[R-br] [ OFF TOPIC ] Qual abordagem utilizar - associação de compostos com resistência a praga/doença

[Marcelo Laia]

Caro(a) listeiro(a),

Possuo um grupo de dados com valores representando a proporção de dado
composto na planta. Esses valores variam de 0 a 100%. Assim, o composto Y
pode apresentar valor 41 e o Z valor 0,02, por exemplo. Há em torno de 70
compostos. Nem todas as plantas contém todos os compostos.

Hipótese: plantas resistentes possuem compostos exclusivos e/ou em
proporção significativamente diferente das plantas suscetíveis.

Para os compostos exclusivos, é tranquilo, pois, se o Z está presente
somente no resistente, é muito possível que ele tenha influência sobre a
resistência.

O problema são aqueles que aparecem tanto no resistente quanto no
suscetível em proporção diferente.

Outra questão que pode acontecer é a interação entre compostos. Ou seja,
dois ou mais compostos explicarem o efeito de resistência ou
suscetibilidade. Neste caso, um composto pode agir como facilitador para a
ação de outro, que seria o composto tóxico. Logo, sem o primeiro, o
composto tóxico, sozinho, não teria efeito.

Pensei em usar abordagem genômica, tratando cada composto como um gene. Não
deu certo. Resultado estatístico não explica o biológico. Outra opção seria
pensar na análise de QTLs. Não tentei essa.

Mas, lendo trabalhos na área médica, vi que alguns utilizam vários sintomas
para explicar a doença. Por exemplo, associam faixas de valores de
hemoglobina, ácido úrico e proteína X para explicar a ocorrência de
determinado câncer.

Pergunto: você já viu ou já fez análises estatísticas no R para esse último
caso? Explicar a doença com base em um roll de sintomas? Qual pacote usou?
Poderia sugerir alguma literatura? Tutorial? Site?

Muito obrigado

Marcelo
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