Eder, muito obrigada! O problema era realmente com os strings e eu não sabia como resolver. Obrigada mesmo!! : ) 2015-03-29 7:04 GMT-04:00 Éder Comunello <comunello.eder@gmail.com>:
Ludmilla, bom dia!
Não cheguei a rodar seu script, mas percebo que as formulas que você está gerando não estão com a referência correta. Os colnames ("resp_1", "pred_1",) estão diferentes da notação da formula (resp1~pred1).
# formulas<-paste("resp",1:37,"~pred",1:6,sep='') formulas<-paste("resp_",1:37,"~pred_",1:6,sep='') ### alterar para essa forma
Outra coisa é verificar se a função está entendendo as strings como formulas. Pra testar, se a primeira forma não rodar, tente a segunda.
glmmadmb(formulas[1],data=data,random=1|~landscape,family="nbinom",zeroInflation=FALSE)
glmmadmb(as.formula(formulas[1]),data=data,random=1|~landscape,family="nbinom",zeroInflation=FALSE)
Espero que ajude,
Éder Comunello <c <comunello.eder@gmail.com>omunello.eder@gmail.com> Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W]
Em 28 de março de 2015 18:44, Ludmila Rattis <ludmilarattis@gmail.com> escreveu:
Ola,
Tenho uma serie de modelos para rodar e quando tento colocar a funcao glmmadmb, pertencente ao pacote glmmADMB, num looping, retorna o seguinte erro:
Error in if (rchar == "") rchar <- "1" : missing value where TRUE/FALSE needed
Procurei por esse erro no google e nao encontrei nada semelhante. Quando tento fora do looping, a funcao roda normalmente. Eis um codigo de exemplo:
install.packages("glmmADMB", repos="http://r-forge.r-project.org", type="source") data<-matrix(0,180,43);for(i in 1:43){data[,i]<-rnorm(180,mean=0,sd=1) } landscape<-factor(sort(rep(1:30,6))) resp<-paste("resp_",1:37,sep='') pred<-paste("pred_",1:6,sep='') data<-cbind(data,landscape) colnames(data)<-c(resp,pred,"landscape") formulas<-paste("resp",1:37,"~pred",1:6,sep='') fitted.glmm<-list() for (i in 1:length(formulas)){
fitted.glmm[[]]<-glmmadmb(formulas[i],data=data,random=1|~landscape,family="nbinom",zeroInflation=FALSE)}
Alguem poderia me dizer o que esta acontecendo?
Muito obrigada, Lud
-- *Ludmila Rattis* Programa de Pós-graduação em Ecologia/UNICAMP Geomatics and Landscape Ecology Research Laboratory (Carleton University - Canada) http://www.glel.carleton.ca Conservation Biogeography Lab (Goias Federal University - Brazil) rdloyola.wix.com/cblab <http://sites.ffclrp.usp.br/ficus>
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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