Novembro 2011 - R-br

Melhor versão do linux para R
by Marcelo Cardoso mello 12 Nov '11

12 Nov '11

Valeu pessoal pelas dicas. Instalei o Ubunto 11.10 que esta me parecendo ótimo. Instalei (acho que instalei) o R via terminal com o comando: $ sudo apt-get install r-base Mas diferentemente de outros programas que instalei pelo terminal (como o amsn) não encontro o ícone de inicialização no painel inicial. O que estou fazendo errado?

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Importar uma matriz na extensão data.xlsx
by Ricardo Olinda 11 Nov '11

11 Nov '11

Prezados! Poderiam me auxiliar na importação de uma matriz de dimensões 5384x7835? O arquivo está em .xlsx e estou utilizando o ubuntu. Utilizei o pacote 'gdata' e instalei o módulo: installXLSXsupport(perl = "perl", verbose = FALSE), suporte para extensão .xlsx... O primeiro erro que aparece é a falta de memória. Grato pela ajuda, Att: Ricardo,

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Erro ao importar mapa (Shapefile)
by Pedro Rafael 10 Nov '11

10 Nov '11

Pessoal estou utilizando a biblioteca maptools para importar mapas no shapefile e está ocorrendo o erro que segue: mapa <- readShapePoly("/home/pedro/Documentos/MALHA MUNICIPAL (MAPA)/PB.shp") Erro em make.names(onames, unique = TRUE) : string multibyte inválida 5 O que pode ser? É algum problema no arquivo DBF? Estou utilizando o Linux e a versão 2.14 do R. -- Saudações, Pedro Rafael Diniz Marinho. Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB.

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benchmarking
by Benilton Carvalho 10 Nov '11

10 Nov '11

Aos interessados em fazer algum benchmarking, aqui uma sugestao: 1) Instale o pacote SuppDists 2) Execute: source('http://r.research.att.com/benchmarks/R-benchmark-25.R') 3) Reporte aqui: a) Informacao de Hardware b) Versao do R c) Informacoes adicionais relevantes (BLAS / LAPACK / etc) d) Resultados do benchmark... Para o meu caso: Mac Pro 4,1 Quad-Core Xeon 2.93GHz x 2 HT 16G RAM R 2.13.2 (binario padrao) + ATLAS BLAS Resultados: R Benchmark 2.5 =============== Number of times each test is run__________________________: 3 I. Matrix calculation --------------------- Creation, transp., deformation of a 2500x2500 matrix (sec): 0.617666666666613 2400x2400 normal distributed random matrix ^1000____ (sec): 0.267000000000053 Sorting of 7,000,000 random values__________________ (sec): 0.821333333333352 2800x2800 cross-product matrix (b = a' * a)_________ (sec): 0.37166666666667 Linear regr. over a 3000x3000 matrix (c = a \ b')___ (sec): 0.316000000000031 -------------------------------------------- Trimmed geom. mean (2 extremes eliminated): 0.417059757745061 II. Matrix functions -------------------- FFT over 2,400,000 random values____________________ (sec): 0.489666666666684 Eigenvalues of a 640x640 random matrix______________ (sec): 0.65166666666668 Determinant of a 2500x2500 random matrix____________ (sec): 0.430999999999964 Cholesky decomposition of a 3000x3000 matrix________ (sec): 0.331666666666706 Inverse of a 1600x1600 random matrix________________ (sec): 0.471333333333329 -------------------------------------------- Trimmed geom. mean (2 extremes eliminated): 0.463342341088548 III. Programmation ------------------ 3,500,000 Fibonacci numbers calculation (vector calc)(sec): 0.721333333333367 Creation of a 3000x3000 Hilbert matrix (matrix calc) (sec): 0.472333333333268 Grand common divisors of 400,000 pairs (recursion)__ (sec): 2.30133333333337 Creation of a 500x500 Toeplitz matrix (loops)_______ (sec): 0.733999999999999 Escoufier's method on a 45x45 matrix (mixed)________ (sec): 0.533999999999992 -------------------------------------------- Trimmed geom. mean (2 extremes eliminated): 0.656333300289129 Total time for all 15 tests_________________________ (sec): 9.53200000000008 Overall mean (sum of I, II and III trimmed means/3)_ (sec): 0.502429238538774 --- End of test ---

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Fwd: [Computing] byte-compiler and parallel computing in R
by Leonard de Assis 10 Nov '11

10 Nov '11

-------- Mensagem original -------- Assunto: [Computing] byte-compiler and parallel computing in R Data: Thu, 10 Nov 2011 12:37:06 -0800 De: Jan de Leeuw <deleeuw(a)stat.ucla.edu> Para: statcompute <computing(a)stat.ucla.edu> R-2.14.0 comes with Luke Tierney's byte-compiler installed. Byte-compilation can speed up R computations by a factor 5, although if your functions are just calls to compiled C code the speedup will be much smaller. By default, only the required packages are byte-compiled. But if you set (in your bash profile) export R_COMPILE_PKGS=1 then all packages will byte-compile when installed. If you set export R_ENABLE_JIT=3 then all functions you define in your interactive or batch session will be byte-compiled the first time they are entered into the workspace (and the same is true for all loops). It should be noted that some contributed packages have namespace problems when byte-compiled. R-2.15.0 (i.e. R-devel) has parallel versions of Map() and mapply(). parallel makes fork or socket cluster and has parallel random number generation. MPI clusters are handled (for now) by passing the information to the snow package. === Jan de Leeuw; Distinguished Professor and Chair, UCLA Department of Statistics; Editor: Journal of Multivariate Analysis, Journal of Statistical Software; US mail: 8125 Math Sciences Bldg, Box 951554, Los Angeles, CA 90095-1554 phone (310)-825-9550; fax (310)-206-5658; email: deleeuw(a)stat.ucla.edu .mac: jdeleeuw ++++++ aim: deleeuwjan ++++++ skype: j_deleeuw homepages: http://gifi.stat.ucla.edu ++++++ http://www.cuddyvalley.org ------------------------------------------------------------------------------------------------- No matter where you go, there you are. --- Buckaroo Banzai http://gifi.stat.ucla.edu/sounds/nomatter.au ------------------------------------------------------------------------------------------------- _______________________________________________ Computing mailing list Computing(a)lists.stat.ucla.edu http://lists.stat.ucla.edu/mailman/listinfo/computing

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problema xlsx
by Vinicius Brito Rocha 10 Nov '11

10 Nov '11

Gente, fui importar uma tabela relativamente pesada no excel 2007 para o R, via read.xlsx e obtive a seguinte mensagem de erro: Erro em .jcall("RJavaTools", "Ljava/lang/Object;", "invokeMethod", cl, : java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space alguém sabe o que é e como resolver? -- Vinicius Brito Rocha. Estatístico e Atuário, Mestre em Pesquisa Operacional www.aplicademic.blogspot.com http://twitter.com/viniciusbritor "Não se preocupe muito com as suas dificuldades em Matemática, posso assegurar-lhe que as minhas são ainda maiores." - Albert Einstein.

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Melhor versão do linux para R
by Marcelo Cardoso mello 10 Nov '11

10 Nov '11

Sou inexperiente e estou querendo instalar uma versão do linux. Observei na página do R que algumas versões não tem atualizações. Parece mais atualizado para ubunto e debian. Gostaria de algumas recomendações de qual versão instalar para que o R funcione bem e que seja sempre atualizado. Se eu usar derivativos o R vai funcionar? Por exemplo, no Kurumin, que é derivativo do debian,o R vai funcionar? Obrigado.

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Seleção de níveis de variável
by Edson Lira 09 Nov '11

09 Nov '11

Boa tarde a todos, gente tenho uma variável que tem os seguintes níveis de resposta: 1,2,3,4,5,6,7,8,9 Estou querendo fazer uma análise aonde junto os niveis 1 e 4 para comparar com o nível 9, ou seja, necessito de uma nova variável aonde junta-se 1 e 4 em um único nível e somente o nivel 9, os demais não deverão constar na nova variável. Algo do tipo: nv= 1 e 4 =1_4 e 9=9 Obrigado. Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas

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Livretos para usuarios de R
by Benilton Carvalho 09 Nov '11

09 Nov '11

Aos interessados em dizer "nao a pirataria" (incluindo de livros), abaixo seguem materiais para usuarios de R que podem ser de interesse da maioria: http://a-little-book-of-r-for-time-series.readthedocs.org/en/latest/index.h… http://a-little-book-of-r-for-biomedical-statistics.readthedocs.org/en/late… http://little-book-of-r-for-multivariate-analysis.readthedocs.org/en/latest… Notem que os respectivos PDFs encontram-se no inicio de cada uma das paginas.

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[Dúvida] Sobrepor mapas no R
by Pedro Rafael 08 Nov '11

08 Nov '11

Pessoas tenho que unir o mesmo mapa, a saber da Paraíba. Tenho 3 mapas em cores diferentes, ou seja, cada mapa apresenta uma região pintada diferente e com cores diferenciadas. Gostaria de criar um único mapa com todas as regiões pintadas após a sobreposição. Existe algum objeto para fazer isso? -- Saudações, Pedro Rafael Diniz Marinho. Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB.

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