Prezados colegas, boa tarde! Preciso de sugestões de material e/ou pacotes do R que faça análise de componentes principais. Desde já agradeço Att., Ana PAula
Olá Ana Paula A função princomp () da instalação básica efetua análise de componentes principais. O pacote psych tem funções para análise de componentes principais e análise fatorial. Att Elisa Em 9 de novembro de 2016 13:10, ana paula coelho madeira via R-br < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Prezados colegas,
boa tarde! Preciso de sugestões de material e/ou pacotes do R que faça análise de componentes principais.
Desde já agradeço
Att.,
Ana PAula
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
Olá, boa tarde! As funções do pacote 'stats' (parte do R usual): -prcomp() -princomp() realizam PCAs. A primeira obtém a matriz de componentes principais através de SVD enquanto a segunda usa a decomposição em autovetores da função eigen(), mas acredito que ambas usem a mesma sintaxe, então é uma questão de escolha. Quanto à literatura, para algo em português costumo usar esse livro: http://www.editora.ufmg.br/pages/obra/69/analise-de-dados-atraves-de-metodos... 2016-11-09 13:10 GMT-02:00 ana paula coelho madeira via R-br < r-br@listas.c3sl.ufpr.br>:
Prezados colegas,
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Boa tarde, seguem alguns links https://www.r-bloggers.com/computing-and-visualizing-pca-in-r/ http://gastonsanchez.com/how-to/2012/06/17/PCA-in-R/ and also ggbiplot Em 9 de novembro de 2016 11:10, ana paula coelho madeira via R-br < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Prezados colegas,
boa tarde! Preciso de sugestões de material e/ou pacotes do R que faça análise de componentes principais.
Desde já agradeço
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Ana PAula
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Ana, Além das funções citadas, recomendo que você veja os pacotes FactoMineR http://factominer.free.fr/ e ade4 http://pbil.univ-lyon1.fr/ade4/home.php?lang=eng. Em adição aos pacotes propriamente ditos (que você pode baixar diretamente dos sites CRAN no ambiente R) nos sites deles há uma extensa documentação e, em particular, esses dois ambientes você encontra a documentação em francês em adição ao inglês, se isso lhe facilitar a vida 😐. Caso sua necessidade seja mais especializada veja também as dicas das Task Views: https://cran.r-project.org/web/views/Environmetrics.html https://cran.r-project.org/web/views/Multivariate.html https://cran.r-project.org/web/views/Cluster.html HTH -- Cesar Rabak 2016-11-09 13:10 GMT-02:00 ana paula coelho madeira via R-br < r-br@listas.c3sl.ufpr.br>:
Prezados colegas,
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Ana PAula
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Pra engrossar o caldo (PCA todo mundo faz, aí tem monte de lugares pra correr), Eu sugiro dares uma olhada no pacote vegan. É um pacote desses "das antiga", tem várias análises de ordenação, inclusive a PCA e ótimos tutoriais/manuais gratuitos. Os exemplos são dados baseados em vegetação, ambiente e tal, mas a PCA é a mesma. Esse é o link para o pacote com várias informações http://cc.oulu.fi/~jarioksa/softhelp/vegan.html ps: O ade4 (já citado aqui) é legal porque dá para correlacionar as PCAs (a tal da análise de co-inércia), caso tu queiras desenvolver mais isso depois. 2016-11-09 16:21 GMT-03:00 Cesar Rabak via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>:
Ana,
Além das funções citadas, recomendo que você veja os pacotes FactoMineR http://factominer.free.fr/ e ade4 http://pbil.univ-lyon1. fr/ade4/home.php?lang=eng.
Em adição aos pacotes propriamente ditos (que você pode baixar diretamente dos sites CRAN no ambiente R) nos sites deles há uma extensa documentação e, em particular, esses dois ambientes você encontra a documentação em francês em adição ao inglês, se isso lhe facilitar a vida 😐.
Caso sua necessidade seja mais especializada veja também as dicas das Task Views:
https://cran.r-project.org/web/views/Environmetrics.html https://cran.r-project.org/web/views/Multivariate.html https://cran.r-project.org/web/views/Cluster.html
HTH -- Cesar Rabak
2016-11-09 13:10 GMT-02:00 ana paula coelho madeira via R-br < r-br@listas.c3sl.ufpr.br>:
Prezados colegas,
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Ana PAula
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-- Graciliano Galdino A. dos Santos Biólogo Doutorando em Ciências Florestais - PPGCF Universidade Federal Rural da Amazônia - UFRA
participantes (6)
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ana paula coelho madeira -
Cesar Rabak -
Elisa Henning -
gabriel henrique pires de mello ribeiro -
Graciliano Galdino -
Tiago Fragoso