[R-br] Heatmap com dois conjuntos de dados

[Cesar Rabak]

Veja se o baloonplot do pacote gplots já atende suas necessidades.
A descrição dessa função mostra como montar os dados, e verás que as duas
abordagens seriam possíveis.

HTH
--
Cesar Rabak


On Fri, May 20, 2022 at 8:04 AM Michele Claire Breton por (R-br) <
r-br em listas.c3sl.ufpr.br> wrote:

> Caríssimos(as) mestres(as), bom dia!
>
> Estou com uma dúvida sobre como deve ser meu ficheiro de entrada para
> plotar um gráfico como o terceiro deste link:
> https://stackoverflow.com/questions/67746044/r-heatmap-with-circles
>
> Eu criei 2 ficheiros .csv, um contento os valores de expressão gênica nos
> diferentes tipos celulares (col->genes, lin->tipos de células); e o outro,
> contendo os valores de freqüência em que a expressão do gene ocorre em cada
> célula, com a mesma estrutura do primeiro.
>
> A representação destes dados no gráfico deve ser: a área do círculo
> construído a partir dos dados de frequencia e a cor do círculo deve
> corresponder aos valores de expressão, como em um heatmap.
>
> Eu tenho que trabalhar com os ficheiros em separado ou tenho que montar um
> único ficheiro para ter este resultado?
>
> Muitíssimo obrigada pela ajuda!!
>
> Michele
>
> --
> ------------------------------------------------------------------------
> *Dra. Michele Claire Breton*
> Técnica Superior em Bioinformática
> CICS - Centro de Investigação em Ciências da Saúde
> Faculdade de Ciências da Saúde
> Universidade da Beira Interior
> Covilhã - Castelo Branco - Portugal
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20220520/ae2ef88c/attachment.htm>