[R-br] Problemas com a paleta de cores

[Cesar Rabak]

Sem um CMR a gente tem que "interpretar" a mensagem...

Parece que o argumento gene_col não tem o tamanho correto... se ñ é ele é
algum outro ligado a cores na chamada encadeada...

Experimento colocar primeiro um valor fixo, como "blue", etc., se funcionar
investigue o descasamento entre o número de cores e indicação de genes...

HTH

--
Cesar Rabak


On Tue, May 31, 2022 at 12:33 PM Michele Claire Breton por (R-br) <
r-br em listas.c3sl.ufpr.br> wrote:

> Caríssimos(as), boa tarde!
>
> Espero que todos se encontrem bem.
>
> Estou tentando plotar um gráfico de bolhas e estou com problemas com as
> cores. A mensagem de erro é a seguinte:
>
>
> [image: image.png]
> O comando foi:
>
> bubble_plot <- ggplot(m3,aes(replicates_list, gene_per)) +
>     geom_point(aes(size=gene_per, fill=gene_col),shape=21,color="black") +
>     theme(panel.grid.major=element_line(linetype=1,color="grey"),
>           axis.text.x=element_text(angle=90,hjust=1,vjust=0),
>           panel.background = element_blank()) +
>     ylab("Gene ID") +
>     xlab("Prostate Adenocarcinome cell types") +
>   scale_fill_discrete(name="Expression values")+
>   scale_size(name="% of cells with expression")
>
> bubble_plot
>
> Minha intenção é que haja um gradiente de cores (tipo heatmap) para
> valores que vão de 0.01 a 5.
>
> e o resultado que espero ver é algo semelhante a isto:
>
> [image: image.png]
>
> Por favor, me ajudem! Falta só isto para plotar o gráfico!
> Aproveito a oportunidade para perdir-lhes indicações de cursos online
> brasileiros de R.
>
> Muitíssimo obrigada pela atenção,
>
> Michele
>
> --------------------------------------------------------------------------
> *Dra. Michele Claire Breton*
> Técnica Superior em Bioinformática
> Doutora em Biologia Celular e Molecular
> CICS - Centro de Investigação em Ciências da Saúde
> Faculdade de Ciências da Saúde
> Universidade da Beira Interior
> Covilhã - Castelo Branco - Portugal
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20220531/58439989/attachment-0001.htm>
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo não-texto foi limpo...
Nome: image.png
Tipo: image/png
Tamanho: 25602 bytes
Descrição: não disponível
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20220531/58439989/attachment-0002.png>
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo não-texto foi limpo...
Nome: image.png
Tipo: image/png
Tamanho: 145070 bytes
Descrição: não disponível
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20220531/58439989/attachment-0003.png>