[R-br] Cores do heatmap

Michele Claire Breton michele.breton20 em gmail.com
Qua Maio 18 09:53:36 -03 2022


Muito obrigada Paulo!
Funcionou!

Michele

Paulo Dick <paulopcdick em gmail.com> escreveu no dia quarta, 18/05/2022 à(s)
12:57:

> Bom dia Michele,
>
> O erro que relatou não aparece no pedaço do código que enviou, então aqui
> rodou sem problemas.
>
> Pela mensagem de erro, o problema está no fato que o novo my_palette
> possui 20 elementos, enquanto a função usada precisa que a diferença entre
> este e os breaks seja de 1 (must have one more break than colour). No
> primeiro caso ocorreu, pois eram 300 elementos no my_palette e 299 breaks.
>
> Atenciosamente
> Paulo Dick
>
> Em qua., 18 de mai. de 2022 às 07:51, Michele Claire Breton por (R-br) <
> r-br em listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>
>> Caríssimos conterrâneos, bom dia!
>>
>> Espero que todos se encontrem bem.
>> Eu estou trabalhando em um heatmap e resolvi mudar o esquema de cores,
>> entretanto, após a mudança, aparece a mensagem de erro: Error in
>> image.default(1:nc, 1:nr, x, xlim = 0.5 + c(0, nc), ylim = 0.5 +  :
>>   must have one more break than colour.
>>
>> A princípio, eu usei:
>> my_palette <- colorRampPalette(c("green","yellow","red"))(n=299)
>>
>> col_breaks = c(seq(-2,-1,length=100),
>>  seq(-0.9,0.9, length=100),
>>   seq(1,2,length=100))
>>
>> E quis mudar para:
>> my_palette <- colorRampPalette(c("blue","white","red"))(n=20)
>>
>> col_breaks = c(seq(-2,-1,length=100),
>>  seq(-0.9,0.9, length=100),
>>   seq(1,2,length=100))
>>
>> ... e enttão surgiu a mensagem de erro. O que fiz de errado?
>> Muito obrigada por me ajudarem
>>
>> Michele
>>
>>
>> --
>> ------------------------------------------------------------------------
>> *Dra. Michele Claire Breton*
>> Técnica Superior em Bioinformática
>> CICS - Centro de Investigação em Ciências da Saúde
>> Faculdade de Ciências da Saúde
>> Universidade da Beira Interior
>> Covilhã - Castelo Branco - Portugal
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