Problemas com a paleta de cores
Caríssimos(as), boa tarde! Espero que todos se encontrem bem. Estou tentando plotar um gráfico de bolhas e estou com problemas com as cores. A mensagem de erro é a seguinte: [image: image.png] O comando foi: bubble_plot <- ggplot(m3,aes(replicates_list, gene_per)) + geom_point(aes(size=gene_per, fill=gene_col),shape=21,color="black") + theme(panel.grid.major=element_line(linetype=1,color="grey"), axis.text.x=element_text(angle=90,hjust=1,vjust=0), panel.background = element_blank()) + ylab("Gene ID") + xlab("Prostate Adenocarcinome cell types") + scale_fill_discrete(name="Expression values")+ scale_size(name="% of cells with expression") bubble_plot Minha intenção é que haja um gradiente de cores (tipo heatmap) para valores que vão de 0.01 a 5. e o resultado que espero ver é algo semelhante a isto: [image: image.png] Por favor, me ajudem! Falta só isto para plotar o gráfico! Aproveito a oportunidade para perdir-lhes indicações de cursos online brasileiros de R. Muitíssimo obrigada pela atenção, Michele -------------------------------------------------------------------------- *Dra. Michele Claire Breton* Técnica Superior em Bioinformática Doutora em Biologia Celular e Molecular CICS - Centro de Investigação em Ciências da Saúde Faculdade de Ciências da Saúde Universidade da Beira Interior Covilhã - Castelo Branco - Portugal
Sem um CMR a gente tem que "interpretar" a mensagem... Parece que o argumento gene_col não tem o tamanho correto... se ñ é ele é algum outro ligado a cores na chamada encadeada... Experimento colocar primeiro um valor fixo, como "blue", etc., se funcionar investigue o descasamento entre o número de cores e indicação de genes... HTH -- Cesar Rabak On Tue, May 31, 2022 at 12:33 PM Michele Claire Breton por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Caríssimos(as), boa tarde!
Espero que todos se encontrem bem.
Estou tentando plotar um gráfico de bolhas e estou com problemas com as cores. A mensagem de erro é a seguinte:
[image: image.png] O comando foi:
bubble_plot <- ggplot(m3,aes(replicates_list, gene_per)) + geom_point(aes(size=gene_per, fill=gene_col),shape=21,color="black") + theme(panel.grid.major=element_line(linetype=1,color="grey"), axis.text.x=element_text(angle=90,hjust=1,vjust=0), panel.background = element_blank()) + ylab("Gene ID") + xlab("Prostate Adenocarcinome cell types") + scale_fill_discrete(name="Expression values")+ scale_size(name="% of cells with expression")
bubble_plot
Minha intenção é que haja um gradiente de cores (tipo heatmap) para valores que vão de 0.01 a 5.
e o resultado que espero ver é algo semelhante a isto:
[image: image.png]
Por favor, me ajudem! Falta só isto para plotar o gráfico! Aproveito a oportunidade para perdir-lhes indicações de cursos online brasileiros de R.
Muitíssimo obrigada pela atenção,
Michele
-------------------------------------------------------------------------- *Dra. Michele Claire Breton* Técnica Superior em Bioinformática Doutora em Biologia Celular e Molecular CICS - Centro de Investigação em Ciências da Saúde Faculdade de Ciências da Saúde Universidade da Beira Interior Covilhã - Castelo Branco - Portugal _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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