Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão? Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações fiquem disponíveis? Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira vez? São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito. Obrigado à todos. [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão?
1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes. 2 certifique-se que voce testou o seu pacote : R CMD check SEU_PACOTE e corrija todos os eventuais problemas
Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações fiquem disponíveis?
Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira vez?
Bem vindo ao Universo do Software livre Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes
São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias!
Obrigado à todos. [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada? [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho. Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] < ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com> escreveu:
On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão?
1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes.
2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
R CMD check SEU_PACOTE
e corrija todos os eventuais problemas
Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações fiquem disponíveis?
Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não
seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele
completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira vez?
Bem vindo ao Universo do Software livre
Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser
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Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias!
Obrigado à todos. [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
_______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657009&i=0> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
------------------------------ If you reply to this email, your message will be added to the discussion below:
http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp465... To unsubscribe from R-br, click here<http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscribe_by_code&node=3357982&code=cGVkcm8ucmFmYWVsLm1hcmluaG9AZ21haWwuY29tfDMzNTc5ODJ8NTAyMjI0MDYw> . NAML<http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_viewer&id=instant_html%21nabble%3Aemail.naml&base=nabble.naml.namespaces.BasicNamespace-nabble.view.web.template.NabbleNamespace-nabble.view.web.template.NodeNamespace&breadcrumbs=notify_subscribers%21nabble%3Aemail.naml-instant_emails%21nabble%3Aemail.naml-send_instant_email%21nabble%3Aemail.naml>
Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro? OBS: Estou em uma máquina Linux. * using log directory ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’ * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK * checking extension type ... Package * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’ * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho. Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael < pedro.rafael.marinho@gmail.com> escreveu:
Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada?
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] < ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com> escreveu:
On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão?
1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes.
2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
R CMD check SEU_PACOTE
e corrija todos os eventuais problemas
Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações fiquem disponíveis?
Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não
seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele
completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira vez?
Bem vindo ao Universo do Software livre
Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser
Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas
Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes
São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias!
Obrigado à todos. [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
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Pedro, teria algo a ver com isso? "cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory" Abraços PN Em 15 de novembro de 2012 00:27, Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com> escreveu:
Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
OBS: Estou em uma máquina Linux.
* using log directory ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’ * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK * checking extension type ... Package * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’ * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com> escreveu:
Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada?
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com> escreveu:
On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão?
1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes.
2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
R CMD check SEU_PACOTE
e corrija todos os eventuais problemas
Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações fiquem disponíveis?
Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira vez?
Bem vindo ao Universo do Software livre
Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser
Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas
Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes
São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias!
Obrigado à todos. [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
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Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando. Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro. Espero ter te ajudado. Att. Tiago. Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 From: pedro.rafael.marinho@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro? OBS: Estou em uma máquina Linux. * using log directory ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’ * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK * checking extension type ... Package * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’ * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho. Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com> escreveu: Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada? [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho. Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com> escreveu: On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão?
1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes. 2 certifique-se que voce testou o seu pacote : R CMD check SEU_PACOTE e corrija todos os eventuais problemas
Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira
fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações
fiquem disponíveis?
Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele
completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira
vez?
Bem vindo ao Universo do Software livre Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes
São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias!
Obrigado à todos.
[ ],
Pedro Rafael Diniz Marinho.
_______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. If you reply to this email, your message will be added to the discussion below: http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp465... To unsubscribe from R-br, click here. NAML _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que estamos usando. Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava. []s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando.
Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro.
Espero ter te ajudado.
Att.
Tiago.
------------------------------------------------------------------------ Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 From: pedro.rafael.marinho@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
OBS: Estou em uma máquina Linux.
* using log directory '/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck' * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file 'PRDM/DESCRIPTION' ... OK * checking extension type ... Package * this is package 'PRDM' version '1.0' * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package 'PRDM' can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com <mailto:pedro.rafael.marinho@gmail.com>> escreveu:
Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada?
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com <mailto:ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com>> escreveu:
On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
> Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão?
1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes.
2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
R CMD check SEU_PACOTE
e corrija todos os eventuais problemas
> Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações > fiquem disponíveis?
Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
> > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira > vez? >
Bem vindo ao Universo do Software livre
Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser
Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas
Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes
> > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias!
> > Obrigado à todos. > [ ], > Pedro Rafael Diniz Marinho. > > > _______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657009&i=0> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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Leonard onde eu consigo baixar esse rutil? Att. Tiago. Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200 From: assis.leonard@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que estamos usando. Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava. []s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu: Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando. Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro. Espero ter te ajudado. Att. Tiago. Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 From: pedro.rafael.marinho@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro? OBS: Estou em uma máquina Linux. * using log directory ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’ * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK * checking extension type ... Package * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’ * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho. Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com> escreveu: Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada? [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho. Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com> escreveu: On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote: > Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão? 1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes. 2 certifique-se que voce testou o seu pacote : R CMD check SEU_PACOTE e corrija todos os eventuais problemas > Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações > fiquem disponíveis? Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION > > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira > vez? > Bem vindo ao Universo do Software livre Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes > > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito. Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias! > > Obrigado à todos. > [ ], > Pedro Rafael Diniz Marinho. > > > _______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. If you reply to this email, your message will be added to the discussion below: http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp465... To unsubscribe from R-br, click here. NAML _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel. _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
RTools, errei o nome voce acha no CRAN []s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:
Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
Att.
Tiago.
------------------------------------------------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200 From: assis.leonard@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que estamos usando.
Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava. []s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando.
Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro.
Espero ter te ajudado.
Att.
Tiago.
------------------------------------------------------------------------ Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 From: pedro.rafael.marinho@gmail.com <mailto:pedro.rafael.marinho@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br <mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
OBS: Estou em uma máquina Linux.
* using log directory '/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck' * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file 'PRDM/DESCRIPTION' ... OK * checking extension type ... Package * this is package 'PRDM' version '1.0' * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package 'PRDM' can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com <mailto:pedro.rafael.marinho@gmail.com>> escreveu:
Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada?
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com <mailto:ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com>> escreveu:
On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
> Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão?
1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes.
2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
R CMD check SEU_PACOTE
e corrija todos os eventuais problemas
> Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações > fiquem disponíveis?
Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
> > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira > vez? >
Bem vindo ao Universo do Software livre
Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser
Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas
Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes
> > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias!
> > Obrigado à todos. > [ ], > Pedro Rafael Diniz Marinho. > > > _______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657009&i=0> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
------------------------------------------------------------------------ If you reply to this email, your message will be added to the discussion below: http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp465...
To unsubscribe from R-br, click here <http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscribe_by_code&node=3357982&code=cGVkcm8ucmFmYWVsLm1hcmluaG9AZ21haWwuY29tfDMzNTc5ODJ8NTAyMjI0MDYw>. NAML <http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_viewer&id=instant_html%21nabble:email.naml&base=nabble.naml.namespaces.BasicNamespace-nabble.view.web.template.NabbleNamespace-nabble.view.web.template.NodeNamespace&breadcrumbs=notify_subscribers%21nabble:email.naml-instant_emails%21nabble:email.naml-send_instant_email%21nabble:email.naml>
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_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R CMD Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9, entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9. Att. Tiago. Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200 From: assis.leonard@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. RTools, errei o nome voce acha no CRAN []s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu: Leonard onde eu consigo baixar esse rutil? Att. Tiago. Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200 From: assis.leonard@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que estamos usando. Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava. []s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu: Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando. Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro. Espero ter te ajudado. Att. Tiago. Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 From: pedro.rafael.marinho@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro? OBS: Estou em uma máquina Linux. * using log directory ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’ * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK * checking extension type ... Package * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’ * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho. Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com> escreveu: Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada? [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho. Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com> escreveu: On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote: > Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão? 1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes. 2 certifique-se que voce testou o seu pacote : R CMD check SEU_PACOTE e corrija todos os eventuais problemas > Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações > fiquem disponíveis? Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION > > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira > vez? > Bem vindo ao Universo do Software livre Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes > > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito. Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias! > > Obrigado à todos. > [ ], > Pedro Rafael Diniz Marinho. > > > _______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. If you reply to this email, your message will be added to the discussion below: http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp465... To unsubscribe from R-br, click here. 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na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei o rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo) []s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu:
O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R CMD Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9, entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9.
Att.
Tiago.
------------------------------------------------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200 From: assis.leonard@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
RTools, errei o nome
voce acha no CRAN []s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:
Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
Att.
Tiago.
------------------------------------------------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200 From: assis.leonard@gmail.com <mailto:assis.leonard@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br <mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que estamos usando.
Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava.
[]s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando.
Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro.
Espero ter te ajudado.
Att.
Tiago.
------------------------------------------------------------------------ Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 From: pedro.rafael.marinho@gmail.com <mailto:pedro.rafael.marinho@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br <mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
OBS: Estou em uma máquina Linux.
* using log directory '/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck' * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file 'PRDM/DESCRIPTION' ... OK * checking extension type ... Package * this is package 'PRDM' version '1.0' * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package 'PRDM' can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com <mailto:pedro.rafael.marinho@gmail.com>> escreveu:
Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada?
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com <mailto:ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com>> escreveu:
On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
> Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão?
1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes.
2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
R CMD check SEU_PACOTE
e corrija todos os eventuais problemas
> Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações > fiquem disponíveis?
Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
> > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira > vez? >
Bem vindo ao Universo do Software livre
Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser
Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas
Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes
> > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias!
> > Obrigado à todos. > [ ], > Pedro Rafael Diniz Marinho. > > > _______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657009&i=0> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
------------------------------------------------------------------------ If you reply to this email, your message will be added to the discussion below: http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp465...
To unsubscribe from R-br, click here <http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscribe_by_code&node=3357982&code=cGVkcm8ucmFmYWVsLm1hcmluaG9AZ21haWwuY29tfDMzNTc5ODJ8NTAyMjI0MDYw>. NAML <http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_viewer&id=instant_html%21nabble:email.naml&base=nabble.naml.namespaces.BasicNamespace-nabble.view.web.template.NabbleNamespace-nabble.view.web.template.NodeNamespace&breadcrumbs=notify_subscribers%21nabble:email.naml-instant_emails%21nabble:email.naml-send_instant_email%21nabble:email.naml>
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br <mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne?a c?digo m?nimo reproduz?vel.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br <mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br <mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne?a c?digo m?nimo reproduz?vel.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br <mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne?a c?digo m?nimo reproduz?vel.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
mais provavelmente *precedencia* na variavel PATH... se vc tiver 2 instalacoes de MikTeX e o caminho para a mais antiga aparece antes em PATH, entao o R vai "enxergar" o MikTeX velho. 2012/11/16 Leonard Mendonça de Assis <assis.leonard@gmail.com>
na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei o rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo)
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu:
O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R CMD Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9, entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9.
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200 From: assis.leonard@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
RTools, errei o nome
voce acha no CRAN
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:
Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200 From: assis.leonard@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que estamos usando.
Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava.
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando.
Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro.
Espero ter te ajudado.
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 From: pedro.rafael.marinho@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
OBS: Estou em uma máquina Linux.
* using log directory ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’ * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK * checking extension type ... Package * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’ * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael < pedro.rafael.marinho@gmail.com> escreveu:
Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada?
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] < ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com> escreveu:
On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão?
1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes.
2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
R CMD check SEU_PACOTE
e corrija todos os eventuais problemas
Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações fiquem disponíveis?
Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não
seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele
completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira vez?
Bem vindo ao Universo do Software livre
Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser
Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas
Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes
São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias!
Obrigado à todos. [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
_______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657009&i=0> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
------------------------------ If you reply to this email, your message will be added to the discussion below:
http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp465... To unsubscribe from R-br, click here<http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscribe_by_code&node=3357982&code=cGVkcm8ucmFmYWVsLm1hcmluaG9AZ21haWwuY29tfDMzNTc5ODJ8NTAyMjI0MDYw> . NAML<http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_viewer&id=instant_html%21nabble:email.naml&base=nabble.naml.namespaces.BasicNamespace-nabble.view.web.template.NabbleNamespace-nabble.view.web.template.NodeNamespace&breadcrumbs=notify_subscribers%21nabble:email.naml-instant_emails%21nabble:email.naml-send_instant_email%21nabble:email.naml>
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
_______________________________________________ R-br mailing listR-br@listas.c3sl.ufpr.brhttps://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
_______________________________________________ R-br mailing listR-br@listas.c3sl.ufpr.brhttps://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
_______________________________________________ R-br mailing listR-br@listas.c3sl.ufpr.brhttps://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
Pessoal consegui. Agora está redondinho. O problema foi simplesmente no nome de uma pasta em que meu pacote estava. Jogue em outra pasta e deu certo. Era o nome de uma pasta que tinha um pequeno problema. Acabei de ler as politicas do CRAN para submeter um pacote em: http://cran.r-project.org/web/packages/policies.html Uma duvida que tenho é: Se eu preciso por exemplo melhorar a documentação eu teria que submeter novamente o pacote com um versão diferente? Se as alterações não forem tão significativas eu poderia simplesmente enviar apenas o pdf ou submeter novamente o pacote com a mesma versão? A última dúvida é com respeito a periodicidade das versões. Tenho que constantemente está atualizando meu pacote? Obrigado à todos pelas ajudas. [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho. Em 16 de novembro de 2012 13:32, beniltoncarvalho [via R-br] < ml-node+s2285057n4657061h68@n4.nabble.com> escreveu:
mais provavelmente *precedencia* na variavel PATH... se vc tiver 2 instalacoes de MikTeX e o caminho para a mais antiga aparece antes em PATH, entao o R vai "enxergar" o MikTeX velho.
2012/11/16 Leonard Mendonça de Assis <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=0>
na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei o
rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo)
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu:
O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R CMD Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9, entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9.
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200 From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=1> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=2> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
RTools, errei o nome
voce acha no CRAN
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:
Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200 From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=3> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=4> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que estamos usando.
Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava.
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando.
Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro.
Espero ter te ajudado.
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=5> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=6> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
OBS: Estou em uma máquina Linux.
* using log directory ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’ * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK * checking extension type ... Package * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’ * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=7>
escreveu:
Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada?
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <[hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657061&i=8>> escreveu:
On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão?
1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes.
2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
R CMD check SEU_PACOTE
e corrija todos os eventuais problemas
Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações fiquem disponíveis?
Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não
seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele
completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira vez?
Bem vindo ao Universo do Software livre
Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser
Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas
Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes
São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias!
Obrigado à todos. [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
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Benilton eu conferi se haviam duas versões do MiKteX instaladas, entretanto, só encontrei a 2.9 e o erro persiste. Vou mandar um exemplo e se você ou pessoal do R listas puderem me ajudar ficarei grato. Meu path esta configurado da seguinte forma:< C:\Perl\site\bin; C:\Perl\bin; C:\Rtools\bin; C:\MiKTeX2.9\miktex\bin; C:\R\R-.15.2\bin\i386; C:\MinGW\bin;C:\HTMLHelpWorkshop; C:\Program Files\Common Files\Microsoft Shared\WindowsLive; %LINDOAPI_HOME%bin\win32; C:\Windows\system32; C:\Windows; C:\Windows\System32\Wbem; C:\Windows\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Program Files\Windows Live\Shared; C:\Program Files\Internet Explorer > Ex: Criação de um pacote chamado "meupacote" anova.fat.dic <-function(fat1, fat2, resp){ fat1<-factor(fat1) fat2<-factor(fat2) av<-aov(resp ~ fat1*fat2) y<-summary(av) return(y) } Na checagem o pdf está ok, porém, quando eu peço para gera-lo com o comando R CMD Rd2pdf é retornada a seguinte mensagem de erro. Hmm ... looks like a packageConverting Rd files to LaTeXCreating pdf output from LaTeXWarning: running command '"C:\MiKTeX2.9\miktex\bin\texi2dvi.exe" -- pdf"Rd2.tex/bst"' had status 1Saving output to 'meupacote.pdf' ...Done'meupacote.pdf' not foud Att. Tiago. From: beniltoncarvalho@gmail.com Date: Fri, 16 Nov 2012 16:31:06 +0000 To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. mais provavelmente *precedencia* na variavel PATH... se vc tiver 2 instalacoes de MikTeX e o caminho para a mais antiga aparece antes em PATH, entao o R vai "enxergar" o MikTeX velho. 2012/11/16 Leonard Mendonça de Assis <assis.leonard@gmail.com> na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei o rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo) []s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu: O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R CMD Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9, entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9. Att. Tiago. Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200 From: assis.leonard@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. RTools, errei o nome voce acha no CRAN []s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu: Leonard onde eu consigo baixar esse rutil? Att. Tiago. Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200 From: assis.leonard@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que estamos usando. Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava. []s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu: Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando. Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro. Espero ter te ajudado. Att. Tiago. Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 From: pedro.rafael.marinho@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro? OBS: Estou em uma máquina Linux. * using log directory ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’ * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK * checking extension type ... Package * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’ * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho. Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com> escreveu: Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada? [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho. Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com> escreveu: On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote: > Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão? 1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes. 2 certifique-se que voce testou o seu pacote : R CMD check SEU_PACOTE e corrija todos os eventuais problemas > Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações > fiquem disponíveis? Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION > > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira > vez? > Bem vindo ao Universo do Software livre Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes > > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito. Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias! > > Obrigado à todos. > [ ], > Pedro Rafael Diniz Marinho. > > > _______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. 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O meu path esta configurado da seguinte forma: C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\Rtools\bin;C:\MiKTeX2.9\miktex\bin;C:\R\R-2.15.2\bin\i386;C:\MinGW\bin;C:\HTMLHelpWorkshop;C:\Program Files\Common Files\Microsoft Shared\WindowsLive;%LINDOAPI_HOME%bin\win32;C:\Windows\system32;C:\Windows;C:\Windows\System32\Wbem;C:\Windows\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Program Files\Windows Live\Shared;C:\Program Files\Internet Explorer Você vê algum problema? Att. Tiago. Date: Fri, 16 Nov 2012 13:58:58 -0200 From: assis.leonard@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei o rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo) []s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu: O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R CMD Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9, entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9. Att. Tiago. Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200 From: assis.leonard@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. RTools, errei o nome voce acha no CRAN []s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu: Leonard onde eu consigo baixar esse rutil? Att. Tiago. Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200 From: assis.leonard@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que estamos usando. Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava. []s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu: Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando. Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro. Espero ter te ajudado. Att. Tiago. Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 From: pedro.rafael.marinho@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro? OBS: Estou em uma máquina Linux. * using log directory ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’ * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK * checking extension type ... Package * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’ * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho. Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com> escreveu: Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada? [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho. Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com> escreveu: On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote: > Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão? 1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes. 2 certifique-se que voce testou o seu pacote : R CMD check SEU_PACOTE e corrija todos os eventuais problemas > Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações > fiquem disponíveis? Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION > > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira > vez? > Bem vindo ao Universo do Software livre Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes > > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito. Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias! > > Obrigado à todos. > [ ], > Pedro Rafael Diniz Marinho. > > > _______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. 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Se vc rodar R CMD check pacote ou seu equivalente para o windows... o que sao os erros e o conteudo dos logs? 2012/11/16 tiago souza marçal <tiagosouzamarcal@hotmail.com>
O meu path esta configurado da seguinte forma:
C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\Rtools\bin;C:\MiKTeX2.9\miktex\bin;C:\R\R-2.15.2\bin\i386;C:\MinGW\bin;C:\HTMLHelpWorkshop;C:\Program Files\Common Files\Microsoft Shared\WindowsLive;%LINDOAPI_HOME%bin\win32;C:\Windows\system32;C:\Windows;C:\Windows\System32\Wbem;C:\Windows\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Program Files\Windows Live\Shared;C:\Program Files\Internet Explorer
Você vê algum problema?
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Fri, 16 Nov 2012 13:58:58 -0200
From: assis.leonard@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei o rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo)
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu:
O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R CMD Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9, entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9.
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200 From: assis.leonard@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
RTools, errei o nome
voce acha no CRAN
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:
Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200 From: assis.leonard@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que estamos usando.
Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava.
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando.
Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro.
Espero ter te ajudado.
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 From: pedro.rafael.marinho@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
OBS: Estou em uma máquina Linux.
* using log directory ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’ * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK * checking extension type ... Package * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’ * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael < pedro.rafael.marinho@gmail.com> escreveu:
Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada?
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] < ml-node+s2285057n4657009h56@n4.nabble.com> escreveu:
On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão?
1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes.
2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
R CMD check SEU_PACOTE
e corrija todos os eventuais problemas
Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações fiquem disponíveis?
Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não
seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele
completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira vez?
Bem vindo ao Universo do Software livre
Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser
Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas
Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes
São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias!
Obrigado à todos. [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
_______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657009&i=0> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
------------------------------ If you reply to this email, your message will be added to the discussion below:
http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp465... To unsubscribe from R-br, click here<http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscribe_by_code&node=3357982&code=cGVkcm8ucmFmYWVsLm1hcmluaG9AZ21haWwuY29tfDMzNTc5ODJ8NTAyMjI0MDYw> . NAML<http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_viewer&id=instant_html%21nabble:email.naml&base=nabble.naml.namespaces.BasicNamespace-nabble.view.web.template.NabbleNamespace-nabble.view.web.template.NodeNamespace&breadcrumbs=notify_subscribers%21nabble:email.naml-instant_emails%21nabble:email.naml-send_instant_email%21nabble:email.naml>
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Pessoal os binarios para windows e Mac sao gerados pelo CRAN? Vi em alguns pacotes que entraram nos espelhos hoje nao tem esses binarios. Existe uma mensagem do lado dizendo que os pacotes sao novos. Os binarios nao sao gerados logo quando o pacofe entra no CRAN? ---------- Mensagem encaminhada ---------- De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <ml-node+s2285057n4657081h88@n4.nabble.com
Data: 16/11/2012 17:01 Assunto: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <pedro.rafael.marinho@gmail.com> Se vc rodar R CMD check pacote ou seu equivalente para o windows... o que sao os erros e o conteudo dos logs? 2012/11/16 tiago souza marçal <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=0>
O meu path esta configurado da seguinte forma:
C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\Rtools\bin;C:\MiKTeX2.9\miktex\bin;C:\R\R-2.15.2\bin\i386;C:\MinGW\bin;C:\HTMLHelpWorkshop;C:\Program Files\Common Files\Microsoft Shared\WindowsLive;%LINDOAPI_HOME%bin\win32;C:\Windows\system32;C:\Windows;C:\Windows\System32\Wbem;C:\Windows\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Program Files\Windows Live\Shared;C:\Program Files\Internet Explorer
Você vê algum problema?
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Fri, 16 Nov 2012 13:58:58 -0200
From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=1> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=2> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei o rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo)
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu:
O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R CMD Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9, entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9.
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200 From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=3> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=4> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
RTools, errei o nome
voce acha no CRAN
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:
Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200 From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=5> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=6> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que estamos usando.
Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava.
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando.
Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro.
Espero ter te ajudado.
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=7> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=8> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
OBS: Estou em uma máquina Linux.
* using log directory ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’ * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK * checking extension type ... Package * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’ * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=9>
escreveu:
Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada?
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <[hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=10>> escreveu:
On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão?
1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes.
2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
R CMD check SEU_PACOTE
e corrija todos os eventuais problemas
Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações fiquem disponíveis?
Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não
seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele
completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira vez?
Bem vindo ao Universo do Software livre
Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser
Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas
Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes
São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias!
Obrigado à todos. [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
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Aguarde 24-48h, é o tempo do ciclo dos "builds". On 16 Nov 2012 20:47, "Pedro Rafael" <pedro.rafael.marinho@gmail.com> wrote:
Pessoal os binarios para windows e Mac sao gerados pelo CRAN? Vi em alguns pacotes que entraram nos espelhos hoje nao tem esses binarios. Existe uma mensagem do lado dizendo que os pacotes sao novos. Os binarios nao sao gerados logo quando o pacofe entra no CRAN? ---------- Mensagem encaminhada ---------- De: "beniltoncarvalho [via R-br]" < ml-node+s2285057n4657081h88@n4.nabble.com> Data: 16/11/2012 17:01 Assunto: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <pedro.rafael.marinho@gmail.com>
Se vc rodar
R CMD check pacote
ou seu equivalente para o windows... o que sao os erros e o conteudo dos logs?
2012/11/16 tiago souza marçal <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=0>
O meu path esta configurado da seguinte forma:
C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\Rtools\bin;C:\MiKTeX2.9\miktex\bin;C:\R\R-2.15.2\bin\i386;C:\MinGW\bin;C:\HTMLHelpWorkshop;C:\Program Files\Common Files\Microsoft Shared\WindowsLive;%LINDOAPI_HOME%bin\win32;C:\Windows\system32;C:\Windows;C:\Windows\System32\Wbem;C:\Windows\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Program Files\Windows Live\Shared;C:\Program Files\Internet Explorer
Você vê algum problema?
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Fri, 16 Nov 2012 13:58:58 -0200
From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=1> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=2> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei o rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo)
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu:
O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R CMD Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9, entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9.
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200 From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=3> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=4> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
RTools, errei o nome
voce acha no CRAN
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:
Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200 From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=5> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=6> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que estamos usando.
Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava.
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando.
Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro.
Espero ter te ajudado.
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=7> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=8> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
OBS: Estou em uma máquina Linux.
* using log directory ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’ * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK * checking extension type ... Package * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’ * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=9>
escreveu:
Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada?
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <[hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=10>>escreveu:
On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão?
1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes.
2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
R CMD check SEU_PACOTE
e corrija todos os eventuais problemas
Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações fiquem disponíveis?
Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não
seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele
completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira vez?
Bem vindo ao Universo do Software livre
Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser
Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas
Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes
São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias!
Obrigado à todos. [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
_______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657009&i=0> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
------------------------------ If you reply to this email, your message will be added to the discussion below:
http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp465... To unsubscribe from R-br, click here. NAML<http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_viewer&id=instant_html%21nabble:email.naml&base=nabble.naml.namespaces.BasicNamespace-nabble.view.web.template.NabbleNamespace-nabble.view.web.template.NodeNamespace&breadcrumbs=notify_subscribers%21nabble:email.naml-instant_emails%21nabble:email.naml-send_instant_email%21nabble:email.naml>
_______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=11> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
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Benilton voce poderia me tirar uma dúvida? Já li a documentacao do R mas nao ficou claro para mim. Caso eu queira fazer uma nova versao do pacote pelo que eu entendi eu devo fazer upload do novo arquivo tar.gz informando a nova versao. Contudo, caso eu precise fazer pequenos ajustes, por exemplo, ajustes na documentacao. Como fazer isso sem mudar a versao do pacote? Isso pode ser feito? ---------- Mensagem encaminhada ---------- De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <ml-node+s2285057n4657087h74@n4.nabble.com
Data: 16/11/2012 17:50 Assunto: Re: [R-br] Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes para o R. Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <pedro.rafael.marinho@gmail.com> Aguarde 24-48h, é o tempo do ciclo dos "builds". On 16 Nov 2012 20:47, "Pedro Rafael" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=0>> wrote:
Pessoal os binarios para windows e Mac sao gerados pelo CRAN? Vi em alguns pacotes que entraram nos espelhos hoje nao tem esses binarios. Existe uma mensagem do lado dizendo que os pacotes sao novos. Os binarios nao sao gerados logo quando o pacofe entra no CRAN? ---------- Mensagem encaminhada ---------- De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=1>
Data: 16/11/2012 17:01 Assunto: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=2>
Se vc rodar
R CMD check pacote
ou seu equivalente para o windows... o que sao os erros e o conteudo dos logs?
2012/11/16 tiago souza marçal <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=0>
O meu path esta configurado da seguinte forma:
C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\Rtools\bin;C:\MiKTeX2.9\miktex\bin;C:\R\R-2.15.2\bin\i386;C:\MinGW\bin;C:\HTMLHelpWorkshop;C:\Program Files\Common Files\Microsoft Shared\WindowsLive;%LINDOAPI_HOME%bin\win32;C:\Windows\system32;C:\Windows;C:\Windows\System32\Wbem;C:\Windows\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Program Files\Windows Live\Shared;C:\Program Files\Internet Explorer
Você vê algum problema?
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Fri, 16 Nov 2012 13:58:58 -0200
From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=1> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=2> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei o rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo)
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu:
O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R CMD Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9, entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9.
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200 From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=3> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=4> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
RTools, errei o nome
voce acha no CRAN
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:
Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200 From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=5> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=6> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que estamos usando.
Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava.
[]s Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando.
Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro.
Espero ter te ajudado.
Att.
Tiago.
------------------------------ Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=7> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=8> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
OBS: Estou em uma máquina Linux.
* using log directory ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’ * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK * checking extension type ... Package * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’ * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=9>
escreveu:
Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada?
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <[hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=10>> escreveu:
On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão?
1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes.
2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
R CMD check SEU_PACOTE
e corrija todos os eventuais problemas
Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações fiquem disponíveis?
Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não
seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele
completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira vez?
Bem vindo ao Universo do Software livre
Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser
Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas
Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes
São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias!
Obrigado à todos. [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
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No meu entendimento é uma nova versão []s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis Em 17/11/2012 11:32, Pedro Rafael escreveu:
Benilton voce poderia me tirar uma dúvida? Já li a documentacao do R mas nao ficou claro para mim. Caso eu queira fazer uma nova versao do pacote pelo que eu entendi eu devo fazer upload do novo arquivo tar.gz informando a nova versao. Contudo, caso eu precise fazer pequenos ajustes, por exemplo, ajustes na documentacao. Como fazer isso sem mudar a versao do pacote? Isso pode ser feito?
---------- Mensagem encaminhada ---------- De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <ml-node+s2285057n4657087h74@n4.nabble.com <mailto:ml-node%2Bs2285057n4657087h74@n4.nabble.com>> Data: 16/11/2012 17:50 Assunto: Re: [R-br] Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes para o R. Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <pedro.rafael.marinho@gmail.com <mailto:pedro.rafael.marinho@gmail.com>>
Aguarde 24-48h, é o tempo do ciclo dos "builds".
On 16 Nov 2012 20:47, "Pedro Rafael" <[hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=0>> wrote:
Pessoal os binarios para windows e Mac sao gerados pelo CRAN? Vi em alguns pacotes que entraram nos espelhos hoje nao tem esses binarios. Existe uma mensagem do lado dizendo que os pacotes sao novos. Os binarios nao sao gerados logo quando o pacofe entra no CRAN?
---------- Mensagem encaminhada ---------- De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <[hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=1>>
Data: 16/11/2012 17:01 Assunto: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <[hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=2>>
Se vc rodar
R CMD check pacote
ou seu equivalente para o windows... o que sao os erros e o conteudo dos logs?
2012/11/16 tiago souza marçal <[hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=0>>
O meu path esta configurado da seguinte forma:
C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\Rtools\bin;C:\MiKTeX2.9\miktex\bin;C:\R\R-2.15.2\bin\i386;C:\MinGW\bin;C:\HTMLHelpWorkshop;C:\Program Files\Common Files\Microsoft Shared\WindowsLive;%LINDOAPI_HOME%bin\win32;C:\Windows\system32;C:\Windows;C:\Windows\System32\Wbem;C:\Windows\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Program Files\Windows Live\Shared;C:\Program Files\Internet Explorer
Você vê algum problema?
Att.
Tiago.
------------------------------------------------------------------------ Date: Fri, 16 Nov 2012 13:58:58 -0200
From: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=1> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=2> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei o rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo)
[]s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis
Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu:
O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R CMD Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9, entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9.
Att.
Tiago.
------------------------------------------------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200 From: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=3> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=4> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
RTools, errei o nome
voce acha no CRAN
[]s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:
Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
Att.
Tiago.
------------------------------------------------------------------------ Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200 From: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=5> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=6> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que estamos usando.
Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava.
[]s Leonard de Assis http://about.me/ldeassis
Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando.
Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro.
Espero ter te ajudado.
Att.
Tiago.
------------------------------------------------------------------------ Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 From: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=7> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=8> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
OBS: Estou em uma máquina Linux.
* using log directory '/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck' * using R version 2.15.1 (2012-06-22) * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) * using session charset: UTF-8 * checking for file 'PRDM/DESCRIPTION' ... OK * checking extension type ... Package * this is package 'PRDM' version '1.0' * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for executable files ... OK * checking whether package 'PRDM' can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking for portable file names ... OK * checking for sufficient/correct file permissions ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking R files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... OK * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK * checking for unstated dependencies in R code ... OK * checking S3 generic/method consistency ... OK * checking replacement functions ... OK * checking foreign function calls ... OK * checking R code for possible problems ... OK * checking Rd files ... WARNING prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... OK * checking for code/documentation mismatches ... OK * checking Rd \usage sections ... OK * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking examples ... OK * checking PDF version of manual ... ERROR Rd conversion errors: Warning: unknown option '-' Warning in file(con, "r") : cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory Error in file(con, "r") : cannot open the connection
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <[hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=9>> escreveu:
Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote que deve ser respeitada?
[ ], Pedro Rafael Diniz Marinho.
Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <[hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=10>> escreveu:
On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
> Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo de submissão?
1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto em detalhes.
2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
R CMD check SEU_PACOTE
e corrija todos os eventuais problemas
> Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as atualizações > fiquem disponíveis?
Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
> > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira > vez? >
Bem vindo ao Universo do Software livre
Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que quiser
Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. Leia sobre licxancas GPL e análogas
Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e livre-se destas preocupacoes
> > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
Nao sao somente suas. Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem controvérsias!
> > Obrigado à todos. > [ ], > Pedro Rafael Diniz Marinho. > > > _______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657009&i=0>
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participantes (6)
-
Benilton Carvalho -
Leonard Mendonça de Assis -
Paulo Justiniano -
Paulo Nogueira -
Pedro Rafael -
tiago souza marçal