Novembro 2013 - R-br

Interromper processo no R - Linux
by Andre Oliveira 28 Nov '13

28 Nov '13

Pessoal, fiz uma busca google e na lista mas não consegui resolver uma pequena situação. Quando no R ocorre um erro na nomenclatura o cursor do R continua piscando esperando novos argumentos etc. Como interromper este processo de forma definitiva? Algo do tipo quando estamos com uma ajuda aberta via terminal e digitamos Q para voltar a tela inicial do R no terminal. obrigado

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Tinn-R: source code on GitHub
by Jose Claudio Faria 27 Nov '13

27 Nov '13

Dear list, The source code of Tinn-R editor is available on GitHub: https://github.com/jcfaria/Tinn-R Tinn-R is free, simple but efficient replacement for the basic code editor provided by Rgui. The project is coordinate by José Cláudio Faria/UESC/DCET. All users are welcome to make it better. LANGUAGE: Object Pascal IDE: Delphi 2007 Regards, -- ///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\ Jose Claudio Faria Estatistica UESC/DCET/Brasil joseclaudio.faria at gmail.com Telefones: 55(73)3680.5545 - UESC 55(73)9100.7351 - TIM 55(73)8817.6159 - OI ///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\

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Teste Bonferonni-Detecção Outlier
by Helder Gramacho 27 Nov '13

27 Nov '13

A saída do teste Bonferonni para detecção de outlier apareceu com os resultados um pouco confusos para mim: > outlierTest(modelo1) No Studentized residuals with Bonferonni p < 0.05 Largest |rstudent|: rstudent unadjusted p-value Bonferonni p 25 3.200023 0.0030963 0.12385 A interpretação abaixo está correta? 25: é o número da observação 3.200023: é o rstudent unadjusted 0.0030963: p-value 0.12385: Bonferonni p No caso, para a observação 25 o p-value indica que esta observação é um outlier, está correto este entendimento? Hélder Gramacho *agrohelder(a)gmail.com <agrohelder(a)hotmail.com>*

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Tinn-R User Guide
by Jose Claudio Faria 27 Nov '13

27 Nov '13

Dears user, The Tinn-R User Guide is completely written in LaTeX and the idea behind this to be available on GitHub is that it has contributions from multiple users. If you find something that you would like to include or impruve: please, fell free to make it better. This User Guide have been developing under both OS: Windows and Linux. Under Windows: we have been using Tinn-R as editor and MikTeX as compiler. Under Linux: we have been using Vim (with LaTeX-Box plugin) as editor and TexLive as compiler. Link: https://github.com/jcfaria/Tinn-R-User-Guide All the best, -- ///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\ Jose Claudio Faria Estatistica UESC/DCET/Brasil joseclaudio.faria at gmail.com Telefones: 55(73)3680.5545 - UESC 55(73)9100.7351 - TIM 55(73)8817.6159 - OI ///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\

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Curso R-Inla
by Gilbert Queiroz 26 Nov '13

26 Nov '13

Pessoal da lista... Existe algum curso sobre R-Inla previsto ainda este ano aqui no Brasil? Pergunto isto pq uma pessoa do LEG havia dito que H. Rue viria ao Br em Nov...Abs Enviado do Yahoo Mail no Android

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matriz de coeficientes do modelo linear
by Samuel Carvalho 26 Nov '13

26 Nov '13

Olá pessoal, Gostaria da opinião de vocês de como proceder para gerar uma matriz de coeficientes para dados agrupados utilizando apenas a função lm, considerando os grupos como fatores. Segue um RCMR de exemplificação com os respectivos comentários. Em seguida apresento uma solução via "nlme". De ante mão já agradeço a ajuda de todos. Forte abraço. Samuel #RMCR data(Orange) head(Orange) class(Orange$Tree) Orange$Tree <- as.numeric(Orange$Tree) ml <- lm(circumference~age*factor(Tree), data=Orange) summary(ml) coef(ml) matrix(coef(ml),length(unique(Orange$Tree)),2) # Nesta matriz que preciso garantir a integridade dos parametros ao seu respectivo grupo # Solucao via nlme require(nlme) ml_list <- lmList(circumference~age|factor(Tree), data=Orange) coef_list <- data.frame(Tree=rownames(coef_list), b0=coef(ml_list)[,1], b1=coef(ml_list)[,2]) coef_list # a ideia é gerar uma saida semelhante a esta porem apenas com a função lm ### ==================================== Samuel P. C. Carvalho Engº Florestal [UFLA] Mestre em Ciências Florestais [UFLA] Doutor em Recursos Florestais [ESALQ/USP] =============================================

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Leitura de arquivos raster no formato Geotiff e JPEG
by Rudiney S Pereira 26 Nov '13

26 Nov '13

Prezados, Extratos de códigos que encontrei na rede para a carga de arquivos nos formatos tiff e jpeg, estão com mensagens de erro. Os arquivos imagens encontram-se na pasta porém persistem as mensagens de erro. Fiz a carga dos pacotes tiff e jpeg. > require(jpeg) > require(tiff) > img <- readJPEG(system.file("img","IMG_0606.jpg",package="jpeg"),TRUE) > Erro em readJPEG(system.file("img", "/home/rudiney/Data_R/IMG_0606.jpg", : unable to open Agradeço! -- Prof. Dr. Rudiney Soares Pereira UFSM - CCR - DER RS 509 KM 9 - Campus Universitário 97.105-900 Santa Maria RS Brasil site: http://www.ufsm.br/geosere skype: rudiney.s.pereira msn: rudiney.s.pereira(a)hotmail.com gtalk: rudiney.s.pereira(a)gmail.com fone: 55 3220-9468 55 9118-4142

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A.mat
by Giselle Davi 26 Nov '13

26 Nov '13

Prezados, alguém sabe me dizer o por que, ao tentar utilizar a função A.mat , do pacote rrBLUP, depamos com: could not find function "A.mat" ??? Att, Giselle

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[OFF-topic] OdfWeave no Windows
by walmes . 26 Nov '13

26 Nov '13

Saudações, Passei um trabalho para meus alunos fazerem no OdfWeave. A esmagadora maioria usa Windows e eles reportam não conseguir usar. A mensagem de erro é referente ao unzip na fase compilação. Essas duas mensagem repostam o mesmo erro observado por eles http://r.789695.n4.nabble.com/odfWeave-td2401995.html http://r.789695.n4.nabble.com/odfWeave-Error-unzipping-file-in-Win-7-td3232… Embora as mensagens apontem soluções para o problema (instalar o winzip, unzip, mudar diretório, retirar espaços do path), a partir delas não houve progresso. Eu não tenho nenhuma máquina windows para fazer testes e então gostaria de saber se tem alguém que usa o OdfWeave com frequência e qual a "mágica" para fazê-lo funcionar no Windows. No Linux eu uso sem problema algum. Grato. Walmes. ========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 skype: walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ==========================================================================

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Dúvida análise de dados
by Kalill V.Páscoa 25 Nov '13

25 Nov '13

Boa tarde pessoal. Estou com algumas duvidas quanto a análise que vou realizar nos meus dados. O meu experimento consiste em avaliar o efeito do espaçamento de plantio sob o crescimento de uma espécie florestal chamada Candeia. Contudo dentro de cada espaçamento ainda existe um sub-tratamento que é a realização de poda. Assim , são 4 tratamentos referentes ao espaçamento de plantio (1,5x1,5; 1,5x2,0; 1,5x2,5 e 1,5x3,0m) distribuídos aleatoriamente e 2 sub-tratamentos (podado e não podado), divididos em 4 Blocos também aleatorizados. Cada tratamento e formado por 4 subparcelas (1-Testemunha, 2-Poda, 3-Poda, 4-Testemunha - sempre nessa ordem, ou seja, os subtratamentos não foram aleatorizados), cada subparcela é formada por 56 plantas. Eu tenho como variáveis resposta o diâmetro (DAP), altura e área da copa, referentes a 16 medições ao longo de 12 anos. Assim eu peguei os dados médios de cada subparcela (Bloco, Espaçamento, Podado ou não e Idade) para realizar a anova. Minhas duvidas são as seguintes: 1- o experimento é uma parcela subdividida no tempo em DBC? 2- se for parcela subdividida no tempo como ficaria a formula do modelo para análise de variância? - imaginei assim: aov(DAP~Bloco+Espaçamento+Poda+Idade+Error(Bloco:Espaçamento, Bloco:Poda)) 3- Como eu testo se existe iteração entre os fatores? Att -- *Kalill José Viana da Páscoa* *Engenheiro Florestal * *Mestrando em Engenharia Florestal Universidade Federal de Lavras* *Rua Geraldo dos Passos, 81 * *Água Limpa, **Lavras-MG* *CEP: 37200-000* *(35)3821-6833* *(35)9152-4828* *(35)9928-6574*

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