Pra engrossar o caldo (PCA todo mundo faz, aí tem monte de lugares pra correr), 

Eu sugiro dares uma olhada no pacote vegan. É um pacote desses "das antiga", tem várias análises de ordenação, inclusive a PCA e ótimos tutoriais/manuais gratuitos. Os exemplos são dados baseados em vegetação, ambiente e tal, mas a PCA é a mesma.

Esse é o link para o pacote com várias informações

http://cc.oulu.fi/~jarioksa/softhelp/vegan.html


ps: O ade4 (já citado aqui) é legal porque dá para correlacionar as PCAs (a tal da análise de co-inércia), caso tu queiras desenvolver mais isso depois.




2016-11-09 16:21 GMT-03:00 Cesar Rabak via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>:
Ana,

Além das funções citadas, recomendo que você veja os pacotes FactoMineR http://factominer.free.fr/ e ade4 http://pbil.univ-lyon1.fr/ade4/home.php?lang=eng.

Em adição aos pacotes propriamente ditos (que você pode baixar diretamente dos sites CRAN no ambiente R) nos sites deles há uma extensa documentação e, em particular, esses dois ambientes você encontra a documentação em francês em adição ao inglês, se isso lhe facilitar a vida 😐.

Caso sua necessidade seja mais especializada veja também as dicas das Task Views:

https://cran.r-project.org/web/views/Environmetrics.html
https://cran.r-project.org/web/views/Multivariate.html
https://cran.r-project.org/web/views/Cluster.html

HTH
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Cesar Rabak


2016-11-09 13:10 GMT-02:00 ana paula coelho madeira via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>:

Prezados colegas,


boa tarde!  Preciso de sugestões de material e/ou pacotes do R que faça análise de componentes principais.

Desde já agradeço


Att.,


Ana PAula


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Graciliano Galdino A. dos Santos
Biólogo
Doutorando em Ciências Florestais - PPGCF
Universidade Federal Rural da Amazônia - UFRA