Outubro 2016 - R-br

Problemas para instalar RNetCDF no Rstudio (linux)
by Paulo Henrique Pimenta 12 Out '16

12 Out '16

Olá a todos, Estou tentando instalar o RNetCDF no R do qual uso, num ubunutu 12.04 no RStudio, porém não consigo instalar o pacote aparecendo o seguinte erro: ####### > install.packages("RNetCDF") Installing package into '/home/notemaster/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0' (as 'lib' is unspecified) --2016-10-11 17:49:52-- https://cran.rstudio.com/src/contrib/RNetCDF_1.8-2.tar.gz Resolvendo cran.rstudio.com (cran.rstudio.com) 54.192.56.107 Conectando-se a cran.rstudio.com (cran.rstudio.com)|54.192.56.107|:443... conectado. A requisição HTTP foi enviada, aguardando resposta... 200 OK Tamanho: 95693 (93K) [application/x-gzip] Salvando em: "/tmp/Rtmpbh1Jqr/downloaded_packages/RNetCDF_1.8-2.tar.gz" 0K .......... .......... .......... .......... .......... 53% 68,7K 1s 50K .......... .......... .......... .......... ... 100% 50,2K=1,6s 2016-10-11 17:49:54 (58,7 KB/s) - "/tmp/Rtmpbh1Jqr/downloaded_packages/RNetCDF_1.8-2.tar.gz" salvo [95693/95693] * installing *source* package 'RNetCDF' ... ** package 'RNetCDF' successfully unpacked and MD5 sums checked checking for nc-config... yes checking for gcc... gcc -std=gnu99 checking whether the C compiler works... yes checking for C compiler default output file name... a.out checking for suffix of executables... checking whether we are cross compiling... no checking for suffix of object files... o checking whether we are using the GNU C compiler... yes checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed checking how to run the C preprocessor... gcc -std=gnu99 -E checking for grep that handles long lines and -e... /bin/grep checking for egrep... /bin/grep -E checking for ANSI C header files... yes checking for sys/types.h... yes checking for sys/stat.h... yes checking for stdlib.h... yes checking for string.h... yes checking for memory.h... yes checking for strings.h... yes checking for inttypes.h... yes checking for stdint.h... yes checking for unistd.h... yes checking netcdf linker flags... -L/usr/lib -lnetcdf checking netcdf pre-processor and compiler flags... -I/usr/include -DgFortran checking for library containing XML_StopParser... no checking for library containing utFree... no checking for library containing utScan... no configure: error: "unable to use udunits2 or udunits" ERROR: configuration failed for package 'RNetCDF' * removing '/home/notemaster/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0/RNetCDF' Warning in install.packages : installation of package 'RNetCDF' had non-zero exit status The downloaded source packages are in '/tmp/Rtmpbh1Jqr/downloaded_packages' > library(RNetCDF) Erro em library(RNetCDF) : there is no package called 'RNetCDF' #################### Tentei usar o pacote netcdf, mas não consegui devido ao pacote ter sido descontinuado. Espero que alguém possa me ajudar, pois sou novo no uso de netcdf no R. Abraços a todos. Paulo Henrique de A. S. Pimenta. Graduando em Meteorologia (Bacharelado) - IAG/USP. Fone: +5511981318435.

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Re: [R-br] Extração de dados climáticos
by sznelwar＠uol.com.br 10 Out '16

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pacote Hyfo
by Elisa Henning 10 Out '16

10 Out '16

Bom dia a todos Estóu com um problema ao usar o pacote Hyfo do R. Precisamos que os dados estejam na forma de lista (list); Gostaria de saber como converter em lista um data.frame contendo na primeira coluna a data e nas demais, as observações (precipitação) de cada estação. Obrigado Elisa

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Re: [R-br] Regexp no grep para linhas que não iniciam com sequência
by Rafael Tieppo 05 Out '16

05 Out '16

Eder, tudo bem?Tentando ajudar, caso tenha alguma máquina com linux, tenho a seguinte sugestão. obs.: parece que o update do windows 10 tem ou terá uma layer do shell do linux test <- c("SPA100", "MSA200", "MSB300", "MSC400", "MSC500", "PRA100", "PRC200", "MGV100", "MTJ400", "MTK500") write.csv(test, "eder.csv", row.names = FALSE) ## indo para o Shell grep -v "MS" < eder.csv ## para salvar em outro arquivo grep -v "MS" < eder.csv > eder2.csv cat eder2.csv espero ter ajudadoSaudações Rafael Tieppo State University of Mato Grosso - Department of Agricultural Engineering site: http://docente.unemat.br/rafaeltieppo/ blog: https://fuidebicicleta.wordpress.com"Evite o desperdício: antes de imprimir pense na sua responsabilidade com o ambiente". On Tuesday, October 4, 2016 11:00 AM, "r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br> wrote: Enviar submissões para a lista de discussão R-br para r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou corpo da mensagem para r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo endereço r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." Tópicos de Hoje: 1. "alternativa não-paramétrica" para o teste de Dunnett (Luiz Leal) 2. Re: Processamento paralelo para um modelo de treinamento (Tito Conte) 3. Re: "alternativa não-paramétrica" para o teste de Dunnett (Tito Conte) 4. Identificar variáveis dicotomicas (Elias Carvalho) 5. Re: Identificar variáveis dicotomicas (Eduardo Junior) 6. Re: Identificar variáveis dicotomicas (Felipe) 7. Re: "alternativa não-paramétrica" para o teste de Dunnett (Luiz Henrique Leal) 8. Regexp no grep para linhas que não iniciam com sequência (Éder Comunello) 9. Re: Regexp no grep para linhas que não iniciam com sequência (Marcus Nunes) ---------------------------------------------------------------------- Message: 1 Date: Mon, 3 Oct 2016 16:24:09 +0000 (UTC) From: Luiz Leal <richfield1974(a)yahoo.com> To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: [R-br] "alternativa não-paramétrica" para o teste de Dunnett Message-ID: <318158849.4552633.1475511849793(a)mail.yahoo.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Boa tarde a todos.Alguém sabe se existe uma "alternativa não-paramétrica" para o teste de Dunnett?Desde já agradeçoLuiz ...Dunnett's test is a multiple comparison procedure to compare each of a number of treatments with a single control. ... -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20161003/2222ae8c/atta…> ------------------------------ Message: 2 Date: Mon, 3 Oct 2016 17:37:36 -0300 From: Tito Conte <tito.conte(a)gmail.com> To: Fernando Gama <f.fabiogama88(a)gmail.com>, a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Processamento paralelo para um modelo de treinamento Message-ID: <CACqq46womHtn9eivqKSQG2K_SdSD9zuSF=9JQG82wWoJuJQAYQ(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Ele está rodando paralelo? Você verificou? Se unix use o comando top e aperte 1 Se windows abra o gerenciador de tarefas e verifique os núcleos de trabalho. Aproveite para ver se é a CPU do seu PC o problema. Pode ser a memória ou a escrita do disco. Uma solução de baixissimo nível, mas que funciona. é você quebrar o código. Em partes e rodar vários Rs, cada um com uma etapa, gerar uns arquivos intermediários e depois concatena tudo. Tito Conte Em 2 de outubro de 2016 08:41, Fernando Gama via R-br < r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: > Pessoal, > > Estou tentando treinar um modelo com 192 atributos e meu objetivo é, no > pós-treinamento, identificar os atributos mais importantes. (seleção de > features). > > A questão é que estou tendo problemas para treinar o modelo porque o > processamento é extremamente lento. Pesquisei sobre o parallel e o > doParallel e coloquei no meu código mas aparentemente não obtive resultados > segue um trecho do código: > > library(caret) > library(doParallel) > > myControl <- trainControl(method = "repeatedcv", number = 10, repeats = 3, > allowParallel = TRUE) > > t<-proc.time() > > cl <- makeCluster(detectCores()) > > registerDoParallel(cl) > > model <- train(GENRE~., data=dtset_genres, method="lvq", preProcess = > "scale", trControl = myControl) > > stopCluster(cl) > > proc.time()-t > > > Alguma sugestão? > > -- > Att, > > | Fernando Gama da Mata | > | Database Specialist | Master's Degree UFPA | > > | Contacts: +55 91 99150 0365 | f.fabiogama88(a)gmail.com | Social > Networks: [ <https://www.facebook.com/fernando.gama.13>][ > <https://plus.google.com/+FernandoGama13>][ > <https://www.linkedin.com/in/fernandogama>] | > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20161003/6d0dada5/atta…> ------------------------------ Message: 3 Date: Mon, 3 Oct 2016 17:38:38 -0300 From: Tito Conte <tito.conte(a)gmail.com> To: Luiz Leal <richfield1974(a)yahoo.com>, a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] "alternativa não-paramétrica" para o teste de Dunnett Message-ID: <CACqq46zura6UmNb=YD0RG84RF4hucLL-MT2aRKQQC8aXVbqnsQ(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Achei isso: "I'm pretty sure Dunnett's Test is for parametric data only. You can use Mann Whitney follow up tests and just divide alpha by how many follow ups you need to run to take a conservative approach." Tito Conte 2016-10-03 13:24 GMT-03:00 Luiz Leal via R-br <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br>: > Boa tarde a todos. > Alguém sabe se existe uma "alternativa não-paramétrica" para o teste de > Dunnett? > Desde já agradeço > Luiz > > ... > *Dunnett's test* is a multiple comparison > <https://en.wikipedia.org/wiki/Multiple_comparisons> procedure to compare > each of a number of treatments with a single control. > ... > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20161003/1a2c2fb0/atta…> ------------------------------ Message: 4 Date: Mon, 3 Oct 2016 20:18:27 -0300 From: Elias Carvalho <ecacarva(a)gmail.com> To: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: [R-br] Identificar variáveis dicotomicas Message-ID: <CAH8E6UvJE4FJdg3sqPSyEJuUy1QR45KEW0B3kTS4i6QUCyypEw(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Boa noite pessoal Existe alguma função do R que permite identificar variáveis dicotomicas em um dataframe ? Como por exemplo: 0 e 1 ou 1 e 2 no mesmo dataframe Obrigado -- *In Jesu et Maria* *Obrigado* *Prof. Elias Carvalho* -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20161003/4c256e4c/atta…> ------------------------------ Message: 5 Date: Mon, 3 Oct 2016 20:48:23 -0300 From: Eduardo Junior <edujrrib(a)gmail.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Identificar variáveis dicotomicas Message-ID: <CAO7eVPz+Nbop7a6e6=yvmMcT4ab2jJOp7KWQoHYvcbT_omCeDA(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" As funções nativas. ## Mostra quantos valores unicos tem em cada coluna sapply(dados, function(x) length(unique(x))) ## Os iguais a dois ... sapply(dados, function(x) length(unique(x))) == 2L Att, Eduardo E. R, Junior <http://jreduardo.github.io/> -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20161003/bf2f4bad/atta…> ------------------------------ Message: 6 Date: Mon, 3 Oct 2016 20:57:38 -0300 From: Felipe <felipe.e.barletta(a)gmail.com> To: Elias Carvalho <ecacarva(a)gmail.com>, a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Identificar variáveis dicotomicas Message-ID: <efd9e8d7-87a5-26cf-bca9-3bf1576561b0(a)gmail.com> Content-Type: text/plain; charset=utf-8; format=flowed Se as variáveis dicotômicas tiverem valores 0 ou 1, pode tentar da seguinte maneira: dados <- data.frame(x1=rbinom(100,1,.5),x2=rnorm(100)) sapply(dados, function(x) all(x%in%c(0,1))) x1 x2 TRUE FALSE ------------------------------ Message: 7 Date: Mon, 03 Oct 2016 22:50:14 -0300 From: Luiz Henrique Leal <richfield1974(a)yahoo.com> To: Tito Conte <tito.conte(a)gmail.com> Cc: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] "alternativa não-paramétrica" para o teste de Dunnett Message-ID: <owgspse5irq36a1succbe6m8.1475545814367(a)email.android.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Muito obrigado Conectado pela Motorola Tito Conte <tito.conte(a)gmail.com> escreveu: >Achei isso: > >"I'm pretty sure Dunnett's Test is for parametric data only. You can use Mann Whitney follow up tests and just divide alpha by how many follow ups you need to run to take a conservative approach." > > >Tito Conte > > >2016-10-03 13:24 GMT-03:00 Luiz Leal via R-br <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br>: > >Boa tarde a todos. > >Alguém sabe se existe uma "alternativa não-paramétrica" para o teste de Dunnett? > >Desde já agradeço > >Luiz > > >... > >Dunnett's test is a multiple comparison procedure to compare each of a number of treatments with a single control. > >... > > >_______________________________________________ >R-br mailing list >R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. > > -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20161003/8ca1874d/atta…> ------------------------------ Message: 8 Date: Tue, 4 Oct 2016 08:49:15 -0400 From: Éder Comunello <comunello.eder(a)gmail.com> To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: [R-br] Regexp no grep para linhas que não iniciam com sequência Message-ID: <CABmC8gmXyf0Cv1movTQqUktHucnSUSd-rxLWv0CLDZLcG6aEcw(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Senhores, bom dia! Considerando o vetor: test <- c("SPA100", "MSA200", "MSB300", "MSC400", "MSC500", "PRA100", "PRC200", "MGV100", "MTJ400", "MTK500") Posso obter facilmente os valores iniciados com a sequência "MS": grep("^MS", test, val=T) # [1] "MSA200" "MSB300" "MSC400" "MSC500" Uma primeira tentativa, sem sucesso, para obter linhas que não iniciam com a sequência foi: grep("^!(MS)", test, val=T) # character(0) Consegui uma solução estranha com: grep("^[^M]|^M[^S]", test, val=T) # [1] "SPA100" "PRA100" "PRC200" "MGV100" "MTJ400" "MTK500" Mas essa solução é limitada quando usando strings maiores, tal como "MSC". Embora existam alternativas como: test[-grep("^MSC", test)] # [1] "SPA100" "MSA200" "MSB300" "PRA100" "PRC200" "MGV100" "MTJ400" "MTK500" Gostaria de saber se há uma forma fácil de fazer isso usando diretamente uma regexp. Grato, ================================================ Éder Comunello Researcher at Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa) DSc in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq) MSc in Environ. Sciences (UEM), Agronomist (UEM) --- Embrapa Agropecuária Oeste, Dourados, MS, Brazil |<O>| ================================================ GEO, -22.2752, -54.8182, 408m UTC-04:00 / DST: UTC-03:00 -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20161004/ed7972df/atta…> ------------------------------ Message: 9 Date: Tue, 4 Oct 2016 10:14:36 -0300 From: Marcus Nunes <marcus.nunes(a)gmail.com> To: comunello.eder(a)gmail.com, a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Regexp no grep para linhas que não iniciam com sequência Message-ID: <CA+QGQvvMACE6i_RA46nvpY-T34QS9hxZadhbNsaezwhXTg4SbQ(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Se entendi corretamente o teu problema, não é necessário utilizar uma regex: test <- c("SPA100", "MSA200", "MSB300", "MSC400", "MSC500", "PRA100", "PRC200", "MGV100", "MTJ400", "MTK500") grep("MS", test, val=T, invert=T) 2016-10-04 9:49 GMT-03:00 Éder Comunello via R-br <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> : > Senhores, bom dia! > > Considerando o vetor: > > test <- c("SPA100", "MSA200", "MSB300", "MSC400", "MSC500", > "PRA100", "PRC200", "MGV100", "MTJ400", "MTK500") > > Posso obter facilmente os valores iniciados com a sequência "MS": > grep("^MS", test, val=T) > > # [1] "MSA200" "MSB300" "MSC400" "MSC500" > > > Uma primeira tentativa, sem sucesso, para obter linhas que não iniciam com > a sequência foi: > grep("^!(MS)", test, val=T) > # character(0) > > Consegui uma solução estranha com: > grep("^[^M]|^M[^S]", test, val=T) > > # [1] "SPA100" "PRA100" "PRC200" "MGV100" "MTJ400" "MTK500" > > > Mas essa solução é limitada quando usando strings maiores, tal como "MSC". > > Embora existam alternativas como: > test[-grep("^MSC", test)] > > # [1] "SPA100" "MSA200" "MSB300" "PRA100" "PRC200" "MGV100" "MTJ400" "MTK500" > > > Gostaria de saber se há uma forma fácil de fazer isso usando diretamente > uma regexp. > > Grato, > > ================================================ > Éder Comunello > Researcher at Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa) > DSc in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq) > MSc in Environ. Sciences (UEM), Agronomist (UEM) > --- > Embrapa Agropecuária Oeste, Dourados, MS, Brazil |<O>| > ================================================ > GEO, -22.2752, -54.8182, 408m > UTC-04:00 / DST: UTC-03:00 > > > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -- Marcus Nunes http://marcusnunes.me/ -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20161004/585080f4/atta…> ------------------------------ Subject: Legenda do Digest _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ------------------------------ Fim da Digest R-br, volume 70, assunto 6 ****************************************

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Re: [R-br] Regexp no grep para linhas que não iniciam com sequência
by Éder Comunello 04 Out '16

04 Out '16

Pessoal, obrigado pelas dicas! Tive sucesso com a sugestão do Marcus e acabei encontrando mais uma forma, transcrita abaixo. test <- c("SPA100", "MSA200", "MSB300", "MSC400", "MSC500", "PRA100", "PRC200", "MGV100", "MTJ400", "MTK500") grep("MSC", test, val=T, invert=T) # [1] "SPA100" "MSA200" "MSB300" "PRA100" "PRC200" "MGV100" "MTJ400" "MTK500" grep("^(?!MSC)", test, val=T, perl=T) # [1] "SPA100" "MSA200" "MSB300" "PRA100" "PRC200" "MGV100" "MTJ400" "MTK500" ================================================ Éder Comunello Researcher at Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa) DSc in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq) MSc in Environ. Sciences (UEM), Agronomist (UEM) --- Embrapa Agropecuária Oeste, Dourados, MS, Brazil |<O>| ================================================ GEO, -22.2752, -54.8182, 408m UTC-04:00 / DST: UTC-03:00 Em 4 de outubro de 2016 10:25, Tiago Fragoso <mingote(a)gmail.com> escreveu: > Oi > > Estou longe do R no momento, mas na sua segunda solução, você tentou usar > a regex "^[^MSC]{0,3}"? > > Em princípio, ela força o início da string e identifica todos os > caracteres fora do conjunto MSC, para valores entre 0 e 3 ocorrências. > > Note que nesse caso a regex vai identificar strings iniciadas em M,S ou C. > Me parece que você tem os padrões M, MS ou MSC, então talvez a regex > > "^[^M|^MS|^MSC]" > > resolva. > > On Oct 4, 2016 9:49 AM, "Éder Comunello via R-br" < > r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> wrote: > >> Senhores, bom dia! >> >> Considerando o vetor: >> >> test <- c("SPA100", "MSA200", "MSB300", "MSC400", "MSC500", >> "PRA100", "PRC200", "MGV100", "MTJ400", "MTK500") >> >> Posso obter facilmente os valores iniciados com a sequência "MS": >> grep("^MS", test, val=T) >> >> # [1] "MSA200" "MSB300" "MSC400" "MSC500" >> >> >> Uma primeira tentativa, sem sucesso, para obter linhas que não iniciam >> com a sequência foi: >> grep("^!(MS)", test, val=T) >> # character(0) >> >> Consegui uma solução estranha com: >> grep("^[^M]|^M[^S]", test, val=T) >> >> # [1] "SPA100" "PRA100" "PRC200" "MGV100" "MTJ400" "MTK500" >> >> >> Mas essa solução é limitada quando usando strings maiores, tal como >> "MSC". >> >> Embora existam alternativas como: >> test[-grep("^MSC", test)] >> >> # [1] "SPA100" "MSA200" "MSB300" "PRA100" "PRC200" "MGV100" "MTJ400" "MTK500" >> >> >> Gostaria de saber se há uma forma fácil de fazer isso usando diretamente >> uma regexp. >> >> Grato, >> >> ================================================ >> Éder Comunello >> Researcher at Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa) >> DSc in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq) >> MSc in Environ. Sciences (UEM), Agronomist (UEM) >> --- >> Embrapa Agropecuária Oeste, Dourados, MS, Brazil |<O>| >> ================================================ >> GEO, -22.2752, -54.8182, 408m >> UTC-04:00 / DST: UTC-03:00 >> >> >> >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >> código mínimo reproduzível. >> >

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Regexp no grep para linhas que não iniciam com sequência
by Éder Comunello 04 Out '16

04 Out '16

Senhores, bom dia! Considerando o vetor: test <- c("SPA100", "MSA200", "MSB300", "MSC400", "MSC500", "PRA100", "PRC200", "MGV100", "MTJ400", "MTK500") Posso obter facilmente os valores iniciados com a sequência "MS": grep("^MS", test, val=T) # [1] "MSA200" "MSB300" "MSC400" "MSC500" Uma primeira tentativa, sem sucesso, para obter linhas que não iniciam com a sequência foi: grep("^!(MS)", test, val=T) # character(0) Consegui uma solução estranha com: grep("^[^M]|^M[^S]", test, val=T) # [1] "SPA100" "PRA100" "PRC200" "MGV100" "MTJ400" "MTK500" Mas essa solução é limitada quando usando strings maiores, tal como "MSC". Embora existam alternativas como: test[-grep("^MSC", test)] # [1] "SPA100" "MSA200" "MSB300" "PRA100" "PRC200" "MGV100" "MTJ400" "MTK500" Gostaria de saber se há uma forma fácil de fazer isso usando diretamente uma regexp. Grato, ================================================ Éder Comunello Researcher at Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa) DSc in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq) MSc in Environ. Sciences (UEM), Agronomist (UEM) --- Embrapa Agropecuária Oeste, Dourados, MS, Brazil |<O>| ================================================ GEO, -22.2752, -54.8182, 408m UTC-04:00 / DST: UTC-03:00

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Re: [R-br] "alternativa não-paramétrica" para o teste de Dunnett
by Luiz Henrique Leal 04 Out '16

04 Out '16

Muito obrigado Conectado pela Motorola Tito Conte <tito.conte(a)gmail.com> escreveu: >Achei isso: > >"I'm pretty sure Dunnett's Test is for parametric data only. You can use Mann Whitney follow up tests and just divide alpha by how many follow ups you need to run to take a conservative approach." > > >Tito Conte > > >2016-10-03 13:24 GMT-03:00 Luiz Leal via R-br <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br>: > >Boa tarde a todos. > >Alguém sabe se existe uma "alternativa não-paramétrica" para o teste de Dunnett? > >Desde já agradeço > >Luiz > > >... > >Dunnett's test is a multiple comparison procedure to compare each of a number of treatments with a single control. > >... > > >_______________________________________________ >R-br mailing list >R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. > >

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Identificar variáveis dicotomicas
by Elias Carvalho 03 Out '16

03 Out '16

Boa noite pessoal Existe alguma função do R que permite identificar variáveis dicotomicas em um dataframe ? Como por exemplo: 0 e 1 ou 1 e 2 no mesmo dataframe Obrigado -- *In Jesu et Maria* *Obrigado* *Prof. Elias Carvalho*

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"alternativa não-paramétrica" para o teste de Dunnett
by Luiz Leal 03 Out '16

03 Out '16

Boa tarde a todos.Alguém sabe se existe uma "alternativa não-paramétrica" para o teste de Dunnett?Desde já agradeçoLuiz ...Dunnett's test is a multiple comparison procedure to compare each of a number of treatments with a single control. ...

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Processamento paralelo para um modelo de treinamento
by Fernando Gama 03 Out '16

03 Out '16

Pessoal, Estou tentando treinar um modelo com 192 atributos e meu objetivo é, no pós-treinamento, identificar os atributos mais importantes. (seleção de features). A questão é que estou tendo problemas para treinar o modelo porque o processamento é extremamente lento. Pesquisei sobre o parallel e o doParallel e coloquei no meu código mas aparentemente não obtive resultados segue um trecho do código: library(caret) library(doParallel) myControl <- trainControl(method = "repeatedcv", number = 10, repeats = 3, allowParallel = TRUE) t<-proc.time() cl <- makeCluster(detectCores()) registerDoParallel(cl) model <- train(GENRE~., data=dtset_genres, method="lvq", preProcess = "scale", trControl = myControl) stopCluster(cl) proc.time()-t Alguma sugestão? -- Att, | Fernando Gama da Mata | | Database Specialist | Master's Degree UFPA | | Contacts: +55 91 99150 0365 | f.fabiogama88(a)gmail.com | Social Networks: [ <https://www.facebook.com/fernando.gama.13>][ <https://plus.google.com/+FernandoGama13>][ <https://www.linkedin.com/in/fernandogama>] |

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