Vitor,

Essa sugestão é boa se o OP tiver os dados das frequências já calculadas por algum outro meio (eventualmente o exemplo do livro que ele cita, que não tenho acesso por ora).

Uma leitura do post inicial dele me faz crer que ele tem um dataframe com (pelo menos) duas colunas uma contendo a espécie e outra presença ou ausência. Nesse caso ele tem que gerar a tabela de contingência a partir desse dataframe.

[]s

--

Cesar Rabak

 

2013/4/27 Vitor Bertoli Nascimento <vitorbertolinascimento@yahoo.com.br>

 Use este para formar sua tabela de contingência:

> d<-matrix(c(3,17,2,64,52,9),nc=2);d

     [,1] [,2]

[1,]    3   64

[2,]   17   52

[3,]    2    9

Assim poderá utilizar o

> chisq.test(d)

 

        Pearson's Chi-squared test

 

data:  d

X-squared = 10.9526, df = 2, p-value = 0.004185

---

De: Cesar Rabak <cesar.rabak@gmail.com>
Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Enviadas: Sábado, 27 de Abril de 2013 20:45
Assunto: Re: [R-br] (sem assunto)

Por favor siga as recomendações no http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia  e  forneça código mínimo reproduzível, mostrando exatamente o que você fez.

Em particular o comando:

> example(chisq.test)

Não é suficientemente ilustrativo?

Obviamente há o help da própria função, mas para o seu caso, acho que lhe está faltando mais base no uso do R em geral.

2013/4/24 Antonio Silva <aolinto.lst@gmail.com>

Olá

Eu estou tentado utilizar o teste de Qui-quadrado para verificar a dependência entre a distribuição de duas espécies, como indicado no livro do Jean Valetin (Ecologia Numérica 2a ed, pg 49).

Eu tenho um dataframe com dados de presença/ausência de duas espécies em um determinado número de unidades amostrais

A equação indicada no livro é:

X2= p*(|ad-bc|-p/2)^2 / ((a+b)*(c+d)*(a+c)*(b+d))

Onde a é o número de dupla presença (1-1), b o número de 1-0, c o número de 0-1 e d o número de 0,0 (dupla ausência)
p é a+b+c+d

Há alguma função no R para este cálculo? Eu não consegui utilizar a função chisq.test para este cálculo.

Obrigado!

Antonio Olinto

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