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Re: [R-br] Engasgada com o RStudio
by Danielle Steffen 14 Nov '13

14 Nov '13

Oi Raphael, Estou usando o Knitr. Ja gerei o relatorio em HTML, ficou bonitinho, mas queria mandar pra PDF, sem charlatanices como usar o Primo PDF. Abs, Danielle Em Quinta-feira, 14 de Novembro de 2013 6:19, Raphael Saldanha <rfsaldanha(a)gmail.com> escreveu: Olá Danielle, Você está usando o Sweave, Brew ou coisa do tipo? 2013/11/14 Danielle Steffen <daniellesteffen(a)yahoo.com> Oi, help. > > >Instalei o RStudio ha um tempinho, venho usando pra sintaxes menores, mas hoje queria salvar em PDF. No video do pai da crianca na internet aparece uma abinha extra do lado o Workspace, que eh Compile PDF ou Save PDF, e nao sei pq nao meu nao tem., > > >Ja instalei o Sumatra pra PDF Preview, ja instalei o MikTex pra poder ter o pdfLatex, mas nada, o erro que da quando tento compliar o Sweave (apesar de usar o Knitr, estou "consertando" isso no Sweave primeiro), o erro que da eh > > >Running pdflatex.exe on pdfsync.tex...failed >Error running C:/PROGRA~1/MIKTEX~1.9/miktex/bin/pdflatex.exe (exit code 1) > > >Alguem me da uma dica? Tenho que mudar o caminho do diretorio de onde o tranqueira do RStudio busca o pdfLatex? Tenho que reinstalar o MikTex? > > >Agradeco as sugestoes atencipadamente. >Danielle >_______________________________________________ >R-br mailing list >R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. >

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Engasgada com o RStudio
by Danielle Steffen 14 Nov '13

14 Nov '13

Oi, help. Instalei o RStudio ha um tempinho, venho usando pra sintaxes menores, mas hoje queria salvar em PDF. No video do pai da crianca na internet aparece uma abinha extra do lado o Workspace, que eh Compile PDF ou Save PDF, e nao sei pq nao meu nao tem., Ja instalei o Sumatra pra PDF Preview, ja instalei o MikTex pra poder ter o pdfLatex, mas nada, o erro que da quando tento compliar o Sweave (apesar de usar o Knitr, estou "consertando" isso no Sweave primeiro), o erro que da eh Running pdflatex.exe on pdfsync.tex...failed Error running C:/PROGRA~1/MIKTEX~1.9/miktex/bin/pdflatex.exe (exit code 1) Alguem me da uma dica? Tenho que mudar o caminho do diretorio de onde o tranqueira do RStudio busca o pdfLatex? Tenho que reinstalar o MikTex? Agradeco as sugestoes atencipadamente. Danielle

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centralizar gráfico
by luc.souza＠usp.br 13 Nov '13

13 Nov '13

Boa noite a todos. Preciso colocar três gráficos em uma mesma figura. Utilizo a função par(mfrow=c(2,2)) Porém, fica sobrando um espaço no último quadrante. Como faço para centralizar o gráfico que fica na metade inferior? Obrigado Lucas Lucas F. de Souza Eng. Agrícola - CONAB M.Sc. Produção Vegetal - UENF Doutorando Engenharia de Sistemas Agrícolas - ESALQ/USP tel: (19) 8160-7068

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Tinn-R: nova versão
by Jose Claudio Faria 13 Nov '13

13 Nov '13

Prezados, Como nem todo mundo fica verificando se existe uma nova versão dos software que usa, e alguns não tem o recurso de verificação automática, venho informar o seguinte: - Após um longo período de desenvolvimento e testes, semana passada foram liberadas 2 novas versõe estáveis do projeto Tinn-R. - As novidades (são muitas) podem ser lidas nos links abaixo: - http://sourceforge.net/p/tinn-r/news/2013/11/tinn-r-3018-released/ - http://sourceforge.net/p/tinn-r/news/2013/11/tinn-r-3019-released/ - Para atualizar: - Fazer download da nova última versão (3.0.1.9) - Desinstalar a antiga (usar o desinstalador do Tinn-R) - Instalar a nova. - Essa versão não necessita mais do script que ficava no arquivo Rprofile.site. (e caso exista recomenda-se remover ou comentar). - Todas as informações são providas pelo novo (e necessário) pacote TinnRcom que acompanha o aplicativo (não está no CRAN). - Links para download: - http://nbcgib.uesc.br/lec/software/editores/tinn-r/pt - http://sourceforge.net/projects/tinn-r/ Ab, -- ///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\ Jose Claudio Faria Estatistica UESC/DCET/Brasil joseclaudio.faria at gmail.com Telefones: 55(73)3680.5545 - UESC 55(73)9100.7351 - TIM 55(73)8817.6159 - OI ///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\

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Dados agrupados
by Maicon J. Galiazzi 13 Nov '13

13 Nov '13

Bom diaSabem me dizer se há a possibilidade operar com dados agrupados no R, e como fazer?Se existe funções que calculem media, mediana e outras descritivas para dados agrupados.E se o R agrupa um conjunto de dados qualquer a partir de um numero de classes desejado. Obrigado por enquanto. Att Maicon J. Galiazzi

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Manual
by Maicon J. Galiazzi 13 Nov '13

13 Nov '13

Olá, estou desenvolvendo um manual de fácil utilização ao usuário, e no momento estou descrevendo a interfacedo software R Stuio 0.97.551, assim como a barra de ferramentas do mesmo. Podem me indicar algum material no qual posso conferir? Desde já agradeço! Att Maicon J. Galiazzi

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ordenar um data.frame
by Aline Lipsky 13 Nov '13

13 Nov '13

Boa tarde a todos, Gostaria de uma ajuda com o seguinte: Tenho um data frame como esse: Animal Ordem Data Especie Sexo Peso 1 47 1 54 1 55 2 52 2 54 2 56 1 53 1 52 1 58 3 57 3 56 3 59 A estrutura é a seguinte: data.frame': 20 obs. of 6 variables: $ Animal : Factor w/ 10 levels "Barcelona","Baronesa",..: 1 4 7 1 4 7 3 2 10 8 ... $ Ordem: int 1 1 1 2 2 2 1 1 1 1 ... $ Data: Factor w/ 19 levels "01/01/2007","01/02/2004",..: 5 4 2 19 13 8 10 11 15 12 ... $ Especie : Factor w/ 5 levels "","",..: 1 2 3 1 4 5 5 4 4 5 ... $ Sexo : Factor w/ 2 levels "F","M": 2 1 1 1 1 2 2 1 2 2 ... $ Peso: num 47 54 55 52 54 56 53 52 58 57 ... Preciso ordenar primeiro todo o data.frame em ordem crescente de acordo com a ordem e depois ordenar todo o data.frame deacordo com o peso em ordem crescente. Agradeço pela ajuda, Aline

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Processar arquivo .rnw
by Andre Oliveira 13 Nov '13

13 Nov '13

Senhores estou meio enferrujado aqui no Sweave. Fiz um print aqui e não deu o esperado. <<>>= setwd("/media/Meus arquivos/Pendrive/KINGSTON/sweave/apostilaR2") require(gdata) dad<-read.xls("dados.xls") str(dad) attach(dad) require(xtable) test=xtable(dad, align = "llllll") print(test, table.placement = "H") @ Saida impressa no pdf. \begin{table}[ht] \centering \begin{tabular}{llllll} \hline & sexo & esc & sal & idad & filhos \\ \hline 1 & masculino & 1 grau & 4.00 & 26 & 0 \\ 2 & masculino & 1 grau & 4.56 & 32 & 1 \\ 3 & feminino & 1 grau & 5.25 & 36 & 2 \\ 4 & masculino & 2 grau & 5.73 & 20 & 0 \\ 5 & feminino & 1 grau & 6.26 & 40 & 1 \\ 6 & masculino & 1 grau & 6.66 & 28 & 1 \\ 7 & feminino & 1 grau & 6.86 & 41 & 0 \\ 8 & masculino & 1 grau & 7.39 & 43 & 0 \\ 9 & feminino & 2 grau & 7.59 & 34 & 1 \\ 10 & masculino & 2 grau & 7.84 & 23 & 0 \\ 11 & feminino & 2 grau & 8.12 & 33 & 2 \\ 12 & masculino & 1 grau & 8.46 & 27 & 0 \\ 13 & feminino & 2 grau & 8.74 & 37 & 0 \\ 14 & masculino & 1 grau & 8.95 & 44 & 3 \\ 15 & feminino & 2 grau & 9.13 & 30 & 0 \\ 16 & masculino & 2 grau & 9.35 & 38 & 3 \\ 17 & feminino & 2 grau & 9.77 & 31 & 1 \\ 18 & masculino & 1 grau & 9.80 & 39 & 2 \\ 19 & feminino & superior & 10.53 & 25 & 1 \\ 20 & masculino & 2 grau & 10.76 & 37 & 0 \\ 21 & feminino & 2 grau & 11.06 & 30 & 1 \\ 22 & masculino & 1 grau & 11.59 & 34 & 2 \\ 23 & feminino & 2 grau & 12.00 & 41 & 4 \\ 24 & masculino & superior & 12.79 & 26 & 0 \\ 25 & feminino & 2 grau & 13.23 & 32 & 2 \\ 26 & masculino & 2 grau & 13.60 & 35 & 2 \\ 27 & feminino & 1 grau & 13.85 & 46 & 0 \\ 28 & masculino & 2 grau & 14.69 & 29 & 2 \\ 29 & masculino & 2 grau & 14.71 & 40 & 5 \\ 30 & masculino & 2 grau & 15.99 & 35 & 2 \\ 31 & feminino & superior & 16.22 & 31 & 3 \\ 32 & masculino & 2 grau & 16.61 & 36 & 1 \\ 33 & feminino & superior & 17.26 & 43 & 3 \\ 34 & masculino & superior & 18.75 & 33 & 4 \\ 35 & feminino & 2 grau & 19.40 & 48 & 2 \\ 36 & masculino & superior & 23.30 & 42 & 3 \\ \hline \end{tabular} \end{table} Não se espera que imprima uma tabela com linhas? O que fiz de errado? André Oliveira Souza

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Customização de gráficos com a função plot() [Resolvido]
by Tiago Souza Marçal 13 Nov '13

13 Nov '13

Consegui aqui. ################################################################# Tiago de Souza Marçal - Graduando em Agronomia pelo CCA-UFES Bolsista de Iniciação Científica da área de Genética e Melhoramento de Plantas #################################################################

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Contrastes em modelos de regressão de poisson inflacionados por zeros
by ASANTOS 13 Nov '13

13 Nov '13

Caros membros, Gostaria de fazer a junção de termos qualitativos não significativos, através de análises de contraste de modelos, para verificar a semelhança entre tratamentos, no entanto, usando modelos de regressão de poisson inflacionados por zeros, aproveitando um modelo do Walmes fiz: #------------------------------------------------------------------ # Definições da sessão. rm(list=ls()) require(pscl) require(multcomp) require(lattice) require(latticeExtra) #------------------------------------------------------------------ # Dados artificiaiscom 3 tratamentos e 10 tempos da <- expand.grid(trat=gl(3,1), tempo=1:10) X <- model.matrix(~trat+tempo, da); ncol(X) betas <- c(0.1,0.1,0.3,0.5) eta <- X%*%betas y1 <- rpois(da$trat, lambda=exp(eta)) y2 <- rbinom(y1, size=1, prob=0.7) da$y <- y1*y2 str(da) xyplot(y~tempo|trat, data=da, jitter.x=TRUE) #------------------------------------------------------------------ # Ajuste do modelo. compl.mod <- zeroinfl(y~trat+tempo|trat, data=da) summary(compl.mod) #------------------------------------------------------------------ # Contrate de modelos de poisson inflacionado com zeros sort(tapply(da$y,da$trat,mean))#Ordena as médias trat2<-da$trat levels(trat2) levels(trat2)[1]<-"T1eT3" levels(trat2)[3]<-"T1eT3" levels(trat2) reduc.mod<-zeroinfl(y~trat2+tempo|trat, data=da) # Comparando o modelo completo e o ajunte com junção dos tratamentos 1 e 3 pchisq(-2*(logLik(compl.mod)-logLik(reduc.mod)),df=3,lower.tail=FALSE) # Na minha simulação: #[1] 1 #attr(,"df") #[1] 7 #attr(,"class") #[1] "logLik" Então pergunto: T1 e T3 são iguais e podem ser representados por um único modelo, isto esta correto? Ou existe alguma outra abordagem? Obrigado, -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 ======================================================================

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