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Como identificar colinearidade?
by Chiara Lubich 18 Out '19

18 Out '19

Boa tarde, Pessoal fiz uma análise de GLM, porém no resultado do modelo ficava aparecendo a seguinte mensagem: Coefficients: (2 not defined because of singularities). Buscando na internet, vi que se trata de colinearidade dos dados, porém não sei como identificar. Na mesma página de internet que encontrei a sugestão de identificar utilizando o comando pairs(), para tentar detectar colinearidade. Mas não sei como fazer a interpretação do gráfico gerado: Segue o gráfico com a variável Y1= CM: CM= Comprimento médio (contínua) D = distância do rio (contínua) R = rios (categórica - nome dos rios) TP = tempo de pesca (Dummy - 0= rios considerados tradicionais e 1= rios com pesca recente) NP= número de pescador por rio [image: image.png] Se puderem me ajuda na explicação de como identifico a colinearidade a partir do gráfico, agradeço. Ou até mesmo outra forma de encontrar... Abraço

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Correlação de Pearson com escala Likert
by Angélica Ricarte 17 Out '19

17 Out '19

Prezados, boa noite. Por gentileza, poriam me ajudar? Preciso fazer uma análise de correlação de Pearson para resultados de uma pesquisa de satisfação para a qual foi utilizado um questionário e realizadas modificações em escala Likert, em que: [cid:image002.png@01D5846B.3C568D50] Alguém sabe me informar qual o pacote do R trabalha com tal análise e como fazê-la? Utilizo o “agricolae” para fazer correlação, mas não havia feito nada antes com escala Likert. Toda informação sobre esta escala me será útil. Grata, aguardo retorno. Abraços, Angélica.

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Re: [R-br] RES: Digest R-br, volume 106, assunto 6
by sznelwar＠uol.com.br 11 Out '19

11 Out '19

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RES: Digest R-br, volume 106, assunto 6
by Max 10 Out '19

10 Out '19

Marcelo Laia Preparei o script e tentei disponibilizar neste link: https://gist.github.com/Verginio/d671ff36b852c68b6ba7b7f59114a22e Pelo que entendi, daria para realizar esta tarefa com a função “group_by” seguidas de “summarise”. Em que a primeira define quais variáveis serão agrupadas e a segunda executa o cálculo para os grupos. library(dplyr) df_summ <- df_bolsa %>% group_by(CPF, Nome) %>% summarise( `Quantidade Parcelas` = n(), `Valor Mês` = mean(Valor), #média `Valor Ano` = sum(Valor) #somatório ) #Resultado head(df_summ) Abraços, Max Verginio De: r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br Enviado:quinta-feira, 10 de outubro de 2019 12:00 Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Assunto: Digest R-br, volume 106, assunto 6 Enviar submissões para a lista de discussão R-br para r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou corpo da mensagem para r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo endereço r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." Tópicos de Hoje: 1. Organizar data.frame e sumarizar dados em transposição (Marcelo Laia) 2. Modelos lineares generalizados multivariados -literatura (Jose Wellingthon Dos Santos) 3. Re: Organizar data.frame e sumarizar dados em transposição (Cesar Rabak) 4. Re: Organizar data.frame e sumarizar dados em transposição (Marcelo Laia) 5. Re: Modelos lineares generalizados multivariados -literatura (Walmes Zeviani) ---------------------------------------------------------------------- Message: 1 Date: Wed, 9 Oct 2019 12:28:26 -0300 From: Marcelo Laia <marcelolaia(a)gmail.com> To: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: [R-br] Organizar data.frame e sumarizar dados em transposição Message-ID: <20191009152826.GC25795@localhost> Content-Type: text/plain; charset=iso-8859-1 Caro(a), Aqui na Universidade nós temos que sumarizar e organizar os dados dos discentes bolsistas por mês e valor recebido de bolsa. Os dados estão assim: CPF Nome Descrição Data Valor xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Permanência 01/02/2018 200,00 xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Permanência 01/03/2018 200,00 xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Integração 01/04/2018 200,00 xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Integração 01/07/2018 400,00 xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Manutenção 01/08/2018 400,00 xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Emergencial 01/06/2018 200,00 Nós precisamos da seguinte saída: CPF Nome Quantidade Parcelas Valor Mês Valor Ano xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal 6 266,67 1600,00 Se puder ajudar, agradeço! -- Marcelo ------------------------------ Message: 2 Date: Wed, 9 Oct 2019 15:46:40 -0300 (BRT) From: Jose Wellingthon Dos Santos <jose-wellingthon.santos(a)embrapa.br> To: a lista Brasileira oficial de discussÃ£o do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Cc: "walmes " <walmes(a)ufpr.br>, "walmeszeviani " <walmeszeviani(a)gmail.com> Subject: [R-br] Modelos lineares generalizados multivariados -literatura Message-ID: <1889187931.11565119.1570646800406.JavaMail.root(a)embrapa.br> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" Oi pessoal, Alguém conhece literatura para modelos lineares generalizados multivariados? Att -- José Wellingthon dos Santos Pesquisador - Métodos Quantitativos Embrapa Algodão Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) Campina Grande, PB jose-wellingthon.santos(a)embrapa.br Telefone: +55 (83) 3182-4401 | Fax: +55 (83) 3182-4367 www.embrapa.br/algodao | https://twitter.com/embrapa_algodao Confira também: www.facebook.com/agrosustentavel ----- Mensagem original ----- De: "Marcelo Laia por (R-br)" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Para: "a lista Brasileira oficial de discussão do programa R." <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Cc: "Marcelo Laia" <marcelolaia(a)gmail.com> Enviadas: Quarta-feira, 9 de outubro de 2019 12:28:26 Assunto: [R-br] Organizar data.frame e sumarizar dados em transposição Caro(a), Aqui na Universidade nós temos que sumarizar e organizar os dados dos discentes bolsistas por mês e valor recebido de bolsa. Os dados estão assim: CPF Nome Descrição Data Valor xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Permanência 01/02/2018 200,00 xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Permanência 01/03/2018 200,00 xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Integração 01/04/2018 200,00 xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Integração 01/07/2018 400,00 xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Manutenção 01/08/2018 400,00 xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Emergencial 01/06/2018 200,00 Nós precisamos da seguinte saída: CPF Nome Quantidade Parcelas Valor Mês Valor Ano xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal 6 266,67 1600,00 Se puder ajudar, agradeço! -- Marcelo _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. ____________________________________________________________________________ Aviso de confidencialidade Esta mensagem da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria (Embrapa), empresa publica federal regida pelo disposto na Lei Federal no. 5.851, de 7 de dezembro de 1972, e enviada exclusivamente a seu destinatario e pode conter informacoes confidenciais, protegidas por sigilo profissional. Sua utilizacao desautorizada e ilegal e sujeita o infrator as penas da lei. Se voce a recebeu indevidamente, queira, por gentileza, reenvia-la ao emitente, esclarecendo o equivoco. Confidentiality note This message from Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria (Embrapa), a government company established under Brazilian law (5.851/72), is directed exclusively to its addressee and may contain confidential data, protected under professional secrecy rules. Its unauthorized use is illegal and may subject the transgressor to the law's penalties. If you are not the addressee, please send it back, elucidating the failure. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20191009/38dbdf38/atta…> ------------------------------ Message: 3 Date: Wed, 9 Oct 2019 16:32:38 -0300 From: Cesar Rabak <cesar.rabak(a)gmail.com> To: R-br <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Organizar data.frame e sumarizar dados em transposição Message-ID: <CAKrF98mdt6jM3Sne8+iiHxDMWEs0_HUmKehmg23Lq+ha-McyEA(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Sem um CMR é difícil ser assertivo, mas o delineamento do que você deseja seria obter uma lista sem repetições da coluna dos CPF (*uniq*), e usando os itens dessa lista como parâmetro para *which* ou *subset* fazer a soma e contar o número de parcelas adicionando no novo dataframe esses resultados. HTH -- Cesar Rabak On Wed, Oct 9, 2019 at 12:28 PM Marcelo Laia por (R-br) < r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> wrote: > Caro(a), > > Aqui na Universidade nós temos que sumarizar e organizar os dados dos > discentes > bolsistas por mês e valor recebido de bolsa. > > Os dados estão assim: > > CPF Nome Descrição Data Valor > xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Permanência 01/02/2018 200,00 > xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Permanência 01/03/2018 200,00 > xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Integração 01/04/2018 200,00 > xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Integração 01/07/2018 400,00 > xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Manutenção 01/08/2018 400,00 > xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Emergencial 01/06/2018 200,00 > > > Nós precisamos da seguinte saída: > > CPF Nome Quantidade Parcelas Valor Mês Valor > Ano > xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal 6 266,67 1600,00 > > Se puder ajudar, agradeço! > > -- > Marcelo > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20191009/fa39d328/atta…> ------------------------------ Message: 4 Date: Wed, 9 Oct 2019 16:53:19 -0300 From: Marcelo Laia <marcelolaia(a)gmail.com> To: a lista Brasileira oficial de discussÃ£o do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Organizar data.frame e sumarizar dados em transposição Message-ID: <20191009195319.GE20280@localhost> Content-Type: text/plain; charset=iso-8859-1 Então, Cesar. Eu tentei fazer um CMR mas não tive conhecimento para tal. Eu tentei com a família apply e com os pacotes dplyr, tidyr e plyr [1]. Não dei conta de fazer. Se puder ajudar, terá que dar mastigado. Isso não é um experimento. Precisamos fazer um relatório aqui na Universidade sobre bolsas dadas a discentes vulneráveis e preciso tratar os dados para inclui-los numa plataforma fixa do governo. Pra eu calcular isso na unha (calc) vai ser muito demorado e temos um prazo. Mas, eu sei que a lista não é pra esse tipo de coisa (dar mastigado). Abração Obrigado 1. http://www.rpubs.com/Kassio_Ferreira/tutorialdplyr Marcelo On 09/10/19 at 04:32, Cesar Rabak por (R-br) wrote: > Sem um CMR é difícil ser assertivo, mas o delineamento do que você > deseja seria obter uma lista sem repetições da coluna dos CPF (uniq), e > usando os itens dessa lista como parâmetro para which ou subset fazer a > soma e contar o número de parcelas adicionando no novo dataframe esses > resultados. > HTH > -- > Cesar Rabak > > On Wed, Oct 9, 2019 at 12:28 PM Marcelo Laia por (R-br) > <[1]r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> wrote: > > Caro(a), > Aqui na Universidade nós temos que sumarizar e organizar os dados > dos discentes > bolsistas por mês e valor recebido de bolsa. > Os dados estão assim: > CPF Nome Descrição Data Valor > xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Permanência 01/02/2018 200,00 > xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Permanência 01/03/2018 200,00 > xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Integração 01/04/2018 200,00 > xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Integração 01/07/2018 400,00 > xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Manutenção 01/08/2018 400,00 > xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal Bolsa Emergencial 01/06/2018 200,00 > Nós precisamos da seguinte saída: > CPF Nome Quantidade Parcelas Valor Mês > Valor Ano > xxx.xxx.xxx-xx Fulano de Tal 6 266,67 > 1600,00 > Se puder ajudar, agradeço! > -- > Marcelo > _______________________________________________ > R-br mailing list > [2]R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > [3]https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem ([4]http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e > forneça código mínimo reproduzível. > > Referências > > 1. mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br > 2. mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br > 3. https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > 4. http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. -- Marcelo ------------------------------ Message: 5 Date: Wed, 9 Oct 2019 18:05:14 -0300 From: Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com> To: Jose Wellingthon Dos Santos <jose-wellingthon.santos(a)embrapa.br> Cc: a lista Brasileira oficial de discussÃ£o do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Modelos lineares generalizados multivariados -literatura Message-ID: <CAFU=EkbNPd5EA=_RRCuVSBOiS4RF4ACSTCiFxvcc0W=q+b+YKg(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" José Wellingthon O prof. Wagner e eu oferecemos um Curso da 62ª RBras que foi em Lavras sobre análise multivariada de dados experimentais http://cursos.leg.ufpr.br/mcglm4aed/ Dê uma olhada no material. Você tem uma necessidade específica de orientação para uma análise ou procura material geral? À disposição. Walmes. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20191009/546c75b5/atta…> ------------------------------ Subject: Legenda do Digest _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ------------------------------ Fim da Digest R-br, volume 106, assunto 6 *****************************************

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MCMCglmm - Parameter Expansion
by Andre Oliveira 03 Out '19

03 Out '19

bom dia! Alguém da lista trabalhou com esta biblioteca? O que seria Parameter Expansion? Sei que é uma reparametrização de priori, mas, não consegui enxergar a distribuição de prob. que se prõe ao usar a Parameter Expansion. att,.André

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Re: [R-br] Ajuda com análise conjunta de dois experimentos com parcelas subdividas
by sznelwar＠uol.com.br 03 Out '19

03 Out '19

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fluxograma no Rmarkdown
by Luiz Leal 02 Out '19

02 Out '19

Prezados, bom dia.Alguém ja utilizou o DiagrammeR com o Rmarkdown?Há um espaço excessivo entre o fluxograma e o texto. Alguém pode me ajudar? (em anexo está o arquivo Rmd)Desde já agradeçoLuiz

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Ajuda com análise conjunta de dois experimentos com parcelas subdividas
by José Lucas Safanelli 02 Out '19

02 Out '19

Caros colegas, Peço ajuda a vocês para conseguir entender e analisar o seguinte experimento: - são dois experimentos feitos lado a lado: um com plantio direto, outro com convencional. - em cada local, existe um experimento de parcelas subdividades, sendo o fator manejo na parcela e dose de nitrogenio na subparcela. Diante disso, gostaria de saber como expressar o modelo da ANOVA no R, a fim de fazer comparação de médias, e mais pra frente, análise multivariada via discriminante canonica. Sei que são necessárias duas coisas: - Dividir o erro dentro da abordagem da análise conjunta. - Dividir o erro na parcela subdividida. Tenho utilizado a seguinte expressão, mas não estou confiante quanto a expressão. Infelizmente nunca trabalhei com experimento mais complexos como este. aov_N <- aov(N_kg_ha ~ Manejo * Rotacao * Nitrogenio + Bloco + Error(Nitrogenio/Bloco/Manejo), data = dados) summary(aov_N) Tanto o croqui quanto os dados estão neste link: https://drive.google.com/drive/folders/1rjVv9KwtE5A7y-VPXTV9Y2GlilKLXK2F?us… Agradeço se alguém puder me ajudar com alguma orientação. José Lucas.

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Ajuda: Escolha de distribuição de probabilidade (GLM)
by Chiara Lubich 30 Set '19

30 Set '19

Oi, Estou tendo dificuldade para achar uma distribuição certa para minha análise (GLM)... Mesmo dados não são normais e também não apresentam homoscedasticidade, mesmo após realizar transformação (log). Qual família devo escolher? Estava trabalhando com binomial negativa, é a correta? Obrigada e aguardo retorno -- *Chiara Lubich Cardoso Furtado* Mestranda em Biologia de Água Doce e Pesca Interior - INPA Engenheira de Pesca - UFAM Telefone: (92) 99110-6657 e-mail: lubichchiara(a)gmail.com Lattes: http://lattes.cnpq.br/0673892253719514

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dic parcela subdividida no tempo
by ANDREA VITA REIS MENDONCA 20 Set '19

20 Set '19

Trata-se de um experimento deduzas temperaturas e seis períodos de avaliação, em DIC. Resolvi conforme mostrado a seguir. Gostaria de saber se está correto. As analises ficaram boas. pkg= c("lattice", "latticeExtra", "doBy", "multcomp", "reshape", "plyr", "nlme") sapply(pkg, require, character.only=TRUE) source("http://dl.dropboxusercontent.com/u/48140237/bandas.R") sessionInfo() trellis.device(color=FALSE) ang=read.csv("ang.csv") str(ang) dh=melt(subset(ang, select=1:8), id.vars=1:2) d=diff(as.Date(c("2017-01-01","2017-01-16", "2017-01-31","2017-02-15", "2017-03-02","2017-03-17"))); d d =cumsum(c(15, d)); d dh$dia=d[as.integer(dh$variable)] levels(dh$variable) xyplot(value~dia|Temperatura, groups=Temperatura, data=dh, type=c("p","a"), auto.key=TRUE) dh1=transform(dh, D=factor(dia), parc=interaction(Rep, Temperatura), subp=interaction(Rep, Temperatura)) str(dh1) m2=lme(value~Temperatura*D, random=~1|parc/subp, data=dh1, method="ML") m3=lme(value~Temperatura*D, random=~1|parc/subp, data=dh1, method="REML") -- Andrea Vita Reis Mendonça Profa. Associado I UFRB/CCAAB

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