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Re: [R-br] [Dúvida] Ler dados direto no HD
by beniltoncarvalho 24 Mar '11

24 Mar '11

Eu nao mencionei converter p Excel :) . Ha' vezes que conversao para txt e' um mal necessario, mas se vc estiver em Windows pode ser que haja problemas tambem (depende do filesystem que vc estiver usando). De qualquer forma, voce pode usar o pacote RODBC com os comandos odbcConnectDbase e sqlFetch. Verifique o arquivo de ajuda para os detalhes. -- View this message in context: http://r-br.2285057.n4.nabble.com/Duvida-Ler-dados-direto-no-HD-tp3400886p3… Sent from the R-br mailing list archive at Nabble.com.

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Ajuda com modelo Log-linear
by Diogo Borges Provete 23 Mar '11

23 Mar '11

Olá a todos, gostaria de uma ajuda para ajustar um modelo log-linear para dados com 3 categorias de pigmentação na superfície de órgãos da cavidade abdominal de anfíbios. Os dados seguem em anexo, a planilha é referente ao coração, a parte da esquerda são os dados originais, que consistem das categorias de pigmentação (0, 1 e 2) de 10 indivíduos divididos nos grupos experimentais (nas colunas). Eu gostaria de saber se há diferença nas categorias de pigmentação de acordo com os tratamentos experimentais. O pacote MASS tem uma função loglm que permite que se insira a fórmula parecida com o lm e glm, mas não sei como usar isso neste caso. Agradeço desde já Atenciosamente, Diogo Borges Provete ============================== Biólogo Mestre em Biologia Animal (UNESP) Doutorando PPG Ecologia e Evolução Laboratório de Ecologia de Insetos (sl. 222) Departamento de Ecologia Instituto de Ciências Biológicas - ICB 1 Universidade Federal de Goiás - UFG Goiânia-GO CP: 131 74001-970 Brazil Tel. +55 62 3521-1732 Cel. +55 62 8231-5775 Skype: diogoprovete MSN: diogoprov(a)yahoo.com.br Personal web page Traduza conosco: <<<American Journal Experts>>> <<<D-Lang Soluções linguisticas>>> <<<Perfil no ProZ.com como tradutor freelancer>>> ==============================

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visita Edzer pebesma ao LEG e mini-curso
by Paulo Justiniano 23 Mar '11

23 Mar '11

Caros Na proxima semana, entre 29-31/03/2011 estaremos recebendo no LEG o Edzer Pebesma Edzer Pebesma Institute for Geoinformatics (ifgi) University of Münster Germany. Phone: +49 251 O Edzer é o autor do pacote gstat, co-autor do pacote pacote sp e co-autor do livro: Analysis of Spatial Data with R (ASDAR) (com Roger Bivand e Virgilio G. Rubio) Durante a visita serah ministrado um curso de "Spatial temporal analysis" 1 hr na terca a tarde (29) 4 hrs na quata de manha (30) e se necessario 1 hr extra na quinta (31) (na segunda 28/03) rodaramos uma intro sobre recursos antes do inicio do curso Paginas relevantes: Instituto: http://ifgi.uni-muenster.de Pagina do Edzer no Instituto: http://ifgi.uni-muenster.de/en/staff/7-mitarbeiterinnen/3-pebesma-edzer-pro… Lista de Publicações: http://ifgi.uni-muenster.de/~epebe_01/publ.html Projeto/Comunidade http://www.52north.org/geostatistics Paulo Justiniano Ribeiro Jr LEG (Laboratorio de Estatistica e Geoinformacao) Universidade Federal do Parana Caixa Postal 19.081 CEP 81.531-990 Curitiba, PR - Brasil Tel: (+55) 41 3361 3573 VOIP: (+55) (41) (3361 3600) 1053 1066 Fax: (+55) 41 3361 3141 e-mail: paulojus AT ufpr br http://www.leg.ufpr.br/~paulojus

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Problemas ao instalar o pacote rgl
by ivanalaman 23 Mar '11

23 Mar '11

Olá senhores de novo. Estou com problemas há alguns dias ao instalar pacotes que dependem do "rgl". Este pacote ("rgl") não está instalando de jeito nenhum. Já tentei até via terminal (R CMD blbaalb) e nada. As mensagens são: * installing to library ‘/home/allaman/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.10’ * installing *source* package ‘rgl’ ... checking for gcc... gcc -std=gnu99 checking for C compiler default output file name... a.out checking whether the C compiler works... yes checking whether we are cross compiling... no checking for suffix of executables... checking for suffix of object files... o checking whether we are using the GNU C compiler... yes checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed checking how to run the C preprocessor... gcc -std=gnu99 -E checking for gcc... (cached) gcc -std=gnu99 checking whether we are using the GNU C compiler... (cached) yes checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... (cached) yes checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... (cached) none needed checking for libpng-config... yes configure: using libpng-config configure: using libpng dynamic linkage checking for X... libraries , headers checking GL/gl.h usability... no checking GL/gl.h presence... no checking for GL/gl.h... no checking GL/glu.h usability... no checking GL/glu.h presence... no checking for GL/glu.h... no configure: error: missing required header GL/gl.h ERROR: configuration failed for package ‘rgl’ * removing ‘/home/allaman/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.10/rgl’ Agradeço mais uma vez se puderem ajudar. Allaman (S,f,P) -- View this message in context: http://r-br.2285057.n4.nabble.com/Problemas-ao-instalar-o-pacote-rgl-tp3399… Sent from the R-br mailing list archive at Nabble.com.

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graficos de regressão linear
by gilsonsch 23 Mar '11

23 Mar '11

Pessoal, to precissando fazer um grafico de analises de regressão de tres espécies dende, caiaue, e hi, eu já conseguir fazer os grafico, mas eu quero que as três linhas estejam num grafico só. o mesmo quando eu quero grafico de dispersão, quero colocar mas de uma variave no mesmo gráfico, como eu faço isso. exemplo: dende 2 dende 2 dende 3 caiuae 4 caiaue 3 caiaue 3 hi 2.5 hi 3.4 hi 5.4 Gilson -- View this message in context: http://r-br.2285057.n4.nabble.com/graficos-de-regressao-linear-tp3400025p34… Sent from the R-br mailing list archive at Nabble.com.

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Ajuda com a função biplot.
by ivanalaman 23 Mar '11

23 Mar '11

Boa tarde senhores!! Estou com dois problemas com a função biplot. O primeiro é o seguinte: Quando tento colorir os pontos referentes a cada grupo, só sai uma cor em todos os grupos. Vejam. data(iris)#Já está na base do R pca <- prcomp(~Petal.Length + Sepal.Length + Petal.Width + Sepal.Width, data=iris, scale=TRUE) biplot(pca, xlabs=rep(c("1","2","3"),c(50,50,50)),col=c("red","blue","green"))#só é plotada a cor "red". Um outro problema, é que quando tento fazer a mesma coisa na minha base de dados, a função solta o seguinte erro. head(dmof) LIN IDADE BL REP TEMPO ESTA CP CC AC A1 A2 A3 D1 D2 L1 1 Verm 85 1 1 1 outono 8.3 25.9 26.4 32.1 28.1 11.8 38.2 11.9 16.5 2 Verm 85 1 2 1 outono 10.5 31.1 31.3 42.2 37.9 14.3 45.2 18.4 19.0 3 Verm 85 1 3 1 outono 9.2 28.1 28.4 36.7 30.1 11.8 42.5 16.2 17.1 4 Verm 85 1 4 1 outono 9.8 28.2 27.4 38.1 30.7 12.4 39.7 16.3 16.8 5 Verm 85 1 5 1 outono 9.1 28.4 29.2 36.2 31.2 12.4 42.7 18.2 18.4 6 Verm 85 1 6 1 outono 8.5 25.3 26.1 34.1 29.8 11.7 35.5 20.4 17.2 L2 L3 1 9.2 4.6 2 10.8 6.0 3 9.3 4.6 4 9.2 4.5 5 9.6 5.0 6 10.2 4.5 dmof$LIN Levels: Com Tai UFLA Verm pca1 <- prcomp(~CP+CC+AC+A1+A2+A3+D1+D2+L1+L2+L3, data=dmof, scale=TRUE) biplot(pca1, xlabs=rep(c("1","2","3","4"),c(200,200,200,200)), xlim=c(-0.1,0.1)) Erro em dimnames(x) <- list(xlabs, dimnames(x)[[2L]]) : comprimento de 'dimnames' [1] não é igual ao tamanho do array Calls: biplot -> biplot.prcomp -> biplot.default Não entendo o erro, pois estou obedecendo as dimensões da minha base de dados. dim(dmof) 800 17 Se alguém puder me ajudar eu agradeço. Allaman (S,f,P) -- View this message in context: http://r-br.2285057.n4.nabble.com/Ajuda-com-a-funcao-biplot-tp3399760p33997… Sent from the R-br mailing list archive at Nabble.com.

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[OFF_TOPIC] - Renomear arquivos linux
by Eder David Borges da Silva 22 Mar '11

22 Mar '11

Pessoal, sei que não é duvida R, mas creio que vcs podem me ajudar. em uma pastas tenho uma sequencia de arquivos (a.nc ,b.nc,...,z.nc) não necessariamente em ordem alfabetica. se fosse para mudar *.nc para *.nc1 isso funcionaria. rename 's/\.nc/\.nc1/' *.nc só que querro algo mais, querro que fique aB.nc, bB.nc, ...xB.nc, ou seja antes do ponto da extensão do arquivo querro por um "B" por exemplo. Alguma dica? Atenciosamente ----- ------------------------------ Éder David Borges da Silva Eng° Agrônomo ederdbs(a)gmail.com eder(a)leg.ufpr.br "Tudo é relativo" Albert Einstein -- View this message in context: http://r-br.2285057.n4.nabble.com/OFF-TOPIC-Renomear-arquivos-linux-tp33973… Sent from the R-br mailing list archive at Nabble.com.

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Teste média Subdividida
by Rafael Tieppo 22 Mar '11

22 Mar '11

Bom dia, Estou com dificuldade para realizar o teste de média para um experimento em parcelas subdivididas, conforme segue abaixo: summary(aov(Ds ~ Bloco + Amb*Prof + Error(Bloco/Amb), data = ATRIB)) Error: Bloco Df Sum Sq Mean Sq Bloco 5 0.0091 0.00182 Error: Bloco:Amb Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F) Amb 2 1.20123 0.60062 34.396 3.293e-05 *** Residuals 10 0.17462 0.01746 --- Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 Error: Within Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F) Prof 3 0.077294 0.0257648 8.8629 9.972e-05 *** Amb:Prof 6 0.045089 0.0075148 2.5850 0.03082 * Residuals 45 0.130817 0.0029070 --- Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 Até essas análises os resultados estão ok, conforme confronto de resultados da literatura. Porém quando insiro o comando de para análise de médias, os seguintes erros são apresentados: comando: TukeyHSD - TukeyHSD(aov(Ds ~ Bloco + Amb*Prof + Error(Bloco/Amb), data = ATRIB)) Erro: Erro em UseMethod("TukeyHSD") : no applicable method for 'TukeyHSD' applied to an object of class "c('aovlist', 'listof')" comando: LTukey (pacote Laercio) Erro em UseMethod("LTukey") : no applicable method for 'LTukey' applied to an object of class "c('aovlist', 'listof')" Como devo proceder para fazer a análise de médias? Obrigado Atenciosamente, Eng. Agrícola Rafael Cesar Tieppo UNEMAT - Campus Tangará da Serra - MT Departamento de Agronomia Fone:+55-65 3311-4922 site:http://www2.unemat.br/rafaeltieppo "Evite o desperdício: antes de imprimir pense na sua responsabilidade com o ambiente".

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Re: [R-br] Teste média Subdividida
by Rafael Tieppo 22 Mar '11

22 Mar '11

Muito obrigado. -- View this message in context: http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Teste-media-Subdividida-tp3396775p33… Sent from the R-br mailing list archive at Nabble.com.

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Fwd: Popularity of R, SAS, SPSS, Stata, Statistica, S-PLUS updated
by Henrique Dallazuanna 22 Mar '11

22 Mar '11

Caros, Esta página mostra uma análise da popularidade de várias ferramentas estatísticas. Att ---------- Forwarded message ---------- From: Muenchen, Robert A (Bob) <muenchen(a)utk.edu> Date: Tue, Mar 22, 2011 at 7:37 AM Subject: Popularity of R, SAS, SPSS, Stata, Statistica, S-PLUS updated Greetings, I've just put out the latest version of "The Popularity of Data Analysis Software" at http://r4stats.com/popularity. This update includes complete data for 2010, the addition of number of blogs for each software, more coverage of Statistica, and, where possible, measures regarding the implementations of the SAS Language: Carolina and the World Programming System (WPS). Cheers, Bob ========================================================= Bob Muenchen (pronounced Min'-chen), Manager Research Computing Support Voice: (865) 974-5230 Email: muenchen(a)utk.edu Web: http://oit.utk.edu/research, News: http://oit.utk.edu/research/news.php ======================================================== ===================== To manage your subscription to SPSSX-L, send a message to LISTSERV(a)LISTSERV.UGA.EDU (not to SPSSX-L), with no body text except the command. To leave the list, send the command SIGNOFF SPSSX-L For a list of commands to manage subscriptions, send the command INFO REFCARD -- Henrique Dallazuanna Curitiba-Paraná-Brasil 25° 25' 40" S 49° 16' 22" O

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