Ludmilla, bom dia!

Não cheguei a rodar seu script, mas percebo que as formulas que você está gerando não estão com a referência correta. Os colnames ("resp_1", "pred_1",) estão diferentes da notação da formula (resp1~pred1). 

# formulas<-paste("resp",1:37,"~pred",1:6,sep='')

formulas<-paste("resp_",1:37,"~pred_",1:6,sep='') ### alterar para essa forma

Outra coisa é verificar se a função está entendendo as strings como formulas. Pra testar, se a primeira forma não rodar, tente a segunda.

glmmadmb(formulas[1],data=data,random=1|~landscape,family="nbinom",zeroInflation=FALSE)

glmmadmb(as.formula(formulas[1]),data=data,random=1|~landscape,family="nbinom",zeroInflation=FALSE)

Espero que ajude,

Éder Comunello <comunello.eder@gmail.com>
Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W]

Em 28 de março de 2015 18:44, Ludmila Rattis <ludmilarattis@gmail.com> escreveu:

Ola,

Tenho uma serie de modelos para rodar e quando tento colocar a funcao glmmadmb, pertencente ao pacote glmmADMB, num looping, retorna o seguinte erro:

Error in if (rchar == "") rchar <- "1" : missing value where TRUE/FALSE needed

Procurei por esse erro no google e nao encontrei nada semelhante. Quando tento fora do looping, a funcao roda normalmente. Eis um codigo de exemplo:

install.packages("glmmADMB", repos="http://r-forge.r-project.org", type="source")

data<-matrix(0,180,43);for(i in 1:43){data[,i]<-rnorm(180,mean=0,sd=1) }

landscape<-factor(sort(rep(1:30,6)))

resp<-paste("resp_",1:37,sep='')

pred<-paste("pred_",1:6,sep='')

data<-cbind(data,landscape)

colnames(data)<-c(resp,pred,"landscape")

formulas<-paste("resp",1:37,"~pred",1:6,sep='')

fitted.glmm<-list()

for (i in 1:length(formulas)){

  fitted.glmm[[]]<-glmmadmb(formulas[i],data=data,random=1|~landscape,family="nbinom",zeroInflation=FALSE)}

Alguem poderia me dizer o que esta acontecendo?

Muito obrigada, Lud

--

Ludmila Rattis
Programa de Pós-graduação em Ecologia/UNICAMP
Geomatics and Landscape Ecology Research Laboratory (Carleton University - Canada)

http://www.glel.carleton.ca

Conservation Biogeography Lab (Goias Federal University - Brazil)

rdloyola.wix.com/cblab

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