Prezado, espero colaborar,Favor add no seu '.emacs' ;;----------------------------------------------------------------------------- ;; Define C-y para fazer linha com 3 sinais de # (global-set-key [?\C-y] (kbd "C-u 0 3 #")) ;;----------------------------------------------------------------------------- Vc pode trocar o y pelo que for mais conveniente para vc. obs: adaptado do Walmes Saudações Rafael Tieppo State University of Mato Grosso - Department of Agricultural Engineering site: http://www2.unemat.br/rafaeltieppo blog: https://sistemasagricolas.wordpress.com   "Evite o desperdício: antes de imprimir pense na sua responsabilidade com o ambiente".  On Thursday, November 5, 2015 11:00 AM, "r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br> wrote: Enviar submissões para a lista de discussão R-br para     r-br@listas.c3sl.ufpr.br Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço     https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou corpo da mensagem para     r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo endereço     r-br-owner@listas.c3sl.ufpr.br Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." Tópicos de Hoje:   1. Re: Chi-quadrado demonstra associação, mas e daí?       (André Figueiras Rutz)   2. Re: Chi-quadrado demonstra associação, mas e daí? (Felipe)   3. Re: quem é o autor de tanks.R ??? (Marcos Vital)   4. Re: Campanha de crowdfunding envolvendo o R e Bioestatística       (Marcos Vital)   5. OFF TOPIC - Criar função no emacs para trocar # por ###       (Augusto Ribas) ---------------------------------------------------------------------- Message: 1 Date: Wed, 4 Nov 2015 16:31:08 -0200 From: André Figueiras Rutz <rutzaf@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Chi-quadrado demonstra associação, mas e daí? Message-ID:     <CAE7MPajKj=PL_67o9n-m7bh=8NJxENkErQhUpS-h7my1HWyy1Q@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Caro Leonardo, Acompanhando as perguntas e  respostas aprendi coisas interessantes como referência de início de estudo. Sua vontade em ajudar foi sim bastante útil. Obrigado pela sua contribuição. André Rutz Psicólogo Em 04/11/2015 11:53, "Leonardo Ferreira Fontenelle" < leonardof@leonardof.med.br> escreveu:

Em Ter 3 nov. 2015, às 22:33, andremoreirazoo escreveu:

[...]

Felipe, acho que o caminho é  esse mesmo, mas você poderia me ajudar com comentários  nas linhas dos comandos?

Apesar de gostar de estudar estatística a matemática  da coisa não  é  o meu forte. Então, uma ajuda  para sabe do que se tratacada comando/resultado me faria entender melhor.

André,

Partindo do princípio de que você saiba os fundamentos de como usar o R, você pode completar seu conhecimento lendo a ajuda para cada comando que Felipe usou. Mesmo assim, eu não recomendo que você escreva código assim. Como você disse, a parte matemática não é seu forte; se você tiver conhecimento suficiente para escrever alguma coisa, ela provavelmente já foi escrita. Pior ainda, você pode acabar deixando de usar uma alternativa melhor, pois existe mais de uma forma de calcular intervalos de confiança.

Por exemplo, o código que Felipe propões calcula o intervalo de confiança da diferença de proporções usando o que se costuma chamar método de Wald. Só que o R já dispõe de uma função para calcular o intervalo de confiança para a diferença de proporções, que é o prop.test(). Essa função utiliza o método dos escores de Wilson, que é uma alternativa superior ao método de Wald <http://citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/download?doi=10.1.1.408.7107&rep=rep1&type=pdf>, especialmente quando a amostra é pequena o suficiente para que isso faça alguma diferença.

Repito que existem pacotes como o "PropCIs" e o "binom" com funções que provavelmente vão atender às suas necessidades, além dos pacotes de epidemiologia.

Se você precisa de ajuda para interpretar as estimativas fornecidas pelo R, você precisa de um livro de estatística (ou epidemiologia). Se você precisa ajuda para chegar a essas estimativas com o R, a gente pode lhe ajudar. Mas, agora me ocorreu, talvez você nem precise do R. Dependendo da complexidade das análises que você pretende realizar, você pode usar o www.openepi.com.

Espero ter ajudado mais do que confundido :)

Leonardo Ferreira Fontenelle <http://lattes.cnpq.br/9234772336296638>

_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.

-------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20151104/439fc86a/attachment-0001.html> ------------------------------ Message: 2 Date: Wed, 4 Nov 2015 18:33:28 -0200 From: Felipe <felipe.e.barletta@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Chi-quadrado demonstra associação, mas e daí? Message-ID: <563A6B98.5070403@gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed" André, Como o Leonardo disse no e-mail anterior, há pacotes que já calculam medidas como diferença de proporção OR, seus respectivos IC e outras medidas que podem atender suas necessidades no seu estudo. Além dos pacotes que ele já sugeriu, outro que pode consultar é o epiR: https://cran.r-project.org/web/packages/epiR/epiR.pdf Outra sugestão de leitura que gostaria de é o material da professora Silvia Shimakura: http://leg.ufpr.br/~silvia/CE008/ http://leg.ufpr.br/~silvia/CE001/node68.html Veja qual forma se apresenta mais interessante para seu aprendizado, mas quando escrevo as funções no R como calculadora, acredito que os exemplos se tornam mais didáticos mesmo que já implementados em alguns pacotes do R. E como solicitou segue alguns comentários acerca dos comandos que enviei anteriormente: ## Carregando os dados da tabela que enviou no e-mail dados<-matrix(c(250,15,34,14),ncol=2,byrow=T) ## Verificando a existência de associação entre os parasitas através da Estatística Qui-quadrado ## Quando utilizamos o teste o argumento sim=500, há um alerta pois há casela com frequência logo um pressuposto de validade do teste não foi atendido. ## Uma alternativa então é calcular o p-valor através de simulação ou o teste exato de Fisher. Note que quando simulamos o p-valor não é necessário usar a correção de continuidade de Yates. Q<-chisq.test(dados,sim=500) Q Q$observed ### frequência observada Q$expected ### frequência esperada ##Há evidências de se rejeitar H0 # Comandos para obtenção da diferença entre proporções e seu IC(95%) ## Calculando as proporções entre Cryptosporidium negativo e Cryptosporidium positivo p11<-(dados[1,1]/(sum(dados[1,]))) p22<-(dados[1,1]/(sum(dados[1,]))) d<-p11-p21 # diferença entre as proporções vd<-((p11*(1-p11))/(sum(dados[1,])-1)) + ((p21*(1-p21))/(sum(dados[2,])-1)) ## Estimativa para a variância dvd<-sqrt(vd) ## raíz quadrada da variância z<-qnorm(0.975) #percentil da Normal padrão li<- d - (z*dvd) # Limite inferior ls<- d + (z*dvd) # Limite superior cbind(d,li,ls) # Intervalo de Confiança de 95%. Como o valor zero não está contido no IC a diferença é significativa ao nível de 95% de confiança. ##Razão de Chances ou Odds Ratio (OR) e IC95%(OR) OR<-(dados[1,1]*dados[2,2])/(dados[1,2]*dados[2,1]) ## Calculando a /*odds ratio (n11*n22/n12*n21) */## Quando OR=1 indica chances iguais. Se for OR>1, o grupo 1 apresenta maior chance que o grupo 2. ## Para o cálculo do IC para a OR, usamos o logaritmo da OR na base /e./ vf<-(1/dados[1,1])+(1/dados[1,2])+(1/dados[2,1]+(1/dados[2,2])) ##Estimativa para variância dpf<-sqrt(vf) ## raíz quadrada da variância z<-qnorm(0.975) #Percentil da Normal padrão liOR<-exp(log(OR)-z*dpf) #Limite inferior lsOR<-exp(log(OR)+z*dpf) # Limite Superior cbind(OR,liOR,lsOR) ## A chance de não haver Cryptosporidium e Giardia é 6,8 vezes maior que a presença podendo variar entre 3 e 15,4 vezes ao nível de confiança de 95%. -- Atenciosamente Felipe E. Barletta Mendes Estatístico - Conre3 9766-A +55 (41)-92077191 +55 (41)-33287216 -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20151104/ae036f7d/attachment-0001.html> ------------------------------ Message: 3 Date: Wed, 4 Nov 2015 18:17:27 -0300 From: Marcos Vital <marcosvital@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] quem é o autor de tanks.R ??? Message-ID:     <CAKLUGQ_d+SyHWigkh=byZMer0+=jiDdYyJt1WQB8Aczc1dLncQ@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Olá, Rodrigo. Fiz uma postagem falando da sua função, e mencionando alguns outros joguinhos no R. Está aqui, caso queira dar uma olhada: https://cantinhodor.wordpress.com/2015/10/25/tiros-explosoes-e-destruicao-a-... Abraços! -- Marcos Vinícius Carneiro Vital Universidade Federal de Alagoas Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde Setor de Biodiversidade e Ecologia -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20151104/62339867/attachment-0001.html> ------------------------------ Message: 4 Date: Wed, 4 Nov 2015 18:20:38 -0300 From: Marcos Vital <marcosvital@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Campanha de crowdfunding envolvendo o R e     Bioestatística Message-ID:     <CAKLUGQ9W5A2kT0jqZexPAu4u=nOTpuBgHknAVqUhLDjarnubEQ@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Oi, pessoal Estou passando só para divulgar nossa campanha de financiamento uma última vez, pois estamos a uma semana do final. Relembrando: estamos usando uma campanha de financiamento coletivo para equipar o nosso laboratório e produzir material didático sobre diversos assuntos, incluindo um bocado de Bioestatística e suas aplicações no R. A campanha está aqui, para quem se interessar: http://www.kickante.com.br/campanhas/ciencia-livre-ecologia-e-bioestatistica... Abraços! -- Marcos Vinícius Carneiro Vital Universidade Federal de Alagoas Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde Setor de Biodiversidade e Ecologia -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20151104/1d033226/attachment-0001.html> ------------------------------ Message: 5 Date: Thu, 5 Nov 2015 10:38:13 -0300 From: Augusto Ribas <ribas.aca@gmail.com> To: R-br Lista <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: [R-br] OFF TOPIC - Criar função no emacs para trocar # por     ### Message-ID:     <CACMkfRwN6HdTp_912PKHpLWYzJjLCaL+zAxkffuu9y26VTWGHQ@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Ola a todos. Bem eu tenho usado o emacs como ide para o R, mas sempre tive alguns problemas com identação. Pelo que entendo, no emacs, ele le comentário como três #, tipo ###. Mais ou menos esse problema, mas com hashtag http://stackoverflow.com/questions/26312317/wrong-indentation-of-comments-in... Assim quando eu ponho o comentário como um #, se dou um enter logo a frente desse #, o emacs identa e joga la pra frente. Pesquisando no google, eu achei gente reclamando da mesma coisa, e a solução que vi foi desligar a identação automática, o que é ruim, porque é legal o código identado bonitinho. Dai eu pensei, se teria como fazer uma função e deixar no .emacs , para que o emacs pega-se toda hora que eu digita-se #, ele transformasse em ###, porque ### funciona perfeito, mas é chato digitar três ###. Ai estou lendo esse tutorial https://www.masteringemacs.org/article/mastering-key-bindings-emacs E vendo que da para alterar o key-map do teclado, se entendi bem, e trocar teclas para outras funções, mas não estou conseguindo implementar isso pra deixar no .emacs para quando iniciar o emacs, toda hora que eu digitar #, na tela vira três ### Será que alguém poderia dar uma luz aqui? -- Grato Augusto C. A. Ribas Site Pessoal: http://recologia.com.br/ <http://augustoribas.heliohost.org> Github: https://github.com/Squiercg Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056 -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20151105/2c14d559/attachment-0001.html> ------------------------------ Subject: Legenda do Digest _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ------------------------------ Fim da Digest R-br, volume 59, assunto 5 ****************************************