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Efeitos marginais após GLMM
by "José Cazuza de Farias Júnior (Farias J únior)" 31 Mar '25

31 Mar '25

Boa tarde. Estou tentando realizar estimativa de efeitos marginais após o uso de GLMM, mas não estou tendo sucesso? Qual a pacote e comandos? José Farias Enviado do meu iPhone

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Re: [R-br] Digest R-br, volume 160, assunto 2
by Maurício Sangiogo 30 Mar '25

30 Mar '25

Emerson, estude a possibilidade de uso de teste mais adequado, talvez o teste de agrupamento de médias de Skot Knott. Terá mais objetividade já separação dos grupos. Atenciosamente, Maurício Sangiogo Obter o Outlook para Android<https://aka.ms/AAb9ysg> ________________________________ From: R-br <r-br-bounces(a)listas.c3sl.ufpr.br> on behalf of r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br <r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br> Sent: Saturday, March 29, 2025 12:00:02 PM To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Digest R-br, volume 160, assunto 2 Enviar submissões para a lista de discussão R-br para r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flistas.inf…<https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br> ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou corpo da mensagem para r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo endereço r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." Tópicos de Hoje: 1. Re: TukeyHSD (Cesar Rabak) 2. Re: TukeyHSD (Cesar Rabak) ---------------------------------------------------------------------- Message: 1 Date: Fri, 28 Mar 2025 13:13:15 -0300 From: Cesar Rabak <cesar.rabak(a)gmail.com> To: Emerson Cotta Bodevan <bodevan.ec(a)gmail.com> Cc: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] TukeyHSD Message-ID: <CAKrF98=K6E0MCv_mYZiMLagQHvUXDxH3_gOdNXD3AX=N2F2=2w(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" @Emerson: Considere adicionar às suas análises uma medida e discussão sobre os tamanhos dos efeitos observados. Ademais, além da diferença mínima detectável dada pelo teste *post hoc* utilizado, aconselho a verificar qual a acurácia (ou pensando estatisticamente, o intervalo de confiança) das medidas da variável resposta, que tendo sido feito a ANOVA, pressuponho seja contínua, pelo menos intervalar. HTH -- Cesar Rabak On Fri, Mar 28, 2025 at 8:49?AM Emerson Cotta Bodevan <bodevan.ec(a)gmail.com> wrote: > Prezados, bom dia. > > Primeiramente, obrigado a todos pelo rápido retorno. > > Marcelo e Fernando... todas as soluções apresentadas funcionaram > direitinho. Obrigado. > > Luiz e Cesar... obrigado pelas considerações. São 24 tratamentos, o que > nos leva a 276 comparações dois a dois. Mas consigo separar em blocos de 8 > tratamentos. Acredito que as discussões serão mais ricas e o teste mais > adequado. Obrigado mais uma vez. > > Abraços. > > *Emerson* > > > Em qui., 27 de mar. de 2025 às 23:50, Cesar Rabak por (R-br) < > r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: > >> Pegando carona na resposta do Luiz Alexandre sobre a inadequação do >> número de tratamentos, que eu concordo, gostaria de acrescentar que >> parece-me que há poucos casos para o número de tratamentos (a divisão do nº >> de casos pelo dos tratamentos não dá nem inteiro, o que me leva a pensar >> que ANOVA pode estar desbalanceada, também...). >> >> Uma outra questão mais prática é por que a ANOVA precisa de tantas >> linhas, a menos que sua formulação inclua interações entre os tratamentos. >> >> HTH >> >> On Thu, Mar 27, 2025 at 6:01?PM Luiz Peternelli por (R-br) < >> r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> wrote: >> >>> Olá. >>> Você precisa fazer isso no R? Fará essa análise comparativa de maneira >>> recorrente, ou somente uma vez e apresentará os resultados num paper? >>> Se fará somente uma vez e se todos os tratamentos tiverem o mesmo número >>> de repetições, fazer à mão é extremamente simples, já q o delta da >>> diferença mínima significativa será único. >>> >>> Outro ponto importante: na prática usar esse teste quando se tem muito >>> tratamentos é inadequado. Só vai trazer mais confusão interpretativa do que >>> auxílio em tomada de decisão. >>> >>> Abraços >>> >>> ?Luiz Alexandre Peternelli >>> >>> >>> >>> >>> >>> On Thu, Mar 27, 2025 at 16:06 Marcelo Laia por (R-br) < >>> r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> wrote: >>> >>>> Oi Emerson, você já testou uma das três opções abaixo? >>>> >>>> Opção 1: Aumentar o limite de impressão >>>> >>>> options(max.print = 10000) # ou qualquer valor maior que o número de >>>> linhas >>>> print(resultado) >>>> >>>> Opção 2: Acessar diretamente os resultados >>>> >>>> resultado$`nome_do_fator` # substitua pelo nome real do fator >>>> >>>> Exemplo: >>>> >>>> resultado <- TukeyHSD(aov(valor ~ tratamento, data = dados)) >>>> View(resultado$tratamento) # abrir em visualização tabular >>>> >>>> Opção 3: Exportar para Excel ou CSV >>>> >>>> write.csv(resultado$tratamento, "tukey_resultados.csv") >>>> >>>> Teoricamente, essas abordagens permitirão acessar todas as comparações, >>>> inclusive as omitidas. >>>> >>>> Marcelo >>>> >>>> Enviado a partir de dispositivo móvel >>>> https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flinktr.ee%…<https://linktr.ee/marcelolaia> >>>> >>>> Em qui., 27 de mar. de 2025, 15:08, Emerson Cotta Bodevan por (R-br) < >>>> r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: >>>> >>>>> Prezados, boa tarde. >>>>> >>>>> Fiz um teste de Tukey, usando o comando >>>>> >>>>> resultado<-TukeyHSD(resultado de uma anova) >>>>> >>>>> O arquivo tem 276 linhas (24 tratamentos diferentes). >>>>> >>>>> Como faço para ver todas as comparações? >>>>> >>>>> Pergunto porque o R da a mensagem >>>>> >>>>> [ reached getOption("max.print") -- omitted 26 rows ] >>>>> >>>>> >>>>> Entendo que ele omitiu 26 linhas. >>>>> >>>>> OBS.: Preciso dos resultados para preencher as letras que diferenciam >>>>> as linhas na tabela de resultados. >>>>> >>>>> >>>>> >>>>> Agradeço qualquer ajuda. >>>>> >>>>> *Emerson* >>>>> _______________________________________________ >>>>> R-br mailing list >>>>> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>>>> https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flistas.inf…<https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br> >>>>> Leia o guia de postagem (https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=http%3A%2F%2Fwww.leg.ufp…<http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia>) e forneça >>>>> código mínimo reproduzível. >>>>> >>>> _______________________________________________ >>>> R-br mailing list >>>> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>>> https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flistas.inf…<https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br> >>>> Leia o guia de postagem (https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=http%3A%2F%2Fwww.leg.ufp…<http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia>) e forneça >>>> código mínimo reproduzível. >>>> >>> _______________________________________________ >>> R-br mailing list >>> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>> https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flistas.inf…<https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br> >>> Leia o guia de postagem (https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=http%3A%2F%2Fwww.leg.ufp…<http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia>) e forneça >>> código mínimo reproduzível. >>> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >> https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flistas.inf…<https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br> >> Leia o guia de postagem (https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=http%3A%2F%2Fwww.leg.ufp…<http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia>) e forneça >> código mínimo reproduzível. >> > -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=http%3A%2F%2Flistas.inf.…<http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20250328/353d2be8/atta…>> ------------------------------ Message: 2 Date: Fri, 28 Mar 2025 13:37:14 -0300 From: Cesar Rabak <cesar.rabak(a)gmail.com> To: Emerson Cotta Bodevan <bodevan.ec(a)gmail.com> Cc: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] TukeyHSD Message-ID: <CAKrF98=5mSpVF215PPJeey+QRF820r+VBtE4WYVHAZwkdmsJ3w(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Como apoio à minha última observação cito dois autores, que eu coloco nos meus relatórios quando é feita uma análise estatística: HTH ?*Always present effect sizes for primary outcomes ? If the units of measurement are meaningful on a practical level ?, then we usually prefer an unstardardized measurement to a standardized measure*.? ? *(Wilkison, L., 1999)**.* ?*In the post p <0.05 era, scientific argumentation is not based on whether a p-value is small enough or not. Attention is paid to effect sizes and confidence intervals. Evidence is thought of as being continuous rather than some sort of dichotomy*.? ? *Ron Wasserstein, executive director of the American Statistical Association**, 2016.* HTH -- Cesar Rabak On Fri, Mar 28, 2025 at 1:13?PM Cesar Rabak <cesar.rabak(a)gmail.com> wrote: > @Emerson: > > Considere adicionar às suas análises uma medida e discussão sobre os > tamanhos dos efeitos observados. > > Ademais, além da diferença mínima detectável dada pelo teste *post hoc* utilizado, > aconselho a verificar qual a acurácia (ou pensando estatisticamente, o > intervalo de confiança) das medidas da variável resposta, que tendo sido > feito a ANOVA, pressuponho seja contínua, pelo menos intervalar. > > HTH > > -- > Cesar Rabak > > > > On Fri, Mar 28, 2025 at 8:49?AM Emerson Cotta Bodevan < > bodevan.ec(a)gmail.com> wrote: > >> Prezados, bom dia. >> >> Primeiramente, obrigado a todos pelo rápido retorno. >> >> Marcelo e Fernando... todas as soluções apresentadas funcionaram >> direitinho. Obrigado. >> >> Luiz e Cesar... obrigado pelas considerações. São 24 tratamentos, o que >> nos leva a 276 comparações dois a dois. Mas consigo separar em blocos de 8 >> tratamentos. Acredito que as discussões serão mais ricas e o teste mais >> adequado. Obrigado mais uma vez. >> >> Abraços. >> >> *Emerson* >> >> >> Em qui., 27 de mar. de 2025 às 23:50, Cesar Rabak por (R-br) < >> r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: >> >>> Pegando carona na resposta do Luiz Alexandre sobre a inadequação do >>> número de tratamentos, que eu concordo, gostaria de acrescentar que >>> parece-me que há poucos casos para o número de tratamentos (a divisão do nº >>> de casos pelo dos tratamentos não dá nem inteiro, o que me leva a pensar >>> que ANOVA pode estar desbalanceada, também...). >>> >>> Uma outra questão mais prática é por que a ANOVA precisa de tantas >>> linhas, a menos que sua formulação inclua interações entre os tratamentos. >>> >>> HTH >>> >>> On Thu, Mar 27, 2025 at 6:01?PM Luiz Peternelli por (R-br) < >>> r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> wrote: >>> >>>> Olá. >>>> Você precisa fazer isso no R? Fará essa análise comparativa de maneira >>>> recorrente, ou somente uma vez e apresentará os resultados num paper? >>>> Se fará somente uma vez e se todos os tratamentos tiverem o mesmo >>>> número de repetições, fazer à mão é extremamente simples, já q o delta da >>>> diferença mínima significativa será único. >>>> >>>> Outro ponto importante: na prática usar esse teste quando se tem muito >>>> tratamentos é inadequado. Só vai trazer mais confusão interpretativa do que >>>> auxílio em tomada de decisão. >>>> >>>> Abraços >>>> >>>> ?Luiz Alexandre Peternelli >>>> >>>> >>>> >>>> >>>> >>>> On Thu, Mar 27, 2025 at 16:06 Marcelo Laia por (R-br) < >>>> r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> wrote: >>>> >>>>> Oi Emerson, você já testou uma das três opções abaixo? >>>>> >>>>> Opção 1: Aumentar o limite de impressão >>>>> >>>>> options(max.print = 10000) # ou qualquer valor maior que o número de >>>>> linhas >>>>> print(resultado) >>>>> >>>>> Opção 2: Acessar diretamente os resultados >>>>> >>>>> resultado$`nome_do_fator` # substitua pelo nome real do fator >>>>> >>>>> Exemplo: >>>>> >>>>> resultado <- TukeyHSD(aov(valor ~ tratamento, data = dados)) >>>>> View(resultado$tratamento) # abrir em visualização tabular >>>>> >>>>> Opção 3: Exportar para Excel ou CSV >>>>> >>>>> write.csv(resultado$tratamento, "tukey_resultados.csv") >>>>> >>>>> Teoricamente, essas abordagens permitirão acessar todas as >>>>> comparações, inclusive as omitidas. >>>>> >>>>> Marcelo >>>>> >>>>> Enviado a partir de dispositivo móvel >>>>> https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flinktr.ee%…<https://linktr.ee/marcelolaia> >>>>> >>>>> Em qui., 27 de mar. de 2025, 15:08, Emerson Cotta Bodevan por (R-br) < >>>>> r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: >>>>> >>>>>> Prezados, boa tarde. >>>>>> >>>>>> Fiz um teste de Tukey, usando o comando >>>>>> >>>>>> resultado<-TukeyHSD(resultado de uma anova) >>>>>> >>>>>> O arquivo tem 276 linhas (24 tratamentos diferentes). >>>>>> >>>>>> Como faço para ver todas as comparações? >>>>>> >>>>>> Pergunto porque o R da a mensagem >>>>>> >>>>>> [ reached getOption("max.print") -- omitted 26 rows ] >>>>>> >>>>>> >>>>>> Entendo que ele omitiu 26 linhas. >>>>>> >>>>>> OBS.: Preciso dos resultados para preencher as letras que diferenciam >>>>>> as linhas na tabela de resultados. >>>>>> >>>>>> >>>>>> >>>>>> Agradeço qualquer ajuda. >>>>>> >>>>>> *Emerson* >>>>>> _______________________________________________ >>>>>> R-br mailing list >>>>>> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>>>>> https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flistas.inf…<https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br> >>>>>> Leia o guia de postagem (https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=http%3A%2F%2Fwww.leg.ufp…<http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia>) e forneça >>>>>> código mínimo reproduzível. >>>>>> >>>>> _______________________________________________ >>>>> R-br mailing list >>>>> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>>>> https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flistas.inf…<https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br> >>>>> Leia o guia de postagem (https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=http%3A%2F%2Fwww.leg.ufp…<http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia>) e forneça >>>>> código mínimo reproduzível. >>>>> >>>> _______________________________________________ >>>> R-br mailing list >>>> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>>> https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flistas.inf…<https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br> >>>> Leia o guia de postagem (https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=http%3A%2F%2Fwww.leg.ufp…<http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia>) e forneça >>>> código mínimo reproduzível. >>>> >>> _______________________________________________ >>> R-br mailing list >>> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>> https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flistas.inf…<https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br> >>> Leia o guia de postagem (https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=http%3A%2F%2Fwww.leg.ufp…<http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia>) e forneça >>> código mínimo reproduzível. >>> >> -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=http%3A%2F%2Flistas.inf.…<http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20250328/1552f22b/atta…>> ------------------------------ Subject: Legenda do Digest _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://na01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Flistas.inf…<https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br> ------------------------------ Fim da Digest R-br, volume 160, assunto 2 *****************************************

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Dados de Votação dos Deputados
by Graciliano Galdino 09 Fev '25

09 Fev '25

Boa tarde gente, quero estudar os dados de votação dos deputados e estou pensando em usar uma análise de ordenação para ver as tendências de votos dos partidos. A primeira ideia que vem é codificar o tipo de voto (Sim, Não, Não votou) em números e rodar uma NMDS. Vocês teriam sugestões mais robustas para essa questão? Geralmente codificar em número não me agrada, mas nesse caso, para análises de ordenação, não enxergo outra solução. Abraços -- Graciliano Galdino A. dos Santos

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Consulta sobre coleta de dados para análise bibliométrica de revistas não indexadas pela Scopus ou WOC
by Ender Ferreira 08 Fev '25

08 Fev '25

Prezados(as) pesquisadores(as), Estou realizando uma análise bibliométrica dos artigos publicados pela Revista História Econômica & História de Empresas utilizando o R-Studio e a interface Biblioshiny. No entanto, a revista não está indexada em bases como Scopus ou Web of Science (WOS), o que dificulta a coleta automatizada de metadados (citações, autores, palavras-chave etc.). Gostaria de pedir a ajuda de vocês com duas dúvidas: 1. Como posso coletar os dados da revista de forma estruturada, já que não está indexada em bases como Scopus ou WOS? Existe alguma ferramenta ou método recomendado para isso? 2. Há tutoriais ou materiais que possam indicar para manipulação de dados bibliométricos quando não se tem acesso a bases indexadas? Agradeço desde já pela atenção e por qualquer orientação que possam oferecer. Toda ajuda é bem-vinda! Atenciosamente,Ender L. Ferreira.

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Cálculo entre áreas
by Izabella Maria Viana 20 Jan '25

20 Jan '25

Boa tarde! Pessoal, alguém conhece alguma função para o cálculo entre duas curvas? Utilizei o pacote "pracma", com a função trapz, que utiliza a regra dos trapézios. Por exemplo: x <- seq(1,100) # Ajustando de duas curvas y1 <- dados1 y2 <- dados2 # Calculo da area diff <- abs(y1 - y2) area <- trapz(x, diff) Este raciocínio está correto? -- Izabella M S Viana Doutoranda em Estatística (UFPE) Economista e Mestre em Economia (UFV) Professora Orientadora USP/ESALq Email secundário: izabella.maria(a)ufpe.br

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Re: [R-br] Teste de Hartley
by Andre Oliveira 20 Jan '25

20 Jan '25

boa noite, a biblioteca faz o teste de Hartley. require(PMCMRplus)hartleyTest(resp ~ as.factor(trat), data = dados) att,.André Em quinta-feira, 19 de setembro de 2013 às 15:01:56 BRT, Luiz Henrique da Conceicao Leal <richfield(a)ig.com.br> escreveu: Pessoal, alguém conhece alguma função que realize o teste de Hartley de homogeneidade de variâncias_______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.

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Uso do ifelse
by Maurício Lordêlo 15 Out '24

15 Out '24

#Olá, #saudações a tod@s!!! #Vou precisar várias comparações múltiplas usando o #teste de Scott Knott #Quero no final, capturar as letras e formar um único vetor #No exemplo abaixo, só serão formados dois "grupos" #Porém pode acontecer de formar um, três ou quatro #Não acontecerá de cinco ou mais #Usei o "ifelse" para isso, porém o retorno é um #vetor de tamanho 1 library(ScottKnott) data(RCBD) sk1 <- with(RCBD, SK(y ~ blk + tra, data=dfm, which='tra')) sk1$out$Result #aqui eu verifico a formação de dois grupos #O objeto que vai ser gerado no final, deveria ser igual a este #aqui grupos = c(sk1$out$Result$G1, sk1$out$Result$G2) grupos[nzchar(grupos)] #Porém, isso não acontece quando eu uso o "ifelse" rm(grupos) grupos = ifelse(dim(sk1$out$Result)[2] == 5, c(sk1$out$Result$G1, sk1$out$Result$G2, sk1$out$Result$G3, sk1$out$Result$G4), ifelse(dim(sk1$out$Result)[2] == 4, c(sk1$out$Result$G1, sk1$out$Result$G2, sk1$out$Result$G3), ifelse(dim(sk1$out$Result)[2] == 3, c(sk1$out$Result$G1, sk1$out$Result$G2), sk1$out$Result$G1))) grupos #O que há de errado?

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Atualização do R
by Elias Carvalho 24 Ago '24

24 Ago '24

Boa tarde pessoal Alguém poderia me recomendar os procedimentos para atualizar o R 4.1 para última versão no Linux Mint ? Eu já segui vários tutoriais, porém nenhum deles funcionou. -- *In Jesu et Maria* *Obrigado / Thank you* *Prof. Dr. Elias Carvalho* *"Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC)"Blessed is he who has been able to understand the cause of things"*

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Acesso aos microdados caged e rais via filezilla
by Recursos Humanos [POSICIONAL.COM®] 25 Jul '24

25 Jul '24

Olá, amigos, boa tarde. Alguém sabe como configurar o FTP de acesso aos microdados caged e rais? Não sei o que aconteceu, mas o Explorer do Windows 11 não está facilitando as coisas para a conexão com a base de dados no PDET/MTE. Algo mudou e não encontro uma solução. No site do MTE diz que é possível fazer esta conexão via Filezilla. Já tentei várias combinações de configuração e não encontro o jeito. Se alguém puder me ajudar agradeço antecipadamente. Abraços. Cícero da Conceição Nunes Consultor Master Remuneração +55 (16) 997-680-226 +55 (11) 999-780-026 <mailto:cicero.nunes@posicional.com> cicero.nunes(a)posicional.com POSICIONAL.COM® Cargos, Salários e Carreiras <http://www.posicional.com/> www.posicional.com <https://comercial.posicional.com/> <https://www.facebook.com/posicional> <https://twitter.com/posicional> <https://www.linkedin.com/company/posicional.com-consultoria-empresarial-ltd a>

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Re: [R-br] Extração de Dados do SUS
by Pedro Paulo Chrispim 11 Jul '24

11 Jul '24

Prezados, Como Tura, uso os dados do DATASUS há muitos anos. Não encontrei nada melhor do que manter uma cópia dos dados em sua máquina e extrair os dados de interesse direto dos DBC. Isso porque as bases não são muito uniformes e as correções nos scripts são relativamente frequentes. Apesar do trabalho maravilhoso que o DATASUS faz nas bases, pois seria um verdadeiro pesadelo usar os dados verdadeiramente crus. Já os dados individualizados não são exatamente o problema, os arquivos DBC fornecem dados individualizados por ficha de registro em cada sistema. Então, se o objetivo for a identificação dos pacientes, isso já não será possível pelos dados públicos. Por fim, minha experiência pessoal (que é maior no caso das AIH) me levou a trabalhar com data.table por razão de performance. Embora não seja uma recomendação definitiva, fica a sugestão. Pedro Paulo Chrispim Inst. Alicerce > On 10 Jul 2024, at 11:00, r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br wrote: > > Enviar submissões para a lista de discussão R-br para > r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou > corpo da mensagem para > r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo > endereço > r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será > mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." > > > Tópicos de Hoje: > > 1. Re: Extração de Dados do SUS (Cesar Rabak) > 2. Re: Extração de Dados do SUS (Bernardo Rangel Tura) > > > ---------------------------------------------------------------------- > > Message: 1 > Date: Tue, 9 Jul 2024 23:49:28 -0300 > From: Cesar Rabak <cesar.rabak(a)gmail.com> > To: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] Extração de Dados do SUS > Message-ID: > <CAKrF98kbYG82aR9nF_qB4crhJMm9x2xJ6BG2cuzjNUTV4-=odA(a)mail.gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Se o formato do SISAB for documentada certamente é factível gerar um código > para extrair os dados e colocá-los nas estruturas de dados convenientes > para uso no R, provavelmente dataframes ou os mais modernos tibles. > > On Tue, Jul 9, 2024 at 9:07?PM Hidelbrando Rodrigues por (R-br) < > r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> wrote: > >> Olá a todos. >> >> Permitam-me participar da conversa. Nosso laboratório LAMAPP (Laboratório >> de Monitoramento e Avaliação de Políticas Públicas), aqui da federal do >> Amazonas, tem parceria com o Centro de Estudos Estratégicos do FIOCRUZ. >> >> Nós criamos um curso de Ciência de Dados Aplicado à Saúde. Ele será >> hospedado em uma plataforma que ainda vamos definir. Ele será aberto e >> gratuito. Utilizamos como base, dados do SISAB, que não são tão amigáveis >> para baixar. >> >> Diante do exposto, seguem as questões: >> >> * Seria possível criar um código para extrair essa base diretamente do >> site?? >> >> * Existem outros pacotes para baixar dados de saúde, além do mencionado >> nesta conversa? >> >> Att. >> >> Hidelbrando >> >> >> >> >> Em ter., 9 de jul. de 2024 12:59, Elias Carvalho por (R-br) < >> r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: >> >>> Caro Bernardo, eu agradeço antecipadamente >>> Eu trabalho no TI de uma universidade estadual e temos nosso hospital >>> universitário que atende muita gente, se não me engano além da cidade, >>> atende mais de 100 municípios ao redor. >>> Nosso problema é que o hospital usa o GSUS (prontuário do PR) e este não >>> exporta dados, não tem API (pelo menos para nós). >>> Gostaríamos de ter informações sobre prontuário, atendimento >>> ambulatorial, prescrição de medicamentos, imagens e laudos de forma >>> analítica, pois eu trabalho com BI (Qlik Sense) e gostaria de gerar >>> gráficos e tabelas com esses dados, além de pedir para minha equipe >>> desenvolver softwares de apoio com base nessas informações. >>> Eu creio que todos esses dados são exportados para o SUS e daí uma >>> tentativa seria extraí-los pelo R. >>> >>> Em ter., 9 de jul. de 2024 às 12:28, Bernardo Rangel Tura por (R-br) < >>> r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: >>> >>>> Elias o pacote do Rafael é maravilhoso vivo sugerindo para as pessoas >>>> usarem mas para algumas coisas às vezes não funciona, quase sempre porque >>>> as bases são muito mal feitas. >>>> Como trabalho com elas a mais e 20 anos estou acostumando a resolver >>>> esse tipo de encrenca. >>>> Que tal você descrever o que precisa e crio um script para você? >>>> >>>> Bernardo Tura >>>> NBB - INC/MS >>>> On 6/18/24 15:19, Elias Carvalho por (R-br) wrote: >>>> >>>> Outra coisa, consigo extrair dados da BPA-I (*Boletim de Produção >>>> Ambulatorial ? Individualizado*) ? >>>> >>>> Em ter., 18 de jun. de 2024 às 15:04, Elias Carvalho <ecacarva(a)gmail.com> >>>> escreveu: >>>> >>>>> Procurei aqui mas não achei, pelo fetch_datasus, dá para extrair dados >>>>> de um CNES específico Rafael ? >>>>> >>>>> Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:59, Raphael Saldanha < >>>>> rfsaldanha(a)gmail.com> escreveu: >>>>> >>>>>> Obrigado! Para filtrar por um hospital específico, você precisa saber >>>>>> o código CNES da unidade de saúde. Você pode procurar o código aqui: >>>>>> cnes.datasus.gov.br >>>>>> On 2024-06-18 15:57, Elias Carvalho wrote: >>>>>> >>>>>> Excelente Rafael ! Muito bom seu pacote. >>>>>> Vou dar uma olhada, no momento eu preciso extrair informações de um >>>>>> hospital público específico >>>>>> >>>>>> Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:40, Raphael Saldanha por (R-br) < >>>>>> r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: >>>>>> >>>>>>> Olá Elias, >>>>>>> >>>>>>> Os dados de atendimentos ambulatoriais da dimensão pública do SUS são >>>>>>> registrados em um sistema de informações em saúde denominado Sistema de >>>>>>> Informações Ambulatoriais. >>>>>>> >>>>>>> Você consegue acessar esses dados com o R usando o pacote >>>>>>> {microdatasus} >>>>>>> >>>>>>> https://rfsaldanha.github.io/microdatasus/ >>>>>>> >>>>>>> Posso te ajudar com mais detalhes se precisar. >>>>>>> >>>>>>> >>>>>>> Abraços, >>>>>>> >>>>>>> Raphael Saldanha >>>>>>> >>>>>>> >>>>>>> On 2024-06-18 15:34, Elias Carvalho por (R-br) wrote: >>>>>>> >>>>>>> Bom dia pessoal >>>>>>> Alguém sabe se há algum pacote do R que extraia dados de atendimentos >>>>>>> do SUS ? >>>>>>> >>>>>>> >>>>>>> >>>>>>> -- >>>>>>> >>>>>>> >>>>>>> *In Jesu et Maria * >>>>>>> >>>>>>> *Obrigado / Thank you * >>>>>>> *Prof. Dr. Elias Carvalho* >>>>>>> >>>>>>> * "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed >>>>>>> is he who has been able to understand the cause of things" * >>>>>>> >>>>>>> _______________________________________________ >>>>>>> R-br mailing listR-br@listas.c3sl.ufpr.brhttps://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>>>>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. >>>>>>> >>>>>>> _______________________________________________ >>>>>>> R-br mailing list >>>>>>> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>>>>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>>>>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >>>>>>> código mínimo reproduzível. >>>>>>> >>>>>> >>>>>> >>>>>> -- >>>>>> >>>>>> >>>>>> *In Jesu et Maria * >>>>>> >>>>>> *Obrigado / Thank you * >>>>>> *Prof. Dr. Elias Carvalho* >>>>>> >>>>>> * "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed >>>>>> is he who has been able to understand the cause of things" * >>>>>> >>>>>> >>>>> >>>>> -- >>>>> >>>>> >>>>> *In Jesu et Maria * >>>>> >>>>> *Obrigado / Thank you * >>>>> *Prof. Dr. Elias Carvalho* >>>>> >>>>> * "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed >>>>> is he who has been able to understand the cause of things" * >>>>> >>>> >>>> >>>> -- >>>> >>>> >>>> *In Jesu et Maria * >>>> >>>> *Obrigado / Thank you * >>>> *Prof. Dr. Elias Carvalho* >>>> >>>> * "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed is >>>> he who has been able to understand the cause of things" * >>>> >>>> _______________________________________________ >>>> R-br mailing listR-br@listas.c3sl.ufpr.brhttps://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. >>>> >>>> _______________________________________________ >>>> R-br mailing list >>>> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >>>> código mínimo reproduzível. >>>> >>> >>> >>> -- >>> >>> >>> *In Jesu et Maria* >>> >>> *Obrigado / Thank you* >>> *Prof. Dr. Elias Carvalho* >>> >>> *"Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC)"Blessed is he >>> who has been able to understand the cause of things"* >>> _______________________________________________ >>> R-br mailing list >>> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >>> código mínimo reproduzível. >>> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >> código mínimo reproduzível. >> > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20240709/94c49b96/atta…> > > ------------------------------ > > Message: 2 > Date: Wed, 10 Jul 2024 08:39:58 -0300 > From: Bernardo Rangel Tura <listasrtura(a)gmail.com> > To: "Hidelbrando Rodrigues por (R-br)" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] Extração de Dados do SUS > Message-ID: <65425f85-4744-43e2-854e-04a8b521e96f(a)gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed" > > Bom dia Hidelbrando > > Eu nunca trabalhei com dados do SISAB mas acredito qeu seja possivel > fazer sim e tipo de rotina, teria que ver o formato dos dados, um > pacote que pode ser interessante para você é o SIDRA > > Abraços > > Bernardo Tura > > NBB - INC/MS > > > On 7/9/24 21:06, Hidelbrando Rodrigues por (R-br) wrote: >> Olá a todos. >> >> Permitam-me participar da conversa. Nosso laboratório LAMAPP >> (Laboratório de Monitoramento e Avaliação de Políticas Públicas), aqui >> da federal do Amazonas, tem parceria com o Centro de Estudos >> Estratégicos do FIOCRUZ. >> >> Nós criamos um curso de Ciência de Dados Aplicado à Saúde. Ele será >> hospedado em uma plataforma que ainda vamos definir. Ele será aberto e >> gratuito. Utilizamos como base, dados do SISAB, que não são tão >> amigáveis para baixar. >> >> Diante do exposto, seguem as questões: >> >> * Seria possível criar um código para extrair essa base diretamente do >> site?? >> >> * Existem outros pacotes para baixar dados de saúde, além do >> mencionado nesta conversa? >> >> Att. >> >> Hidelbrando >> >> >> >> >> Em ter., 9 de jul. de 2024 12:59, Elias Carvalho por (R-br) >> <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: >> >> Caro Bernardo, eu agradeço antecipadamente >> Eu trabalho no TI de uma universidade estadual e temos nosso >> hospital universitário que atende muita gente, se não me engano >> além da cidade, atende mais de 100 municípios ao redor. >> Nosso problema é que o hospital usa o GSUS (prontuário do PR) e >> este não exporta dados, não tem API (pelo menos para nós). >> Gostaríamos de ter informações sobre prontuário, atendimento >> ambulatorial, prescrição de medicamentos, imagens e laudos de >> forma analítica, pois eu trabalho com BI (Qlik Sense) e gostaria >> de gerar gráficos e tabelas com esses dados, além de pedir para >> minha equipe desenvolver softwares de apoio com base nessas >> informações. >> Eu creio que todos esses dados são exportados para o SUS e daí uma >> tentativa seria extraí-los pelo R. >> >> Em ter., 9 de jul. de 2024 às 12:28, Bernardo Rangel Tura por >> (R-br) <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: >> >> Elias o pacote do Rafael é maravilhoso vivo sugerindo para as >> pessoas usarem mas para algumas coisas às vezes não funciona, >> quase sempre porque as bases são muito mal feitas. >> Como trabalho com elas a mais e 20 anos estou acostumando a >> resolver esse tipo de encrenca. >> Que tal você descrever o que precisa e crio um script para você? >> >> Bernardo Tura >> NBB - INC/MS >> >> On 6/18/24 15:19, Elias Carvalho por (R-br) wrote: >>> Outra coisa, consigo extrair dados da BPA-I (*Boletim de >>> Produção Ambulatorial ? Individualizado*) ? >>> >>> Em ter., 18 de jun. de 2024 às 15:04, Elias Carvalho >>> <ecacarva(a)gmail.com> escreveu: >>> >>> Procurei aqui mas não achei, pelo fetch_datasus, dá para >>> extrair dados de um CNES específico Rafael ? >>> >>> Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:59, Raphael Saldanha >>> <rfsaldanha(a)gmail.com> escreveu: >>> >>> Obrigado! Para filtrar por um hospital específico, >>> você precisa saber o código CNES da unidade de saúde. >>> Você pode procurar o código aqui: cnes.datasus.gov.br >>> <http://cnes.datasus.gov.br> >>> >>> On 2024-06-18 15:57, Elias Carvalho wrote: >>>> Excelente Rafael ! Muito bom seu pacote. >>>> Vou dar uma olhada, no momento eu preciso extrair >>>> informações de um hospital público específico >>>> >>>> Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:40, Raphael >>>> Saldanha por (R-br) <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: >>>> >>>> Olá Elias, >>>> >>>> Os dados de atendimentos ambulatoriais da >>>> dimensão pública do SUS são registrados em um >>>> sistema de informações em saúde denominado >>>> Sistema de Informações Ambulatoriais. >>>> >>>> Você consegue acessar esses dados com o R usando >>>> o pacote {microdatasus} >>>> >>>> https://rfsaldanha.github.io/microdatasus/ >>>> >>>> Posso te ajudar com mais detalhes se precisar. >>>> >>>> >>>> Abraços, >>>> >>>> Raphael Saldanha >>>> >>>> >>>> On 2024-06-18 15:34, Elias Carvalho por (R-br) >>>> wrote: >>>>> Bom dia pessoal >>>>> Alguém sabe se há algum pacote do R que extraia >>>>> dados de atendimentos do SUS ? >>>>> >>>>> >>>>> >>>>> -- >>>>> /In Jesu et Maria >>>>> >>>>> / >>>>> /Obrigado / Thank you >>>>> / >>>>> /Prof. Dr. Elias Carvalho/ >>>>> / >>>>> / >>>>> / >>>>> "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" >>>>> (Virgil 29 BC) >>>>> "Blessed is he who has been able to understand >>>>> the cause of things" >>>>> / >>>>> >>>>> _______________________________________________ >>>>> R-br mailing list >>>>> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. >>>> _______________________________________________ >>>> R-br mailing list >>>> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>>> Leia o guia de postagem >>>> (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >>>> código mínimo reproduzível. >>>> >>>> >>>> >>>> -- >>>> /In Jesu et Maria >>>> >>>> / >>>> /Obrigado / Thank you >>>> / >>>> /Prof. Dr. Elias Carvalho/ >>>> / >>>> / >>>> / >>>> "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil >>>> 29 BC) >>>> "Blessed is he who has been able to understand the >>>> cause of things" >>>> / >>> >>> >>> >>> -- >>> /In Jesu et Maria >>> >>> / >>> /Obrigado / Thank you >>> / >>> /Prof. Dr. Elias Carvalho/ >>> / >>> / >>> / >>> "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) >>> "Blessed is he who has been able to understand the cause >>> of things" >>> / >>> >>> >>> >>> -- >>> /In Jesu et Maria >>> >>> / >>> /Obrigado / Thank you >>> / >>> /Prof. Dr. Elias Carvalho/ >>> / >>> / >>> / >>> "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) >>> "Blessed is he who has been able to understand the cause of >>> things" >>> / >>> >>> _______________________________________________ >>> R-br mailing list >>> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e >> forneça código mínimo reproduzível. >> >> >> >> -- >> /In Jesu et Maria >> >> / >> /Obrigado / Thank you >> / >> /Prof. Dr. Elias Carvalho/ >> / >> / >> / >> "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) >> "Blessed is he who has been able to understand the cause of things" >> / >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e >> forneça código mínimo reproduzível. >> >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20240710/5629f82b/atta…> > > ------------------------------ > > Subject: Legenda do Digest > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > > ------------------------------ > > Fim da Digest R-br, volume 155, assunto 3 > *****************************************

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