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Correlação canônica
by Marcos Toebe 10 Jan '14

10 Jan '14

Prezados! Alguém saberia me informar um pacote do r com o qual eu poderia fazer a análise de correlação canônica a partir de matrizes de correlação de dimensões diferentes? Por exemplo, um grupo X com matriz de correlação simétrica de dimensão 3x3 e um grupo Y com dimensão 4x4. Teria que ser um pacote ou comando que permitisse a análise a partir dessas matrizes, pois tenho problema de multicolinearidade num dos grupos e optei por adicionar uma constante *k *na diagonal dessa matriz para corrigir esse problema. Desde já agradeço pela ajuda *----------------------* *Marcos Toebe* *Engenheiro Agrônomo - UFSM* *Mestre em Agronomia - UFSM* *Doutorando em Agronomia - UFSMProfessor de Estatística e Experimentação da* *Universidade Federal do Pampa - Itaqui - RS* m.toebe(a)gmail.com 55-96617761

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Vaga para doutorado em geoestatistica (Wagningen)
by Wenceslau Teixeira 09 Jan '14

09 Jan '14

Caro Moderador, veja a viabilidade de divulgar esta nota na Lista do R. Cordialmente, Wenceslau ___________________________________ Dear colleagues, We have a PhD vacancy on ‘Bayesian geostatistics for mapping soil and agronomic variables’.Perhaps you know suitable candidates, in which case we hope that you will forward them this email. Please also feel free to forward this message to anyone who might know of suitable candidates. The application deadline is January 20. More information and application instructions at https://www.academictransfer.com/employer/WUR/vacancy/21307/lang/en/. Best wishes, Gerard Gerard B.M. Heuvelink Wageningen University and ISRIC World Soil Information P.O. Box 47 6700 AA Wageningen The Netherlands -- Wenceslau Teixeira wgt007(a)gmail.com skype: wgt007

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Re: [R-br] Análise de agrupamento
by Marcos Vital 08 Jan '14

08 Jan '14

Natália, é possível que o problema seja a métrica que você está utilizando. Aparece um erro quando você calcula a matriz de distância usando Bray Curtis? É isso? Ou é alguma outra coisa? Não sei se o coeficiente de Bray Curtis aceita linhas com zeros. Acredito que não aceite, pois acho que uma linha de zeros não deva fazer muito sentido nesta métrica. Normalmente usamos Bray Curtis para comparar comunidades biológicas de acordo com sua similaridade de composição e abundâncias de espécies (algo como a "estrutura" da comunidade), e neste contexto uma linha só de zeros não dá informações úteis para compreendermos as relações de similaridade. Se for isto mesmo, a questão aqui é encontrar uma métrica que possa responder a sua pergunta. Aliás, este é um ponto crucial: qual a sua pergunta? Por que os zeros importam? Dependendo da situação você pode até criar uma métrica própria usando a função designdist, também do pacote vegan. Se precisar de uma boa literatura sobre estas medidas, sugiro começar pelo Numerical Ecology (Legendre & Legendre). Abraços Marcos -- Marcos Vinícius Carneiro Vital Universidade Federal de Alagoas Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde Setor de Biodiversidade e Ecologia

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Diferença no teste de Qui quadrado com e sem arredondamento
by ASANTOS 08 Jan '14

08 Jan '14

Boa tarde Pessoal, Gostaria de comparar duas variáveis var1 e var2 pelo teste de qui-quadrado e pergunto se é incorreto ou não fazer o arrendondamento com round() da var2, se nos dois casos os resultados são ligeiramente semelhantes, segue CRM abaixo: # Sem arredondamento var1<-c(11, 8, 8, 8, 7, 14) var2<-c(14.550682, 15.971429, 19.086132 , 3.403902 , 9.441030, 15.817173) teste1<-rbind(var1,var2) (Xsq <- chisq.test(teste1,correct=TRUE)) # # Com arredondamento var1<-c(11, 8, 8, 8, 7, 14) var2<-c(14.550682, 15.971429, 19.086132 , 3.403902 , 9.441030, 15.817173) teste2<-rbind(var1,round(var2)) (Xsq <- chisq.test(teste2,correct=TRUE)) # Obrigado, -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 ======================================================================

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[OFF-TOPIC] Qual a diferença entre duas abordagens espaciais?
by ASANTOS 08 Jan '14

08 Jan '14

Boa tarde Pessoal, Estou estudando algumas abordagens utilizando GLM para a predição espacial e me deparei com uma dúvida, qual a diferença entre o ajuste de modelos GLM com o pacote geoRglm preconizado pelo Prof Paulo e o ajuste de modelos GLM com a função glm() e posterior uso dos resíduos no ajuste de semivariogramas como o pacote gstat preconizado pelo Prof. Tomislav Hengl, qundo o objetivo é a predição espacial da densidade de uma variável tendo variáveis explicativas a altitude, temperatura, etc, Obrigado -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 ======================================================================

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Rmpi
by Vinicius Brito Rocha 08 Jan '14

08 Jan '14

Pessoal, estou começando a estudar processamento em paralelo. O pacote Rmpi não possui versão para windows. É isso mesmo? Pelo que vi o pacote snow utiliza dependências desses pacotes. trabalho em uma maquina co win 7 e 4gb. Abs -- *Vinicius Brito Rocha.* *Estatístico e Atuário * * M.Sc. Engenharia de Produção/PO*

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Duvida sobre expressões regulares.
by Augusto Ribas 07 Jan '14

07 Jan '14

Ola a todos, e feliz ano novo. Suponha que eu tenho o seguinte exemplo: # exemplo<-c("Bursey et al. (2001)", "Bursey et al. (2001)", "Bursey et al. (2001)", "Bursey et al. (2001)", "Martins and Fabio (2005)", "Martins and Fabio (2005)", "Martins and Fabio (2005)", "Vicente et al. (1991)", "Vicente et al. (1991); Martins and Fabio (2005)", "Vicente et al. (1991)", "Vicente et al. (1991); Martins and Fabio (2005)", "Martins and Fabio (2005)", "Martins and Fabio (2005)", "Walton (1935)", "Yamaguti (1958)", "Iannacone (2003a)", "Iannacone (2003a)", "Iannacone (2003a)", "Iannacone (2003a)", "Iannacone (2003a)", "Iannacone (2003a)", "Iannacone (2003a)", "Goldberg and Bursey (2003)", "Goldberg and Bursey (2003)", "Goldberg and Bursey (2003)", "Combes and Laurent (1978)", "Baker (1980a)", "Yamaguti (1961); Sueldo and Ramirez (1976); Baker (1987) ", "Lent and Freitas (1948); Ramirez et al. (1979)", "Ramallo et al. (2007)", "Ramallo et al. (2007)", "Yamaguti (1958)", "Travassos et al. (1969)", "Travassos et al. (1969)", "González and Hamann (2007a; 2007b)" , "González and Hamann (2007a; 2007b)" , "González and Hamann (2007b)" , "Travassos (1926a)", "Vicente et al. (1991); McAllister et al. (2010b)", "Kloss (1971; 1974)", "Rodrigues et al. (1982); Vicente et al. (1991)", "Walton (1935); Vicente et al. (1991)", "Vicente et al. (1991)", "Walton (1935); Vicente et al. (1991)", "Vicente et al. (1991)", "McAllister et al. (2010b)", "Vicente et al. (1991)", "Vicente et al. (1991)", "Vicente et al. (1991); McAllister et al. (2010b)", "Vicente et al. (1991)" ) # Isso esta como uma coluna de um data-frame na verdade. Eu gostaria de fazer uma expressão regular que encontra-se casos como "González and Hamann (2007a; 2007b)", mas não os outros. Então seria algo como abre parenteses, 4 números, uma letra, ponto e virgula, espaço 4 números e uma letra, fecha parenteses. Eu tentei varias coisas e não consegui. Eu imagino que se eu fizer algo para encontrar abre parenteses, ponto e virgula, fecha parenteses, sendo o independente do conteudo dentro do parenteses, basta abrir o parenteses, ter um ponto e virgula e fechar o parenteses, ja resolveria, sendo que o antes do parenteses podem ter qualquer coisas (nome de autores). Então alguém poderia me ajudar a conseguir uma expressão regular que pega-se casos como esse exemplo "González and Hamann (2007a; 2007b)" em que há dois anos e um ponto e virgula dentro do parenteses mas não pegue outros casos? Bem é isso, agradeço desde ja qualquer ajuda :) -- Grato Augusto C. A. Ribas Site Pessoal: http://recologia.com.br/ <http://augustoribas.heliohost.org> Github: https://github.com/Squiercg Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056

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(sem assunto)
by Ari Clecius 06 Jan '14

06 Jan '14

Bom dia alguém sabe como acrescento o valor da média e do desvio padrão em cada ,ponto deste gráfico, ou seja, um label para cada ponto? Att, Ari Clecius Alves de Lima Engenheiro Químico Me. Engenharia Civil (085)87687786 (085)33669042 #código library(scatterplot3d) x=c(-1,-1,-1,-1,-1,0,1,0,0,1,0,0,1,1,0) y=c(-1,-1,0,1,0,1,0,-1,-1,-1,-1,1,1,0,0) z=c(-1,0,1,0,-1,-1,-1,-1,1,0,-1,1,0,1,0) w=scatterplot3d(x,y,z, highlight.3d = T, angle = 45, scale.y = .5,xlab="Concentração", ylab="pH",zlab="Agitação",col.axis="blue",type="n") w$points3d(x,y,z,col="red",pch=20,cex=5)

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Problemas ao instalar Vim e vim-r-plugin
by Fernando 04 Jan '14

04 Jan '14

Caros amigos, Estou tentando instalar o editor Vim e o plugin Vim-r-plugin seguindo as recomendações existentes no endereço: http://www.lepem.ufc.br/jaa/r-plugin.html#r-plugin-installation, escrito pelo Jackson A. Aquino e o José Claudio Faria, autores do plugin. Eu instalei o Gvim, R, Tmux,Vimcom plus e screen.vba. Então seguindo as recomendações, estou tendo dificuldades na seguinte parte: Start a terminal emulator, go to the directory where you have downloaded the plugin and type: | vim Vim-R-plugin.vmb| Then, in Vim, type: | :so %| Press|<Enter>| and the plugin will be installed (because the plugin has many files, you have to press the space bar a few times to finish the installation). You should, then, quit Vim.|Note:| if you need too install the plugin in a non default directory, do :UseVimball [path]. Eu adicionei o comando "|vim Vim-R-plugin.vmb|" no terminal o que fez o editor Vim abrir no entanto ao inserir o comando so% aparece o seguinte mensagem: Erro detectado ao processar function vimball#Vimball: linha 10: (Vimball) The current file does not appear to be a Vimball! Aperte ENTER ou digite um comando para continuar É a primeira vez que estou instalando o Vim e por isso não tenho noção de onde estou errando. Alguém pode me guiar de forma mais simples (para Dummies mesmo!) em como fazer a instalação? Atenciosamente

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Pacote incompatível com R 3.0.0
by Jefferson Ferreira Ferreira 04 Jan '14

04 Jan '14

Colegas, Estou tentando trabalhar com os pacotes PPAHomeRange e DI_func ( http://www.geog.uvic.ca/spar/PPAHomeRange/index.html / http://www.geog.uvic.ca/spar/DynamicInteraction/index.html) No entanto, estou recebendo a mensagem package ‘PPAHomeRange’ is not available (for R version 3.0.0). Algum de vocês acha que há uma forma de contornar esse problema sem ter que fazer um "downgrade" ? Abraço -- *Jefferson Ferreira Ferreira* Geógrafo – GEOPROCESSAMENTO IDSM | Coordenadoria de TI Jefferson.ferreira(a)mamiraua.org.br *Instituto de Desenvolvimento Sustentável Mamirauá* Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação Telefone: +55 97 3343-9710 *Google Maps* - Mapas deste e-mail: Exibir mapa ampliado<https://maps.google.com.br/maps?q=-3.355557,-64.731151&ll=-3.355471,-64.731…> *Contatos particulares:* *(55) 9615-0100MSN: jecogeo(a)yahoo.com.br <jecogeo(a)yahoo.com.br>*

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