Maio 2014 - R-br - DINF UFPR

Re: [R-br] Digest R-br, volume 41, assunto 31
by Diogo Caribe de Sousa 30 Mai '14

30 Mai '14

Caros, Estou precisando fazer o índice de Kappa, mas não estou conseguindo. Tenho dois vetores, com o nome das classes do modelo e da realidade de campo. Os vetores são do tipo string. Alguém tem alguma sugestão? Abraços Em Sexta-feira, 30 de Maio de 2014 8:45, "r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: Enviar submissões para a lista de discussão R-br para r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou corpo da mensagem para r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo endereço r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." Tópicos de Hoje: 1. Re: IDW (Éder Comunello) 2. Link para elaboração de mapas (Edson Lira) 3. Re: Manual de uso do R (Edson Lira) 4. Re: Bibliografia (David Feitosa) 5. correlação robusta em dados longitudinais (Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil) 6. Re: IDW (Elias T. Krainski) 7. Re: Bibliografia (Elias T. Krainski) 8. Re: Manual de uso do R (Elton Gean Araújo Araújo) 9. Re: Manual de uso do R (claudia christina sobrinho do nascimento) 10. Re: Fwd: Representação de gráfico tipo torta em um shapefile (ASANTOS) 11. RES: Link para elaboração de mapas (Mauro Sznelwar) 12. INLA short course with Elias (Paulo Justiniano) 13. Re: sos (Edson Lira) ---------------------------------------------------------------------- Message: 1 Date: Thu, 29 May 2014 11:16:47 -0400 From: Éder Comunello <comunello.eder(a)gmail.com> To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] IDW Message-ID: <CABmC8gnR7Z_qU1Ccv_xbY2TtWDb14WRtjwTULVqkbGZfbf=V5g(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" Elias, bom dia! Reconheço o mérito das suas colocações, só complementei! Aproveitando a deixa... A exemplo do material do Jackson Aquino, mantenho também para consulta um material seu, "Introdução à análise de dados espacialmente referenciados". Tenho aqui uma versão de 2012. Tens alguma edição mais atual ou intenção de transformar esse material em livro? Grato, Éder Comunello <c <comunello.eder(a)gmail.com>omunello.eder(a)gmail.com> Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W] Em 29 de maio de 2014 07:18, Elias T. Krainski <eliaskrainski(a)yahoo.com.br> escreveu: > humilhou... :) > > > On 29/05/14 12:36, Éder Comunello wrote: > > Hélio, bom dia! > > Faz sentido interpolar? Acredito que sim, partindo do princípio que a > dependência espacial pode existir, mas seu método não permitiu detectá-la. > Acredito que a causa mais comum seja o esquema de amostragem utilizado, > sobretudo no que se refere à distância entre amostras. No caso particular, > você conseguiu modelar em algumas áreas e não em outras, dando margem à > essa interpretação. > > O colega Elias já postou uma solução, mas acrescento o código abaixo, > caso ainda tenha interesse em utilizar o {gstat}. > > Em termos gerais, a ideia de operação no {gstat} é similar a do {geoR}, > no sentido em que você vai precisar criar um grid pra receber o resultado > da interpolação. O espaçamento da grade será a resolução da interpolação. O > ponto principal é que tem que trabalhar com objetos da classe 'sp'. > > Verifique os parâmetros número de vizinhos (nmax) e peso/potência da > distância (idp). No {gstat} por default utilizam-se todos os pontos e o > idp=2. > > Atte., > > ### <code r> > sapply(c("gstat", "sp", "geoR", "RColorBrewer"), require, character.only=T) > > data(parana); names(parana) > hist(parana$data, col=3) > points(parana, pt.divide='quart') > > ### Criar objeto 'sp' > pr <- data.frame(x=parana$coords[,1], y=parana$coords[,2], > chuva=parana$data) > names(pr); coordinates(pr) <- ~x+y > class(pr) > plot(pr, asp=1, axes=T, pch=20); polygon(parana$borders, border=2) > > ### Criar 'grid' > bbox(pr) > lim <- round(bbox(pr)+c(-1,-1, 1, 1)*50); lim ### amplia a área do bbox > grid <- expand.grid(x=seq(lim[1,1],lim[1,2], by=10), > y=seq(lim[2,1],lim[2,2], by=10)) > grid -> grid.pt > gridded(grid) = ~x+y ### SpatialPixels > coordinates(grid.pt) = ~x+y ### SpatialPoints > > ### IDW Default > idw <- idw(pr$chuva~1, pr, grid) > idw.pt <- idw(chuva~1, pr, grid.pt) > > ### Visualização > spplot(idw, "var1.pred", main = "IDW Default") > spplot(idw.pt, "var1.pred", main = "IDW default - Mapa Pontuado") > image(idw); polygon(parana$borders); points(pr) > > ### Variando parâmetros > idw.data <- data.frame( > default = idw(chuva ~ 1, pr, grid)$var1.pred, ### nmax=todos & > idp=2 > idw6 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, nmax=6)$var1.pred, > idw9 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, nmax=9)$var1.pred, > idp1 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, idp = 1)$var1.pred, > idp4 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, idp = 4)$var1.pred, > idp8 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, idp = 8)$var1.pred) > > grid.data <- SpatialPixelsDataFrame(grid, idw.data) > dput(names(grid.data)) > > spplot(grid.data, c("default", "idw6", "idw9", "idp1", "idp4", "idp8"), > main = "IDW", col.regions=rainbow(16) > # idp: numeric; specify the inverse distance weighting power > # nmax: the number of nearest observations that should be used > ### </code> > > > > > Éder Comunello <c <comunello.eder(a)gmail.com>omunello.eder(a)gmail.com> > Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W] > > > > > > _______________________________________________ > R-br mailing listR-br@listas.c3sl.ufpr.brhttps://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. > > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/798804be/atta…> ------------------------------ Message: 2 Date: Thu, 29 May 2014 08:25:27 -0700 (PDT) From: Edson Lira <edinhoestat(a)yahoo.com.br> To: R-br Lista <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: [R-br] Link para elaboração de mapas Message-ID: <1401377127.34381.YahooMailNeo(a)web160105.mail.bf1.yahoo.com> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" Eder, Mauro e caros amigos da lista, encontrei um material para elaboração de mapas com o R que achei muito bom, abaixo o link. http://www.social-statistics.org/?p=764 [ ]'s Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/8ec70cd2/atta…> ------------------------------ Message: 3 Date: Thu, 29 May 2014 08:27:41 -0700 (PDT) From: Edson Lira <edinhoestat(a)yahoo.com.br> To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br>, Alan Rodrigo Panosso <arpanosso(a)yahoo.com.br> Subject: Re: [R-br] Manual de uso do R Message-ID: <1401377261.20167.YahooMailNeo(a)web160104.mail.bf1.yahoo.com> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" Concordo com a opinião dos colegas, o livro é muito bom mesmo. Com certeza irá estimular muitos alunos a iniciarem-se no uso do R. Parabens Jackson!!! [ ]'s. Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas Em Quinta-feira, 29 de Maio de 2014 10:37, David Feitosa <contato(a)davidfeitosa.com> escreveu: Eu já li a obra em pdf. Muito boa mesmo, principalmente para quem não é da área de desenvolvimento. Atenciosamente, David Feitosa (\_(\ (=°;°) (("")("") Em 29 de maio de 2014 11:14, Alan Rodrigo Panosso <arpanosso(a)yahoo.com.br> escreveu: Fantástico! Parabéns!!!! > >Alan Rodrigo Panosso >---------------------------------------------------------------------------- >Departamento de Matemática - >Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira - FEIS - UNESP >Alameda Rio de Janeiro, 266 >15 385 - 000 - Ilha Solteira - SP.-Brasil >E_mail: alanrp(a)mat.feis.unesp.br ou >arpanosso(a)yahoo.com.br >Tel.: (18) 3743-1968 > > > > >Em Quinta-feira, 29 de Maio de 2014 6:08, Rodrigo Muniz <uenf.rodrigo(a)gmail.com> escreveu: > > > > >Parabens, Jakson, tanto pela iniciativa quanto pela qualidade do material, vi que embora seja voltada para analise de dados sociais poderei utilizar em minhas análises pela didática apresentada e pela programação. >Mais uma vez parabéns... >Att... > > > >2014-05-29 9:23 GMT-03:00 Jakson Alves de Aquino <jalvesaq(a)gmail.com>: > >On 29-05-2014 07:49, Éder Comunello wrote: >>> Já utilizo seu material há um bom tempo e pela qualidade e utilidade do >>> mesmo, já esperava que saísse na forma de livro. Parabéns! >> >>Obrigado a você e a todos os outros da lista que fizeram comentários! >> >> >>> Sou do tempo antigo :D, e gostaria de saber se também vai ter versão >>> impressa. Caso sim, gentileza informar como adquirir. >> >>Não há nenhuma previsão de produção de versão impressa. Acho que não >>haverá, mas, se houver, anunciarei aqui. >> >>-- >>Jakson >> >>_______________________________________________ >>R-br mailing list >>R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. >> > > > >-- > >Rodrigo A. Muniz >Eng. Agrônomo. Ms Produção Vegetal (UENF) >Doutorando em Engenharia de Sistemas Agrícolas (ESALQ/USP) >E-mail - muniz.ra(a)usp.br >Cel (19) 98300-4333 (Pessoal) > > > >_______________________________________________ >R-br mailing list >R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. > > >_______________________________________________ >R-br mailing list >R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. > _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/00b2369c/atta…> ------------------------------ Message: 4 Date: Thu, 29 May 2014 12:27:39 -0300 From: David Feitosa <contato(a)davidfeitosa.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Bibliografia Message-ID: <CAL1rLtoZTdqbfwvuV0u9vL4vz8=SKxbKBYRvqmXPzTDBF_SPbA(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Marcus, Sou formado em Ciências da Computação. Eu tentei alguns livros sobre o assunto, mas achei a linguagem muito "pesada". Darei uma olhada na sua sugestão. Obrigado! [?] Atenciosamente, David Feitosa (\_(\ (=°;°) (("")("") Em 29 de maio de 2014 11:56, Marcus Nunes <marcus.nunes(a)gmail.com> escreveu: > David, > > Acho que a definição de "didática" vai variar muito de pessoa para pessoa. > Particularmente, tenho formação em Matemática e estudei Processos > Estocásticos, em 2006, através de A First Course in Stochastic Processes, > de Samuel Karlin e Howard Taylor - > http://www.amazon.com/Course-Stochastic-Processes-Second-Edition/dp/0123985… > > > Este era o livro clássico da disciplina de Processos Estocásticos do > Mestrado da UFRGS. > > > 2014-05-29 11:40 GMT-03:00 David Feitosa <contato(a)davidfeitosa.com>: > >> Caríssimos, bom dia. >> >> Desculpe se o assunto já tiver sido discutido na lista, >> mas os senhores poderiam indicar bibliografia que fosse didática sobre >> Estatística em Geral e Processos Estocásticos? >> >> Poderia ser em Inglês e, não necessariamente, associada ao R. >> Claro que se puder ser, melhor ainda. [?] >> >> Obrigado! >> >> Atenciosamente, >> >> David Feitosa >> >> (\_(\ >> (=°;°) >> (("")("") >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >> código mínimo reproduzível. >> > > > > -- > Marcus Nunes > http://marcusnunes.me/ > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/054ef567/atta…> -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo não-texto foi limpo... Nome: 330.gif Tipo: image/gif Tamanho: 96 bytes Descrição: não disponível URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/054ef567/atta…> ------------------------------ Message: 5 Date: Thu, 29 May 2014 14:17:50 -0300 From: Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil <emmanuel.brasil(a)gmail.com> To: R BR lista <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: [R-br] correlação robusta em dados longitudinais Message-ID: <CAFfGvyKX+4Xq6teF9VJMN17fomesnfb2RLYyrrTGcTUyV7fM3w(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Amigos de R, Estou conduzindo uma análise de dados longitudinais com a função nlme::lme. POr enquanto o melhor modelo que tenho é expresso como: f7 <- lme(Velocidade ~ lado + as.factor(dia) ,data=l,random = ~1|Id/Arteria,correlation=corAR1(.8,form=~dia)) Nessa função eu gostaria que a correlçao fosse considerada para os diferentes grupos dado para a variável lado, porque que graficamente me parece ser diferente. Mas eu não consegui colocar esse argumento dentro de corAR1. Mas esse nem é o problema que me preocupa mais. A leitura fonte que tenho indica que sempre que possivel, deve-se utilizar uma correlaçao robusta, pois assim provavelmente evita-se o erro de assumir uma estrutura incorreta da correlação, apesar de eu ter experimentado várias. Mas eu não achei no pacote nlme qualquer função/argumento que me levasse acreditar que uma correlçao robusta esteja disponível. Alguem saberia saber no lugar de corAR1 é possivel utilizar alguma coisa que funcionasse como uma correlação robusta? Abraço, Dr. Pedro Emmanuel A. A. do Brasil http://blog.ipec.fiocruz.br/lapclin-chagas/ Curriculum Lattes: http://lattes.cnpq.br/6597654894290806 ResearchGate.net: https://www.researchgate.net/profile/Pedro_Brasil2/ Instituto Nacional de Infectologia/Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas Fundação Oswaldo Cruz Rio de Janeiro - Brasil Av. Brasil 4365, CEP 21040-360, Tel 55 21 3865-9648 e-mail: pedro.brasil(a)ipec.fiocruz.br e-mail: emmanuel.brasil(a)gmail.com ---Apoio aos softwares livres www.zotero.org - gerenciamento de referências bibliográficas. www.broffice.org ou www.libreoffice.org - textos, planilhas ou apresentações. www.epidata.dk - entrada de dados. www.r-project.org - análise de dados. www.ubuntu.com - sistema operacional -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/21b5880e/atta…> ------------------------------ Message: 6 Date: Thu, 29 May 2014 20:21:53 +0200 From: "Elias T. Krainski" <eliaskrainski(a)yahoo.com.br> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] IDW Message-ID: <53877AC1.9030708(a)yahoo.com.br> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed" Éder, essa e' a ultima versao... On 29/05/14 17:16, Éder Comunello wrote: > Elias, bom dia! > > Reconheço o mérito das suas colocações, só complementei! > > Aproveitando a deixa... A exemplo do material do Jackson Aquino, > mantenho também para consulta um material seu, "Introdução à análise > de dados espacialmente referenciados". Tenho aqui uma versão de 2012. > Tens alguma edição mais atual ou intenção de transformar esse material > em livro? > > Grato, > > > Éder Comunello <c > <mailto:comunello.eder@gmail.com>omunello.eder(a)gmail.com > <mailto:omunello.eder@gmail.com>> > Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W] > > > Em 29 de maio de 2014 07:18, Elias T. Krainski > <eliaskrainski(a)yahoo.com.br <mailto:eliaskrainski@yahoo.com.br>> escreveu: > > humilhou... :) > > > On 29/05/14 12:36, Éder Comunello wrote: >> Hélio, bom dia! >> >> Faz sentido interpolar? Acredito que sim, partindo do princípio >> que a dependência espacial pode existir, mas seu método não >> permitiu detectá-la. Acredito que a causa mais comum seja o >> esquema de amostragem utilizado, sobretudo no que se refere à >> distância entre amostras. No caso particular, você conseguiu >> modelar em algumas áreas e não em outras, dando margem à essa >> interpretação. >> >> O colega Elias já postou uma solução, mas acrescento o código >> abaixo, caso ainda tenha interesse em utilizar o {gstat}. >> >> Em termos gerais, a ideia de operação no {gstat} é similar a do >> {geoR}, no sentido em que você vai precisar criar um grid pra >> receber o resultado da interpolação. O espaçamento da grade será >> a resolução da interpolação. O ponto principal é que tem que >> trabalhar com objetos da classe 'sp'. >> >> Verifique os parâmetros número de vizinhos (nmax) e peso/potência >> da distância (idp). No {gstat} por default utilizam-se todos os >> pontos e o idp=2. >> >> Atte., >> >> ### <code r> >> sapply(c("gstat", "sp", "geoR", "RColorBrewer"), require, >> character.only=T) >> >> data(parana); names(parana) >> hist(parana$data, col=3) >> points(parana, pt.divide='quart') >> >> ### Criar objeto 'sp' >> pr <- data.frame(x=parana$coords[,1], y=parana$coords[,2], >> chuva=parana$data) >> names(pr); coordinates(pr) <- ~x+y >> class(pr) >> plot(pr, asp=1, axes=T, pch=20); polygon(parana$borders, border=2) >> >> ### Criar 'grid' >> bbox(pr) >> lim <- round(bbox(pr)+c(-1,-1, 1, 1)*50); lim ### amplia a área >> do bbox >> grid <- expand.grid(x=seq(lim[1,1],lim[1,2], by=10), >> y=seq(lim[2,1],lim[2,2], by=10)) >> grid -> grid.pt <http://grid.pt> >> gridded(grid) = ~x+y ### SpatialPixels >> coordinates(grid.pt <http://grid.pt>) = ~x+y ### SpatialPoints >> >> ### IDW Default >> idw <- idw(pr$chuva~1, pr, grid) >> idw.pt <http://idw.pt> <- idw(chuva~1, pr, grid.pt <http://grid.pt>) >> >> ### Visualização >> spplot(idw, "var1.pred", main = "IDW Default") >> spplot(idw.pt <http://idw.pt>, "var1.pred", main = "IDW default - >> Mapa Pontuado") >> image(idw); polygon(parana$borders); points(pr) >> >> ### Variando parâmetros >> idw.data <- data.frame( >> default = idw(chuva ~ 1, pr, grid)$var1.pred, ### >> nmax=todos & idp=2 >> idw6 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, nmax=6)$var1.pred, >> idw9 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, nmax=9)$var1.pred, >> idp1 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, idp = 1)$var1.pred, >> idp4 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, idp = 4)$var1.pred, >> idp8 = idw(chuva ~ 1, pr, grid, idp = 8)$var1.pred) >> >> grid.data <- SpatialPixelsDataFrame(grid, idw.data) >> dput(names(grid.data)) >> >> spplot(grid.data, c("default", "idw6", "idw9", "idp1", "idp4", >> "idp8"), main = "IDW", col.regions=rainbow(16) >> # idp: numeric; specify the inverse distance weighting power >> # nmax: the number of nearest observations that should be used >> ### </code> >> >> >> >> >> Éder Comunello <c >> <mailto:comunello.eder@gmail.com>omunello.eder(a)gmail.com >> <mailto:omunello.eder@gmail.com>> >> Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W] >> >> >> >> >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br <mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br> >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br <mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e > forneça código mínimo reproduzível. > > > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/d965ea0f/atta…> ------------------------------ Message: 7 Date: Thu, 29 May 2014 20:23:55 +0200 From: "Elias T. Krainski" <eliaskrainski(a)yahoo.com.br> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Bibliografia Message-ID: <53877B3B.4020809(a)yahoo.com.br> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed" Ha dois livros bons de processos estocasticos. Um mais aplicado e outro com resultados mais teoricos (sem aprofundar na prova dos resultados). http://www.maths.lth.se/matstat/staff/georg/ On 29/05/14 16:40, David Feitosa wrote: > Caríssimos, bom dia. > > Desculpe se o assunto já tiver sido discutido na lista, > mas os senhores poderiam indicar bibliografia que fosse didática sobre > Estatística em Geral e Processos Estocásticos? > > Poderia ser em Inglês e, não necessariamente, associada ao R. > Claro que se puder ser, melhor ainda. > > Obrigado! > > Atenciosamente, > > David Feitosa > > (\_(\ > (=°;°) > (("")("") > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/f9158328/atta…> -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo não-texto foi limpo... Nome: não disponível Tipo: image/gif Tamanho: 96 bytes Descrição: não disponível URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/f9158328/atta…> ------------------------------ Message: 8 Date: Thu, 29 May 2014 12:55:36 -0700 (PDT) From: Elton Gean Araújo Araújo <egarauj(a)yahoo.com.br> To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Manual de uso do R Message-ID: <1401393336.35171.YahooMailNeo(a)web142706.mail.bf1.yahoo.com> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" Parabéns Jackson! Muito bom ter este conhecimento compartilhado. Abraços. Elton Gean Araújo Mestre em Estatística e Experimentação Agronômica - ESALQ - USP. Professor da Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campus de Paranaíba Em Quarta-feira, 28 de Maio de 2014 15:51, Fernando Antonio de souza <nandodesouza(a)gmail.com> escreveu: Parabéns Jackson. Este livro será refência ao curso de introdução ao R que leciono aqui na UFAL Em 28 de maio de 2014 13:09, Jakson Alves de Aquino <jalvesaq(a)gmail.com> escreveu: Olá, > > >Peço licença a vocês para anunciar que o meu trabalho "R para cientistas sociais" foi publicado como livro eletrônico pela Editus (Editora da Universidade Estadual de Santa Cruz, Bahia). Aproveito a oportunidade para parabenizar a Editus por disponibilizar livremente suas publicações digitais: > > >http://www.uesc.br/editora/index.php?item=conteudo_livros_digitais.php > > > >Embora voltado para as necessidades mais comuns de cientistas sociais, acredito que o livro pode ser um manual útil a todos os que estão aprendendo a usar o R. Os dados necessários para reproduzir os exemplos estão em: > > >http://www.lepem.ufc.br/jaa/RparaCS.php > > > >-- >Jakson Alves de Aquino >Universidade Federal do Ceará >_______________________________________________ >R-br mailing list >R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. > _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/8acb73b1/atta…> ------------------------------ Message: 9 Date: Thu, 29 May 2014 19:37:42 -0300 From: claudia christina sobrinho do nascimento <claudiachris(a)ig.com.br> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Manual de uso do R Message-ID: <CABKDUPNK8AZVW0qr1Fp79F2AW_WeK_cB=82tTjtdgmxVc+UBtA(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Parabéns! E obrigada por divulgar. Em 29 de maio de 2014 11:37, David Feitosa <contato(a)davidfeitosa.com> escreveu: > Eu já li a obra em pdf. > Muito boa mesmo, principalmente para quem não é da área de desenvolvimento. > > > > Atenciosamente, > > David Feitosa > > (\_(\ > (=°;°) > (("")("") > > > Em 29 de maio de 2014 11:14, Alan Rodrigo Panosso <arpanosso(a)yahoo.com.br> > escreveu: > > Fantástico! Parabéns!!!! >> >> Alan Rodrigo Panosso >> >> ---------------------------------------------------------------------------- >> Departamento de Matemática - >> Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira - FEIS - UNESP >> Alameda Rio de Janeiro, 266 >> 15 385 - 000 - Ilha Solteira - SP.-Brasil >> E_mail: alanrp(a)mat.feis.unesp.br ou >> arpanosso(a)yahoo.com.br >> Tel.: (18) 3743-1968 >> >> >> >> Em Quinta-feira, 29 de Maio de 2014 6:08, Rodrigo Muniz < >> uenf.rodrigo(a)gmail.com> escreveu: >> >> >> Parabens, Jakson, tanto pela iniciativa quanto pela qualidade do >> material, vi que embora seja voltada para analise de dados sociais poderei >> utilizar em minhas análises pela didática apresentada e pela programação. >> Mais uma vez parabéns... >> Att... >> >> >> 2014-05-29 9:23 GMT-03:00 Jakson Alves de Aquino <jalvesaq(a)gmail.com>: >> >> On 29-05-2014 07:49, Éder Comunello wrote: >> > Já utilizo seu material há um bom tempo e pela qualidade e utilidade do >> > mesmo, já esperava que saísse na forma de livro. Parabéns! >> >> Obrigado a você e a todos os outros da lista que fizeram comentários! >> >> > Sou do tempo antigo :D, e gostaria de saber se também vai ter versão >> > impressa. Caso sim, gentileza informar como adquirir. >> >> Não há nenhuma previsão de produção de versão impressa. Acho que não >> haverá, mas, se houver, anunciarei aqui. >> >> -- >> Jakson >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >> código mínimo reproduzível. >> >> >> >> >> -- >> *Rodrigo A. Muniz* >> Eng. Agrônomo. Ms Produção Vegetal (UENF) >> Doutorando em Engenharia de Sistemas Agrícolas (ESALQ/USP) >> E-mail - muniz.ra(a)usp.br >> Cel (19) 98300-4333 (Pessoal) >> >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >> código mínimo reproduzível. >> >> >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >> código mínimo reproduzível. >> > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -- Cláudia Christina Sobrinho do Nascimento nutricionista Residência terapia nutricional (HUPE/UERJ) Aperfeiçoamento vigilância alimentar e nutricional (ENSP/FIOCRUZ) Mestre e doutoranda saúde coletiva/epidemiologia (IMS/UERJ) cel.997332776 P *- ANTES DE IMPRIMIR ESTE OU QUALQUER OUTRO DOCUMENTO, PENSE EM SEU COMPROMISSO COM O MEIO AMBIENTE. -* -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/7968e4fb/atta…> ------------------------------ Message: 10 Date: Thu, 29 May 2014 19:17:57 -0400 From: ASANTOS <alexandresantosbr(a)yahoo.com.br> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br, ecomunel(a)gmail.com Subject: Re: [R-br] Fwd: Representação de gráfico tipo torta em um shapefile Message-ID: <5387C025.6000404(a)yahoo.com.br> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed" Boa noite Éder, Tentei seguir seu roteiro usando maptools::unionSpatialPolygons() e não deu certo a dissolução de bacias, fiz: require(shapefiles) library(maptools) library(gpclib) library(rgdal) library(PBSmapping) #Shapefile e dados links <- c( "https://www.dropbox.com/s/3ph2630xicpexo0/dem.crop.final.tif", "https://www.dropbox.com/s/3ph2630xicpexo0/dem.crop.final.tif", "https://www.dropbox.com/s/3ph2630xicpexo0/dem.crop.final.tif", "https://www.dropbox.com/s/3ph2630xicpexo0/dem.crop.final.tif") if (sum(sapply(basename(links), file.exists))<4) { lapply(links, function(a) tryCatch(download.file(a, dest=basename(a), mode='wb'), error=function(...) message("ERRO!")))} else message('OK!') # #abrido shapefile # bacias <- readOGR(".", "sa_bas_ll_r500m") CRS.new <- CRS("+proj=longlat +datum=WGS84") proj4string(bacias) <- CRS.new plot(bacias) str(bacias) ## Separando os ID dos atributos do LEVEL2, pois tenho 6 níveis de bacias IDlevel2<- cut(bacias@data$LEVEL2, range(bacias@data$LEVEL2), include.lowest=TRUE) ## Bacias "dissolvidas" para o nível 2 Dissolve_bacia <- unionSpatialPolygons(bacias ,Dissolve_bacia) Dissolve_bacia_2 <- SpatialPolygons2PolySet(DissolveResult) ## Representação gráfica plotPolys(Dissolve_bacia_2 , proj = TRUE,col="wheat1",xlab="longitude",ylab="latitude") E a figura resultante em plotPolys não são minhas bacias no nível 2. Poderia me dizer o que estou fazendo de errado, Obrigado, -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 ====================================================================== Em 26/05/2014 15:12, Éder Comunello escreveu: Alexandre, boa tarde! Sugiro que você trabalhe com o mapa de bacias "dissolvidas" para o nível 2. Para isso você pode fazer uso de maptools::unionSpatialPolygons(). Para fins de visualização você pode ainda utilizar outras funções de simplificação. Feito isso, além de visualizar mais rápido, você poderá obter o centróide dos polígonos dissolvidos pra locar os gráficos de torta. Depois de rodar o sp::over() você precisa tabular as frequências por bacia e adicionar a coordenada de cada uma. A entrada do add.pie() é individual, então você poderá pensar num laço ou uma função da família apply pra entradas múltiplas. Atte., Éder Comunello <c <mailto:comunello.eder@gmail.com>omunello.eder(a)gmail.com <mailto:omunello.eder@gmail.com>> Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W] -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/f4be8c48/atta…> ------------------------------ Message: 11 Date: Thu, 29 May 2014 21:14:42 -0300 From: "Mauro Sznelwar" <sznelwar(a)uol.com.br> To: <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br>, "'Edson Lira'" <edinhoestat(a)yahoo.com.br> Subject: [R-br] RES: Link para elaboração de mapas Message-ID: <017c01cf7b9c$28245ca0$786d15e0$(a)com.br> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" Muito obrigado, parece ótimo, ainda vou tentar rodar os comandos que aparecem lá. Eder, Mauro e caros amigos da lista, encontrei um material para elaboração de mapas com o R que achei muito bom, abaixo o link. http://www.social-statistics.org/?p=764 [ ]'s Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas --- Este email está limpo de vírus e malwares porque a proteção do avast! Antivírus está ativa. http://www.avast.com -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140529/8af19984/atta…> ------------------------------ Message: 12 Date: Thu, 29 May 2014 15:36:44 -0300 (BRT) From: Paulo Justiniano <paulojus(a)leg.ufpr.br> To: leg_l(a)leg.ufpr.br Cc: rbras_l(a)rbras.org.br Subject: [R-br] INLA short course with Elias Message-ID: <alpine.DEB.2.00.1405291529480.31612(a)pataxo.est.ufpr.br> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed" O Elias Krainski vai passar uns dias aqui em Curitiba e no período vai apresentar um curso sobre o INLA. A enfase será mais na motivaçãoe "entranhas" do INLA (e nao apenas no uso do pacote e exemplos de dados) A seguir um resumo, tb em www.leg.ufpr.br/seminarios todos interessados são bem vindos Local: LEG/UFPR Periodo: 09-13/06/2014 Horario: 10:00 - 12:00 ------------------------------------------------------------------------------- The main objective of this course is to look at the ideas behind INLA. INLA has a history which can be followed by looking bacl at the sequence of works by Prof. H. Rue's. We start on the MCMC algorithms, including single site and block updates and the Gaussian approximation as a proposal. Then, the INLA algorithm is used as one further step more wich makes sampling from the posterior no longer needed for most inference tasks. An working example is used to show, in details, how the algorithms work. At end we can see that any additive linear model with conditional independent likelihood can be easily included in the framework. If time allows, we will look at the INLA package and at some tricks implemented to deal with more complex models. ------------------------------ Message: 13 Date: Fri, 30 May 2014 04:44:38 -0700 (PDT) From: Edson Lira <edinhoestat(a)yahoo.com.br> To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] sos Message-ID: <1401450278.8566.YahooMailNeo(a)web160104.mail.bf1.yahoo.com> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" a=c(1,3,5,4,3, NA, NA) max(a,na.rm=T) [ ]'s. Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas Em Terça-feira, 27 de Maio de 2014 15:33, Luiz Roberto Martins Pinto <luizroberto.uesc(a)gmail.com> escreveu: Caros, tenho um vetor a=c(1,3,5,4,3, NA, NA) preciso encontrar o valor máximo deste vetor, neste caso encontrar o 5 utilizei max(a) Resultado: [1] NA O que devo fazer? Luiz Roberto. Luiz Roberto Martins Pinto Prof. Pleno/DCET/UESC Laboratório de Estatística Computacional Universidade Estadual de Santa Cruz Ilhéus-Bahia luizroberto.uesc(a)gmail.com skype: lrmpinto http://lattes.cnpq.br/2732314327604831 _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20140530/43ca707f/atta…> ------------------------------ Subject: Legenda do Digest _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ------------------------------ Fim da Digest R-br, volume 41, assunto 31 *****************************************

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Link para elaboração de mapas
by Edson Lira 30 Mai '14

30 Mai '14

Eder, Mauro e caros amigos da lista, encontrei um material para elaboração de mapas com o R que achei muito bom, abaixo o link. http://www.social-statistics.org/?p=764 [ ]'s Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas

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sos
by Luiz Roberto Martins Pinto 30 Mai '14

30 Mai '14

Caros, tenho um vetor a=c(1,3,5,4,3, NA, NA) preciso encontrar o valor máximo deste vetor, neste caso encontrar o 5 utilizei max(a) Resultado: [1] NA O que devo fazer? Luiz Roberto. Luiz Roberto Martins Pinto Prof. Pleno/DCET/UESC Laboratório de Estatística Computacional Universidade Estadual de Santa Cruz Ilhéus-Bahia luizroberto.uesc(a)gmail.com skype: lrmpinto http://lattes.cnpq.br/2732314327604831

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Manual de uso do R
by Jakson Alves de Aquino 29 Mai '14

29 Mai '14

Olá, Peço licença a vocês para anunciar que o meu trabalho "R para cientistas sociais" foi publicado como livro eletrônico pela Editus (Editora da Universidade Estadual de Santa Cruz, Bahia). Aproveito a oportunidade para parabenizar a Editus por disponibilizar livremente suas publicações digitais: http://www.uesc.br/editora/index.php?item=conteudo_livros_digitais.php Embora voltado para as necessidades mais comuns de cientistas sociais, acredito que o livro pode ser um manual útil a todos os que estão aprendendo a usar o R. Os dados necessários para reproduzir os exemplos estão em: http://www.lepem.ufc.br/jaa/RparaCS.php -- Jakson Alves de Aquino Universidade Federal do Ceará

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INLA short course with Elias
by Paulo Justiniano 29 Mai '14

29 Mai '14

O Elias Krainski vai passar uns dias aqui em Curitiba e no período vai apresentar um curso sobre o INLA. A enfase será mais na motivaçãoe "entranhas" do INLA (e nao apenas no uso do pacote e exemplos de dados) A seguir um resumo, tb em www.leg.ufpr.br/seminarios todos interessados são bem vindos Local: LEG/UFPR Periodo: 09-13/06/2014 Horario: 10:00 - 12:00 ------------------------------------------------------------------------------- The main objective of this course is to look at the ideas behind INLA. INLA has a history which can be followed by looking bacl at the sequence of works by Prof. H. Rue's. We start on the MCMC algorithms, including single site and block updates and the Gaussian approximation as a proposal. Then, the INLA algorithm is used as one further step more wich makes sampling from the posterior no longer needed for most inference tasks. An working example is used to show, in details, how the algorithms work. At end we can see that any additive linear model with conditional independent likelihood can be easily included in the framework. If time allows, we will look at the INLA package and at some tricks implemented to deal with more complex models.

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Bibliografia
by David Feitosa 29 Mai '14

29 Mai '14

Caríssimos, bom dia. Desculpe se o assunto já tiver sido discutido na lista, mas os senhores poderiam indicar bibliografia que fosse didática sobre Estatística em Geral e Processos Estocásticos? Poderia ser em Inglês e, não necessariamente, associada ao R. Claro que se puder ser, melhor ainda. [?] Obrigado! Atenciosamente, David Feitosa (\_(\ (=°;°) (("")("")

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IDW
by Hélio Gallo Rocha 29 Mai '14

29 Mai '14

Caros Listeiros. Estou utilizando o pacote geoR para análise geoestatística. Numa das áreas em estudo não apresentou dependência espacial. Sei que no pacote geosat contempla o método IDW. Alguém teria um CRM com este método? Agradeço desde já. -- Hélio Gallo Rocha IFSULDEMINAS - Câmpus Muzambinho

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Regex
by Roney Fraga Souza 29 Mai '14

29 Mai '14

Caros, Tenho o seguinte arquivo: https://gist.github.com/roneyfraga/ca682b6193c75e7be4bf Quero manter apenas as linhas que começam com AU, DT, PY, VL e BP no arquivo. O resultado seria: AU Lin, TH DT Article PY 2012 VL 116 BP 314 AU Brodeur-Campbell, M DT Article PY 2012 VL 116 BP 320 Agora preciso que a cada 4 linhas estas sejam transpostas, de modo que ficaria assim: V1 V2 V3 V4 V5 AU Lin, TH DT Article PY 2012 VL 116 BP 314 AU Brodeur-Campbell, M DT Article PY 2012 VL 116 BP 320 Qualquer sugestão será bem vinda? Atenciosamente, Roney

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Interpretação do gráfico com distância de Cook
by ana paula coelho madeira 29 Mai '14

29 Mai '14

Boa tarde! A função "plot" apresenta uma série de gráficos para análise de um modelo, sendo que a 'which' 4, 5 e 6 apresentam gráficos em função da distância de Cook. Como interpretar esses gráficos? Desde já agradeço! Ana Paula

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Erro na saída de gráfico!!!
by Nory 28 Mai '14

28 Mai '14

Olá pessoal, No momento de pedir algum gráfico, aparece esse aviso de erro: > require(stats) > plot(cars) Error in (function (display = "", width, height, pointsize, gamma, bg, : X11 module cannot be loaded Uso o *R* na plataforma *Emacs* para *Mac OS X 10.9.3* Agradeço qualquer ajuda. -- Nory Daniel de Carvalho Erazo Técnico em Sistemática Vegetal/Herbário INPA Coordenação de Biodiversidade - CBio Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação - MCTI Av. André Araújo, 2.936 - Petrópolis - CEP: 69067-375 Caixa Postal nº 2223 CEP 69080-971 Manaus - AM, Brasil Telefone: (92) 3643-3125 Celular: (92) 9378-7592 nory(a)inpa.gov.br norydaniel(a)gmail.com

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