Julho 2011 - R-br - DINF UFPR

R utilizando apenas 1 processador para rodar
by Paulo Nogueira 06 Jul '11

06 Jul '11

Bom dia R-Br. Eu participava da antiga R-Stat e demorei um pouco para migrar para o novo ambiente mas estou por aqui faz alguns dias. Tenho uma questão com relação à priorização que o R faz relacionada aos processadores disponíveis no computador. Tenho um notebook com 4 núcleos de processamento mas percebo que quando rodo algo pesado no R apenas um deles é utilizado. O escolhido varia de vez em vez. Alguém sabe como fazer ele utilizar melhor o processamento disponível ou que caminho devo seguir para descobrir? Acho que o ideal seria ter os processadores trabalhando juntos. Utilizo o R através do RStudio (http://rstudio.org/) rodando em Ubuntu 10.10. Obrigado. Paulo Nogueira Starzynski

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FEDORA ou UBUNTU?
by Leonard Assis 06 Jul '11

06 Jul '11

Qual dos dois é melhor pra rodar o R em um i5 notebook com 6GB de RAM e hd de 640 gb (Samsung sd1) Leonard

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desenhos de blocos incompletos com restrição
by Bernardo Rangel Tura 06 Jul '11

06 Jul '11

Bom dia Estou precisando de uma ajuda para gerar uma tabela de blocos incompletos no R. Meu problema é o seguinte tenho 9 tratamentos: A1,A2,A3 B1,B2,B3 C1,C2,C3 Preciso gerar blocos com 6 tratamentos cada mas com três limitações 1- Cada bloco tem que ter pelo menos um representante de cada letra (ou seja não pode haver o bloco: A1,A2,A3,B1,B2,B3) 2- Cada bloco tem que ter pelo menos um representante de cada numero (ou seja não pode haver o bloco A1,A2,B2,B1,C2,C1) 3- Não pode haver tratamentos repetidos (ou seja não pode haver o bloco: A1,A2,A1,B1,C2,B3) O total de observações deve ser em torno de 300. Se não houvesse as restrições seria fácil require(crossdres) find.BIB(9,50,6) Porém com esta restrições (1,2) não estou conseguindo alguém pode me ajudar? -- []s Tura

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Ajuda para plotar um gráfico
by Daniele Portela de oliveira 05 Jul '11

05 Jul '11

Boa tarde colegas, estou recorrendo ao grupo pois estou com problemas para plotar um gráfico com dois tratamentos (Sol e Sombrite), e o tempo em função do ócio. Gostaria de colocar legenda também. Abaixo tem o modelo usando e também a minha rotina do grafico: mod.10<-glm(formula=ocio ~ tempo%in%trat + I(tempo^2)%in%trat+ I(tempo^3)%in%trat+ I(tempo^4)%in%trat, family=poisson(link=log), data = dados) summary(mod.10) pred.o4<-predict(mod.10) # gráfico pred<-cbind(pred.o4) trat1<-pred[1:280,] trat2<-pred[281:560,] grafico<-predict(mod.10) ordenax<- tempo[order(tempo)] ordenat1<-trat1[order(tempo)] ordenat2<-trat2[order(tempo)] plot(ordenax,ordenat1,col="red", xlim=c(8,18),type="l", xlab="Horas do Dia", ylab="Ócio") line(ordenax,ordenat2, col="blue",xlim=c(8,18),type="l") Daniele Portela de Oliveira Mestranda Produção Animal - UEM Cel: 44 9949 3525 67 9617 0965

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Como trabalhar com uma base de dados muito grande
by Carlos Mendonça 05 Jul '11

05 Jul '11

Estou com problema para utilizar a minha base de dados(.mdb). Ela tem em torno de 2 milhões de registros, e > > quando tento executar aparece um erro de falta de memória ("Erro: não é > possível alocar vetor de tamanho 1.1 Gb"). > Como posso resolver essa questão? > Coloquei um exemplo reproduzivel, inclusive com a leitura de dados. > Criei um arquivo com parte da minha base de dados. O link é > http://www.datafilehost.com/download-529c5b03.html > > <http://www.datafilehost.com/download-529c5b03.htmlO> > O código que eu estou utilizando está no link > http://www.datafilehost.com/download-a5b8a3ca.html > Obrigado, > > Carlos Mendonça. >

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Data entry e data management, quais as opções?
by Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil 05 Jul '11

05 Jul '11

Amigos de R, Desculpem o tópico um tanto fora do escopo da lista... :-( mas como imagino que muitos aqui trabalham com data management tambem, Ontem, a diretora da unidade que trabalho na FIOCRUZ veio me perguntar se acharia interessante a instituição se engajar nessa iniciativa aqui: http://www.project-redcap.org/ Eu lembro de ter lido umas mensagens antigas, provavelmente ainda no R_Stat, de alguns falando de softwares e linguagens de entrada de dados. Na minha experiencia (pra que o que eu faço), eu experimento e olho por ai, mas sempre acabo voltando para o EpiData - www.epidata.dk. Esse é bacana, é livre, é pequeno, é portatil, fácil fácil de usar, e faz o trabalho. O EpiData tem algumas desvantagens, nao permite um log de modificação de dados, ou seja, nao sei quem e quando os dados foram inseridos ou editados, nao permite entrada pela web, nao permite multiplos digitadores simultaneamente. Uma nova versão do Epidata está em teste e parece que muitas dessas coisas estão em solução. O redcap me parece ser iniciativa legal, e pelo que vi tem solução para essas questões, e melhor, exporta direto para R (entre outros). Alguem tem alguma experiencia com redcap, boa ou ruim? Alguem daria alguma dica de alguma coisa parecida? Abraço forte e que a força esteja com vocês, Dr. Pedro Emmanuel A. A. do Brasil Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas Fundação Oswaldo Cruz Rio de Janeiro - Brasil Av. Brasil 4365 Tel 55 21 3865-9648 email: pedro.brasil(a)ipec.fiocruz.br email: emmanuel.brasil(a)gmail.com ---Apoio aos softwares livres www.zotero.org - gerenciamento de referências bibliográficas. www.broffice.org ou www.openoffice.org - textos, planilhas ou apresentações. www.epidata.dk - entrada de dados. www.r-project.org - análise de dados. www.ubuntu.com - sistema operacional

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Re: [R-br] Levene.test
by Daniel C Bezerra 04 Jul '11

04 Jul '11

Eu gostaria de sugerir muito cuidado aos mais novos antes de usar o comando: dados<-na.omit(dados) Isto fara com que todas as linhas do banco de dados que tenham NAs sejam apagadas, o que obviamente pode levar a problemas em outras análises. O mais seguro é usar o argumento na.omit=T apenas na função de interesse. Ex.: mean(idade,na.omit=T) Para os modelos, não há necessidade de se preocupar pois por default o R usará na.omit apenas para as variáveis incluídas no modelo. O único problema é que se vc incluir duas variáveis que tenham números diferentes de observações, os modelos não estarão aninhados para comparações. Abs, D On Jul 4, 2011 8:56 AM, "Fernando Henrique Toledo" < fernandohtoledo(a)gmail.com> wrote:

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Plotar média no box plot
by Edson Lira 04 Jul '11

04 Jul '11

Bom dia R-lista, como faço para mostrar no boxplot a média? Não vi nada no material que tenho. Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas

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Coeficiente de Contingência
by Victor Eduardo 04 Jul '11

04 Jul '11

Gente, estou fazendo uma análise aqui em que tenho 2 variáveis qualitativas e preciso saber se elas estão ou não relacionadas, para isso, preciso do coeficiente de contingência, tem algum comando no R que faz esse cálculo para mim??? Abraços

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Levene.test
by Victor Eduardo 04 Jul '11

04 Jul '11

Gente, alguém sabe como posso tirar os NAs para realizar o Levene.test? Tentei alguns recursos e está dando sempre erro.

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