Sem um CMR a gente tem que "interpretar" a mensagem...

Parece que o argumento gene_col não tem o tamanho correto... se ñ é ele é algum outro ligado a cores na chamada encadeada...

Experimento colocar primeiro um valor fixo, como "blue", etc., se funcionar investigue o descasamento entre o número de cores e indicação de genes...

HTH

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Cesar Rabak


On Tue, May 31, 2022 at 12:33 PM Michele Claire Breton por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Caríssimos(as), boa tarde!

Espero que todos se encontrem bem.

Estou tentando plotar um gráfico de bolhas e estou com problemas com as cores. A mensagem de erro é a seguinte: 

image.png
O comando foi: 

bubble_plot <- ggplot(m3,aes(replicates_list, gene_per)) +
    geom_point(aes(size=gene_per, fill=gene_col),shape=21,color="black") +
    theme(panel.grid.major=element_line(linetype=1,color="grey"),
          axis.text.x=element_text(angle=90,hjust=1,vjust=0),
          panel.background = element_blank()) +
    ylab("Gene ID") +
    xlab("Prostate Adenocarcinome cell types") +
  scale_fill_discrete(name="Expression values")+
  scale_size(name="% of cells with expression")
   
bubble_plot

Minha intenção é que haja um gradiente de cores (tipo heatmap) para valores que vão de 0.01 a 5.

e o resultado que espero ver é algo semelhante a isto: 

image.png

Por favor, me ajudem! Falta só isto para plotar o gráfico!
Aproveito a oportunidade para perdir-lhes indicações de cursos online brasileiros de R.

Muitíssimo obrigada pela atenção,

Michele
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Dra. Michele Claire Breton
Técnica Superior em Bioinformática
Doutora em Biologia Celular e Molecular
CICS - Centro de Investigação em Ciências da Saúde
Faculdade de Ciências da Saúde
Universidade da Beira Interior
Covilhã - Castelo Branco - Portugal
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