Efeitos fixo e aleatório em Experimentos.

Boa tarde a todos. Estou dando uma estudada em Análise de Experimentos. Supondo que estou trabalhando com um fatorial 2X2 com repetições diferentes e efeitos fixos. No R como identifico o tipo de efeito fixo para a análise de variância? O efeito aleatório é o default, imagino. E as repetições perdidas, ou seja, os missings? Posso eliminá-las ? No caso de estimar as repetições perdidas comop proceder no R? p.s. algumas respostas já encontrei no Help, mas gostaria de ouvir os amigos da lista, para confirmar minha interpretação. []'s Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas

Edson, Não entendi suas dúvidas. Você pode usar lm() quando todos os fatores são de efeito fixo, pode usar a aov() declarando fator de efeito aleatório com o termo Error() na formula do modelo (estimação por mínimos quadrados), e pode usar a nlme::lme() declarando fatores de efeito aleatório na opção random=, e pode usar a lme4::lmer(). Veja a página de Ridículas do LEG para ver o uso da lme() no caso de blocos incompletos www.leg.ufpr.br/ridiculas. À disposição. Walmes. ========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 VoIP: (3361 3600) 1053 1173 e-mail: walmes@ufpr.br twitter: @walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ==========================================================================

Boa tarde Edson, O uso de algum método de imputação de dados pode ser uma alternativa para a substituição de repetições perdidas. Como não sei se este é o seu caso, gostaria que vc explicasse (se for possível) como foi montado e executado seu experimento ok? Dessa forma posso tentar fornecer alguma ajuda. Um abraço. Atenciosamente, -- Hemílio Fernandes Em 27 de abril de 2011 13:32, Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com>escreveu:
Edson,
Não entendi suas dúvidas. Você pode usar lm() quando todos os fatores são de efeito fixo, pode usar a aov() declarando fator de efeito aleatório com o termo Error() na formula do modelo (estimação por mínimos quadrados), e pode usar a nlme::lme() declarando fatores de efeito aleatório na opção random=, e pode usar a lme4::lmer(). Veja a página de Ridículas do LEG para ver o uso da lme() no caso de blocos incompletos www.leg.ufpr.br/ridiculas.
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São espécies de árvores, mediu-se altura, no de galhos, medida da copa, com três repetições. Deseja-se estudar o efeito de dois fatores, o tipo de plantio (misto e puro) e o tipo de aração(arado e não arado). Algumas dessas medidas são zero. Para o pesquisador são medidas perdidas, pois a árvore morreu. Quanto ao experimento: é aleatório. Obrigado. Edson Lira Estatístico Ma-Am Em 27/04/2011, às 15:50, Hemilio Fernandes <hemilio@gmail.com> escreveu:
Boa tarde Edson,
O uso de algum método de imputação de dados pode ser uma alternativa para a substituição de repetições perdidas. Como não sei se este é o seu caso, gostaria que vc explicasse (se for possível) como foi montado e executado seu experimento ok? Dessa forma posso tentar fornecer alguma ajuda. Um abraço.
Atenciosamente,
-- Hemílio Fernandes
Em 27 de abril de 2011 13:32, Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> escreveu: Edson,
Não entendi suas dúvidas. Você pode usar lm() quando todos os fatores são de efeito fixo, pode usar a aov() declarando fator de efeito aleatório com o termo Error() na formula do modelo (estimação por mínimos quadrados), e pode usar a nlme::lme() declarando fatores de efeito aleatório na opção random=, e pode usar a lme4::lmer(). Veja a página de Ridículas do LEG para ver o uso da lme() no caso de blocos incompletos www.leg.ufpr.br/ridiculas.
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Edson, Não entendo porque os fatores tipo de plantio e aração devem ser considerados de efeito aleatório. Os níveis não representam uma amostra aleatória dos possíveis, portanto não é justificável assumir efeito aleatório. O que você entende por experimento aleatório? Acho que está havendo algum viés de terminologia. À disposição. Walmes. ========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 VoIP: (3361 3600) 1053 1173 e-mail: walmes@ufpr.br twitter: @walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ==========================================================================

Walmes, você está certo, o efeito fixo é a aração e o efeito aleatório é o tipo de plantio, pois para aplicá-lo foi usado o acaso. Vou tentar explicar melhor. são duas áreas, tipo de aração (arado e não arado) plantou-se árvores nas duas áreas, quanto ao tipo de plantio, que é aplicado nas duas áreas, porém foi sorteado em que árvores se aplicaria o plantio puro e misto. Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas --- Em qui, 28/4/11, Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> escreveu: De: Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> Assunto: Re: [R-br] Efeitos fixo e aleatório em Experimentos. Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Data: Quinta-feira, 28 de Abril de 2011, 0:06 Edson, Não entendo porque os fatores tipo de plantio e aração devem ser considerados de efeito aleatório. Os níveis não representam uma amostra aleatória dos possíveis, portanto não é justificável assumir efeito aleatório. O que você entende por experimento aleatório? Acho que está havendo algum viés de terminologia. À disposição. Walmes. ========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 VoIP: (3361 3600) 1053 1173 e-mail: walmes@ufpr.br twitter: @walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ========================================================================== -----Anexo incorporado----- _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br

Edson, O sorteio dos níveis dos fatores às unidades experimentais sempre deve ser feito ao acaso. Não é isso que faz com que o efeito de um fator seja aleatório. Quando um fator é de efeito aleatório, os seus níveis foram sorteados (vindos de um procedimento de amostragem) para serem usados no experimento. Quando são de efeito fixo, eles são escolhidos/definidos pelo pesquisador. Veja, os seus níveis de plantio são 2, PURO e MISTO. Eles são níveis de uma infinidade de níveis de possíveis de forma de plantio? Acredito que não. Eles foram escolhidos porque o pesquisador que comparar apenas esses níveis. Agora imagine uma demartologista que quer estudar dois produtos para pele. Faz um levantamento aleatório de pessoas para compor o experimento e cada pessoa vai receber/fazer uso de um produto para cada uma das mãos. O efeito de produto é fixo porque ela definiu que queria estudar estes produtos. Pórem, o efeito do fator "pessoa" é aleatório porque ela fez uma amostra numa população de pessoas (população de todos os níveis) para obter uma amostra (níveis extraídos ao acaso) e usar no experimento. À disposição. Walmes. ========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 VoIP: (3361 3600) 1053 1173 e-mail: walmes@ufpr.br twitter: @walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ========================================================================== 2011/4/28 Edson Lira <edinhoestat@yahoo.com.br>
Walmes, você está certo, o efeito fixo é a aração e o efeito aleatório é o tipo de plantio, pois para aplicá-lo foi usado o acaso.
Vou tentar explicar melhor. são duas áreas, tipo de aração (arado e não arado) plantou-se árvores nas duas áreas, quanto ao tipo de plantio, que é aplicado nas duas áreas, porém foi sorteado em que árvores se aplicaria o plantio puro e misto.
Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas
--- Em *qui, 28/4/11, Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com>* escreveu:
De: Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> Assunto: Re: [R-br] Efeitos fixo e aleatório em Experimentos. Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Data: Quinta-feira, 28 de Abril de 2011, 0:06
Edson,
Não entendo porque os fatores tipo de plantio e aração devem ser considerados de efeito aleatório. Os níveis não representam uma amostra aleatória dos possíveis, portanto não é justificável assumir efeito aleatório. O que você entende por experimento aleatório? Acho que está havendo algum viés de terminologia.
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Walmes, valeu, é que estou auxiliando uma amiga minha que está fazendo doutourado, realmente tenho dificuldade, conversando com ela, me disse que só existem dois tipos de plantio o puro e o misto dentro do arado e não arado (área). Estou com dúvida para definir o tipo do efeito, pelo que você me explica, me parece que ambos os efeitos são fixos. É isto? Qual procedimento ou rotina devo implementar para avaliar o efeito dos fatores, lembrando que o experimento é desbalanceado, dá para checar interação entre os efeitos? Muito obrigado. Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas --- Em qui, 28/4/11, Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> escreveu: De: Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> Assunto: Re: [R-br] Efeitos fixo e aleatório em Experimentos. Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Data: Quinta-feira, 28 de Abril de 2011, 12:49 Edson, O sorteio dos níveis dos fatores às unidades experimentais sempre deve ser feito ao acaso. Não é isso que faz com que o efeito de um fator seja aleatório. Quando um fator é de efeito aleatório, os seus níveis foram sorteados (vindos de um procedimento de amostragem) para serem usados no experimento. Quando são de efeito fixo, eles são escolhidos/definidos pelo pesquisador. Veja, os seus níveis de plantio são 2, PURO e MISTO. Eles são níveis de uma infinidade de níveis de possíveis de forma de plantio? Acredito que não. Eles foram escolhidos porque o pesquisador que comparar apenas esses níveis. Agora imagine uma demartologista que quer estudar dois produtos para pele. Faz um levantamento aleatório de pessoas para compor o experimento e cada pessoa vai receber/fazer uso de um produto para cada uma das mãos. O efeito de produto é fixo porque ela definiu que queria estudar estes produtos. Pórem, o efeito do fator "pessoa" é aleatório porque ela fez uma amostra numa população de pessoas (população de todos os níveis) para obter uma amostra (níveis extraídos ao acaso) e usar no experimento. À disposição. Walmes. ========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 VoIP: (3361 3600) 1053 1173 e-mail: walmes@ufpr.br twitter: @walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ========================================================================== 2011/4/28 Edson Lira <edinhoestat@yahoo.com.br> Walmes, você está certo, o efeito fixo é a aração e o efeito aleatório é o tipo de plantio, pois para aplicá-lo foi usado o acaso. Vou tentar explicar melhor. são duas áreas, tipo de aração (arado e não arado) plantou-se árvores nas duas áreas, quanto ao tipo de plantio, que é aplicado nas duas áreas, porém foi sorteado em que árvores se aplicaria o plantio puro e misto. Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas --- Em qui, 28/4/11, Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> escreveu: De: Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> Assunto: Re: [R-br] Efeitos fixo e aleatório em Experimentos. Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Data: Quinta-feira, 28 de Abril de 2011, 0:06 Edson, Não entendo porque os fatores tipo de plantio e aração devem ser considerados de efeito aleatório. Os níveis não representam uma amostra aleatória dos possíveis, portanto não é justificável assumir efeito aleatório. O que você entende por experimento aleatório? Acho que está havendo algum viés de terminologia. À disposição. Walmes. ========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 VoIP: (3361 3600) 1053 1173 e-mail: walmes@ufpr.br twitter: @walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ========================================================================== -----Anexo incorporado----- _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br -----Anexo incorporado----- _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br

Edson, Sim, os fatores são de efeito fixo. Se para todas as combinações de níveis você possui observações, então a interação é estimável. Usa a lm() ou aov(). À disposição. Walmes. ========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 VoIP: (3361 3600) 1053 1173 e-mail: walmes@ufpr.br twitter: @walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ==========================================================================

Walmes, muito obrigado, este trabalho é para a tese de Doutourado de minha amiga Rosana, que já virou fã do R, pois estava usando outro pacote o Stat e eu a convenci a migrar para o R pela facilidade (não de programação,rsrsrsrs!), pela qualidade dos gráficos, por ser livre e por conta desta discussão que nos ajuda muito a entender e melhorar o que estamos fazendo. Mais uma vez obrigado a todos. Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas --- Em qui, 28/4/11, Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> escreveu: De: Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> Assunto: Re: [R-br] Efeitos fixo e aleatório em Experimentos. Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Data: Quinta-feira, 28 de Abril de 2011, 13:38 Edson, Sim, os fatores são de efeito fixo. Se para todas as combinações de níveis você possui observações, então a interação é estimável. Usa a lm() ou aov(). À disposição. Walmes. ========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 VoIP: (3361 3600) 1053 1173 e-mail: walmes@ufpr.br twitter: @walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ========================================================================== -----Anexo incorporado----- _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
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