 0,0 (dupla ausência) p é a+b+c+d
Há alguma função no R para este cálculo? Eu não consegui utilizar a função chisq.test para este cálculo.
Obrigado!
Antonio Olinto
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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participantes (4)
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Antonio Silva -
Cesar Rabak -
Rodrigo Coster -
Vitor Bertoli Nascimento