[R-br] Cores do heatmap

[Paulo Dick]

Bom dia Michele,

O erro que relatou não aparece no pedaço do código que enviou, então aqui
rodou sem problemas.

Pela mensagem de erro, o problema está no fato que o novo my_palette possui
20 elementos, enquanto a função usada precisa que a diferença entre este e
os breaks seja de 1 (must have one more break than colour). No primeiro
caso ocorreu, pois eram 300 elementos no my_palette e 299 breaks.

Atenciosamente
Paulo Dick

Em qua., 18 de mai. de 2022 às 07:51, Michele Claire Breton por (R-br) <
r-br em listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Caríssimos conterrâneos, bom dia!
>
> Espero que todos se encontrem bem.
> Eu estou trabalhando em um heatmap e resolvi mudar o esquema de cores,
> entretanto, após a mudança, aparece a mensagem de erro: Error in
> image.default(1:nc, 1:nr, x, xlim = 0.5 + c(0, nc), ylim = 0.5 +  :
>   must have one more break than colour.
>
> A princípio, eu usei:
> my_palette <- colorRampPalette(c("green","yellow","red"))(n=299)
>
> col_breaks = c(seq(-2,-1,length=100),
>  seq(-0.9,0.9, length=100),
>   seq(1,2,length=100))
>
> E quis mudar para:
> my_palette <- colorRampPalette(c("blue","white","red"))(n=20)
>
> col_breaks = c(seq(-2,-1,length=100),
>  seq(-0.9,0.9, length=100),
>   seq(1,2,length=100))
>
> ... e enttão surgiu a mensagem de erro. O que fiz de errado?
> Muito obrigada por me ajudarem
>
> Michele
>
>
> --
> ------------------------------------------------------------------------
> *Dra. Michele Claire Breton*
> Técnica Superior em Bioinformática
> CICS - Centro de Investigação em Ciências da Saúde
> Faculdade de Ciências da Saúde
> Universidade da Beira Interior
> Covilhã - Castelo Branco - Portugal
> _______________________________________________
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> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
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> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
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